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转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family，查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中，并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因，不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif；应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引，可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card，点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
SmilChr04G003117 XP_057809539.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr04G003114 XP_057809538.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr01G005298 XP_057788621.1
ARR-B 1
MP00010
 8344 9778 查靶基因
SmilChr03G003924 XP_057798851.1
NAC 1
MP00059
 8333 9940 查靶基因
SmilChr01G005344 XP_057788686.1
MYB 1
MP00296
 8304 9873 查靶基因
SmilChr08G004408 XP_057780613.1
MYB 1
MP00114
 8151 9897 查靶基因
SmilChr04G001094 XP_057804404.1
WRKY 1
MP00408
 8149 9902 查靶基因
SmilChr07G003597 XP_057773587.1
Nin-like 1
MP00449
 8096 9453 查靶基因
SmilChr02G005433 XP_057792682.1
WRKY 1
MP00209
 8083 9910 查靶基因
SmilChr04G004136 XP_057806072.1
MYB 1
MP00627
 8075 9835 查靶基因
SmilChr01G003955 XP_057779712.1
WRKY 1
MP00450
 8044 9901 查靶基因
SmilChr03G003685 XP_057798538.1
ERF 1
MP00558
 8044 9762 查靶基因
SmilChr07G002937 XP_057777490.1
MIKC_MADS 1
MP00096
 8019 9914 查靶基因
SmilChr02G003833 XP_057794421.1
MYB 1
MP00476
 7981 9904 查靶基因
SmilChr07G002803 XP_057777238.1
NAC 1
MP00221
 7965 9903 查靶基因
SmilChr05G002364 XP_057809766.1
WRKY 1
MP00069
 7882 9917 查靶基因
SmilChr08G003267 XP_057779249.1
MYB 1
MP00406
 7839 9917 查靶基因
SmilChr02G005012 XP_057792191.1
TALE 1
MP00670
 7758 9906 查靶基因
SmilChr07G001978 XP_057776996.1
SBP 1
MP00555
 7648 9805 查靶基因
SmilChr05G000741 XP_057764423.1
ARF 1
MP00021
 7629 9812 查靶基因
SmilChr01G004579 XP_057787263.1
MYB 1
MP00132
 7583 9926 查靶基因
SmilChr05G000593 XP_057764223.1
MIKC_MADS 1
MP00609
 7575 9941 查靶基因
SmilChr03G004518 XP_057799834.1
ERF 1
MP00529
 7559 9247 查靶基因
SmilChr06G001829 XP_057766988.1
MYB 1
MP00510
 7526 9799 查靶基因
SmilChr05G000830 XP_057764550.1
NAC 1
MP00058
 7440 9855 查靶基因
SmilChr08G002543 XP_057778423.1
bZIP 1
MP00303
 7416 9868 查靶基因
SmilChr01G002743 XP_057765725.1
MYB_related 1
MP00565
 7412 9785 查靶基因
SmilChr04G002704 XP_057807081.1
ERF 1
MP00026
 7408 9854 查靶基因
SmilChr05G001395 XP_057765344.1
WRKY 1
MP00071
 7408 9764 查靶基因
SmilChr04G002953 XP_057809314.1
ARF 1
MP00033
 7406 9827 查靶基因
SmilChr01G004199 XP_057782208.1
bHLH 1
MP00074
 7396 9969 查靶基因
SmilChr05G004009 XP_057810662.1
MYB 1
MP00216
 7342 9832 查靶基因
SmilChr03G001606 XP_057802772.1
WRKY 1
MP00539
 7338 9848 查靶基因
SmilChr02G004600 XP_057791481.1
ARF 1
MP00574
 7302 9846 查靶基因
SmilChr03G004179 XP_057799230.1
WRKY 1
MP00464
 7299 9864 查靶基因
SmilChr04G003805 XP_057805691.1
MIKC_MADS 1
MP00315
 7291 9567 查靶基因
SmilChr03G003761 XP_057798625.1
WRKY 1
MP00525
 7235 9838 查靶基因
SmilChr01G001885 XP_057806790.1
WRKY 1
MP00171
 7182 9833 查靶基因
SmilChr05G004392 XP_057811204.1
WRKY 1
MP00506
 7173 9818 查靶基因
SmilChr04G002757 XP_057807158.1
MIKC_MADS 1
MP00272
 7172 9889 查靶基因
SmilChr01G003404 XP_057773670.1
bZIP 1
MP00184
 7147 9840 查靶基因
SmilChr03G002335 XP_057801256.1
bZIP 1
MP00647
 7133 9953 查靶基因
SmilChr07G002075 XP_057773918.1
C2H2 1
MP00485
 7130 8059 查靶基因
SmilChr04G000162 XP_057807467.1
MYB 1
MP00134
 7078 8676 查靶基因
SmilChr04G000040 XP_057808382.1
ERF 1
MP00312
 7006 8490 查靶基因
SmilChr08G001896 XP_057783815.1
MYB 1
MP00564
 6984 9893 查靶基因
SmilChr02G005217 XP_057792502.1
G2-like 1
MP00022
 6959 9720 查靶基因
SmilChr05G000260 XP_057763683.1
bZIP 1
MP00040
 6920 9919 查靶基因
SmilChr01G002885 XP_057767601.1
ERF 1
MP00151
 6907 9976 查靶基因
SmilChr05G001518 XP_057765511.1
WRKY 1
MP00455
 6900 9792 查靶基因
SmilChr03G002503 XP_057801356.1
MYB 1
MP00482
 6899 8940 查靶基因
SmilChr03G001252 XP_057802461.1
bZIP 1
MP00291
 6894 9321 查靶基因
SmilChr06G001365 XP_057768799.1
SBP 1
MP00307
 6893 9755 查靶基因
SmilChr03G003439 XP_057798243.1
bHLH 1
MP00195
 6878 9832 查靶基因
SmilChr06G001111 XP_057768512.1
MYB 1
MP00388
 6870 9774 查靶基因
SmilChr02G000949 XP_057795176.1
bZIP 1
MP00318
 6849 9413 查靶基因
SmilChr01G000025 XP_057790305.1
SBP 1
MP00633
 6833 8026 查靶基因
SmilChr01G004313 XP_057783598.1
bHLH 1
MP00308
 6805 9826 查靶基因
SmilChr02G005502 XP_057792768.1
bHLH 1
MP00082
 6784 9435 查靶基因
SmilChr03G004274 XP_057799397.1
MIKC_MADS 1
MP00080
 6766 9850 查靶基因
SmilChr02G003688 XP_057794248.1
MYB 1
MP00028
 6764 9024 查靶基因
SmilChr04G003367 XP_057804957.1
MYB 1
MP00191
 6736 9690 查靶基因
SmilChr04G000157 XP_057807462.1
bHLH 1
MP00081
 6729 9942 查靶基因
SmilChr07G002147 XP_057774045.1
MYB 1
MP00500
 6697 9681 查靶基因
SmilChr05G002277 XP_057809665.1
ERF 1
MP00452
 6671 7783 查靶基因
SmilChr07G004480 XP_057776222.1
WRKY 1
MP00531
 6663 9784 查靶基因
SmilChr02G004447 XP_057797242.1
HD-ZIP 1
MP00200
 6661 9930 查靶基因
SmilChr04G000070 XP_057807324.1
bHLH 1
MP00034
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G002039 XP_057808459.1
bHLH 1
MP00660
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G005851 XP_057789306.1
MYB 1
MP00055
 6638 9685 查靶基因
SmilChr02G005238 XP_057792594.1
SBP 1
MP00634
 6619 7771 查靶基因
SmilChr06G002048 XP_057770293.1
bHLH 1
MP00035
 6618 9903 查靶基因
SmilChr07G000836 XP_057772437.1
MYB_related 1
MP00568
 6611 9696 查靶基因
SmilChr04G003119 XP_057809542.1
bZIP 1
MP00039
 6610 9936 查靶基因
SmilChr01G004114 XP_057781125.1
WRKY 1
MP00284
 6552 9774 查靶基因
SmilChr08G004246 XP_057780410.1
WRKY 1
MP00422
 6535 9791 查靶基因
SmilChr05G001980 XP_057766076.1
ARF 1
MP00153
 6534 9706 查靶基因
SmilChr04G000094 XP_057807365.1
YABBY 1
MP00620
 6504 9844 查靶基因
SmilChr02G002534 XP_057797741.1
TCP 1
MP00169
 6498 7295 查靶基因
SmilChr05G001269 XP_057765199.1
G2-like 1
MP00252
 6478 9780 查靶基因
SmilChr07G003441 XP_057773618.1
NAC 1
MP00108
 6458 9810 查靶基因
SmilChr02G001791 XP_057795933.1
TCP 1
MP00062
 6454 7249 查靶基因
SmilChr05G003285 XP_057810127.1
RAV 1
MP00024
 6450 9853 查靶基因
SmilChr05G000619 XP_057764205.1
WRKY 1
MP00167
 6439 9756 查靶基因
SmilChr04G003745 XP_057809144.1
C2H2 1
MP00416
 6433 9716 查靶基因
SmilChr02G004607 XP_057791470.1
C2H2 1
MP00608
 6398 9817 查靶基因
SmilChr02G003399 XP_057793859.1
ERF 1
MP00240
 6368 9978 查靶基因
SmilChr01G004920 XP_057788125.1
MYB_related 1
MP00607
 6362 9718 查靶基因
SmilChr06G001059 XP_057768449.1
Dof 1
MP00402
 6278 9875 查靶基因
SmilChr01G004552 XP_057786668.1
bZIP 1
MP00409
 6252 8429 查靶基因
SmilChr01G006187 XP_057798078.1
GRAS 1
MP00611
 6232 9807 查靶基因
SmilChr01G001516 XP_057803325.1
bZIP 1
MP00648
 6170 9939 查靶基因
SmilChr04G003955 XP_057805828.1
ERF 1
MP00120
 6144 7514 查靶基因
SmilChr01G004708 XP_057787833.1
WRKY 1
MP00251
 6140 9713 查靶基因
SmilChr05G001961 XP_057766054.1
MIKC_MADS 1
MP00077
 6125 9815 查靶基因
SmilChr08G000478 XP_057781809.1
GATA 1
MP00130
 6015 9821 查靶基因
SmilChr01G000943 XP_057790035.1
MIKC_MADS 1
MP00508
 5979 7481 查靶基因
SmilChr05G004106 XP_057810779.1
WRKY 1
MP00260
 5932 9706 查靶基因
SmilChr04G003973 XP_057805857.1
HD-ZIP 1
MP00013
 5927 9712 查靶基因
SmilChr03G002207 XP_057801109.1
WRKY 1
MP00299
 5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr04G001094; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00021820-RA_Salv SmilChr04G001094 WRKY XP_057804404.1 MP00408 AGCGTTGACTTTT

可能结合的靶基因

9902 个结合位点 8149 个候选靶基因 第 60 / 163 下载 TSV

上一页 60 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr04G000465 Chr04 NC_080390.1:4969462-4969474promoter 内 744-756 bp - 3245 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 4958936-4966217(-) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 TGCGTTGACCTAA
SmilChr02G000449 Chr02 NC_080388.1:5876385-5876397promoter 内 739-751 bp - 3250 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 5869129-5873135(-) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 GCAGTTGACTCTG
SmilChr02G000856 Chr02 NC_080388.1:14602018-14602030promoter 内 677-689 bp - 3312 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 14605342-14605797(+) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 GAAAGTCAACAGG
SmilChr02G000862 Chr02 NC_080388.1:14802807-14802819promoter 内 674-686 bp - 3315 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 14806134-14806589(+) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 GAAAGTCAACAGG
SmilChr03G002604 Chr03 NC_080389.1:41426251-41426263promoter 内 615-627 bp - 3374 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 41429637-41432804(+) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 TTAGGTCAACGGG
SmilChr01G001610 Chr01 NC_080387.1:30250099-30250111promoter 内 597-609 bp + 3392 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 30253503-30255496(+) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 TCGGTTGACTTCT
SmilChr06G000540 Chr06 NC_080392.1:4513374-4513386promoter 内 553-565 bp - 3436 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 4507934-4509938(-) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 TGAGTTGACTTGT
SmilChr07G000783 Chr07 NC_080393.1:5505652-5505664promoter 内 525-537 bp + 3464 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 5509128-5513526(+) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 TGCGTTGACCTAA
SmilChr04G000793 Chr04 NC_080390.1:9796511-9796523promoter 内 409-421 bp - 3580 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 9800103-9803925(+) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 CTGAGTCAACGGA
SmilChr03G001072 Chr03 NC_080389.1:12423731-12423743promoter 内 408-420 bp - 3581 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 12427324-12430901(+) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 GCAAGTCAACCCC
SmilChr06G002913 Chr06 NC_080392.1:41976229-41976241promoter 内 395-407 bp + 3594 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 41979835-41996589(+) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 GGGGTTGACTTGC
SmilChr05G003243 Chr05 NC_080391.1:41752134-41752146promoter 内 380-392 bp - 3609 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 41755755-41757959(+) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 GAACGTCAACGCC
SmilChr03G003315 Chr03 NC_080389.1:51393716-51393728promoter 内 363-375 bp + 3626 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 51397354-51400647(+) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 GCTGTTGACTTCT
SmilChr07G001408 Chr07 NC_080393.1:10966847-10966859promoter 内 316-328 bp + 3673 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 10954274-10963174(-) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 CAGAGTCAACTGC
SmilChr05G001384 Chr05 NC_080391.1:12404651-12404663promoter 内 288-300 bp + 3701 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 12408364-12409517(+) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 CGAGTTGACTTCG
SmilChr03G002944 Chr03 NC_080389.1:46177778-46177790promoter 内 272-284 bp + 3717 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 46168929-46174061(-) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 CAGAGTCAACTGC
SmilChr02G005184 Chr02 NC_080388.1:73150574-73150586promoter 内 228-240 bp - 3761 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 73145483-73146813(-) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 CCCGTTGACCTAA
SmilChr03G000559 Chr03 NC_080389.1:6065619-6065631promoter 内 205-217 bp + 3784 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 6058931-6061835(-) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 GAAAGTCAACTAA
SmilChr06G001046 Chr06 NC_080392.1:10336791-10336803promoter 内 194-206 bp + 3795 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 10325654-10332996(-) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 GCAAGTCAACCCC
SmilChr07G001409 Chr07 NC_080393.1:10966847-10966859promoter 内 113-125 bp + 3876 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 10959849-10962971(-) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 CAGAGTCAACTGC
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SmilChr05G003242 Chr05 NC_080391.1:41752134-41752146promoter 内 60-72 bp - 3929 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 41744130-41748205(-) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 GGCGTTGACGTTC
SmilChr04G004003 Chr04 NC_080390.1:55369127-55369139promoter 内 58-70 bp - 3931 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 55373070-55378103(+) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 TAAAGTCAACACT
SmilChr07G002914 Chr07 NC_080393.1:29540507-29540519promoter 内 41-53 bp - 3948 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 29532505-29536559(-) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 ACGGTTGACTATT
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SmilChr05G001909 Chr05 NC_080391.1:19369160-19369172promoter 内 3348-3360 bp + 641 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 3 19365804-19368519(-) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 TAAAGTCAACTTT
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SmilChr01G002965 Chr01 NC_080387.1:48535320-48535332promoter 内 426-438 bp - 3563 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 3 48524866-48531757(-) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 CACGTTGACCTCG
SmilChr06G003010 Chr06 NC_080392.1:42978928-42978940promoter 内 251-263 bp + 3738 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 3 42982678-42983722(+) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 ACCGTTGACTACA
SmilChr05G001910 Chr05 NC_080391.1:19369160-19369172promoter 内 3245-3257 bp + 744 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 2 19369916-19371708(+) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 AAAGTTGACTTTA
SmilChr07G003237 Chr07 NC_080393.1:34338217-34338229promoter 内 3042-3054 bp + 947 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 2 34337138-34337270(-) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 CACAGTCAACGTG
SmilChr07G003236 Chr07 NC_080393.1:34338217-34338229promoter 内 2804-2816 bp + 1185 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 2 34336899-34337032(-) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 CACAGTCAACGTG
SmilChr01G005029 Chr01 NC_080387.1:68244655-68244667promoter 内 2363-2375 bp + 1626 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 2 68242265-68243029(-) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 GATAGTCAACTCC
SmilChr03G002888 Chr03 NC_080389.1:45548261-45548273promoter 内 2167-2179 bp + 1822 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 2 45550095-45553642(+) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 GGAGTTGACTATC
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SmilChr01G000272 Chr01 NC_080387.1:5411304-5411316promoter 内 1098-1110 bp - 2891 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 2 5414207-5415073(+) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 GATGGTCAACGAC
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SmilChr08G002414 Chr08 NC_080394.1:22934787-22934799promoter 内 526-538 bp - 3463 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 2 22927842-22931324(-) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 TGAGTTGACTTCG
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SmilChr04G003518 Chr04 NC_080390.1:51574145-51574157promoter 内 490-502 bp - 3499 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 2 51568977-51570646(-) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 GACGTTGACTCCG
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SmilChr03G003800 Chr03 NC_080389.1:57076483-57076495promoter 内 3948-3960 bp - 41 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 57060998-57076442(-) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 GTAGTTGACTTAT
SmilChr03G003790 Chr03 NC_080389.1:57002349-57002361promoter 内 3942-3954 bp - 47 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 56993332-57002302(-) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 GTAGTTGACTTAT
SmilChr01G001778 Chr01 NC_080387.1:32666582-32666594promoter 内 3911-3923 bp - 78 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 32666672-32668220(+) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 AAAAGTCAATGCG
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SmilChr01G001792 Chr01 NC_080387.1:32782537-32782549promoter 内 3570-3582 bp + 419 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 32778863-32782118(-) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 TGAGGTCAACGAC