转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr02G004607; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00002089-RA_Salv SmilChr02G004607 C2H2 XP_057791470.1 MP00608 AAAAACAGAGCA

可能结合的靶基因

9817 个结合位点 6398 个候选靶基因 第 52 / 128 下载 TSV

上一页 52 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr02G005465 Chr02 NC_080388.1:74951562-74951573promoter 内 746-757 bp - 3244 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 74945122-74948318(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 CAGAACAGAGAA
SmilChr02G001822 Chr02 NC_080388.1:33111079-33111090promoter 内 501-512 bp + 3489 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 33104793-33107590(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 ACCTCTGTTTCA
SmilChr01G004222 Chr01 NC_080387.1:60587121-60587132promoter 内 422-433 bp + 3568 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 60582237-60583553(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 AGCTCTGTTCTG
SmilChr02G001846 Chr02 NC_080388.1:33668394-33668405promoter 内 274-285 bp + 3716 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 33672121-33675345(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 CAGAACAGAGAA
SmilChr01G000562 Chr01 NC_080387.1:11670884-11670895promoter 内 208-219 bp - 3782 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 11666755-11667102(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 CAGAACAGAGCT
SmilChr03G001336 Chr03 NC_080389.1:15602883-15602894promoter 内 34-45 bp - 3956 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 15595801-15598927(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 CAGAACAGAGAA
SmilChr01G002964 Chr01 NC_080387.1:48521811-48521822promoter 内 3574-3585 bp - 416 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 4 48522238-48524845(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 CCCTCTGTTCCG
SmilChr03G000279 Chr03 NC_080389.1:3175355-3175366promoter 内 2328-2339 bp + 1662 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 4 3171369-3173693(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 CCCTCTGTTCCG
SmilChr03G000689 Chr03 NC_080389.1:7685238-7685249promoter 内 2932-2943 bp + 1058 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 3 7682537-7684180(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 ACCTCTGTTTTA
SmilChr01G004718 Chr01 NC_080387.1:65391058-65391069promoter 内 2325-2336 bp - 1665 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 3 65386205-65389393(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 CGGAACAGAGGG
SmilChr01G003295 Chr01 NC_080387.1:51642511-51642522promoter 内 2200-2211 bp - 1790 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 3 51644312-51650026(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TTCTCTGTTCTC
SmilChr02G002245 Chr02 NC_080388.1:39868914-39868925promoter 内 2132-2143 bp + 1858 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 3 39864346-39867056(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 AGCTCTGTTCTC
SmilChr02G004400 Chr02 NC_080388.1:66347859-66347870promoter 内 515-526 bp - 3475 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 3 66341746-66344384(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 CGGAACAGAGGG
SmilChr02G003297 Chr02 NC_080388.1:54245452-54245463promoter 内 3904-3915 bp + 86 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 2 54243482-54245366(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 CACTCTGTTTTA
SmilChr01G005997 Chr01 NC_080387.1:75556700-75556711promoter 内 3436-3447 bp + 554 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 2 75552914-75556146(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 CCCTCTGTTCCG
SmilChr01G003543 Chr01 NC_080387.1:54017935-54017946promoter 内 3395-3406 bp - 595 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 2 54014397-54017340(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 CAGAACAGAGGG
SmilChr01G004400 Chr01 NC_080387.1:62129653-62129664promoter 内 3247-3258 bp - 743 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 2 62127717-62128910(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 CGGAACAGAGGG
SmilChr02G003087 Chr02 NC_080388.1:51760849-51760860promoter 内 3078-3089 bp - 912 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 2 51758673-51759937(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TGAAACAGAGTG
SmilChr01G001287 Chr01 NC_080387.1:25654380-25654391promoter 内 3005-3016 bp + 985 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 2 25655376-25656574(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 GAGAACAGAGCT
SmilChr02G004126 Chr02 NC_080388.1:63508081-63508092promoter 内 2760-2771 bp + 1230 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 2 63509322-63511553(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 CAGAACAGAGGG
SmilChr02G003964 Chr02 NC_080388.1:61796844-61796855promoter 内 2031-2042 bp - 1959 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 2 61791360-61794885(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 CGGAACAGAGGG
SmilChr02G003704 Chr02 NC_080388.1:58526885-58526896promoter 内 1495-1506 bp + 2495 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 2 58529391-58534339(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 CGGAACAGAGGG
SmilChr01G005981 Chr01 NC_080387.1:75474584-75474595promoter 内 1472-1483 bp + 2518 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 2 75468432-75472066(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 ACCTCTGTTTTA
SmilChr01G000685 Chr01 NC_080387.1:15314184-15314195promoter 内 1247-1258 bp - 2743 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 2 15310308-15311441(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 CGGAACAGAGGG
SmilChr02G001291 Chr02 NC_080388.1:23733212-23733223promoter 内 1210-1221 bp + 2780 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 2 23726053-23730432(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 AGCTCTGTTCTC
SmilChr02G002272 Chr02 NC_080388.1:40189950-40189961promoter 内 585-596 bp + 3405 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 2 40185049-40186545(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 CCCTCTGTTCCG
SmilChr01G005983 Chr01 NC_080387.1:75474584-75474595promoter 内 238-249 bp + 3752 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 2 75478347-75479513(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TAAAACAGAGGT
SmilChr02G003235 Chr02 NC_080388.1:53629291-53629302promoter 内 198-209 bp + 3792 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 2 53633094-53636210(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TAAAACAGAGTG
SmilChr01G004401 Chr01 NC_080387.1:62129653-62129664promoter 内 30-41 bp - 3960 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 2 62133624-62135549(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 CCCTCTGTTCCG
SmilChr01G003236 Chr01 NC_080387.1:51116452-51116463promoter 内 3936-3947 bp + 54 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 51116517-51117513(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TAAAACAGAGGT
SmilChr01G003164 Chr01 NC_080387.1:50451513-50451524promoter 内 3620-3631 bp - 370 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 50449264-50451143(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TAAAACAGAGGT
SmilChr02G002783 Chr02 NC_080388.1:47912192-47912203promoter 内 3570-3581 bp + 420 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 47911401-47911772(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 GGCTCTGTTCCA
SmilChr01G003714 Chr01 NC_080387.1:55481224-55481235promoter 内 3422-3433 bp - 568 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 55481803-55486554(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 CACTCTGTTTTA
SmilChr02G002098 Chr02 NC_080388.1:37659287-37659298promoter 内 3279-3290 bp - 711 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 37657053-37658576(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 GAGAACAGAGAA
SmilChr01G004153 Chr01 NC_080387.1:60054022-60054033promoter 内 3242-3253 bp - 748 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 60051287-60053274(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 CAGAACAGAGGG
SmilChr01G005801 Chr01 NC_080387.1:74087005-74087016promoter 内 3059-3070 bp - 931 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 74087947-74093377(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 CACTCTGTTTTA
SmilChr02G002795 Chr02 NC_080388.1:48036111-48036122promoter 内 2879-2890 bp + 1111 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 48037233-48039898(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 GAGAACAGAGAA
SmilChr01G005062 Chr01 NC_080387.1:68527669-68527680promoter 内 2750-2761 bp + 1240 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 68528920-68531209(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TGAAACAGAGTG
SmilChr02G005154 Chr02 NC_080388.1:72905815-72905826promoter 内 2709-2720 bp + 1281 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 72907107-72915812(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 GAGAACAGAGCT
SmilChr01G003737 Chr01 NC_080387.1:55698051-55698062promoter 内 2684-2695 bp + 1306 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 55699368-55701398(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 GAGAACAGAGCT
SmilChr01G002029 Chr01 NC_080387.1:35866994-35867005promoter 内 2503-2514 bp + 1487 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 35864563-35865507(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TTCTCTGTTCTC
SmilChr03G001016 Chr03 NC_080389.1:11675368-11675379promoter 内 2486-2497 bp + 1504 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 11676883-11677709(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 GAGAACAGAGCT
SmilChr02G004431 Chr02 NC_080388.1:66667537-66667548promoter 内 2232-2243 bp - 1758 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 66663173-66665779(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 GAGAACAGAGCT
SmilChr01G004763 Chr01 NC_080387.1:65805360-65805371promoter 内 2137-2148 bp - 1853 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 65799425-65803507(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 CAGAACAGAGGG
SmilChr02G003411 Chr02 NC_080388.1:55272878-55272889promoter 内 1972-1983 bp - 2018 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 55274907-55280014(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 AGCTCTGTTCTC
SmilChr02G000619 Chr02 NC_080388.1:9066178-9066189promoter 内 1849-1860 bp - 2141 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 9068330-9069128(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 AGCTCTGTTCTC
SmilChr01G002962 Chr01 NC_080387.1:48521811-48521822promoter 内 1805-1816 bp - 2185 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 48514321-48519626(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 CGGAACAGAGGG
SmilChr02G003307 Chr02 NC_080388.1:54343545-54343556promoter 内 1675-1686 bp - 2315 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 54336271-54341230(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TGAAACAGAGTG
SmilChr03G001639 Chr03 NC_080389.1:21147119-21147130promoter 内 1642-1653 bp - 2348 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 21149478-21151086(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TTCTCTGTTCCC
SmilChr01G000237 Chr01 NC_080387.1:4440317-4440328promoter 内 1472-1483 bp - 2518 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 4442846-4444444(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 CACTCTGTTTTA