转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr02G004607; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00002089-RA_Salv SmilChr02G004607 C2H2 XP_057791470.1 MP00608 AAAAACAGAGCA

可能结合的靶基因

9817 个结合位点 6398 个候选靶基因 第 61 / 128 下载 TSV

上一页 61 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr01G002788 Chr01 NC_080387.1:46354461-46354472promoter 内 1371-1382 bp + 2619 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 46347565-46351842(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TTTTCTGTTTTT
SmilChr02G000805 Chr02 NC_080388.1:13427946-13427957promoter 内 1364-1375 bp - 2626 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 13425214-13425320(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 AAAAACAGAAAA
SmilChr01G004476 Chr01 NC_080387.1:62877850-62877861promoter 内 1334-1345 bp - 2656 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 62872367-62875194(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 AAAAACAGAAGG
SmilChr02G003596 Chr02 NC_080388.1:57155052-57155063promoter 内 1319-1330 bp - 2671 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 57151576-57152381(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 AAAAACAGAAAA
SmilChr01G003331 Chr01 NC_080387.1:52022255-52022266promoter 内 1302-1313 bp - 2688 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 52024954-52026587(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TTTTCTGTTTTT
SmilChr02G001303 Chr02 NC_080388.1:24177022-24177033promoter 内 1296-1307 bp - 2694 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 24174222-24174328(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 AAAAACAGAAAA
SmilChr02G004819 Chr02 NC_080388.1:70311298-70311309promoter 内 1263-1274 bp + 2727 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 70314036-70316452(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 AAAAACAGAAAA
SmilChr02G000302 Chr02 NC_080388.1:3834525-3834536promoter 内 1257-1268 bp - 2733 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 3828212-3831792(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 AAAAACAGAAGG
SmilChr02G003525 Chr02 NC_080388.1:56407710-56407721promoter 内 1230-1241 bp - 2760 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 56410481-56413936(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TTTTCTGTTTTT
SmilChr02G004172 Chr02 NC_080388.1:64002930-64002941promoter 内 1224-1235 bp + 2766 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 64005707-64007191(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 CAAAACAGAATA
SmilChr02G005603 Chr02 NC_080388.1:75733567-75733578promoter 内 1215-1226 bp - 2775 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 75736353-75739430(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TTTTCTGTTTTT
SmilChr01G004916 Chr01 NC_080387.1:67198003-67198014promoter 内 1103-1114 bp - 2887 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 67193509-67195116(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 AAAAACAGAAAA
SmilChr01G000792 Chr01 NC_080387.1:17215919-17215930promoter 内 1097-1108 bp - 2893 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 17210660-17213026(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 AGAAACAGAAGG
SmilChr02G003144 Chr02 NC_080388.1:52450260-52450271promoter 内 1033-1044 bp - 2957 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 52444223-52447303(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 AAAAACAGAAAA
SmilChr02G003261 Chr02 NC_080388.1:53897726-53897737promoter 内 993-1004 bp - 2997 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 53900734-53908580(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 CCTTCTGTTTCT
SmilChr01G005154 Chr01 NC_080387.1:69327710-69327721promoter 内 961-972 bp + 3029 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 69324610-69324681(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TGCTCTGTATCG
SmilChr01G005867 Chr01 NC_080387.1:74610699-74610710promoter 内 932-943 bp + 3058 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 74613768-74614675(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 AAAAACAGAAAA
SmilChr01G005104 Chr01 NC_080387.1:68830609-68830620promoter 内 913-924 bp + 3077 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 68833697-68837380(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 AAAAACAGAAAA
SmilChr02G004304 Chr02 NC_080388.1:65421113-65421124promoter 内 812-823 bp - 3178 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 65424302-65430699(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TATTCTGTTTTG
SmilChr01G004159 Chr01 NC_080387.1:60086038-60086049promoter 内 806-817 bp + 3184 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 60080427-60082854(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TTTTCTGTTTTT
SmilChr01G005446 Chr01 NC_080387.1:71553803-71553814promoter 内 767-778 bp - 3223 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 71546333-71550580(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 CAATACAGAGCA
SmilChr03G000410 Chr03 NC_080389.1:4444628-4444639promoter 内 732-743 bp + 3258 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 4440018-4441370(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 CCTTCTGTTTCT
SmilChr03G000256 Chr03 NC_080389.1:3001639-3001650promoter 内 646-657 bp + 3344 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 3004994-3009642(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 AAAAACAGAAGG
SmilChr02G005392 Chr02 NC_080388.1:74538428-74538439promoter 内 633-644 bp - 3357 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 74532819-74535071(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 AAAAACAGAAAA
SmilChr01G000255 Chr01 NC_080387.1:4885354-4885365promoter 内 630-641 bp - 3360 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 4888725-4895148(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TTTTCTGTTTTT
SmilChr03G000054 Chr03 NC_080389.1:530619-530630promoter 内 609-620 bp - 3381 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 526416-527238(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 AAAAACAGAAAA
SmilChr02G005043 Chr02 NC_080388.1:72153814-72153825promoter 内 599-610 bp - 3391 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 72146367-72150423(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 AGAAACAGAAGG
SmilChr01G004296 Chr01 NC_080387.1:61150138-61150149promoter 内 581-592 bp + 3409 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 61153558-61157057(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 AAAAACAGAAAA
SmilChr02G002557 Chr02 NC_080388.1:44470451-44470462promoter 内 579-590 bp + 3411 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 44473873-44500678(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 AAAAACAGAAGG
SmilChr01G006030 Chr01 NC_080387.1:75849175-75849186promoter 内 540-551 bp - 3450 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 75845074-75845725(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 AAGAACAGAGTT
SmilChr01G004295 Chr01 NC_080387.1:61150138-61150149promoter 内 441-452 bp + 3549 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 61142915-61146589(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TTTTCTGTTTTT
SmilChr03G000901 Chr03 NC_080389.1:10316919-10316930promoter 内 433-444 bp - 3557 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 10320487-10323925(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TTTTCTGTTTTT
SmilChr02G001318 Chr02 NC_080388.1:24500935-24500946promoter 内 419-430 bp + 3571 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 24504517-24509144(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 AAGAACAGAGTT
SmilChr01G001269 Chr01 NC_080387.1:25362143-25362154promoter 内 397-408 bp - 3593 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 25365747-25366130(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TATTCTGTTTTG
SmilChr02G004393 Chr02 NC_080388.1:66277049-66277060promoter 内 337-348 bp - 3653 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 66266627-66273396(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 AAAAACAGAAAA
SmilChr02G004200 Chr02 NC_080388.1:64314089-64314100promoter 内 325-336 bp - 3665 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 64310317-64310424(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 AAAAACAGAAAA
SmilChr01G003040 Chr01 NC_080387.1:49400960-49400971promoter 内 309-320 bp - 3681 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 49384449-49397279(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 CAAAACAGAATA
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SmilChr02G003976 Chr02 NC_080388.1:62019561-62019572promoter 内 159-170 bp + 3831 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 62023403-62027692(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 AAGAACAGAGTT
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SmilChr02G004591 Chr02 NC_080388.1:68419427-68419438promoter 内 3923-3934 bp - 67 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 4 68405219-68419360(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 GAATACAGAGCA
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