转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr03G001252; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00025976-RA_Salv SmilChr03G001252 bZIP XP_057802461.1 MP00291 AATGGTCACGTGGCA

可能结合的靶基因

9321 个结合位点 6894 个候选靶基因 第 55 / 138 下载 TSV

上一页 55 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr07G003836 Chr07 NC_080393.1:47467113-47467127promoter 内 2694-2708 bp + 1293 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 2 47460184-47465820(-) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 CTCCACGTGGCCGCC
SmilChr02G005159 Chr02 NC_080388.1:72940954-72940968promoter 内 1665-1679 bp + 2322 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 2 72943290-72944833(+) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 ATTATCCACGTGGCA
SmilChr01G002687 Chr01 NC_080387.1:45083692-45083706promoter 内 658-672 bp + 3329 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 2 45087035-45090326(+) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 TCCGTCCACGTGGCG
SmilChr02G001921 Chr02 NC_080388.1:34611131-34611145promoter 内 39-53 bp + 3948 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 2 34615093-34616120(+) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 AGGTTCCACGTGGCG
SmilChr06G002533 Chr06 NC_080392.1:36343000-36343014promoter 内 3975-3989 bp - 12 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 36341936-36342988(-) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 TCCGATGACGTGGCG
SmilChr05G002609 Chr05 NC_080391.1:29356955-29356969promoter 内 3949-3963 bp + 38 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 29357007-29359215(+) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 AAATTCGACGTGGCG
SmilChr05G000467 Chr05 NC_080391.1:3523142-3523156promoter 内 3928-3942 bp + 59 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 3523215-3526859(+) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 CCCCGTGACGTGGCA
SmilChr03G000193 Chr03 NC_080389.1:2134077-2134091promoter 内 3871-3885 bp + 116 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 2134207-2145325(+) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 ATTGCTTACGTGGCG
SmilChr08G002146 Chr08 NC_080394.1:19332333-19332347promoter 内 3857-3871 bp + 130 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 19331378-19332203(-) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 CGCCACGTGTACGAT
SmilChr06G001506 Chr06 NC_080392.1:16093033-16093047promoter 内 3835-3849 bp - 152 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 16090638-16092881(-) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 AAACATCACGTGGCA
SmilChr02G002356 Chr02 NC_080388.1:41345147-41345161promoter 内 3817-3831 bp + 170 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 41344284-41344977(-) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 TGCCACGTCATTAAT
SmilChr05G000691 Chr05 NC_080391.1:5231206-5231220promoter 内 3762-3776 bp - 225 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 5231445-5234476(+) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 TGCCACGTGAGTTGG
SmilChr02G003207 Chr02 NC_080388.1:53236157-53236171promoter 内 3723-3737 bp - 264 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 53233294-53235893(-) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 ATTATCCACGTGGCA
SmilChr02G003312 Chr02 NC_080388.1:54363582-54363596promoter 内 3722-3736 bp - 265 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 54362925-54363317(-) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 GATAAAGACGTGGCA
SmilChr02G002329 Chr02 NC_080388.1:40985492-40985506promoter 内 3635-3649 bp + 352 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 40983990-40985140(-) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 TGCCACGTGTTACGC
SmilChr02G002489 Chr02 NC_080388.1:43302558-43302572promoter 内 3444-3458 bp + 543 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 43301248-43302015(-) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 TGCCACGTATCCCAT
SmilChr08G001518 Chr08 NC_080394.1:12335165-12335179promoter 内 3413-3427 bp - 574 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 12331922-12334591(-) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 CGCGGCGACGTGGCT
SmilChr04G002294 Chr04 NC_080390.1:37216686-37216700promoter 内 3393-3407 bp + 594 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 37215355-37216092(-) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 TGCCACGTCATTAAT
SmilChr02G005122 Chr02 NC_080388.1:72698635-72698649promoter 内 3353-3367 bp - 634 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 72699283-72703370(+) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 TTCCACGTGGTCACC
SmilChr04G000486 Chr04 NC_080390.1:5235014-5235028promoter 内 3205-3219 bp + 782 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 5235810-5236573(+) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 CGATCCCACGTGGCC
SmilChr01G004427 Chr01 NC_080387.1:62377901-62377915promoter 内 3146-3160 bp + 841 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 62372553-62377060(-) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 TGCCACGTAAGAAAC
SmilChr08G000747 Chr08 NC_080394.1:5523570-5523584promoter 内 3053-3067 bp + 934 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 5520412-5522636(-) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 TGCCACGTGATGATG
SmilChr02G001162 Chr02 NC_080388.1:21210456-21210470promoter 内 2986-3000 bp - 1001 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 21211471-21212307(+) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 TGACACGTGACATTT
SmilChr04G002295 Chr04 NC_080390.1:37216686-37216700promoter 内 2961-2975 bp + 1026 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 37217726-37219938(+) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 ATTAATGACGTGGCA
SmilChr06G001083 Chr06 NC_080392.1:10821137-10821151promoter 内 2933-2947 bp + 1054 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 10814147-10820083(-) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 TTCCACGTGGGCCTA
SmilChr02G003286 Chr02 NC_080388.1:54152922-54152936promoter 内 2847-2861 bp - 1140 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 54149753-54151782(-) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 GCGTACCACGTGGCG
SmilChr01G003298 Chr01 NC_080387.1:51665575-51665589promoter 内 2823-2837 bp + 1164 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 51666753-51674549(+) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 CGCGGCGACGTGGCT
SmilChr03G000683 Chr03 NC_080389.1:7630357-7630371promoter 内 2756-2770 bp - 1231 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 7631602-7633987(+) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 CGCCACGTGTCTAAA
SmilChr04G000559 Chr04 NC_080390.1:6255330-6255344promoter 内 2354-2368 bp - 1633 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 6256977-6258392(+) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 TGCCACGTGATGATG
SmilChr05G002610 Chr05 NC_080391.1:29356955-29356969promoter 内 2259-2273 bp + 1728 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 29358697-29365128(+) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 AAATTCGACGTGGCG
SmilChr02G002423 Chr02 NC_080388.1:42196410-42196424promoter 内 2150-2164 bp - 1837 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 42198261-42199616(+) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 TGCCACGTCATTAAT
SmilChr04G000195 Chr04 NC_080390.1:1727007-1727021promoter 内 2123-2137 bp + 1864 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 1724233-1725143(-) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 AGCCACGTGTCCGTC
SmilChr03G002964 Chr03 NC_080389.1:46392283-46392297promoter 内 2011-2025 bp - 1976 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 46394273-46397932(+) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 CGCCACGTCGGTGTT
SmilChr03G002362 Chr03 NC_080389.1:37247876-37247890promoter 内 1945-1959 bp + 2042 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 37249932-37253935(+) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 GACGCATACGTGGCA
SmilChr07G001745 Chr07 NC_080393.1:14801729-14801743promoter 内 1932-1946 bp + 2055 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 14803798-14809162(+) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 ATTAATGACGTGGCA
SmilChr08G003048 Chr08 NC_080394.1:30621295-30621309promoter 内 1911-1925 bp - 2076 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 30623385-30624060(+) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 GGCCACGTGGGATGC
SmilChr04G002293 Chr04 NC_080390.1:37216686-37216700promoter 内 1802-1816 bp + 2185 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 37213446-37214501(-) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 TGCCACGTCATTAAT
SmilChr01G000189 Chr01 NC_080387.1:3236610-3236624promoter 内 1544-1558 bp + 2443 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 3239067-3240349(+) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 ACCACTCACGTGGCA
SmilChr05G001075 Chr05 NC_080391.1:8943641-8943655promoter 内 1219-1233 bp - 2768 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 8939476-8940873(-) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 CAAACAGACGTGGCA
SmilChr02G002487 Chr02 NC_080388.1:43302558-43302572promoter 内 768-782 bp + 3219 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 43295034-43299339(-) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 TGCCACGTATCCCAT
SmilChr04G002296 Chr04 NC_080390.1:37216686-37216700promoter 内 735-749 bp + 3252 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 37219952-37224381(+) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 ATTAATGACGTGGCA
SmilChr05G002385 Chr05 NC_080391.1:26306570-26306584promoter 内 656-670 bp + 3331 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 26299731-26303239(-) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 TGCCACGTAGGATCC
SmilChr08G004373 Chr08 NC_080394.1:53511660-53511674promoter 内 492-506 bp - 3495 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 53504049-53508165(-) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 GACGGACACGTGGCT
SmilChr05G000285 Chr05 NC_080391.1:2208383-2208397promoter 内 458-472 bp + 3529 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 2202419-2204854(-) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 TGCCACGTAGGATCC
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SmilChr01G001969 Chr01 NC_080387.1:35076200-35076214promoter 内 353-367 bp - 3634 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 35079848-35080779(+) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 CGCCACGTCATATAT
SmilChr04G000480 Chr04 NC_080390.1:5183347-5183361promoter 内 64-78 bp - 3923 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 5187284-5190588(+) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 CGACACGTGACCCTA
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SmilChr05G002215 Chr05 NC_080391.1:23621506-23621520promoter 内 7-21 bp + 3980 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 23625500-23629796(+) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 TTAACCGACGTGGCG
SmilChr01G005106 Chr01 NC_080387.1:68850902-68850916promoter 内 2046-2060 bp - 1941 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 3 68852857-68853840(+) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 CGCCACGTGAAATTT