转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr04G003367; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00001784-RA_Salv SmilChr04G003367 MYB XP_057804957.1 MP00191 ATTAACCTTATCCTC

可能结合的靶基因

9690 个结合位点 6736 个候选靶基因 第 56 / 135 下载 TSV

上一页 56 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr02G005075 Chr02 NC_080388.1:72398311-72398325promoter 内 898-912 bp - 3089 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 72390349-72395222(-) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 CACCCCCTTATCCAT
SmilChr01G000973 Chr01 NC_080387.1:20587507-20587521promoter 内 833-847 bp + 3154 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 20590675-20594808(+) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 CTTTGCCTTATCCCT
SmilChr02G002775 Chr02 NC_080388.1:47811320-47811334promoter 内 813-827 bp - 3174 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 47814508-47817471(+) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 AGGGATAAGCTTAGG
SmilChr02G005334 Chr02 NC_080388.1:74174749-74174763promoter 内 799-813 bp + 3188 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 74162934-74171561(-) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 GAGGATAATAATAAT
SmilChr02G002048 Chr02 NC_080388.1:36875034-36875048promoter 内 777-791 bp - 3210 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 36878258-36879733(+) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 GGTGATAAGGAAGAG
SmilChr02G001663 Chr02 NC_080388.1:30850517-30850531promoter 内 745-759 bp - 3242 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 30853773-30857355(+) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 TTGGATAAGATATCT
SmilChr01G002150 Chr01 NC_080387.1:37487805-37487819promoter 内 732-746 bp - 3255 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 37491074-37491916(+) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 ATTGATAAGGTAATT
SmilChr02G000192 Chr02 NC_080388.1:2407600-2407614promoter 内 677-691 bp - 3310 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 2410924-2412487(+) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 TTGGATAAGAAAACA
SmilChr01G000323 Chr01 NC_080387.1:6380730-6380744promoter 内 662-676 bp + 3325 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 6384069-6392414(+) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 AAGAACCTTATCAAT
SmilChr01G003279 Chr01 NC_080387.1:51494195-51494209promoter 内 641-655 bp - 3346 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 51489904-51490849(-) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 TATAGCCTTATCCCT
SmilChr01G001909 Chr01 NC_080387.1:34216204-34216218promoter 内 608-622 bp - 3379 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 34211136-34212825(-) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 CCTCAGCTTATCCTT
SmilChr01G005447 Chr01 NC_080387.1:71543164-71543178promoter 内 548-562 bp - 3439 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 71546617-71547534(+) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 CTAGATAAGGATGAC
SmilChr01G005843 Chr01 NC_080387.1:74424115-74424129promoter 内 494-508 bp + 3493 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 74416401-74420622(-) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 ACAGATAAGGTGTGG
SmilChr01G002431 Chr01 NC_080387.1:41850812-41850826promoter 内 493-507 bp + 3494 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 41845480-41847318(-) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 CCGGATAAGGATTTG
SmilChr01G005815 Chr01 NC_080387.1:74138288-74138302promoter 内 395-409 bp + 3592 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 74141894-74144092(+) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 GAAACCCTTATCCAT
SmilChr02G000509 Chr02 NC_080388.1:7006856-7006870promoter 内 374-388 bp - 3613 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 7010483-7028520(+) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 TTGGATAAGATATCT
SmilChr02G002003 Chr02 NC_080388.1:36182013-36182027promoter 内 326-340 bp - 3661 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 36185688-36187781(+) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 TAGGATAAGAAACAA
SmilChr03G001349 Chr03 NC_080389.1:15727525-15727539promoter 内 268-282 bp - 3719 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 15731258-15734814(+) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 AAAGATAAGGAGCAT
SmilChr02G001412 Chr02 NC_080388.1:26760865-26760879promoter 内 243-257 bp + 3744 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 26752421-26757121(-) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 ACGGATAAGGACGTC
SmilChr01G004521 Chr01 NC_080387.1:63324795-63324809promoter 内 201-215 bp + 3786 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 63319523-63321009(-) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 AGAGATAAGGTAGTT
SmilChr02G002924 Chr02 NC_080388.1:49641293-49641307promoter 内 190-204 bp - 3797 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 49645104-49649297(+) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 GTTGATAAGGTCTTT
SmilChr01G003435 Chr01 NC_080387.1:52971446-52971460promoter 内 144-158 bp + 3843 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 52975303-52976891(+) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 GACGTCCTTATCCGT
SmilChr01G004009 Chr01 NC_080387.1:58504088-58504102promoter 内 142-156 bp + 3845 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 58507947-58510160(+) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 ATACTCCTTATCATC
SmilChr02G005010 Chr02 NC_080388.1:71898324-71898338promoter 内 112-126 bp - 3875 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 71902213-71908333(+) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 TAAGATAAGGTGTCA
SmilChr01G000852 Chr01 NC_080387.1:18408661-18408675promoter 内 3857-3871 bp - 130 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 3 18408805-18412146(+) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 TTAGATAAGGACTAC
SmilChr02G002295 Chr02 NC_080388.1:40472506-40472520promoter 内 3630-3644 bp - 357 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 3 40470118-40472149(-) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 TTTCATCTTATCCGA
SmilChr01G000559 Chr01 NC_080387.1:11647024-11647038promoter 内 2953-2967 bp - 1034 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 3 11644323-11645990(-) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 CTTAACCTCATCATA
SmilChr03G002124 Chr03 NC_080389.1:33023648-33023662promoter 内 752-766 bp - 3235 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 3 33019287-33020413(-) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 TTTCATCTTATCCGA
SmilChr03G001018 Chr03 NC_080389.1:11707327-11707341promoter 内 290-304 bp + 3697 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 3 11711038-11712571(+) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 TTTCATCTTATCCGA
SmilChr02G000439 Chr02 NC_080388.1:5711000-5711014promoter 内 3852-3866 bp - 135 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 2 5709996-5710865(-) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 TTTCATCTTATCCGA
SmilChr02G002244 Chr02 NC_080388.1:39857975-39857989promoter 内 3852-3866 bp - 135 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 2 39856971-39857840(-) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 TTTCATCTTATCCGA
SmilChr03G001017 Chr03 NC_080389.1:11707327-11707341promoter 内 3852-3866 bp + 135 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 2 11707476-11708342(+) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 TTTCATCTTATCCGA
SmilChr01G001778 Chr01 NC_080387.1:32666519-32666533promoter 内 3848-3862 bp - 139 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 2 32666672-32668220(+) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 GAGGATAAGCAAGTT
SmilChr01G001109 Chr01 NC_080387.1:22713316-22713330promoter 内 3714-3728 bp + 273 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 2 22710281-22713043(-) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 ATTGATAAGGTTCTA
SmilChr01G003408 Chr01 NC_080387.1:52748730-52748744promoter 内 3658-3672 bp - 329 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 2 52749073-52750858(+) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 TATGATAAGGATTTT
SmilChr02G000990 Chr02 NC_080388.1:17419782-17419796promoter 内 3627-3641 bp - 360 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 2 17418789-17419422(-) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 TTTCATCTTATCCGA
SmilChr02G001138 Chr02 NC_080388.1:20512705-20512719promoter 内 3507-3521 bp - 480 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 2 20509831-20512225(-) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 TTTCATCTTATCCGA
SmilChr03G000385 Chr03 NC_080389.1:4282327-4282341promoter 内 3428-3442 bp + 559 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 2 4282900-4291525(+) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 CTTCTCCTTATCAGC
SmilChr01G005094 Chr01 NC_080387.1:68789482-68789496promoter 内 3396-3410 bp - 591 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 2 68786704-68788891(-) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 TTAATTCTTATCCCT
SmilChr02G003962 Chr02 NC_080388.1:61783447-61783461promoter 内 3359-3373 bp - 628 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 2 61784089-61785619(+) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 AAGGATAATATTGAG
SmilChr01G005299 Chr01 NC_080387.1:70291781-70291795promoter 内 3146-3160 bp - 841 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 2 70289908-70290940(-) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 TTCATGCTTATCCTT
SmilChr02G000432 Chr02 NC_080388.1:5621515-5621529promoter 内 3024-3038 bp + 963 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 2 5617091-5620552(-) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 ATGGATAAGAAATGA
SmilChr03G002877 Chr03 NC_080389.1:45448400-45448414promoter 内 2813-2827 bp + 1174 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 2 45449588-45451248(+) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 TCATTTCTTATCCAT
SmilChr02G001855 Chr02 NC_080388.1:33767836-33767850promoter 内 2254-2268 bp + 1733 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 2 33765968-33766103(-) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 AATGATAAGGTGAGT
SmilChr01G000522 Chr01 NC_080387.1:10657690-10657704promoter 内 1992-2006 bp - 1995 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 2 10659699-10665472(+) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 TTGGATAAGATATCC
SmilChr01G000922 Chr01 NC_080387.1:19553568-19553582promoter 内 1896-1910 bp + 2091 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 2 19555673-19556946(+) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 ATTTTCCTTATCTGA
SmilChr02G001717 Chr02 NC_080388.1:31629047-31629061promoter 内 1846-1860 bp - 2141 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 2 31626175-31626906(-) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 TCGTTCCTTATCTTT
SmilChr02G001329 Chr02 NC_080388.1:24753649-24753663promoter 内 1768-1782 bp + 2219 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 2 24748839-24751430(-) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 TCGGATAAGATGAAA
SmilChr02G005572 Chr02 NC_080388.1:75601328-75601342promoter 内 1708-1722 bp + 2279 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 2 75603621-75605872(+) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 GAATTTCTTATCCTT
SmilChr01G001935 Chr01 NC_080387.1:34545923-34545937promoter 内 1703-1717 bp - 2284 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 2 34548221-34549926(+) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 AAGGATAATGTTTGC