转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr02G003688; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00003637-RA_Salv SmilChr02G003688 MYB XP_057794248.1 MP00028 GGCTCAGCGCG

可能结合的靶基因

9024 个结合位点 6764 个候选靶基因 第 5 / 136 下载 TSV

上一页 5 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr05G001687 Chr05 NC_080391.1:16015923-16015933promoter 内 3454-3464 bp + 537 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.9/ 100 2 16016470-16019361(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCTCAGCGCC
SmilChr02G005583 Chr02 NC_080388.1:75652498-75652508promoter 内 3278-3288 bp + 713 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.9/ 100 2 75650735-75651785(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CCCGCTGAGGC
SmilChr01G002536 Chr01 NC_080387.1:43430149-43430159promoter 内 2258-2268 bp - 1733 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.9/ 100 2 43424648-43428416(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCTCAGCGCC
SmilChr04G000229 Chr04 NC_080390.1:2041731-2041741promoter 内 1976-1986 bp + 2015 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.9/ 100 2 2034220-2039716(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGCGCTGAGCA
SmilChr05G000748 Chr05 NC_080391.1:5794808-5794818promoter 内 1524-1534 bp - 2467 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.9/ 100 2 5797285-5801799(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGCGCTGAGCT
SmilChr03G004646 Chr03 NC_080389.1:64022595-64022605promoter 内 1465-1475 bp - 2526 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.9/ 100 2 64019175-64020069(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TGCTCAGCGCG
SmilChr06G003194 Chr06 NC_080392.1:44826609-44826619promoter 内 1398-1408 bp - 2593 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.9/ 100 2 44829212-44830519(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGCGCTGAGCT
SmilChr03G001765 Chr03 NC_080389.1:24091424-24091434promoter 内 1273-1283 bp + 2718 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.9/ 100 2 24087711-24088706(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGCGCTGAGCT
SmilChr01G000382 Chr01 NC_080387.1:7859915-7859925promoter 内 1033-1043 bp + 2958 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.9/ 100 2 7856244-7856957(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGCGCTGAGCT
SmilChr02G001372 Chr02 NC_080388.1:25968008-25968018promoter 内 655-665 bp - 3336 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.9/ 100 2 25961839-25964672(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCTCAGCGCC
SmilChr05G001686 Chr05 NC_080391.1:16015923-16015933promoter 内 355-365 bp + 3636 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.9/ 100 2 16010204-16012287(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGCGCTGAGCT
SmilChr07G002504 Chr07 NC_080393.1:23748369-23748379promoter 内 3922-3932 bp + 69 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.9/ 100 1 23748448-23750988(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCTCAGCGCC
SmilChr06G002814 Chr06 NC_080392.1:40861602-40861612promoter 内 3913-3923 bp - 78 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.9/ 100 1 40860680-40861524(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TGCTCAGCGCG
SmilChr05G003992 Chr05 NC_080391.1:53760566-53760576promoter 内 3851-3861 bp + 140 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.9/ 100 1 53760716-53761432(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCTCAGCGCC
SmilChr07G003730 Chr07 NC_080393.1:45307574-45307584promoter 内 3770-3780 bp + 221 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.9/ 100 1 45307805-45310101(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCTCAGCGCC
SmilChr05G001224 Chr05 NC_080391.1:10302164-10302174promoter 内 3710-3720 bp + 281 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.9/ 100 1 10302455-10306055(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCTCAGCGCC
SmilChr03G001033 Chr03 NC_080389.1:12031262-12031272promoter 内 3708-3718 bp - 283 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.9/ 100 1 12031555-12031661(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGCGCTGAGCT
SmilChr01G001134 Chr01 NC_080387.1:23098412-23098422promoter 内 3665-3675 bp + 326 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.9/ 100 1 23098748-23103278(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCTCAGCGCC
SmilChr01G003013 Chr01 NC_080387.1:49168535-49168545promoter 内 3566-3576 bp + 425 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.9/ 100 1 49168970-49169650(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCTCAGCGCC
SmilChr03G003286 Chr03 NC_080389.1:50934331-50934341promoter 内 3512-3522 bp + 479 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.9/ 100 1 50934820-50935836(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCTCAGCGCC
SmilChr03G000997 Chr03 NC_080389.1:11318228-11318238promoter 内 3377-3387 bp + 614 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.9/ 100 1 11316122-11317614(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGCGCTGAGCT
SmilChr03G000994 Chr03 NC_080389.1:11308340-11308350promoter 内 3375-3385 bp + 616 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.9/ 100 1 11306232-11307724(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGCGCTGAGCT
SmilChr01G006102 Chr01 NC_080387.1:76524480-76524490promoter 内 3366-3376 bp + 625 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.9/ 100 1 76521564-76523855(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGCGCTGAGCT
SmilChr01G006103 Chr01 NC_080387.1:76534266-76534276promoter 内 3358-3368 bp + 633 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.9/ 100 1 76529367-76533633(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGCGCTGAGCT
SmilChr07G003884 Chr07 NC_080393.1:48504903-48504913promoter 内 3314-3324 bp - 677 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.9/ 100 1 48486672-48504226(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCTCAGCGCC
SmilChr06G001840 Chr06 NC_080392.1:21599153-21599163promoter 内 3237-3247 bp - 754 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.9/ 100 1 21595784-21598399(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TGCTCAGCGCG
SmilChr01G002344 Chr01 NC_080387.1:40590890-40590900promoter 内 3077-3087 bp - 914 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.9/ 100 1 40586139-40589976(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GCCTCAGCGGG
SmilChr06G000990 Chr06 NC_080392.1:9784908-9784918promoter 内 2992-3002 bp - 999 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.9/ 100 1 9780960-9783909(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCTCAGCGCC
SmilChr05G003594 Chr05 NC_080391.1:48033752-48033762promoter 内 2875-2885 bp - 1116 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.9/ 100 1 48028748-48032636(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TGCTCAGCGCG
SmilChr05G003352 Chr05 NC_080391.1:44246081-44246091promoter 内 2873-2883 bp - 1118 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.9/ 100 1 44243828-44244963(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GCCTCAGCGGG
SmilChr03G003648 Chr03 NC_080389.1:55240328-55240338promoter 内 2834-2844 bp + 1157 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.9/ 100 1 55241495-55244036(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TGCTCAGCGCG
SmilChr01G004855 Chr01 NC_080387.1:66730096-66730106promoter 内 2747-2757 bp + 1244 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.9/ 100 1 66731350-66734673(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCTCAGCGCC
SmilChr04G002079 Chr04 NC_080390.1:33571882-33571892promoter 内 2692-2702 bp - 1299 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.9/ 100 1 33561589-33570583(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCTCAGCGCC
SmilChr01G002072 Chr01 NC_080387.1:36627133-36627143promoter 内 2549-2559 bp - 1442 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.9/ 100 1 36628585-36629689(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGCGCTGAGCT
SmilChr05G000572 Chr05 NC_080391.1:4310962-4310972promoter 内 2546-2556 bp + 1445 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.9/ 100 1 4304539-4309517(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGCGCTGAGCT
SmilChr04G004173 Chr04 NC_080390.1:56359504-56359514promoter 内 2513-2523 bp + 1478 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.9/ 100 1 56354676-56358026(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGCGCTGAGCT
SmilChr06G002813 Chr06 NC_080392.1:40861602-40861612promoter 内 2499-2509 bp - 1492 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.9/ 100 1 40853513-40860110(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TGCTCAGCGCG
SmilChr02G005448 Chr02 NC_080388.1:74844145-74844155promoter 内 2457-2467 bp + 1534 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.9/ 100 1 74838279-74842611(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGCGCTGAGCT
SmilChr02G000248 Chr02 NC_080388.1:3209852-3209862promoter 内 2421-2431 bp - 1570 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.9/ 100 1 3204946-3208282(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TGCTCAGCGCG
SmilChr02G004977 Chr02 NC_080388.1:71661922-71661932promoter 内 2281-2291 bp + 1710 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.9/ 100 1 71656099-71660212(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGCGCTGAGCA
SmilChr01G001517 Chr01 NC_080387.1:29046983-29046993promoter 内 1990-2000 bp - 2001 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.9/ 100 1 29048994-29051927(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGCGCTGAGCT
SmilChr04G001339 Chr04 NC_080390.1:21653362-21653372promoter 内 1973-1983 bp - 2018 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.9/ 100 1 21655390-21657354(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGCGCTGAGCA
SmilChr02G002620 Chr02 NC_080388.1:45506915-45506925promoter 内 1934-1944 bp + 2057 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.9/ 100 1 45503857-45504858(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGCGCTGAGCA
SmilChr01G002552 Chr01 NC_080387.1:43614813-43614823promoter 内 1907-1917 bp - 2084 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.9/ 100 1 43616907-43618214(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGCGCTGAGCT
SmilChr07G003120 Chr07 NC_080393.1:33094887-33094897promoter 内 1897-1907 bp + 2094 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.9/ 100 1 33096991-33099278(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCTCAGCGCC
SmilChr02G005539 Chr02 NC_080388.1:75418958-75418968promoter 内 1880-1890 bp - 2111 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.9/ 100 1 75413636-75416847(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GCCTCAGCGGG
SmilChr03G001971 Chr03 NC_080389.1:28410741-28410751promoter 内 1874-1884 bp - 2117 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.9/ 100 1 28412868-28414304(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGCGCTGAGCA
SmilChr05G002292 Chr05 NC_080391.1:24756966-24756976promoter 内 1743-1753 bp - 2248 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.9/ 100 1 24759224-24762489(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CCCGCTGAGGC
SmilChr01G005130 Chr01 NC_080387.1:69100165-69100175promoter 内 1586-1596 bp + 2405 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.9/ 100 1 69096784-69097760(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGCGCTGAGCT
SmilChr05G002269 Chr05 NC_080391.1:24404421-24404431promoter 内 1474-1484 bp + 2517 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.9/ 100 1 24400693-24401904(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGCGCTGAGCA