转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr05G000593; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00001545-RA_Salv SmilChr05G000593 MIKC_MADS XP_057764223.1 MP00609 TTTTTTCCATTTTTGGTAA

可能结合的靶基因

9941 个结合位点 7575 个候选靶基因 第 6 / 152 下载 TSV

上一页 6 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr06G002022 Chr06 NC_080392.1:26064912-26064930promoter 内 2829-2847 bp - 1154 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.2/ 100 2 26061076-26063758(-) SMil_00001545-RA_Salv MP00609 TTCTTTCCATTTTTGGACA
SmilChr01G005151 Chr01 NC_080387.1:69298615-69298633promoter 内 2789-2807 bp - 1194 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.2/ 100 2 69287163-69297421(-) SMil_00001545-RA_Salv MP00609 TTCTTTCCATTTTTGGACA
SmilChr02G004097 Chr02 NC_080388.1:63276604-63276622promoter 内 2785-2803 bp + 1198 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.2/ 100 2 63277820-63278786(+) SMil_00001545-RA_Salv MP00609 TTCTTTCCATTTTTGGACA
SmilChr03G001836 Chr03 NC_080389.1:25197826-25197844promoter 内 2771-2789 bp + 1212 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.2/ 100 2 25188485-25196614(-) SMil_00001545-RA_Salv MP00609 TGTCCAAAAATGGAAAGAA
SmilChr06G002147 Chr06 NC_080392.1:29163635-29163653promoter 内 2743-2761 bp - 1240 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.2/ 100 2 29164893-29195347(+) SMil_00001545-RA_Salv MP00609 TGTCCAAAAATGGAAAGAA
SmilChr04G000590 Chr04 NC_080390.1:6589034-6589052promoter 内 2728-2746 bp + 1255 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.2/ 100 2 6590307-6591658(+) SMil_00001545-RA_Salv MP00609 TTCTTTCCATTTTTGGACA
SmilChr02G005070 Chr02 NC_080388.1:72374116-72374134promoter 内 2723-2741 bp + 1260 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.2/ 100 2 72370778-72372856(-) SMil_00001545-RA_Salv MP00609 TGTCCAAAAATGGAAAGAA
SmilChr05G003842 Chr05 NC_080391.1:51859648-51859666promoter 内 2668-2686 bp - 1315 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.2/ 100 2 51860981-51863738(+) SMil_00001545-RA_Salv MP00609 TGTCCAAAAATGGAAAGAA
SmilChr05G003583 Chr05 NC_080391.1:47864897-47864915promoter 内 2650-2668 bp - 1333 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.2/ 100 2 47866248-47869132(+) SMil_00001545-RA_Salv MP00609 TGTCCAAAAATGGAAAGAA
SmilChr06G000878 Chr06 NC_080392.1:8308249-8308267promoter 内 2600-2618 bp - 1383 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.2/ 100 2 8309650-8312357(+) SMil_00001545-RA_Salv MP00609 TGTCCAAAAATGGAAAGAA
SmilChr06G001236 Chr06 NC_080392.1:12749641-12749659promoter 内 2582-2600 bp - 1401 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.2/ 100 2 12745874-12748240(-) SMil_00001545-RA_Salv MP00609 TTCTTTCCATTTTTGGACA
SmilChr04G001522 Chr04 NC_080390.1:25136057-25136075promoter 内 2563-2581 bp + 1420 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.2/ 100 2 25133386-25134637(-) SMil_00001545-RA_Salv MP00609 TGTCCAAAAATGGAAAGAA
SmilChr02G000225 Chr02 NC_080388.1:2939279-2939297promoter 内 2543-2561 bp + 1440 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.2/ 100 2 2940737-2943803(+) SMil_00001545-RA_Salv MP00609 TTCTTTCCATTTTTGGACA
SmilChr04G002692 Chr04 NC_080390.1:42324938-42324956promoter 内 2524-2542 bp - 1459 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.2/ 100 2 42322783-42323479(-) SMil_00001545-RA_Salv MP00609 TTGTTTCCTTTTTTGGCAA
SmilChr03G003888 Chr03 NC_080389.1:57958220-57958238promoter 内 2512-2530 bp - 1471 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.2/ 100 2 57959709-57961036(+) SMil_00001545-RA_Salv MP00609 TGTCCAAAAATGGAAAGAA
SmilChr05G002102 Chr05 NC_080391.1:22022871-22022889promoter 内 2506-2524 bp + 1477 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.2/ 100 2 22024366-22029143(+) SMil_00001545-RA_Salv MP00609 TTCTTTCCATTTTTGGACA
SmilChr06G001536 Chr06 NC_080392.1:16593346-16593364promoter 内 2481-2499 bp - 1502 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.2/ 100 2 16587156-16591844(-) SMil_00001545-RA_Salv MP00609 TTCTTTCCATTTTTGGACA
SmilChr01G003180 Chr01 NC_080387.1:50581974-50581992promoter 内 2477-2495 bp - 1506 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.2/ 100 2 50583498-50586790(+) SMil_00001545-RA_Salv MP00609 TGTCCAAAAATGGAAAGAA
SmilChr02G001428 Chr02 NC_080388.1:26961632-26961650promoter 内 2360-2378 bp + 1623 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.2/ 100 2 26957821-26960009(-) SMil_00001545-RA_Salv MP00609 TGTCCAAAAATGGAAAGAA
SmilChr04G000709 Chr04 NC_080390.1:8269230-8269248promoter 内 2327-2345 bp + 1656 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.2/ 100 2 8270904-8278229(+) SMil_00001545-RA_Salv MP00609 TTCTTTCCATTTTTGGACA
SmilChr02G000094 Chr02 NC_080388.1:1235954-1235972promoter 内 2292-2310 bp - 1691 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.2/ 100 2 1230404-1234263(-) SMil_00001545-RA_Salv MP00609 TTGTTTCCTTTTTTGGCAA
SmilChr01G003988 Chr01 NC_080387.1:58306662-58306680promoter 内 2272-2290 bp - 1711 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.2/ 100 2 58308391-58311924(+) SMil_00001545-RA_Salv MP00609 TGTCCAAAAATGGAAAGAA
SmilChr01G004277 Chr01 NC_080387.1:61002669-61002687promoter 内 2271-2289 bp - 1712 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.2/ 100 2 61004399-61005116(+) SMil_00001545-RA_Salv MP00609 TGTCCAAAAATGGAAAGAA
SmilChr01G000345 Chr01 NC_080387.1:7040303-7040321promoter 内 2264-2282 bp - 1719 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.2/ 100 2 7035909-7038584(-) SMil_00001545-RA_Salv MP00609 TTCTTTCCATTTTTGGACA
SmilChr01G002842 Chr01 NC_080387.1:46986734-46986752promoter 内 2219-2237 bp - 1764 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.2/ 100 2 46988516-46992084(+) SMil_00001545-RA_Salv MP00609 TGTCCAAAAATGGAAAGAA
SmilChr04G001995 Chr04 NC_080390.1:32245607-32245625promoter 内 2173-2191 bp - 1810 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.2/ 100 2 32247435-32248851(+) SMil_00001545-RA_Salv MP00609 TGTCCAAAAATGGAAAGAA
SmilChr06G002848 Chr06 NC_080392.1:41243636-41243654promoter 内 2172-2190 bp + 1811 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.2/ 100 2 41245465-41247626(+) SMil_00001545-RA_Salv MP00609 TTCTTTCCATTTTTGGACA
SmilChr01G004447 Chr01 NC_080387.1:62572163-62572181promoter 内 2107-2125 bp + 1876 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.2/ 100 2 62574057-62578662(+) SMil_00001545-RA_Salv MP00609 TTCTTTCCATTTTTGGACA
SmilChr04G003442 Chr04 NC_080390.1:50944739-50944757promoter 内 2070-2088 bp + 1913 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.2/ 100 2 50938830-50942826(-) SMil_00001545-RA_Salv MP00609 TGTCCAAAAATGGAAAGAA
SmilChr04G001665 Chr04 NC_080390.1:27619249-27619267promoter 内 2063-2081 bp - 1920 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.2/ 100 2 27613201-27617329(-) SMil_00001545-RA_Salv MP00609 TTCTTTCCATTTTTGGACA
SmilChr03G002731 Chr03 NC_080389.1:43374847-43374865promoter 内 2029-2047 bp - 1954 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.2/ 100 2 43368980-43372893(-) SMil_00001545-RA_Salv MP00609 TTCTTTCCATTTTTGGACA
SmilChr04G000928 Chr04 NC_080390.1:12093913-12093931promoter 内 2025-2043 bp - 1958 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.2/ 100 2 12089431-12091955(-) SMil_00001545-RA_Salv MP00609 TTCTTTCCATTTTTGGACA
SmilChr02G004358 Chr02 NC_080388.1:65874667-65874685promoter 内 2015-2033 bp - 1968 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.2/ 100 2 65868832-65872699(-) SMil_00001545-RA_Salv MP00609 TTCTTTCCATTTTTGGACA
SmilChr01G003408 Chr01 NC_080387.1:52747077-52747095promoter 内 2005-2023 bp - 1978 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.2/ 100 2 52749073-52750858(+) SMil_00001545-RA_Salv MP00609 TGTCCAAAAATGGAAAGAA
SmilChr02G000871 Chr02 NC_080388.1:14999803-14999821promoter 内 2001-2019 bp + 1982 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.2/ 100 2 15001803-15003549(+) SMil_00001545-RA_Salv MP00609 TTCTTTCCATTTTTGGACA
SmilChr03G002227 Chr03 NC_080389.1:35092112-35092130promoter 内 2001-2019 bp - 1982 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.2/ 100 2 35094112-35096951(+) SMil_00001545-RA_Salv MP00609 TGTCCAAAAATGGAAAGAA
SmilChr05G002636 Chr05 NC_080391.1:29764263-29764281promoter 内 1990-2008 bp - 1993 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.2/ 100 2 29766274-29768252(+) SMil_00001545-RA_Salv MP00609 TGTCCAAAAATGGAAAGAA
SmilChr04G001458 Chr04 NC_080390.1:23996687-23996705promoter 内 1931-1949 bp - 2052 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.2/ 100 2 23991754-23994635(-) SMil_00001545-RA_Salv MP00609 TTCTTTCCATTTTTGGACA
SmilChr02G002278 Chr02 NC_080388.1:40266382-40266400promoter 内 1916-1934 bp + 2067 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.2/ 100 2 40268467-40269588(+) SMil_00001545-RA_Salv MP00609 TTCTTTCCATTTTTGGACA
SmilChr01G003778 Chr01 NC_080387.1:56180188-56180206promoter 内 1908-1926 bp - 2075 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.2/ 100 2 56177508-56178113(-) SMil_00001545-RA_Salv MP00609 TTGTTTCCTTTTTTGGCAA
SmilChr04G001208 Chr04 NC_080390.1:18712209-18712227promoter 内 1675-1693 bp - 2308 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.2/ 100 2 18714535-18721749(+) SMil_00001545-RA_Salv MP00609 TGTCCAAAAATGGAAAGAA
SmilChr03G003385 Chr03 NC_080389.1:52217365-52217383promoter 内 1671-1689 bp - 2312 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.2/ 100 2 52205301-52215053(-) SMil_00001545-RA_Salv MP00609 TTCTTTCCATTTTTGGACA
SmilChr02G004747 Chr02 NC_080388.1:69681984-69682002promoter 内 1612-1630 bp - 2371 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.2/ 100 2 69674212-69679613(-) SMil_00001545-RA_Salv MP00609 TTCTTTCCATTTTTGGACA
SmilChr02G004952 Chr02 NC_080388.1:71480847-71480865promoter 内 1605-1623 bp + 2378 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.2/ 100 2 71483243-71487460(+) SMil_00001545-RA_Salv MP00609 TTCTTTCCATTTTTGGACA
SmilChr01G002363 Chr01 NC_080387.1:40784887-40784905promoter 内 1482-1500 bp - 2501 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.2/ 100 2 40781386-40782386(-) SMil_00001545-RA_Salv MP00609 TTCTTTCCATTTTTGGACA
SmilChr04G002606 Chr04 NC_080390.1:41471571-41471589promoter 内 1413-1431 bp - 2570 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.2/ 100 2 41467616-41469001(-) SMil_00001545-RA_Salv MP00609 TTCTTTCCATTTTTGGACA
SmilChr01G006038 Chr01 NC_080387.1:75879876-75879894promoter 内 1334-1352 bp + 2649 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.2/ 100 2 75882543-75886160(+) SMil_00001545-RA_Salv MP00609 TTCTTTCCATTTTTGGACA
SmilChr01G001341 Chr01 NC_080387.1:26650442-26650460promoter 内 1298-1316 bp - 2685 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.2/ 100 2 26653145-26656117(+) SMil_00001545-RA_Salv MP00609 TGTCCAAAAATGGAAAGAA
SmilChr05G003984 Chr05 NC_080391.1:53658170-53658188promoter 内 1237-1255 bp + 2746 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.2/ 100 2 53660934-53665953(+) SMil_00001545-RA_Salv MP00609 TTCTTTCCATTTTTGGACA
SmilChr01G003235 Chr01 NC_080387.1:51106995-51107013promoter 内 1229-1247 bp + 2754 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.2/ 100 2 51101765-51104241(-) SMil_00001545-RA_Salv MP00609 TGTCCAAAAATGGAAAGAA