转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr02G000949; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00003681-RA_Salv SmilChr02G000949 bZIP XP_057795176.1 MP00318 TGCCACGTCAGCATT

可能结合的靶基因

9413 个结合位点 6849 个候选靶基因 第 61 / 137 下载 TSV

上一页 61 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr08G000084 Chr08 NC_080394.1:482294-482308promoter 内 1018-1032 bp - 2969 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 485277-487830(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 GGAGATGACGTGTCC
SmilChr01G000538 Chr01 NC_080387.1:11060800-11060814promoter 内 861-875 bp - 3126 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 11063940-11065616(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 ATGTGACACGTGGCA
SmilChr05G001491 Chr05 NC_080391.1:13677280-13677294promoter 内 823-837 bp + 3164 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 13680458-13683035(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 TTCCACGTCAACATT
SmilChr08G000035 Chr08 NC_080394.1:244955-244969promoter 内 819-833 bp - 3168 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 248137-250766(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 GGAGATGACGTGTCC
SmilChr08G000076 Chr08 NC_080394.1:441282-441296promoter 内 799-813 bp - 3188 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 444484-446942(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 GGAGATGACGTGTCC
SmilChr08G001733 Chr08 NC_080394.1:14580597-14580611promoter 内 780-794 bp + 3207 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 14571580-14577390(-) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 GGCTCCTACGTGGCA
SmilChr08G000204 Chr08 NC_080394.1:1419567-1419581promoter 内 755-769 bp - 3232 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 1392568-1416335(-) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 TGCCACGTCATTTAA
SmilChr08G000033 Chr08 NC_080394.1:233393-233407promoter 内 616-630 bp - 3371 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 236778-240106(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 GGAGATGACGTGTCC
SmilChr02G002850 Chr02 NC_080388.1:48681387-48681401promoter 内 534-548 bp - 3453 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 48674009-48677934(-) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 AGACACGTCAGCTTT
SmilChr04G000725 Chr04 NC_080390.1:8515130-8515144promoter 内 523-537 bp + 3464 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 8518608-8520353(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 TGCCACGTGTCACTA
SmilChr01G004947 Chr01 NC_080387.1:67569564-67569578promoter 内 486-500 bp + 3501 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 67561799-67566063(-) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 ATGTATGACGTGGCC
SmilChr01G000537 Chr01 NC_080387.1:11060800-11060814promoter 内 452-466 bp - 3535 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 11056474-11057265(-) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 TGCCACGTGTCACAT
SmilChr01G001620 Chr01 NC_080387.1:30306779-30306793promoter 内 351-365 bp - 3636 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 30300687-30303143(-) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 TTCCACGTCAACTTC
SmilChr01G003559 Chr01 NC_080387.1:54195937-54195951promoter 内 336-350 bp + 3651 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 54199602-54203213(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 TGCCACGTAACATTA
SmilChr03G000813 Chr03 NC_080389.1:9302022-9302036promoter 内 313-327 bp - 3674 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 9305710-9308869(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 CCAGATGACGTGTCA
SmilChr01G004980 Chr01 NC_080387.1:67855420-67855434promoter 内 305-319 bp - 3682 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 67848459-67851738(-) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 AGCCACGTAGCCACC
SmilChr04G001764 Chr04 NC_080390.1:28989584-28989598promoter 内 223-237 bp + 3764 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 28993362-28995853(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 TGCCACGTAGGAGCC
SmilChr05G001311 Chr05 NC_080391.1:11298137-11298151promoter 内 183-197 bp + 3804 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 11301955-11304810(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 TGCCACGTAGGAGCC
SmilChr07G004641 Chr07 NC_080393.1:59274784-59274798promoter 内 119-133 bp - 3868 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 59269918-59270916(-) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 TGCCACGTCATTTAA
SmilChr08G000050 Chr08 NC_080394.1:311821-311835promoter 内 92-106 bp + 3895 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 306275-307926(-) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 GGAGATGACGTGTCC
SmilChr03G001219 Chr03 NC_080389.1:14013979-14013993promoter 内 84-98 bp + 3903 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 14007534-14010076(-) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 TTAAATGACGTGGCA
SmilChr07G000512 Chr07 NC_080393.1:3591480-3591494promoter 内 80-94 bp - 3907 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 3595401-3597637(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 GTCGGCGACGTGGAG
SmilChr03G003932 Chr03 NC_080389.1:58394224-58394238promoter 内 76-90 bp + 3911 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 58380573-58390313(-) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 GACCCCGACGTGGCG
SmilChr03G001852 Chr03 NC_080389.1:25511946-25511960promoter 内 29-43 bp - 3958 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 25507883-25507988(-) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 TGCCACGTGACTCAT
SmilChr08G000071 Chr08 NC_080394.1:403706-403720promoter 内 5-19 bp - 3982 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 407702-418069(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 GAAGATGACGTGTCC
SmilChr04G002611 Chr04 NC_080390.1:41507306-41507320promoter 内 3411-3425 bp - 576 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 8 41505716-41506730(-) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 TGCCACGTAGGATAA
SmilChr04G002652 Chr04 NC_080390.1:41911070-41911084promoter 内 3486-3500 bp - 501 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 6 41909552-41910569(-) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 TGCCACGTAGGATAA
SmilChr01G003282 Chr01 NC_080387.1:51513348-51513362promoter 内 2394-2408 bp - 1593 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 4 51514955-51522867(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 TTATCCTACGTGGCA
SmilChr01G001500 Chr01 NC_080387.1:28856740-28856754promoter 内 2829-2843 bp - 1158 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 3 28851143-28855582(-) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 TGCCACGTCATGGCC
SmilChr08G002536 Chr08 NC_080394.1:24609336-24609350promoter 内 2044-2058 bp + 1943 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 3 24611293-24616342(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 TGCCACGTAGGATAA
SmilChr01G002906 Chr01 NC_080387.1:47760097-47760111promoter 内 1971-1985 bp + 2016 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 3 47752984-47758081(-) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 TACTGCCACGTGGCG
SmilChr03G003358 Chr03 NC_080389.1:51927163-51927177promoter 内 1735-1749 bp + 2252 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 3 51929429-51930661(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 TGCCACGTAGGATAA
SmilChr08G001121 Chr08 NC_080394.1:8722145-8722159promoter 内 1609-1623 bp + 2378 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 3 8724537-8733411(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 AGCCACGTCATATAC
SmilChr02G000894 Chr02 NC_080388.1:15386395-15386409promoter 内 1366-1380 bp - 2621 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 3 15389030-15392007(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 TTATCCTACGTGGCA
SmilChr04G003096 Chr04 NC_080390.1:47571645-47571659promoter 内 984-998 bp - 3003 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 3 47574662-47576809(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 AATTATTACGTGGCA
SmilChr05G000064 Chr05 NC_080391.1:312310-312324promoter 内 3924-3938 bp - 63 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 2 312387-314742(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 ACATGACACGTGGCA
SmilChr01G001124 Chr01 NC_080387.1:22850236-22850250promoter 内 3892-3906 bp - 95 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 2 22850345-22851537(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 GTATGACACGTGGCG
SmilChr02G001906 Chr02 NC_080388.1:34355631-34355645promoter 内 3078-3092 bp + 909 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 2 34356554-34360351(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 TGCCACGTAGGATAA
SmilChr02G001047 Chr02 NC_080388.1:18537037-18537051promoter 内 2523-2537 bp - 1464 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 2 18535094-18535573(-) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 TGCCACGTCGCGCCG
SmilChr06G001160 Chr06 NC_080392.1:11781220-11781234promoter 内 2421-2435 bp + 1566 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 2 11782800-11785184(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 TGCCACGTAGGATAA
SmilChr08G001497 Chr08 NC_080394.1:12141234-12141248promoter 内 2300-2314 bp + 1687 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 2 12138432-12139547(-) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 TTATCCTACGTGGCA
SmilChr04G000677 Chr04 NC_080390.1:7739313-7739327promoter 内 2212-2226 bp - 1775 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 2 7741102-7747480(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 TTATCCTACGTGGCA
SmilChr05G000785 Chr05 NC_080391.1:6130088-6130102promoter 内 1788-1802 bp - 2199 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 2 6126607-6127889(-) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 TGCCACGTGTCATGT
SmilChr02G003609 Chr02 NC_080388.1:57349138-57349152promoter 内 1556-1570 bp + 2431 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 2 57340981-57346707(-) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 TTATCCTACGTGGCA
SmilChr01G001388 Chr01 NC_080387.1:27293334-27293348promoter 内 612-626 bp + 3375 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 2 27283075-27289959(-) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 TTATCCTACGTGGCA
SmilChr02G003884 Chr02 NC_080388.1:60917632-60917646promoter 内 323-337 bp + 3664 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 2 60908928-60913968(-) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 TGGCCCCACGTGGCA
SmilChr01G004959 Chr01 NC_080387.1:67683912-67683926promoter 内 266-280 bp - 3721 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 2 67687647-67692378(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 TTATCCTACGTGGCA
SmilChr04G003413 Chr04 NC_080390.1:50763241-50763255promoter 内 3938-3952 bp - 49 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 50755390-50763192(-) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 TGCCACGTAGCATCT
SmilChr04G000895 Chr04 NC_080390.1:11510058-11510072promoter 内 3911-3925 bp + 76 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 11509075-11509982(-) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 CCGGCTGACGTGGAG
SmilChr02G002849 Chr02 NC_080388.1:48668860-48668874promoter 内 3887-3901 bp + 100 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 48668974-48673486(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 TGCCACGTAATATCC