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转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family，查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中，并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因，不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif；应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引，可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card，点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
SmilChr04G003117 XP_057809539.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr04G003114 XP_057809538.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr01G005298 XP_057788621.1
ARR-B 1
MP00010
 8344 9778 查靶基因
SmilChr03G003924 XP_057798851.1
NAC 1
MP00059
 8333 9940 查靶基因
SmilChr01G005344 XP_057788686.1
MYB 1
MP00296
 8304 9873 查靶基因
SmilChr08G004408 XP_057780613.1
MYB 1
MP00114
 8151 9897 查靶基因
SmilChr04G001094 XP_057804404.1
WRKY 1
MP00408
 8149 9902 查靶基因
SmilChr07G003597 XP_057773587.1
Nin-like 1
MP00449
 8096 9453 查靶基因
SmilChr02G005433 XP_057792682.1
WRKY 1
MP00209
 8083 9910 查靶基因
SmilChr04G004136 XP_057806072.1
MYB 1
MP00627
 8075 9835 查靶基因
SmilChr01G003955 XP_057779712.1
WRKY 1
MP00450
 8044 9901 查靶基因
SmilChr03G003685 XP_057798538.1
ERF 1
MP00558
 8044 9762 查靶基因
SmilChr07G002937 XP_057777490.1
MIKC_MADS 1
MP00096
 8019 9914 查靶基因
SmilChr02G003833 XP_057794421.1
MYB 1
MP00476
 7981 9904 查靶基因
SmilChr07G002803 XP_057777238.1
NAC 1
MP00221
 7965 9903 查靶基因
SmilChr05G002364 XP_057809766.1
WRKY 1
MP00069
 7882 9917 查靶基因
SmilChr08G003267 XP_057779249.1
MYB 1
MP00406
 7839 9917 查靶基因
SmilChr02G005012 XP_057792191.1
TALE 1
MP00670
 7758 9906 查靶基因
SmilChr07G001978 XP_057776996.1
SBP 1
MP00555
 7648 9805 查靶基因
SmilChr05G000741 XP_057764423.1
ARF 1
MP00021
 7629 9812 查靶基因
SmilChr01G004579 XP_057787263.1
MYB 1
MP00132
 7583 9926 查靶基因
SmilChr05G000593 XP_057764223.1
MIKC_MADS 1
MP00609
 7575 9941 查靶基因
SmilChr03G004518 XP_057799834.1
ERF 1
MP00529
 7559 9247 查靶基因
SmilChr06G001829 XP_057766988.1
MYB 1
MP00510
 7526 9799 查靶基因
SmilChr05G000830 XP_057764550.1
NAC 1
MP00058
 7440 9855 查靶基因
SmilChr08G002543 XP_057778423.1
bZIP 1
MP00303
 7416 9868 查靶基因
SmilChr01G002743 XP_057765725.1
MYB_related 1
MP00565
 7412 9785 查靶基因
SmilChr04G002704 XP_057807081.1
ERF 1
MP00026
 7408 9854 查靶基因
SmilChr05G001395 XP_057765344.1
WRKY 1
MP00071
 7408 9764 查靶基因
SmilChr04G002953 XP_057809314.1
ARF 1
MP00033
 7406 9827 查靶基因
SmilChr01G004199 XP_057782208.1
bHLH 1
MP00074
 7396 9969 查靶基因
SmilChr05G004009 XP_057810662.1
MYB 1
MP00216
 7342 9832 查靶基因
SmilChr03G001606 XP_057802772.1
WRKY 1
MP00539
 7338 9848 查靶基因
SmilChr02G004600 XP_057791481.1
ARF 1
MP00574
 7302 9846 查靶基因
SmilChr03G004179 XP_057799230.1
WRKY 1
MP00464
 7299 9864 查靶基因
SmilChr04G003805 XP_057805691.1
MIKC_MADS 1
MP00315
 7291 9567 查靶基因
SmilChr03G003761 XP_057798625.1
WRKY 1
MP00525
 7235 9838 查靶基因
SmilChr01G001885 XP_057806790.1
WRKY 1
MP00171
 7182 9833 查靶基因
SmilChr05G004392 XP_057811204.1
WRKY 1
MP00506
 7173 9818 查靶基因
SmilChr04G002757 XP_057807158.1
MIKC_MADS 1
MP00272
 7172 9889 查靶基因
SmilChr01G003404 XP_057773670.1
bZIP 1
MP00184
 7147 9840 查靶基因
SmilChr03G002335 XP_057801256.1
bZIP 1
MP00647
 7133 9953 查靶基因
SmilChr07G002075 XP_057773918.1
C2H2 1
MP00485
 7130 8059 查靶基因
SmilChr04G000162 XP_057807467.1
MYB 1
MP00134
 7078 8676 查靶基因
SmilChr04G000040 XP_057808382.1
ERF 1
MP00312
 7006 8490 查靶基因
SmilChr08G001896 XP_057783815.1
MYB 1
MP00564
 6984 9893 查靶基因
SmilChr02G005217 XP_057792502.1
G2-like 1
MP00022
 6959 9720 查靶基因
SmilChr05G000260 XP_057763683.1
bZIP 1
MP00040
 6920 9919 查靶基因
SmilChr01G002885 XP_057767601.1
ERF 1
MP00151
 6907 9976 查靶基因
SmilChr05G001518 XP_057765511.1
WRKY 1
MP00455
 6900 9792 查靶基因
SmilChr03G002503 XP_057801356.1
MYB 1
MP00482
 6899 8940 查靶基因
SmilChr03G001252 XP_057802461.1
bZIP 1
MP00291
 6894 9321 查靶基因
SmilChr06G001365 XP_057768799.1
SBP 1
MP00307
 6893 9755 查靶基因
SmilChr03G003439 XP_057798243.1
bHLH 1
MP00195
 6878 9832 查靶基因
SmilChr06G001111 XP_057768512.1
MYB 1
MP00388
 6870 9774 查靶基因
SmilChr02G000949 XP_057795176.1
bZIP 1
MP00318
 6849 9413 查靶基因
SmilChr01G000025 XP_057790305.1
SBP 1
MP00633
 6833 8026 查靶基因
SmilChr01G004313 XP_057783598.1
bHLH 1
MP00308
 6805 9826 查靶基因
SmilChr02G005502 XP_057792768.1
bHLH 1
MP00082
 6784 9435 查靶基因
SmilChr03G004274 XP_057799397.1
MIKC_MADS 1
MP00080
 6766 9850 查靶基因
SmilChr02G003688 XP_057794248.1
MYB 1
MP00028
 6764 9024 查靶基因
SmilChr04G003367 XP_057804957.1
MYB 1
MP00191
 6736 9690 查靶基因
SmilChr04G000157 XP_057807462.1
bHLH 1
MP00081
 6729 9942 查靶基因
SmilChr07G002147 XP_057774045.1
MYB 1
MP00500
 6697 9681 查靶基因
SmilChr05G002277 XP_057809665.1
ERF 1
MP00452
 6671 7783 查靶基因
SmilChr07G004480 XP_057776222.1
WRKY 1
MP00531
 6663 9784 查靶基因
SmilChr02G004447 XP_057797242.1
HD-ZIP 1
MP00200
 6661 9930 查靶基因
SmilChr04G000070 XP_057807324.1
bHLH 1
MP00034
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G002039 XP_057808459.1
bHLH 1
MP00660
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G005851 XP_057789306.1
MYB 1
MP00055
 6638 9685 查靶基因
SmilChr02G005238 XP_057792594.1
SBP 1
MP00634
 6619 7771 查靶基因
SmilChr06G002048 XP_057770293.1
bHLH 1
MP00035
 6618 9903 查靶基因
SmilChr07G000836 XP_057772437.1
MYB_related 1
MP00568
 6611 9696 查靶基因
SmilChr04G003119 XP_057809542.1
bZIP 1
MP00039
 6610 9936 查靶基因
SmilChr01G004114 XP_057781125.1
WRKY 1
MP00284
 6552 9774 查靶基因
SmilChr08G004246 XP_057780410.1
WRKY 1
MP00422
 6535 9791 查靶基因
SmilChr05G001980 XP_057766076.1
ARF 1
MP00153
 6534 9706 查靶基因
SmilChr04G000094 XP_057807365.1
YABBY 1
MP00620
 6504 9844 查靶基因
SmilChr02G002534 XP_057797741.1
TCP 1
MP00169
 6498 7295 查靶基因
SmilChr05G001269 XP_057765199.1
G2-like 1
MP00252
 6478 9780 查靶基因
SmilChr07G003441 XP_057773618.1
NAC 1
MP00108
 6458 9810 查靶基因
SmilChr02G001791 XP_057795933.1
TCP 1
MP00062
 6454 7249 查靶基因
SmilChr05G003285 XP_057810127.1
RAV 1
MP00024
 6450 9853 查靶基因
SmilChr05G000619 XP_057764205.1
WRKY 1
MP00167
 6439 9756 查靶基因
SmilChr04G003745 XP_057809144.1
C2H2 1
MP00416
 6433 9716 查靶基因
SmilChr02G004607 XP_057791470.1
C2H2 1
MP00608
 6398 9817 查靶基因
SmilChr02G003399 XP_057793859.1
ERF 1
MP00240
 6368 9978 查靶基因
SmilChr01G004920 XP_057788125.1
MYB_related 1
MP00607
 6362 9718 查靶基因
SmilChr06G001059 XP_057768449.1
Dof 1
MP00402
 6278 9875 查靶基因
SmilChr01G004552 XP_057786668.1
bZIP 1
MP00409
 6252 8429 查靶基因
SmilChr01G006187 XP_057798078.1
GRAS 1
MP00611
 6232 9807 查靶基因
SmilChr01G001516 XP_057803325.1
bZIP 1
MP00648
 6170 9939 查靶基因
SmilChr04G003955 XP_057805828.1
ERF 1
MP00120
 6144 7514 查靶基因
SmilChr01G004708 XP_057787833.1
WRKY 1
MP00251
 6140 9713 查靶基因
SmilChr05G001961 XP_057766054.1
MIKC_MADS 1
MP00077
 6125 9815 查靶基因
SmilChr08G000478 XP_057781809.1
GATA 1
MP00130
 6015 9821 查靶基因
SmilChr01G000943 XP_057790035.1
MIKC_MADS 1
MP00508
 5979 7481 查靶基因
SmilChr05G004106 XP_057810779.1
WRKY 1
MP00260
 5932 9706 查靶基因
SmilChr04G003973 XP_057805857.1
HD-ZIP 1
MP00013
 5927 9712 查靶基因
SmilChr03G002207 XP_057801109.1
WRKY 1
MP00299
 5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr01G004199; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00010571-RA_Salv SmilChr01G004199 bHLH XP_057782208.1 MP00074 AGAAGGTCACGTGG

可能结合的靶基因

9969 个结合位点 7396 个候选靶基因 第 63 / 148 下载 TSV

上一页 63 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr02G001208 Chr02 NC_080388.1:22249554-22249567promoter 内 3770-3783 bp - 218 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 22245375-22249336(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 GAAAACACACGTGG
SmilChr05G000962 Chr05 NC_080391.1:7766246-7766259promoter 内 3740-3753 bp - 248 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 7766507-7769940(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGCTCCTCG
SmilChr02G003833 Chr02 NC_080388.1:59976137-59976150promoter 内 3679-3692 bp - 309 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 59974151-59975828(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 TAACCGACACGTGG
SmilChr07G000408 Chr07 NC_080393.1:2817369-2817382promoter 内 3661-3674 bp + 327 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 2813666-2817042(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGTACTTTC
SmilChr05G002340 Chr05 NC_080391.1:25354023-25354036promoter 内 3591-3604 bp - 397 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 25354433-25360443(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGTGTTTTC
SmilChr01G004433 Chr01 NC_080387.1:62424996-62425009promoter 内 3590-3603 bp - 398 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 62425407-62433090(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGCACCGAA
SmilChr03G000978 Chr03 NC_080389.1:11063618-11063631promoter 内 3557-3570 bp - 431 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 11064062-11066677(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 GCACGTGAGGTGAA
SmilChr07G002832 Chr07 NC_080393.1:28376413-28376426promoter 内 3445-3458 bp - 543 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 28376969-28379671(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGTGTTTTC
SmilChr07G001872 Chr07 NC_080393.1:16197957-16197970promoter 内 3308-3321 bp + 680 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 16198650-16205594(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 GACCCCACACGTGG
SmilChr05G000257 Chr05 NC_080391.1:1975991-1976004promoter 内 3294-3307 bp - 694 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 1971415-1975297(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 AATCGGACACGTGG
SmilChr05G001605 Chr05 NC_080391.1:14796827-14796840promoter 内 3183-3196 bp + 805 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 14795008-14796022(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGAAACCAT
SmilChr07G003996 Chr07 NC_080393.1:51008341-51008354promoter 内 3166-3179 bp - 822 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 51006099-51007519(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 AGTATCCCACGTGG
SmilChr05G001079 Chr05 NC_080391.1:8976503-8976516promoter 内 2920-2933 bp + 1068 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 8974888-8975435(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGGAGCACA
SmilChr07G001212 Chr07 NC_080393.1:9264349-9264362promoter 内 2797-2810 bp - 1191 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 9265553-9267723(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 GCACGTGATTTGCC
SmilChr07G002040 Chr07 NC_080393.1:18516858-18516871promoter 内 2563-2576 bp + 1425 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 18511461-18515433(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGTCATATA
SmilChr02G003158 Chr02 NC_080388.1:52619315-52619328promoter 内 2518-2531 bp - 1470 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 52616406-52617845(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 TTGACTTCACGTGG
SmilChr01G003480 Chr01 NC_080387.1:53360095-53360108promoter 内 2408-2421 bp - 1580 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 53356289-53358515(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 GGTCACTCACGTGG
SmilChr07G004655 Chr07 NC_080393.1:59427203-59427216promoter 内 2395-2408 bp - 1593 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 59422563-59425610(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 AAAGGCTCACGTGC
SmilChr01G001195 Chr01 NC_080387.1:24101528-24101541promoter 内 2297-2310 bp + 1691 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 24097390-24099837(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGTATTGAC
SmilChr02G002732 Chr02 NC_080388.1:47237948-47237961promoter 内 2068-2081 bp - 1920 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 47232592-47236028(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 AAGGTCGCACGTGG
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SmilChr01G004762 Chr01 NC_080387.1:65801176-65801189promoter 内 1582-1595 bp - 2406 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 65797080-65798770(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 TGAAGAACACGTGG
SmilChr08G001033 Chr08 NC_080394.1:7863017-7863030promoter 内 1453-1466 bp - 2535 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 7859726-7860482(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 GTCAATACACGTGG
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SmilChr01G004919 Chr01 NC_080387.1:67274242-67274255promoter 内 1248-1261 bp + 2740 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 67276995-67278442(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CTTGGGTCACGTGT
SmilChr01G002937 Chr01 NC_080387.1:48146453-48146466promoter 内 906-919 bp - 3082 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 48149548-48151258(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGTCTATTC
SmilChr03G001788 Chr03 NC_080389.1:24428119-24428132promoter 内 756-769 bp - 3232 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 24422338-24424887(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 GGACTCGCACGTGG
SmilChr06G002914 Chr06 NC_080392.1:42008837-42008850promoter 内 568-581 bp - 3420 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 42002592-42005417(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 GGCTGTTCACGTGC
SmilChr04G000769 Chr04 NC_080390.1:9426444-9426457promoter 内 488-501 bp + 3500 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 9429957-9431777(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 TGATTGTCACGTGC
SmilChr01G005583 Chr01 NC_080387.1:72531929-72531942promoter 内 445-458 bp + 3543 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 72527807-72528386(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGTATTGAC
SmilChr07G003995 Chr07 NC_080393.1:51008341-51008354promoter 内 423-436 bp - 3565 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 51002214-51004776(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 AGTATCCCACGTGG
SmilChr07G003783 Chr07 NC_080393.1:46426887-46426900promoter 内 396-409 bp + 3592 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 46422345-46423295(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGTGTTTTC
SmilChr07G002042 Chr07 NC_080393.1:18516858-18516871promoter 内 332-345 bp + 3656 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 18520527-18524903(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 TATATGACACGTGG
SmilChr02G001209 Chr02 NC_080388.1:22249554-22249567promoter 内 297-310 bp - 3691 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 22253258-22253737(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGTGTTTTC
SmilChr03G002107 Chr03 NC_080389.1:32779804-32779817promoter 内 1681-1694 bp + 2307 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 4 32774926-32777497(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 ACACGTGATCCTCC
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SmilChr01G003597 Chr01 NC_080387.1:54518509-54518522promoter 内 1597-1610 bp - 2391 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 3 54520913-54523342(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGGAATCCA
SmilChr05G003153 Chr05 NC_080391.1:40278580-40278593promoter 内 750-763 bp + 3238 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 3 40272717-40275342(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 TCACGTGACTCGTG
SmilChr05G003280 Chr05 NC_080391.1:42732766-42732779promoter 内 3984-3997 bp - 4 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 2 42728929-42732762(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 TAGGTGTCACGTGT
SmilChr05G004396 Chr05 NC_080391.1:57388506-57388519promoter 内 3698-3711 bp - 290 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 2 57388809-57390341(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 TCACGTGAACCTCT
SmilChr06G000699 Chr06 NC_080392.1:6221349-6221362promoter 内 2626-2639 bp + 1362 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 2 6216183-6219987(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGGGATCAT
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SmilChr05G002438 Chr05 NC_080391.1:26882975-26882988promoter 内 1984-1997 bp + 2004 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 2 26878994-26880971(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGGACTCAT
SmilChr01G001833 Chr01 NC_080387.1:33285542-33285555promoter 内 1805-1818 bp - 2183 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 2 33278872-33283359(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 TGTGGAACACGTGG
SmilChr06G000152 Chr06 NC_080392.1:1069978-1069991promoter 内 1721-1734 bp + 2267 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 2 1062496-1067711(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 GCACGTGACTATCA