Red Sage Omics 丹参基因组信息平台
首页 基因查询 ID 对照表 功能注释 结构域预测 Pfam 基因组工具 蛋白互作 亚细胞定位 表达量 共表达 同源/共线性 GO/KEGG 注释 TF 结合位点 TF 靶基因 EMS 突变 JBrowse BLAST 下载 关于 帮助
数据资源
ID 对照表 功能注释 功能检索 次生代谢专题 文献证据 结构域预测 Pfam 同源/共线性
分析工具
基因组工具 引物设计 同源重组引物设计 核酸翻译 BLAST 蛋白互作 亚细胞定位 共表达 GO/KEGG 注释 功能检索
调控/突变
TF 结合位点 TF 靶基因 EMS 突变
帮助
关于 帮助 资源与版本
中文 EN

转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family，查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中，并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因，不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif；应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引，可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card，点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
SmilChr04G003117 XP_057809539.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr04G003114 XP_057809538.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr01G005298 XP_057788621.1
ARR-B 1
MP00010
 8344 9778 查靶基因
SmilChr03G003924 XP_057798851.1
NAC 1
MP00059
 8333 9940 查靶基因
SmilChr01G005344 XP_057788686.1
MYB 1
MP00296
 8304 9873 查靶基因
SmilChr08G004408 XP_057780613.1
MYB 1
MP00114
 8151 9897 查靶基因
SmilChr04G001094 XP_057804404.1
WRKY 1
MP00408
 8149 9902 查靶基因
SmilChr07G003597 XP_057773587.1
Nin-like 1
MP00449
 8096 9453 查靶基因
SmilChr02G005433 XP_057792682.1
WRKY 1
MP00209
 8083 9910 查靶基因
SmilChr04G004136 XP_057806072.1
MYB 1
MP00627
 8075 9835 查靶基因
SmilChr01G003955 XP_057779712.1
WRKY 1
MP00450
 8044 9901 查靶基因
SmilChr03G003685 XP_057798538.1
ERF 1
MP00558
 8044 9762 查靶基因
SmilChr07G002937 XP_057777490.1
MIKC_MADS 1
MP00096
 8019 9914 查靶基因
SmilChr02G003833 XP_057794421.1
MYB 1
MP00476
 7981 9904 查靶基因
SmilChr07G002803 XP_057777238.1
NAC 1
MP00221
 7965 9903 查靶基因
SmilChr05G002364 XP_057809766.1
WRKY 1
MP00069
 7882 9917 查靶基因
SmilChr08G003267 XP_057779249.1
MYB 1
MP00406
 7839 9917 查靶基因
SmilChr02G005012 XP_057792191.1
TALE 1
MP00670
 7758 9906 查靶基因
SmilChr07G001978 XP_057776996.1
SBP 1
MP00555
 7648 9805 查靶基因
SmilChr05G000741 XP_057764423.1
ARF 1
MP00021
 7629 9812 查靶基因
SmilChr01G004579 XP_057787263.1
MYB 1
MP00132
 7583 9926 查靶基因
SmilChr05G000593 XP_057764223.1
MIKC_MADS 1
MP00609
 7575 9941 查靶基因
SmilChr03G004518 XP_057799834.1
ERF 1
MP00529
 7559 9247 查靶基因
SmilChr06G001829 XP_057766988.1
MYB 1
MP00510
 7526 9799 查靶基因
SmilChr05G000830 XP_057764550.1
NAC 1
MP00058
 7440 9855 查靶基因
SmilChr08G002543 XP_057778423.1
bZIP 1
MP00303
 7416 9868 查靶基因
SmilChr01G002743 XP_057765725.1
MYB_related 1
MP00565
 7412 9785 查靶基因
SmilChr04G002704 XP_057807081.1
ERF 1
MP00026
 7408 9854 查靶基因
SmilChr05G001395 XP_057765344.1
WRKY 1
MP00071
 7408 9764 查靶基因
SmilChr04G002953 XP_057809314.1
ARF 1
MP00033
 7406 9827 查靶基因
SmilChr01G004199 XP_057782208.1
bHLH 1
MP00074
 7396 9969 查靶基因
SmilChr05G004009 XP_057810662.1
MYB 1
MP00216
 7342 9832 查靶基因
SmilChr03G001606 XP_057802772.1
WRKY 1
MP00539
 7338 9848 查靶基因
SmilChr02G004600 XP_057791481.1
ARF 1
MP00574
 7302 9846 查靶基因
SmilChr03G004179 XP_057799230.1
WRKY 1
MP00464
 7299 9864 查靶基因
SmilChr04G003805 XP_057805691.1
MIKC_MADS 1
MP00315
 7291 9567 查靶基因
SmilChr03G003761 XP_057798625.1
WRKY 1
MP00525
 7235 9838 查靶基因
SmilChr01G001885 XP_057806790.1
WRKY 1
MP00171
 7182 9833 查靶基因
SmilChr05G004392 XP_057811204.1
WRKY 1
MP00506
 7173 9818 查靶基因
SmilChr04G002757 XP_057807158.1
MIKC_MADS 1
MP00272
 7172 9889 查靶基因
SmilChr01G003404 XP_057773670.1
bZIP 1
MP00184
 7147 9840 查靶基因
SmilChr03G002335 XP_057801256.1
bZIP 1
MP00647
 7133 9953 查靶基因
SmilChr07G002075 XP_057773918.1
C2H2 1
MP00485
 7130 8059 查靶基因
SmilChr04G000162 XP_057807467.1
MYB 1
MP00134
 7078 8676 查靶基因
SmilChr04G000040 XP_057808382.1
ERF 1
MP00312
 7006 8490 查靶基因
SmilChr08G001896 XP_057783815.1
MYB 1
MP00564
 6984 9893 查靶基因
SmilChr02G005217 XP_057792502.1
G2-like 1
MP00022
 6959 9720 查靶基因
SmilChr05G000260 XP_057763683.1
bZIP 1
MP00040
 6920 9919 查靶基因
SmilChr01G002885 XP_057767601.1
ERF 1
MP00151
 6907 9976 查靶基因
SmilChr05G001518 XP_057765511.1
WRKY 1
MP00455
 6900 9792 查靶基因
SmilChr03G002503 XP_057801356.1
MYB 1
MP00482
 6899 8940 查靶基因
SmilChr03G001252 XP_057802461.1
bZIP 1
MP00291
 6894 9321 查靶基因
SmilChr06G001365 XP_057768799.1
SBP 1
MP00307
 6893 9755 查靶基因
SmilChr03G003439 XP_057798243.1
bHLH 1
MP00195
 6878 9832 查靶基因
SmilChr06G001111 XP_057768512.1
MYB 1
MP00388
 6870 9774 查靶基因
SmilChr02G000949 XP_057795176.1
bZIP 1
MP00318
 6849 9413 查靶基因
SmilChr01G000025 XP_057790305.1
SBP 1
MP00633
 6833 8026 查靶基因
SmilChr01G004313 XP_057783598.1
bHLH 1
MP00308
 6805 9826 查靶基因
SmilChr02G005502 XP_057792768.1
bHLH 1
MP00082
 6784 9435 查靶基因
SmilChr03G004274 XP_057799397.1
MIKC_MADS 1
MP00080
 6766 9850 查靶基因
SmilChr02G003688 XP_057794248.1
MYB 1
MP00028
 6764 9024 查靶基因
SmilChr04G003367 XP_057804957.1
MYB 1
MP00191
 6736 9690 查靶基因
SmilChr04G000157 XP_057807462.1
bHLH 1
MP00081
 6729 9942 查靶基因
SmilChr07G002147 XP_057774045.1
MYB 1
MP00500
 6697 9681 查靶基因
SmilChr05G002277 XP_057809665.1
ERF 1
MP00452
 6671 7783 查靶基因
SmilChr07G004480 XP_057776222.1
WRKY 1
MP00531
 6663 9784 查靶基因
SmilChr02G004447 XP_057797242.1
HD-ZIP 1
MP00200
 6661 9930 查靶基因
SmilChr04G000070 XP_057807324.1
bHLH 1
MP00034
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G002039 XP_057808459.1
bHLH 1
MP00660
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G005851 XP_057789306.1
MYB 1
MP00055
 6638 9685 查靶基因
SmilChr02G005238 XP_057792594.1
SBP 1
MP00634
 6619 7771 查靶基因
SmilChr06G002048 XP_057770293.1
bHLH 1
MP00035
 6618 9903 查靶基因
SmilChr07G000836 XP_057772437.1
MYB_related 1
MP00568
 6611 9696 查靶基因
SmilChr04G003119 XP_057809542.1
bZIP 1
MP00039
 6610 9936 查靶基因
SmilChr01G004114 XP_057781125.1
WRKY 1
MP00284
 6552 9774 查靶基因
SmilChr08G004246 XP_057780410.1
WRKY 1
MP00422
 6535 9791 查靶基因
SmilChr05G001980 XP_057766076.1
ARF 1
MP00153
 6534 9706 查靶基因
SmilChr04G000094 XP_057807365.1
YABBY 1
MP00620
 6504 9844 查靶基因
SmilChr02G002534 XP_057797741.1
TCP 1
MP00169
 6498 7295 查靶基因
SmilChr05G001269 XP_057765199.1
G2-like 1
MP00252
 6478 9780 查靶基因
SmilChr07G003441 XP_057773618.1
NAC 1
MP00108
 6458 9810 查靶基因
SmilChr02G001791 XP_057795933.1
TCP 1
MP00062
 6454 7249 查靶基因
SmilChr05G003285 XP_057810127.1
RAV 1
MP00024
 6450 9853 查靶基因
SmilChr05G000619 XP_057764205.1
WRKY 1
MP00167
 6439 9756 查靶基因
SmilChr04G003745 XP_057809144.1
C2H2 1
MP00416
 6433 9716 查靶基因
SmilChr02G004607 XP_057791470.1
C2H2 1
MP00608
 6398 9817 查靶基因
SmilChr02G003399 XP_057793859.1
ERF 1
MP00240
 6368 9978 查靶基因
SmilChr01G004920 XP_057788125.1
MYB_related 1
MP00607
 6362 9718 查靶基因
SmilChr06G001059 XP_057768449.1
Dof 1
MP00402
 6278 9875 查靶基因
SmilChr01G004552 XP_057786668.1
bZIP 1
MP00409
 6252 8429 查靶基因
SmilChr01G006187 XP_057798078.1
GRAS 1
MP00611
 6232 9807 查靶基因
SmilChr01G001516 XP_057803325.1
bZIP 1
MP00648
 6170 9939 查靶基因
SmilChr04G003955 XP_057805828.1
ERF 1
MP00120
 6144 7514 查靶基因
SmilChr01G004708 XP_057787833.1
WRKY 1
MP00251
 6140 9713 查靶基因
SmilChr05G001961 XP_057766054.1
MIKC_MADS 1
MP00077
 6125 9815 查靶基因
SmilChr08G000478 XP_057781809.1
GATA 1
MP00130
 6015 9821 查靶基因
SmilChr01G000943 XP_057790035.1
MIKC_MADS 1
MP00508
 5979 7481 查靶基因
SmilChr05G004106 XP_057810779.1
WRKY 1
MP00260
 5932 9706 查靶基因
SmilChr04G003973 XP_057805857.1
HD-ZIP 1
MP00013
 5927 9712 查靶基因
SmilChr03G002207 XP_057801109.1
WRKY 1
MP00299
 5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr07G002075; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00008328-RA_Salv SmilChr07G002075 C2H2 XP_057773918.1 MP00485 TTTTTTTTTGTCGTTTTCTG

可能结合的靶基因

8059 个结合位点 7130 个候选靶基因 第 54 / 143 下载 TSV

上一页 54 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr06G000981 Chr06 NC_080392.1:9576842-9576861promoter 内 1943-1962 bp - 2039 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 9571781-9574803(-) SMil_00008328-RA_Salv MP00485 TTTTTTTTTGTCCTTTATGT
SmilChr03G000475 Chr03 NC_080389.1:5052170-5052189promoter 内 1930-1949 bp - 2052 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 5046979-5050118(-) SMil_00008328-RA_Salv MP00485 TATTTTTTTGTCAGTTTGCT
SmilChr06G001565 Chr06 NC_080392.1:17095758-17095777promoter 内 1843-1862 bp + 2139 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 17093071-17093619(-) SMil_00008328-RA_Salv MP00485 TACGAAATGACAAAAAAAGA
SmilChr08G002400 Chr08 NC_080394.1:22792109-22792128promoter 内 1831-1850 bp + 2151 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 22783831-22789958(-) SMil_00008328-RA_Salv MP00485 ACATAAACGACAAAAAGTAT
SmilChr02G004859 Chr02 NC_080388.1:70725512-70725531promoter 内 1723-1742 bp - 2259 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 70720193-70723253(-) SMil_00008328-RA_Salv MP00485 TTTTTTTTTGTTTTTTTGCT
SmilChr02G000934 Chr02 NC_080388.1:16265149-16265168promoter 内 1667-1686 bp + 2315 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 16267483-16270555(+) SMil_00008328-RA_Salv MP00485 TTTTTTTTTGTCCTTTATGT
SmilChr06G002924 Chr06 NC_080392.1:42091168-42091187promoter 内 1649-1668 bp + 2333 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 42093520-42093592(+) SMil_00008328-RA_Salv MP00485 TTTTTTTTTGTTTTTTTCTC
SmilChr05G002310 Chr05 NC_080391.1:24941311-24941330promoter 内 1541-1560 bp + 2441 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 24936549-24938870(-) SMil_00008328-RA_Salv MP00485 TAGTAAACGACAAATTCTGC
SmilChr04G000008 Chr04 NC_080390.1:123613-123632promoter 内 1534-1553 bp - 2448 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 126080-127625(+) SMil_00008328-RA_Salv MP00485 TCGTAAACGACAAATCATAA
SmilChr07G004641 Chr07 NC_080393.1:59273370-59273389promoter 内 1528-1547 bp - 2454 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 59269918-59270916(-) SMil_00008328-RA_Salv MP00485 TAAAATCTTGTCGTTTCCTG
SmilChr05G001302 Chr05 NC_080391.1:11252266-11252285promoter 内 1510-1529 bp - 2472 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 11246094-11249794(-) SMil_00008328-RA_Salv MP00485 TTTTTTTTTGGCTTTTTGAG
SmilChr05G000620 Chr05 NC_080391.1:4690616-4690635promoter 内 1461-1480 bp + 2521 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 4687270-4688095(-) SMil_00008328-RA_Salv MP00485 CACTAAACAACAAAAATTGG
SmilChr02G004637 Chr02 NC_080388.1:68833602-68833621promoter 内 1432-1451 bp + 2550 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 68830047-68831052(-) SMil_00008328-RA_Salv MP00485 ATGAAAATGACAAAATAAAA
SmilChr04G001309 Chr04 NC_080390.1:20899189-20899208promoter 内 1303-1322 bp - 2679 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 20892283-20896510(-) SMil_00008328-RA_Salv MP00485 TACATTTTTGTCGCATTGTT
SmilChr01G002443 Chr01 NC_080387.1:42007321-42007340promoter 内 1254-1273 bp + 2728 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 42010068-42015034(+) SMil_00008328-RA_Salv MP00485 AATTCCTTTGTCGTTTATCG
SmilChr07G002889 Chr07 NC_080393.1:29186945-29186964promoter 内 1144-1163 bp - 2838 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 29178772-29184107(-) SMil_00008328-RA_Salv MP00485 ACTTTTTTTGTCCTCATTCG
SmilChr08G002021 Chr08 NC_080394.1:17984899-17984918promoter 内 1106-1125 bp + 2876 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 17987794-17989122(+) SMil_00008328-RA_Salv MP00485 ATTGTTTTTGTCGATTTGCA
SmilChr05G000749 Chr05 NC_080391.1:5800978-5800997promoter 内 1094-1113 bp + 2888 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 5803885-5804777(+) SMil_00008328-RA_Salv MP00485 TTGATTTTTGTCTTTTCTTT
SmilChr04G003649 Chr04 NC_080390.1:52994406-52994425promoter 内 1090-1109 bp + 2892 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 52989568-52991514(-) SMil_00008328-RA_Salv MP00485 AGCAAAAGGCCAAAAAAGGG
SmilChr07G001780 Chr07 NC_080393.1:15087474-15087493promoter 内 1032-1051 bp - 2950 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 15090443-15091510(+) SMil_00008328-RA_Salv MP00485 CCCAAATCGACAAAAATCAA
SmilChr01G001022 Chr01 NC_080387.1:21386968-21386987promoter 内 1017-1036 bp + 2965 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 21389952-21391214(+) SMil_00008328-RA_Salv MP00485 TTTTTTTTTGTCTTGTTTAG
SmilChr03G000498 Chr03 NC_080389.1:5317342-5317361promoter 内 993-1012 bp + 2989 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 5320350-5320955(+) SMil_00008328-RA_Salv MP00485 TTATTTTTTGTCTATTTCTT
SmilChr03G000792 Chr03 NC_080389.1:9012318-9012337promoter 内 991-1010 bp - 2991 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 9008719-9009327(-) SMil_00008328-RA_Salv MP00485 TTATTTTTTGTCTATTTCTT
SmilChr03G003183 Chr03 NC_080389.1:49283814-49283833promoter 内 979-998 bp + 3003 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 49286836-49291900(+) SMil_00008328-RA_Salv MP00485 ACTTTTTTTGTTGTGTTGTG
SmilChr06G002962 Chr06 NC_080392.1:42407908-42407927promoter 内 934-953 bp + 3048 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 42402488-42404860(-) SMil_00008328-RA_Salv MP00485 CGAGAAACGACAAATATATG
SmilChr04G003711 Chr04 NC_080390.1:53416942-53416961promoter 内 907-926 bp - 3075 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 53420036-53421268(+) SMil_00008328-RA_Salv MP00485 GAGAAAACGACGAAAAGTCG
SmilChr08G001863 Chr08 NC_080394.1:15991051-15991070promoter 内 888-907 bp + 3094 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 15994164-15994634(+) SMil_00008328-RA_Salv MP00485 TTTTTTTTTGTCTTTTTAAC
SmilChr02G003068 Chr02 NC_080388.1:51544435-51544454promoter 内 868-887 bp - 3114 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 51547568-51548423(+) SMil_00008328-RA_Salv MP00485 TGCAAGACGACAACAGAAAC
SmilChr03G003440 Chr03 NC_080389.1:52790072-52790091promoter 内 866-885 bp - 3116 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 52793207-52796355(+) SMil_00008328-RA_Salv MP00485 TACTACAAGACAAAAAAGTT
SmilChr01G000037 Chr01 NC_080387.1:601141-601160promoter 内 841-860 bp + 3141 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 604301-606337(+) SMil_00008328-RA_Salv MP00485 AAGGTTTTTGTCTTCATCTT
SmilChr08G001853 Chr08 NC_080394.1:15924881-15924900promoter 内 806-825 bp - 3176 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 15928076-15931215(+) SMil_00008328-RA_Salv MP00485 CTAAAAATGACAAAAAAAAA
SmilChr03G004292 Chr03 NC_080389.1:61328660-61328679promoter 内 770-789 bp - 3212 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 61321866-61325448(-) SMil_00008328-RA_Salv MP00485 GTTAGTTTTGTCCTTTTATC
SmilChr08G003691 Chr08 NC_080394.1:41246422-41246441promoter 内 637-656 bp - 3345 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 41249786-41260650(+) SMil_00008328-RA_Salv MP00485 AAGAATCGGACAAAAAAGAG
SmilChr02G001748 Chr02 NC_080388.1:32077378-32077397promoter 内 613-632 bp - 3369 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 32072280-32074009(-) SMil_00008328-RA_Salv MP00485 TTTTTTTTTGTTGTTTTATT
SmilChr04G002713 Chr04 NC_080390.1:42739886-42739905promoter 内 571-590 bp - 3411 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 42743316-42745112(+) SMil_00008328-RA_Salv MP00485 CCGTAAACGACAAATCCAGC
SmilChr01G002850 Chr01 NC_080387.1:47079009-47079028promoter 内 546-565 bp + 3436 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 47072622-47075573(-) SMil_00008328-RA_Salv MP00485 AGAAACCCGACAAAAAAAAT
SmilChr07G001054 Chr07 NC_080393.1:7695296-7695315promoter 内 485-504 bp + 3497 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 7690418-7691799(-) SMil_00008328-RA_Salv MP00485 TGTAAAAAGACAAAATCGTA
SmilChr06G002821 Chr06 NC_080392.1:40951229-40951248promoter 内 463-482 bp + 3519 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 40954767-40956851(+) SMil_00008328-RA_Salv MP00485 CTAGGATTTGTCGTTTTGAT
SmilChr07G002027 Chr07 NC_080393.1:18268532-18268551promoter 内 370-389 bp - 3612 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 18272163-18273742(+) SMil_00008328-RA_Salv MP00485 ATGAAAAAGACAAAACGATT
SmilChr08G004215 Chr08 NC_080394.1:51527960-51527979promoter 内 315-334 bp - 3667 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 51521599-51524293(-) SMil_00008328-RA_Salv MP00485 TTTTGTTTTGTCTTATATTG
SmilChr07G002018 Chr07 NC_080393.1:18041388-18041407promoter 内 284-303 bp - 3698 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 18045105-18046547(+) SMil_00008328-RA_Salv MP00485 ATGAAAAAGACAAAACGATT
SmilChr01G003230 Chr01 NC_080387.1:51080860-51080879promoter 内 242-261 bp + 3740 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 51075306-51077120(-) SMil_00008328-RA_Salv MP00485 CAGATGACGACAACACATAA
SmilChr05G001304 Chr05 NC_080391.1:11252266-11252285promoter 内 141-160 bp - 3841 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 11256126-11257890(+) SMil_00008328-RA_Salv MP00485 CTCAAAAAGCCAAAAAAAAA
SmilChr01G001702 Chr01 NC_080387.1:31460039-31460058promoter 内 112-131 bp - 3870 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 31463928-31468910(+) SMil_00008328-RA_Salv MP00485 GATAAAACGACAAATTAACT
SmilChr07G001527 Chr07 NC_080393.1:12326489-12326508promoter 内 72-91 bp + 3910 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 12314024-12322579(-) SMil_00008328-RA_Salv MP00485 TATAAGAAGACAAAATATGG
SmilChr03G000793 Chr03 NC_080389.1:9012318-9012337promoter 内 54-73 bp - 3928 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 9016265-9021580(+) SMil_00008328-RA_Salv MP00485 AAGAAATAGACAAAAAATAA
SmilChr06G002922 Chr06 NC_080392.1:42091168-42091187promoter 内 42-61 bp + 3940 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 42080580-42087228(-) SMil_00008328-RA_Salv MP00485 GAGAAAAAAACAAAAAAAAA
SmilChr03G001680 Chr03 NC_080389.1:22086330-22086349promoter 内 13-32 bp - 3969 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 22076687-22082361(-) SMil_00008328-RA_Salv MP00485 ACCTTTTTTGTCATTTTCGA
SmilChr01G001616 Chr01 NC_080387.1:30280341-30280360promoter 内 3859-3878 bp - 123 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 3 30278689-30280218(-) SMil_00008328-RA_Salv MP00485 TTGTTTTTTGTTTTTTTGTT
SmilChr03G004631 Chr03 NC_080389.1:63957500-63957519promoter 内 2364-2383 bp - 1618 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 3 63952085-63955882(-) SMil_00008328-RA_Salv MP00485 ATCATGTTTGTCGGCTTCTA