转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr07G002803; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00020702-RA_Salv SmilChr07G002803 NAC XP_057777238.1 MP00221 ACACGTAACTT

可能结合的靶基因

9903 个结合位点 7965 个候选靶基因 第 6 / 160 下载 TSV

上一页 6 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr05G000418 Chr05 NC_080391.1:3164565-3164575promoter 内 2607-2617 bp + 1384 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.3/ 100 1 3160583-3163181(-) SMil_00020702-RA_Salv MP00221 GGGTTACGTGC
SmilChr03G001606 Chr03 NC_080389.1:20411834-20411844promoter 内 2310-2320 bp + 1681 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.3/ 100 1 20407165-20410153(-) SMil_00020702-RA_Salv MP00221 AGGTTACGTAT
SmilChr01G005629 Chr01 NC_080387.1:72739994-72740004promoter 内 2075-2085 bp + 1916 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.3/ 100 1 72741920-72744555(+) SMil_00020702-RA_Salv MP00221 ACACGTAAGCT
SmilChr01G005071 Chr01 NC_080387.1:68588314-68588324promoter 内 2006-2016 bp - 1985 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.3/ 100 1 68590309-68591133(+) SMil_00020702-RA_Salv MP00221 CGATTACGTGT
SmilChr01G000898 Chr01 NC_080387.1:19056027-19056037promoter 内 1739-1749 bp - 2252 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.3/ 100 1 19058289-19060128(+) SMil_00020702-RA_Salv MP00221 AGCTTACGTGT
SmilChr05G000604 Chr05 NC_080391.1:4547332-4547342promoter 内 1721-1731 bp - 2270 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.3/ 100 1 4549612-4554739(+) SMil_00020702-RA_Salv MP00221 CGATTACGTGT
SmilChr02G001113 Chr02 NC_080388.1:20097008-20097018promoter 内 1590-1600 bp + 2401 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.3/ 100 1 20099419-20102046(+) SMil_00020702-RA_Salv MP00221 ACACGTAAGCT
SmilChr03G002905 Chr03 NC_080389.1:45802702-45802712promoter 内 1414-1424 bp - 2577 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.3/ 100 1 45805289-45808881(+) SMil_00020702-RA_Salv MP00221 CGATTACGTGT
SmilChr01G001839 Chr01 NC_080387.1:33320696-33320706promoter 内 1225-1235 bp - 2766 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.3/ 100 1 33323472-33324897(+) SMil_00020702-RA_Salv MP00221 CGATTACGTGT
SmilChr04G002161 Chr04 NC_080390.1:34796231-34796241promoter 内 1204-1214 bp - 2787 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.3/ 100 1 34789902-34793444(-) SMil_00020702-RA_Salv MP00221 ATACGTAACCT
SmilChr05G002706 Chr05 NC_080391.1:31114522-31114532promoter 内 1113-1123 bp - 2878 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.3/ 100 1 31111003-31111644(-) SMil_00020702-RA_Salv MP00221 ACACGTAATCG
SmilChr01G005070 Chr01 NC_080387.1:68588314-68588324promoter 内 1046-1056 bp - 2945 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.3/ 100 1 68583423-68585369(-) SMil_00020702-RA_Salv MP00221 ACACGTAATCG
SmilChr05G000623 Chr05 NC_080391.1:4703179-4703189promoter 内 901-911 bp - 3090 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.3/ 100 1 4706279-4715947(+) SMil_00020702-RA_Salv MP00221 AGCTTACGTGT
SmilChr04G002160 Chr04 NC_080390.1:34729453-34729463promoter 内 862-872 bp - 3129 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.3/ 100 1 34722757-34726324(-) SMil_00020702-RA_Salv MP00221 ATACGTAACCT
SmilChr04G002629 Chr04 NC_080390.1:41700657-41700667promoter 内 723-733 bp - 3268 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.3/ 100 1 41695722-41697389(-) SMil_00020702-RA_Salv MP00221 ATACGTAACCT
SmilChr02G003771 Chr02 NC_080388.1:59404170-59404180promoter 内 320-330 bp + 3671 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.3/ 100 1 59398874-59400499(-) SMil_00020702-RA_Salv MP00221 AGCTTACGTGT
SmilChr05G002485 Chr05 NC_080391.1:27489332-27489342promoter 内 3738-3748 bp + 253 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.2/ 100 3 27489595-27493351(+) SMil_00020702-RA_Salv MP00221 AGACGTAACCT
SmilChr01G004005 Chr01 NC_080387.1:58437894-58437904promoter 内 789-799 bp - 3202 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.2/ 100 3 58441106-58442543(+) SMil_00020702-RA_Salv MP00221 AAGTTACGTGA
SmilChr05G001247 Chr05 NC_080391.1:10596840-10596850promoter 内 2826-2836 bp + 1165 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.2/ 100 2 10598015-10601637(+) SMil_00020702-RA_Salv MP00221 AGACGTAACCT
SmilChr03G004447 Chr03 NC_080389.1:62607988-62607998promoter 内 2278-2288 bp - 1713 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.2/ 100 2 62609711-62615303(+) SMil_00020702-RA_Salv MP00221 AAGTTACGTGA
SmilChr03G002643 Chr03 NC_080389.1:42037580-42037590promoter 内 1336-1346 bp - 2655 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.2/ 100 2 42029806-42034925(-) SMil_00020702-RA_Salv MP00221 TCACGTAACTT
SmilChr01G005199 Chr01 NC_080387.1:69671035-69671045promoter 内 934-944 bp + 3057 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.2/ 100 2 69674102-69681886(+) SMil_00020702-RA_Salv MP00221 TCACGTAACTT
SmilChr03G000912 Chr03 NC_080389.1:10433269-10433279promoter 内 277-287 bp + 3714 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.2/ 100 2 10436993-10445143(+) SMil_00020702-RA_Salv MP00221 AGACGTAACCT
SmilChr03G001634 Chr03 NC_080389.1:21036650-21036660promoter 内 3958-3968 bp + 33 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.2/ 100 1 21034448-21036617(-) SMil_00020702-RA_Salv MP00221 AAGTTACGTGA
SmilChr04G003396 Chr04 NC_080390.1:50500546-50500556promoter 内 3551-3561 bp - 440 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.2/ 100 1 50500996-50502099(+) SMil_00020702-RA_Salv MP00221 AAGTTACGTGA
SmilChr02G000414 Chr02 NC_080388.1:5257518-5257528promoter 内 3416-3426 bp - 575 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.2/ 100 1 5258103-5261633(+) SMil_00020702-RA_Salv MP00221 AAGTTACGTGA
SmilChr03G002998 Chr03 NC_080389.1:46798258-46798268promoter 内 3225-3235 bp + 766 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.2/ 100 1 46795834-46797492(-) SMil_00020702-RA_Salv MP00221 AGGTTACGTCT
SmilChr04G002981 Chr04 NC_080390.1:46237486-46237496promoter 内 3099-3109 bp - 892 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.2/ 100 1 46238388-46242612(+) SMil_00020702-RA_Salv MP00221 AGGTTACGTCT
SmilChr04G003395 Chr04 NC_080390.1:50500546-50500556promoter 内 2862-2872 bp - 1129 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.2/ 100 1 50492490-50499417(-) SMil_00020702-RA_Salv MP00221 TCACGTAACTT
SmilChr03G003595 Chr03 NC_080389.1:54589292-54589302promoter 内 2365-2375 bp + 1626 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.2/ 100 1 54584497-54587666(-) SMil_00020702-RA_Salv MP00221 AAGTTACGTGA
SmilChr01G003517 Chr01 NC_080387.1:53778378-53778388promoter 内 2066-2076 bp - 1925 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.2/ 100 1 53771630-53776453(-) SMil_00020702-RA_Salv MP00221 TCACGTAACTT
SmilChr03G002630 Chr03 NC_080389.1:41753390-41753400promoter 内 2006-2016 bp - 1985 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.2/ 100 1 41755385-41756770(+) SMil_00020702-RA_Salv MP00221 AGGTTACGTCT
SmilChr03G000665 Chr03 NC_080389.1:7447611-7447621promoter 内 1631-1641 bp + 2360 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.2/ 100 1 7444379-7445251(-) SMil_00020702-RA_Salv MP00221 AGGTTACGTCT
SmilChr01G000747 Chr01 NC_080387.1:16548477-16548487promoter 内 1196-1206 bp - 2795 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.2/ 100 1 16551282-16555327(+) SMil_00020702-RA_Salv MP00221 AGGTTACGTCT
SmilChr05G002009 Chr05 NC_080391.1:20771750-20771760promoter 内 1179-1189 bp - 2812 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.2/ 100 1 20774572-20775817(+) SMil_00020702-RA_Salv MP00221 AAGTTACGTGA
SmilChr01G001968 Chr01 NC_080387.1:35041325-35041335promoter 内 902-912 bp - 3089 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.2/ 100 1 35032507-35038236(-) SMil_00020702-RA_Salv MP00221 TCACGTAACTT
SmilChr01G005047 Chr01 NC_080387.1:68408220-68408230promoter 内 533-543 bp + 3458 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.2/ 100 1 68401320-68404762(-) SMil_00020702-RA_Salv MP00221 AGGTTACGTCT
SmilChr03G003081 Chr03 NC_080389.1:47830533-47830543promoter 内 422-432 bp + 3569 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.2/ 100 1 47834112-47842494(+) SMil_00020702-RA_Salv MP00221 AGACGTAACCT
SmilChr05G000949 Chr05 NC_080391.1:7663943-7663953promoter 内 3840-3850 bp + 151 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.1/ 100 2 7664104-7664721(+) SMil_00020702-RA_Salv MP00221 ACACGTATCCG
SmilChr06G000491 Chr06 NC_080392.1:4019156-4019166promoter 内 3051-3061 bp - 940 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.1/ 100 2 4020106-4022047(+) SMil_00020702-RA_Salv MP00221 CGGATACGTGT
SmilChr04G003838 Chr04 NC_080390.1:54410630-54410640promoter 内 2465-2475 bp - 1526 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.1/ 100 2 54406072-54409104(-) SMil_00020702-RA_Salv MP00221 GCACGTAACTG
SmilChr05G000507 Chr05 NC_080391.1:3930343-3930353promoter 内 3805-3815 bp + 186 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.1/ 100 1 3930539-3931111(+) SMil_00020702-RA_Salv MP00221 GCACGTAACTG
SmilChr05G000506 Chr05 NC_080391.1:3930343-3930353promoter 内 3697-3707 bp + 294 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.1/ 100 1 3929977-3930049(-) SMil_00020702-RA_Salv MP00221 CAGTTACGTGC
SmilChr05G002161 Chr05 NC_080391.1:22853331-22853341promoter 内 3007-3017 bp - 984 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.1/ 100 1 22845596-22852347(-) SMil_00020702-RA_Salv MP00221 ACACGTATCCG
SmilChr01G004757 Chr01 NC_080387.1:65770153-65770163promoter 内 1883-1893 bp - 2108 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.1/ 100 1 65772271-65776936(+) SMil_00020702-RA_Salv MP00221 CAGTTACGTGC
SmilChr03G002991 Chr03 NC_080389.1:46726178-46726188promoter 内 1389-1399 bp + 2602 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.1/ 100 1 46728790-46730217(+) SMil_00020702-RA_Salv MP00221 ACACGTATCCG
SmilChr05G000508 Chr05 NC_080391.1:3930343-3930353promoter 内 1257-1267 bp + 2734 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.1/ 100 1 3933087-3933249(+) SMil_00020702-RA_Salv MP00221 GCACGTAACTG
SmilChr03G004543 Chr03 NC_080389.1:63440343-63440353promoter 内 1042-1052 bp - 2949 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.1/ 100 1 63434258-63437394(-) SMil_00020702-RA_Salv MP00221 ACACGTATCCG
SmilChr03G002099 Chr03 NC_080389.1:32453876-32453886promoter 内 991-1001 bp - 3000 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.1/ 100 1 32449626-32450876(-) SMil_00020702-RA_Salv MP00221 ACACGTATCCG
SmilChr03G000915 Chr03 NC_080389.1:10474195-10474205promoter 内 644-654 bp + 3347 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.1/ 100 1 10469068-10470848(-) SMil_00020702-RA_Salv MP00221 CGGATACGTGT