转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr02G000949; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00003681-RA_Salv SmilChr02G000949 bZIP XP_057795176.1 MP00318 TGCCACGTCAGCATT

可能结合的靶基因

9413 个结合位点 6849 个候选靶基因 第 50 / 137 下载 TSV

上一页 50 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr01G001077 Chr01 NC_080387.1:22194119-22194133promoter 内 2281-2295 bp - 1706 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 22195839-22202144(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 GTTGTTGACGTGGAA
SmilChr08G004345 Chr08 NC_080394.1:53122451-53122465promoter 内 2273-2287 bp + 1714 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 53116342-53120737(-) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 TGATGACACGTGGCA
SmilChr03G001399 Chr03 NC_080389.1:16608306-16608320promoter 内 2042-2056 bp + 1945 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 16604416-16606361(-) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 ACTCCCGACGTGGCG
SmilChr03G003752 Chr03 NC_080389.1:56599959-56599973promoter 内 2005-2019 bp - 1982 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 56595578-56597977(-) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 TGCCACGTGTCACGC
SmilChr03G003011 Chr03 NC_080389.1:47010930-47010944promoter 内 1985-1999 bp - 2002 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 47012946-47018637(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 GTTGTCCACGTGGCC
SmilChr02G001605 Chr02 NC_080388.1:29879817-29879831promoter 内 1948-1962 bp - 2039 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 29881870-29888854(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 AACGTCGACGTGGCG
SmilChr06G000130 Chr06 NC_080392.1:920126-920140promoter 内 1879-1893 bp - 2108 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 922248-929003(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 TCGGGACACGTGGCG
SmilChr05G002768 Chr05 NC_080391.1:32108788-32108802promoter 内 1875-1889 bp + 2112 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 32110914-32111924(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 TGCCACGTAAGACAT
SmilChr07G003513 Chr07 NC_080393.1:40066808-40066822promoter 内 1618-1632 bp - 2369 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 40064368-40064439(-) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 TGCCACGTCTCAGCA
SmilChr08G004346 Chr08 NC_080394.1:53122451-53122465promoter 内 1596-1610 bp + 2391 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 53124856-53125613(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 TGCCACGTGTCATCA
SmilChr07G001133 Chr07 NC_080393.1:8512989-8513003promoter 内 1494-1508 bp + 2493 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 8515496-8518192(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 GTCCACGTCAGCATG
SmilChr06G000391 Chr06 NC_080392.1:3128061-3128075promoter 内 1429-1443 bp + 2558 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 3123050-3125503(-) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 GTTGTTGACGTGGAA
SmilChr07G000742 Chr07 NC_080393.1:5185498-5185512promoter 内 1402-1416 bp + 2585 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 5188097-5189245(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 AGCCACGTGGGAACT
SmilChr02G003460 Chr02 NC_080388.1:55894348-55894362promoter 内 1401-1415 bp - 2586 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 55896948-55897020(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 AGCGTCGACGTGGCG
SmilChr03G001603 Chr03 NC_080389.1:20359638-20359652promoter 内 1391-1405 bp + 2596 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 20356209-20357042(-) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 ATAGACGACGTGGAA
SmilChr03G001925 Chr03 NC_080389.1:27016239-27016253promoter 内 1316-1330 bp - 2671 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 27006361-27013568(-) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 AGCCACGTGGGAACT
SmilChr02G005360 Chr02 NC_080388.1:74316376-74316390promoter 内 1314-1328 bp + 2673 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 74319063-74320542(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 TGCCACGTCATTATG
SmilChr06G000683 Chr06 NC_080392.1:6053280-6053294promoter 内 1142-1156 bp + 2845 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 6045857-6050435(-) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 TTTTCCGACGTGGAA
SmilChr08G004502 Chr08 NC_080394.1:54623094-54623108promoter 内 890-904 bp + 3097 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 54626205-54630205(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 GGCCACGTCGACTCT
SmilChr02G002498 Chr02 NC_080388.1:43420383-43420397promoter 内 885-899 bp - 3102 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 43416478-43417281(-) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 AGCCACGTGGGAACT
SmilChr02G001765 Chr02 NC_080388.1:32393642-32393656promoter 内 877-891 bp - 3110 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 32384930-32390532(-) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 TGCCACGTCGTAGTG
SmilChr08G004500 Chr08 NC_080394.1:54623094-54623108promoter 内 820-834 bp + 3167 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 54619052-54619927(-) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 AGAGTCGACGTGGCC
SmilChr07G001601 Chr07 NC_080393.1:13365989-13366003promoter 内 766-780 bp - 3221 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 13369224-13370279(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 GCGTGACACGTGGCA
SmilChr05G003309 Chr05 NC_080391.1:43346418-43346432promoter 内 739-753 bp + 3248 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 43349680-43350075(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 TGCCACGTGTCACGC
SmilChr03G000840 Chr03 NC_080389.1:9598665-9598679promoter 内 689-703 bp - 3298 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 9601977-9604830(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 ATTACAGACGTGGCA
SmilChr01G005734 Chr01 NC_080387.1:73474719-73474733promoter 内 570-584 bp + 3417 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 73478150-73479250(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 AGCCACGTGGGAACT
SmilChr01G006127 Chr01 NC_080387.1:76810942-76810956promoter 内 569-583 bp - 3418 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 76806425-76807524(-) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 AGCCACGTGGGAACT
SmilChr04G000744 Chr04 NC_080390.1:9129681-9129695promoter 内 355-369 bp - 3632 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 9123447-9126049(-) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 CTCCACGTCACAATC
SmilChr05G003183 Chr05 NC_080391.1:40737081-40737095promoter 内 228-242 bp + 3759 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 40740854-40741900(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 TGCCACGTGTCACGC
SmilChr08G003675 Chr08 NC_080394.1:40879104-40879118promoter 内 184-198 bp + 3803 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 40882921-40886399(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 AGCCACGTGGGAACT
SmilChr08G003671 Chr08 NC_080394.1:40661614-40661628promoter 内 172-186 bp + 3815 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 40665443-40668681(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 AGCCACGTGGGAACT
SmilChr06G002185 Chr06 NC_080392.1:30189367-30189381promoter 内 105-119 bp + 3882 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 30193263-30196280(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 TGCCACGTCACGCCG
SmilChr08G002124 Chr08 NC_080394.1:19112227-19112241promoter 内 3951-3965 bp - 36 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 3 19112277-19118582(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 TCTGAACACGTGGCG
SmilChr08G002429 Chr08 NC_080394.1:23103294-23103308promoter 内 2627-2641 bp - 1360 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 3 23104668-23105896(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 GGAGACGACGTGGAG
SmilChr06G002412 Chr06 NC_080392.1:34852588-34852602promoter 内 2318-2332 bp + 1669 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 3 34850164-34850919(-) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 GAGCGCCACGTGGCA
SmilChr01G002530 Chr01 NC_080387.1:43322548-43322562promoter 内 242-256 bp + 3745 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 3 43317510-43318803(-) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 GGAGACGACGTGGAG
SmilChr07G001220 Chr07 NC_080393.1:9346263-9346277promoter 内 3982-3996 bp - 5 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 2 9346282-9349423(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 CACTCAGACGTGGCA
SmilChr07G002225 Chr07 NC_080393.1:20477009-20477023promoter 内 3471-3485 bp + 516 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 2 20477539-20479968(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 AGCCACGTCAACACA
SmilChr04G002461 Chr04 NC_080390.1:39435042-39435056promoter 内 2805-2819 bp - 1182 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 2 39436238-39442760(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 ATAAATGACGTGGCA
SmilChr04G002018 Chr04 NC_080390.1:32747827-32747841promoter 内 2719-2733 bp + 1268 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 2 32744425-32746559(-) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 TTTGCCGACGTGGAC
SmilChr02G000256 Chr02 NC_080388.1:3288727-3288741promoter 内 2690-2704 bp - 1297 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 2 3290038-3292845(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 AGCTGCCACGTGGCG
SmilChr02G001767 Chr02 NC_080388.1:32407391-32407405promoter 内 2262-2276 bp + 1725 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 2 32409130-32411706(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 GGCCACGTCATACGC
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SmilChr04G000736 Chr04 NC_080390.1:8827099-8827113promoter 内 1533-1547 bp + 2454 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 2 8821774-8824645(-) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 GGTGATGACGTGGAC
SmilChr02G001766 Chr02 NC_080388.1:32407391-32407405promoter 内 1329-1343 bp + 2658 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 2 32404592-32404733(-) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 GCGTATGACGTGGCC
SmilChr04G002460 Chr04 NC_080390.1:39435042-39435056promoter 内 1151-1165 bp - 2836 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 2 39425976-39432206(-) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 TGCCACGTCATTTAT
SmilChr01G003407 Chr01 NC_080387.1:52730123-52730137promoter 内 1099-1113 bp + 2888 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 2 52733025-52736021(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 TGCCACGTCGAATAT
SmilChr07G001893 Chr07 NC_080393.1:16350604-16350618promoter 内 636-650 bp + 3351 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 2 16346138-16347253(-) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 TTTGCCGACGTGGAC
SmilChr06G002047 Chr06 NC_080392.1:26866311-26866325promoter 内 209-223 bp - 3778 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 2 26870103-26872012(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 TAAAATGACGTGGCA