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转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family，查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中，并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因，不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif；应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引，可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card，点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
SmilChr04G003117 XP_057809539.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr04G003114 XP_057809538.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr01G005298 XP_057788621.1
ARR-B 1
MP00010
 8344 9778 查靶基因
SmilChr03G003924 XP_057798851.1
NAC 1
MP00059
 8333 9940 查靶基因
SmilChr01G005344 XP_057788686.1
MYB 1
MP00296
 8304 9873 查靶基因
SmilChr08G004408 XP_057780613.1
MYB 1
MP00114
 8151 9897 查靶基因
SmilChr04G001094 XP_057804404.1
WRKY 1
MP00408
 8149 9902 查靶基因
SmilChr07G003597 XP_057773587.1
Nin-like 1
MP00449
 8096 9453 查靶基因
SmilChr02G005433 XP_057792682.1
WRKY 1
MP00209
 8083 9910 查靶基因
SmilChr04G004136 XP_057806072.1
MYB 1
MP00627
 8075 9835 查靶基因
SmilChr01G003955 XP_057779712.1
WRKY 1
MP00450
 8044 9901 查靶基因
SmilChr03G003685 XP_057798538.1
ERF 1
MP00558
 8044 9762 查靶基因
SmilChr07G002937 XP_057777490.1
MIKC_MADS 1
MP00096
 8019 9914 查靶基因
SmilChr02G003833 XP_057794421.1
MYB 1
MP00476
 7981 9904 查靶基因
SmilChr07G002803 XP_057777238.1
NAC 1
MP00221
 7965 9903 查靶基因
SmilChr05G002364 XP_057809766.1
WRKY 1
MP00069
 7882 9917 查靶基因
SmilChr08G003267 XP_057779249.1
MYB 1
MP00406
 7839 9917 查靶基因
SmilChr02G005012 XP_057792191.1
TALE 1
MP00670
 7758 9906 查靶基因
SmilChr07G001978 XP_057776996.1
SBP 1
MP00555
 7648 9805 查靶基因
SmilChr05G000741 XP_057764423.1
ARF 1
MP00021
 7629 9812 查靶基因
SmilChr01G004579 XP_057787263.1
MYB 1
MP00132
 7583 9926 查靶基因
SmilChr05G000593 XP_057764223.1
MIKC_MADS 1
MP00609
 7575 9941 查靶基因
SmilChr03G004518 XP_057799834.1
ERF 1
MP00529
 7559 9247 查靶基因
SmilChr06G001829 XP_057766988.1
MYB 1
MP00510
 7526 9799 查靶基因
SmilChr05G000830 XP_057764550.1
NAC 1
MP00058
 7440 9855 查靶基因
SmilChr08G002543 XP_057778423.1
bZIP 1
MP00303
 7416 9868 查靶基因
SmilChr01G002743 XP_057765725.1
MYB_related 1
MP00565
 7412 9785 查靶基因
SmilChr04G002704 XP_057807081.1
ERF 1
MP00026
 7408 9854 查靶基因
SmilChr05G001395 XP_057765344.1
WRKY 1
MP00071
 7408 9764 查靶基因
SmilChr04G002953 XP_057809314.1
ARF 1
MP00033
 7406 9827 查靶基因
SmilChr01G004199 XP_057782208.1
bHLH 1
MP00074
 7396 9969 查靶基因
SmilChr05G004009 XP_057810662.1
MYB 1
MP00216
 7342 9832 查靶基因
SmilChr03G001606 XP_057802772.1
WRKY 1
MP00539
 7338 9848 查靶基因
SmilChr02G004600 XP_057791481.1
ARF 1
MP00574
 7302 9846 查靶基因
SmilChr03G004179 XP_057799230.1
WRKY 1
MP00464
 7299 9864 查靶基因
SmilChr04G003805 XP_057805691.1
MIKC_MADS 1
MP00315
 7291 9567 查靶基因
SmilChr03G003761 XP_057798625.1
WRKY 1
MP00525
 7235 9838 查靶基因
SmilChr01G001885 XP_057806790.1
WRKY 1
MP00171
 7182 9833 查靶基因
SmilChr05G004392 XP_057811204.1
WRKY 1
MP00506
 7173 9818 查靶基因
SmilChr04G002757 XP_057807158.1
MIKC_MADS 1
MP00272
 7172 9889 查靶基因
SmilChr01G003404 XP_057773670.1
bZIP 1
MP00184
 7147 9840 查靶基因
SmilChr03G002335 XP_057801256.1
bZIP 1
MP00647
 7133 9953 查靶基因
SmilChr07G002075 XP_057773918.1
C2H2 1
MP00485
 7130 8059 查靶基因
SmilChr04G000162 XP_057807467.1
MYB 1
MP00134
 7078 8676 查靶基因
SmilChr04G000040 XP_057808382.1
ERF 1
MP00312
 7006 8490 查靶基因
SmilChr08G001896 XP_057783815.1
MYB 1
MP00564
 6984 9893 查靶基因
SmilChr02G005217 XP_057792502.1
G2-like 1
MP00022
 6959 9720 查靶基因
SmilChr05G000260 XP_057763683.1
bZIP 1
MP00040
 6920 9919 查靶基因
SmilChr01G002885 XP_057767601.1
ERF 1
MP00151
 6907 9976 查靶基因
SmilChr05G001518 XP_057765511.1
WRKY 1
MP00455
 6900 9792 查靶基因
SmilChr03G002503 XP_057801356.1
MYB 1
MP00482
 6899 8940 查靶基因
SmilChr03G001252 XP_057802461.1
bZIP 1
MP00291
 6894 9321 查靶基因
SmilChr06G001365 XP_057768799.1
SBP 1
MP00307
 6893 9755 查靶基因
SmilChr03G003439 XP_057798243.1
bHLH 1
MP00195
 6878 9832 查靶基因
SmilChr06G001111 XP_057768512.1
MYB 1
MP00388
 6870 9774 查靶基因
SmilChr02G000949 XP_057795176.1
bZIP 1
MP00318
 6849 9413 查靶基因
SmilChr01G000025 XP_057790305.1
SBP 1
MP00633
 6833 8026 查靶基因
SmilChr01G004313 XP_057783598.1
bHLH 1
MP00308
 6805 9826 查靶基因
SmilChr02G005502 XP_057792768.1
bHLH 1
MP00082
 6784 9435 查靶基因
SmilChr03G004274 XP_057799397.1
MIKC_MADS 1
MP00080
 6766 9850 查靶基因
SmilChr02G003688 XP_057794248.1
MYB 1
MP00028
 6764 9024 查靶基因
SmilChr04G003367 XP_057804957.1
MYB 1
MP00191
 6736 9690 查靶基因
SmilChr04G000157 XP_057807462.1
bHLH 1
MP00081
 6729 9942 查靶基因
SmilChr07G002147 XP_057774045.1
MYB 1
MP00500
 6697 9681 查靶基因
SmilChr05G002277 XP_057809665.1
ERF 1
MP00452
 6671 7783 查靶基因
SmilChr07G004480 XP_057776222.1
WRKY 1
MP00531
 6663 9784 查靶基因
SmilChr02G004447 XP_057797242.1
HD-ZIP 1
MP00200
 6661 9930 查靶基因
SmilChr04G000070 XP_057807324.1
bHLH 1
MP00034
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G002039 XP_057808459.1
bHLH 1
MP00660
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G005851 XP_057789306.1
MYB 1
MP00055
 6638 9685 查靶基因
SmilChr02G005238 XP_057792594.1
SBP 1
MP00634
 6619 7771 查靶基因
SmilChr06G002048 XP_057770293.1
bHLH 1
MP00035
 6618 9903 查靶基因
SmilChr07G000836 XP_057772437.1
MYB_related 1
MP00568
 6611 9696 查靶基因
SmilChr04G003119 XP_057809542.1
bZIP 1
MP00039
 6610 9936 查靶基因
SmilChr01G004114 XP_057781125.1
WRKY 1
MP00284
 6552 9774 查靶基因
SmilChr08G004246 XP_057780410.1
WRKY 1
MP00422
 6535 9791 查靶基因
SmilChr05G001980 XP_057766076.1
ARF 1
MP00153
 6534 9706 查靶基因
SmilChr04G000094 XP_057807365.1
YABBY 1
MP00620
 6504 9844 查靶基因
SmilChr02G002534 XP_057797741.1
TCP 1
MP00169
 6498 7295 查靶基因
SmilChr05G001269 XP_057765199.1
G2-like 1
MP00252
 6478 9780 查靶基因
SmilChr07G003441 XP_057773618.1
NAC 1
MP00108
 6458 9810 查靶基因
SmilChr02G001791 XP_057795933.1
TCP 1
MP00062
 6454 7249 查靶基因
SmilChr05G003285 XP_057810127.1
RAV 1
MP00024
 6450 9853 查靶基因
SmilChr05G000619 XP_057764205.1
WRKY 1
MP00167
 6439 9756 查靶基因
SmilChr04G003745 XP_057809144.1
C2H2 1
MP00416
 6433 9716 查靶基因
SmilChr02G004607 XP_057791470.1
C2H2 1
MP00608
 6398 9817 查靶基因
SmilChr02G003399 XP_057793859.1
ERF 1
MP00240
 6368 9978 查靶基因
SmilChr01G004920 XP_057788125.1
MYB_related 1
MP00607
 6362 9718 查靶基因
SmilChr06G001059 XP_057768449.1
Dof 1
MP00402
 6278 9875 查靶基因
SmilChr01G004552 XP_057786668.1
bZIP 1
MP00409
 6252 8429 查靶基因
SmilChr01G006187 XP_057798078.1
GRAS 1
MP00611
 6232 9807 查靶基因
SmilChr01G001516 XP_057803325.1
bZIP 1
MP00648
 6170 9939 查靶基因
SmilChr04G003955 XP_057805828.1
ERF 1
MP00120
 6144 7514 查靶基因
SmilChr01G004708 XP_057787833.1
WRKY 1
MP00251
 6140 9713 查靶基因
SmilChr05G001961 XP_057766054.1
MIKC_MADS 1
MP00077
 6125 9815 查靶基因
SmilChr08G000478 XP_057781809.1
GATA 1
MP00130
 6015 9821 查靶基因
SmilChr01G000943 XP_057790035.1
MIKC_MADS 1
MP00508
 5979 7481 查靶基因
SmilChr05G004106 XP_057810779.1
WRKY 1
MP00260
 5932 9706 查靶基因
SmilChr04G003973 XP_057805857.1
HD-ZIP 1
MP00013
 5927 9712 查靶基因
SmilChr03G002207 XP_057801109.1
WRKY 1
MP00299
 5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr04G000040; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00000579-RA_Salv SmilChr04G000040 ERF XP_057808382.1 MP00312 AATTGTCGGTGGAGT

可能结合的靶基因

8490 个结合位点 7006 个候选靶基因 第 57 / 141 下载 TSV

上一页 57 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr05G000633 Chr05 NC_080391.1:4768841-4768855promoter 内 841-855 bp - 3146 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 4772001-4773993(+) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 TTGCTACCGACACCC
SmilChr01G002931 Chr01 NC_080387.1:48096648-48096662promoter 内 817-831 bp + 3170 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 48090316-48093478(-) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 TCCTCACCGACGTCG
SmilChr02G003596 Chr02 NC_080388.1:57155556-57155570promoter 内 812-826 bp + 3175 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 57151576-57152381(-) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 ACACCACCGACTCAT
SmilChr08G001165 Chr08 NC_080394.1:9304890-9304904promoter 内 792-806 bp + 3195 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 9300345-9301695(-) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 CCTCCACCGCCATTG
SmilChr08G004887 Chr08 NC_080394.1:57927375-57927389promoter 内 781-795 bp + 3206 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 57930595-57932871(+) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 TGTTGTCGGTGATTA
SmilChr07G002491 Chr07 NC_080393.1:23590891-23590905promoter 内 773-787 bp - 3214 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 23581810-23587677(-) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 CGGGGTCGGTGGAGG
SmilChr07G003033 Chr07 NC_080393.1:31375459-31375473promoter 内 713-727 bp + 3274 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 31369810-31372185(-) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 TCTCCACCGCCGCCG
SmilChr04G001661 Chr04 NC_080390.1:27585054-27585068promoter 内 648-662 bp - 3339 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 27588407-27589223(+) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 TCTCCACCGCCGCCG
SmilChr01G000499 Chr01 NC_080387.1:10147950-10147964promoter 内 588-602 bp - 3399 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 10151363-10165383(+) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 ACCGCACCGACGTCG
SmilChr02G000508 Chr02 NC_080388.1:6999954-6999968promoter 内 556-570 bp - 3431 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 6995906-6996523(-) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 GTTTGTCGGTGCCTT
SmilChr08G001787 Chr08 NC_080394.1:15065913-15065927promoter 内 540-554 bp + 3447 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 15059742-15062466(-) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 GTGGCGCCGACAACA
SmilChr06G000113 Chr06 NC_080392.1:805954-805968promoter 内 504-518 bp - 3483 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 795578-802471(-) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 CGGCGGCGGTGGAGA
SmilChr01G001178 Chr01 NC_080387.1:23833015-23833029promoter 内 486-500 bp + 3501 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 23827198-23829514(-) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 CTTCCACCGCCAACG
SmilChr04G003446 Chr04 NC_080390.1:50979882-50979896promoter 内 400-414 bp + 3587 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 50971642-50976295(-) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 TCAGCACCGACGTCG
SmilChr08G002275 Chr08 NC_080394.1:21130860-21130874promoter 内 394-408 bp + 3593 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 21134467-21136546(+) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 ACTTGTCGGTGTTGG
SmilChr06G000447 Chr06 NC_080392.1:3622558-3622572promoter 内 342-356 bp + 3645 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 3626217-3626288(+) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 CGGCGGCGGTGGAGA
SmilChr04G001572 Chr04 NC_080390.1:26096961-26096975promoter 内 249-263 bp + 3738 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 26092027-26093223(-) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 TTAGCACCGACAGCT
SmilChr02G001532 Chr02 NC_080388.1:28576892-28576906promoter 内 241-255 bp - 3746 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 28571974-28573146(-) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 CGGCGGCGGTGGAGA
SmilChr04G002978 Chr04 NC_080390.1:46254797-46254811promoter 内 188-202 bp - 3799 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 46174008-46250998(-) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 CTCCGTCGGTGACAT
SmilChr01G000502 Chr01 NC_080387.1:10193668-10193682promoter 内 149-163 bp + 3838 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 10187311-10189830(-) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 TCAGCACCGACGTCG
SmilChr05G000452 Chr05 NC_080391.1:3440384-3440398promoter 内 136-150 bp + 3851 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 3434519-3436533(-) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 GAATCGCCGACAACG
SmilChr02G005564 Chr02 NC_080388.1:75575090-75575104promoter 内 112-126 bp - 3875 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 75564504-75571215(-) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 CGGCGGCGGTGGAGA
SmilChr02G000289 Chr02 NC_080388.1:3681612-3681626promoter 内 60-74 bp + 3927 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 3676633-3677685(-) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 TCCTCGCCGACAAAA
SmilChr04G002898 Chr04 NC_080390.1:45271909-45271923promoter 内 42-56 bp - 3945 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 45266190-45267964(-) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 CGGCGGCGGTGGAGA
SmilChr06G001713 Chr06 NC_080392.1:19728263-19728277promoter 内 39-53 bp - 3948 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 19722674-19724315(-) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 CCTCGTCGGTGATGA
SmilChr04G001103 Chr04 NC_080390.1:15792228-15792242promoter 内 22-36 bp - 3965 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 15785082-15788263(-) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 AGGAGTCGGTGGATG
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SmilChr07G001733 Chr07 NC_080393.1:14732228-14732242promoter 内 3496-3510 bp - 491 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 2 14727904-14731737(-) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 TGTCGTCGGTGAATG
SmilChr08G003513 Chr08 NC_080394.1:37680714-37680728promoter 内 3309-3323 bp - 678 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 2 37681406-37686427(+) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 CCTCCACCGCCGCCC
SmilChr08G003399 Chr08 NC_080394.1:35845552-35845566promoter 内 2250-2264 bp - 1737 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 2 35842949-35843815(-) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 AAACGTCGGTGATGG
SmilChr02G002938 Chr02 NC_080388.1:49892221-49892235promoter 内 1559-1573 bp - 2428 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 2 49884668-49889793(-) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 TTGTGTCGGTAGTAG
SmilChr08G004155 Chr08 NC_080394.1:50726473-50726487promoter 内 837-851 bp + 3150 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 2 50729637-50729743(+) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 ATTCGTCGGTGAAGA
SmilChr02G004121 Chr02 NC_080388.1:63479838-63479852promoter 内 389-403 bp + 3598 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 2 63483450-63491767(+) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 AGATGTCGGTGCGTG
SmilChr07G001827 Chr07 NC_080393.1:15763116-15763130promoter 内 287-301 bp + 3700 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 2 15766830-15768964(+) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 GCGAGTCGGTGGCGT
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SmilChr01G001817 Chr01 NC_080387.1:33102587-33102601promoter 内 3970-3984 bp - 17 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 33099523-33102570(-) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 CGATGTCGGTGCACC
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SmilChr01G004271 Chr01 NC_080387.1:60958864-60958878promoter 内 3869-3883 bp - 118 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 60955056-60958746(-) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 ACGTGTCGGTGTAGA
SmilChr06G000361 Chr06 NC_080392.1:2762065-2762079promoter 内 3783-3797 bp - 204 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 2762283-2765846(+) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 AGCTCACCGACAACA
SmilChr01G001079 Chr01 NC_080387.1:22231765-22231779promoter 内 3760-3774 bp + 227 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 22226648-22231538(-) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 CTTCCACCGACTGCG
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