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转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family，查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中，并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因，不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif；应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引，可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card，点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
SmilChr04G003117 XP_057809539.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr04G003114 XP_057809538.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr01G005298 XP_057788621.1
ARR-B 1
MP00010
 8344 9778 查靶基因
SmilChr03G003924 XP_057798851.1
NAC 1
MP00059
 8333 9940 查靶基因
SmilChr01G005344 XP_057788686.1
MYB 1
MP00296
 8304 9873 查靶基因
SmilChr08G004408 XP_057780613.1
MYB 1
MP00114
 8151 9897 查靶基因
SmilChr04G001094 XP_057804404.1
WRKY 1
MP00408
 8149 9902 查靶基因
SmilChr07G003597 XP_057773587.1
Nin-like 1
MP00449
 8096 9453 查靶基因
SmilChr02G005433 XP_057792682.1
WRKY 1
MP00209
 8083 9910 查靶基因
SmilChr04G004136 XP_057806072.1
MYB 1
MP00627
 8075 9835 查靶基因
SmilChr01G003955 XP_057779712.1
WRKY 1
MP00450
 8044 9901 查靶基因
SmilChr03G003685 XP_057798538.1
ERF 1
MP00558
 8044 9762 查靶基因
SmilChr07G002937 XP_057777490.1
MIKC_MADS 1
MP00096
 8019 9914 查靶基因
SmilChr02G003833 XP_057794421.1
MYB 1
MP00476
 7981 9904 查靶基因
SmilChr07G002803 XP_057777238.1
NAC 1
MP00221
 7965 9903 查靶基因
SmilChr05G002364 XP_057809766.1
WRKY 1
MP00069
 7882 9917 查靶基因
SmilChr08G003267 XP_057779249.1
MYB 1
MP00406
 7839 9917 查靶基因
SmilChr02G005012 XP_057792191.1
TALE 1
MP00670
 7758 9906 查靶基因
SmilChr07G001978 XP_057776996.1
SBP 1
MP00555
 7648 9805 查靶基因
SmilChr05G000741 XP_057764423.1
ARF 1
MP00021
 7629 9812 查靶基因
SmilChr01G004579 XP_057787263.1
MYB 1
MP00132
 7583 9926 查靶基因
SmilChr05G000593 XP_057764223.1
MIKC_MADS 1
MP00609
 7575 9941 查靶基因
SmilChr03G004518 XP_057799834.1
ERF 1
MP00529
 7559 9247 查靶基因
SmilChr06G001829 XP_057766988.1
MYB 1
MP00510
 7526 9799 查靶基因
SmilChr05G000830 XP_057764550.1
NAC 1
MP00058
 7440 9855 查靶基因
SmilChr08G002543 XP_057778423.1
bZIP 1
MP00303
 7416 9868 查靶基因
SmilChr01G002743 XP_057765725.1
MYB_related 1
MP00565
 7412 9785 查靶基因
SmilChr04G002704 XP_057807081.1
ERF 1
MP00026
 7408 9854 查靶基因
SmilChr05G001395 XP_057765344.1
WRKY 1
MP00071
 7408 9764 查靶基因
SmilChr04G002953 XP_057809314.1
ARF 1
MP00033
 7406 9827 查靶基因
SmilChr01G004199 XP_057782208.1
bHLH 1
MP00074
 7396 9969 查靶基因
SmilChr05G004009 XP_057810662.1
MYB 1
MP00216
 7342 9832 查靶基因
SmilChr03G001606 XP_057802772.1
WRKY 1
MP00539
 7338 9848 查靶基因
SmilChr02G004600 XP_057791481.1
ARF 1
MP00574
 7302 9846 查靶基因
SmilChr03G004179 XP_057799230.1
WRKY 1
MP00464
 7299 9864 查靶基因
SmilChr04G003805 XP_057805691.1
MIKC_MADS 1
MP00315
 7291 9567 查靶基因
SmilChr03G003761 XP_057798625.1
WRKY 1
MP00525
 7235 9838 查靶基因
SmilChr01G001885 XP_057806790.1
WRKY 1
MP00171
 7182 9833 查靶基因
SmilChr05G004392 XP_057811204.1
WRKY 1
MP00506
 7173 9818 查靶基因
SmilChr04G002757 XP_057807158.1
MIKC_MADS 1
MP00272
 7172 9889 查靶基因
SmilChr01G003404 XP_057773670.1
bZIP 1
MP00184
 7147 9840 查靶基因
SmilChr03G002335 XP_057801256.1
bZIP 1
MP00647
 7133 9953 查靶基因
SmilChr07G002075 XP_057773918.1
C2H2 1
MP00485
 7130 8059 查靶基因
SmilChr04G000162 XP_057807467.1
MYB 1
MP00134
 7078 8676 查靶基因
SmilChr04G000040 XP_057808382.1
ERF 1
MP00312
 7006 8490 查靶基因
SmilChr08G001896 XP_057783815.1
MYB 1
MP00564
 6984 9893 查靶基因
SmilChr02G005217 XP_057792502.1
G2-like 1
MP00022
 6959 9720 查靶基因
SmilChr05G000260 XP_057763683.1
bZIP 1
MP00040
 6920 9919 查靶基因
SmilChr01G002885 XP_057767601.1
ERF 1
MP00151
 6907 9976 查靶基因
SmilChr05G001518 XP_057765511.1
WRKY 1
MP00455
 6900 9792 查靶基因
SmilChr03G002503 XP_057801356.1
MYB 1
MP00482
 6899 8940 查靶基因
SmilChr03G001252 XP_057802461.1
bZIP 1
MP00291
 6894 9321 查靶基因
SmilChr06G001365 XP_057768799.1
SBP 1
MP00307
 6893 9755 查靶基因
SmilChr03G003439 XP_057798243.1
bHLH 1
MP00195
 6878 9832 查靶基因
SmilChr06G001111 XP_057768512.1
MYB 1
MP00388
 6870 9774 查靶基因
SmilChr02G000949 XP_057795176.1
bZIP 1
MP00318
 6849 9413 查靶基因
SmilChr01G000025 XP_057790305.1
SBP 1
MP00633
 6833 8026 查靶基因
SmilChr01G004313 XP_057783598.1
bHLH 1
MP00308
 6805 9826 查靶基因
SmilChr02G005502 XP_057792768.1
bHLH 1
MP00082
 6784 9435 查靶基因
SmilChr03G004274 XP_057799397.1
MIKC_MADS 1
MP00080
 6766 9850 查靶基因
SmilChr02G003688 XP_057794248.1
MYB 1
MP00028
 6764 9024 查靶基因
SmilChr04G003367 XP_057804957.1
MYB 1
MP00191
 6736 9690 查靶基因
SmilChr04G000157 XP_057807462.1
bHLH 1
MP00081
 6729 9942 查靶基因
SmilChr07G002147 XP_057774045.1
MYB 1
MP00500
 6697 9681 查靶基因
SmilChr05G002277 XP_057809665.1
ERF 1
MP00452
 6671 7783 查靶基因
SmilChr07G004480 XP_057776222.1
WRKY 1
MP00531
 6663 9784 查靶基因
SmilChr02G004447 XP_057797242.1
HD-ZIP 1
MP00200
 6661 9930 查靶基因
SmilChr04G000070 XP_057807324.1
bHLH 1
MP00034
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G002039 XP_057808459.1
bHLH 1
MP00660
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G005851 XP_057789306.1
MYB 1
MP00055
 6638 9685 查靶基因
SmilChr02G005238 XP_057792594.1
SBP 1
MP00634
 6619 7771 查靶基因
SmilChr06G002048 XP_057770293.1
bHLH 1
MP00035
 6618 9903 查靶基因
SmilChr07G000836 XP_057772437.1
MYB_related 1
MP00568
 6611 9696 查靶基因
SmilChr04G003119 XP_057809542.1
bZIP 1
MP00039
 6610 9936 查靶基因
SmilChr01G004114 XP_057781125.1
WRKY 1
MP00284
 6552 9774 查靶基因
SmilChr08G004246 XP_057780410.1
WRKY 1
MP00422
 6535 9791 查靶基因
SmilChr05G001980 XP_057766076.1
ARF 1
MP00153
 6534 9706 查靶基因
SmilChr04G000094 XP_057807365.1
YABBY 1
MP00620
 6504 9844 查靶基因
SmilChr02G002534 XP_057797741.1
TCP 1
MP00169
 6498 7295 查靶基因
SmilChr05G001269 XP_057765199.1
G2-like 1
MP00252
 6478 9780 查靶基因
SmilChr07G003441 XP_057773618.1
NAC 1
MP00108
 6458 9810 查靶基因
SmilChr02G001791 XP_057795933.1
TCP 1
MP00062
 6454 7249 查靶基因
SmilChr05G003285 XP_057810127.1
RAV 1
MP00024
 6450 9853 查靶基因
SmilChr05G000619 XP_057764205.1
WRKY 1
MP00167
 6439 9756 查靶基因
SmilChr04G003745 XP_057809144.1
C2H2 1
MP00416
 6433 9716 查靶基因
SmilChr02G004607 XP_057791470.1
C2H2 1
MP00608
 6398 9817 查靶基因
SmilChr02G003399 XP_057793859.1
ERF 1
MP00240
 6368 9978 查靶基因
SmilChr01G004920 XP_057788125.1
MYB_related 1
MP00607
 6362 9718 查靶基因
SmilChr06G001059 XP_057768449.1
Dof 1
MP00402
 6278 9875 查靶基因
SmilChr01G004552 XP_057786668.1
bZIP 1
MP00409
 6252 8429 查靶基因
SmilChr01G006187 XP_057798078.1
GRAS 1
MP00611
 6232 9807 查靶基因
SmilChr01G001516 XP_057803325.1
bZIP 1
MP00648
 6170 9939 查靶基因
SmilChr04G003955 XP_057805828.1
ERF 1
MP00120
 6144 7514 查靶基因
SmilChr01G004708 XP_057787833.1
WRKY 1
MP00251
 6140 9713 查靶基因
SmilChr05G001961 XP_057766054.1
MIKC_MADS 1
MP00077
 6125 9815 查靶基因
SmilChr08G000478 XP_057781809.1
GATA 1
MP00130
 6015 9821 查靶基因
SmilChr01G000943 XP_057790035.1
MIKC_MADS 1
MP00508
 5979 7481 查靶基因
SmilChr05G004106 XP_057810779.1
WRKY 1
MP00260
 5932 9706 查靶基因
SmilChr04G003973 XP_057805857.1
HD-ZIP 1
MP00013
 5927 9712 查靶基因
SmilChr03G002207 XP_057801109.1
WRKY 1
MP00299
 5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr04G003973; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00011986-RA_Salv SmilChr04G003973 HD-ZIP XP_057805857.1 MP00013 TAATGATTGG

可能结合的靶基因

9712 个结合位点 5927 个候选靶基因 第 65 / 119 下载 TSV

上一页 65 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr01G004099 Chr01 NC_080387.1:59452039-59452048promoter 内 1918-1927 bp + 2074 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 59454122-59456655(+) SMil_00011986-RA_Salv MP00013 AAATGATTGC
SmilChr01G001991 Chr01 NC_080387.1:35318071-35318080promoter 内 1913-1922 bp + 2079 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 35320159-35325141(+) SMil_00011986-RA_Salv MP00013 AAATGATTGC
SmilChr02G003625 Chr02 NC_080388.1:57574031-57574040promoter 内 1864-1873 bp - 2128 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 57570021-57571903(-) SMil_00011986-RA_Salv MP00013 AAATGATTGC
SmilChr01G005568 Chr01 NC_080387.1:72470427-72470436promoter 内 1829-1838 bp + 2163 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 72465758-72468264(-) SMil_00011986-RA_Salv MP00013 GCAATCATTT
SmilChr02G002239 Chr02 NC_080388.1:39734115-39734124promoter 内 1792-1801 bp + 2200 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 39736324-39742802(+) SMil_00011986-RA_Salv MP00013 AAATGATTGC
SmilChr01G003614 Chr01 NC_080387.1:54679472-54679481promoter 内 1693-1702 bp + 2299 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 54681780-54685540(+) SMil_00011986-RA_Salv MP00013 AAATGATTGC
SmilChr02G002991 Chr02 NC_080388.1:50580085-50580094promoter 内 1461-1470 bp - 2531 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 50574042-50577554(-) SMil_00011986-RA_Salv MP00013 AAATGATTGC
SmilChr01G001137 Chr01 NC_080387.1:23163395-23163404promoter 内 1363-1372 bp - 2629 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 23166033-23167776(+) SMil_00011986-RA_Salv MP00013 GCAATCATTT
SmilChr01G005211 Chr01 NC_080387.1:69741454-69741463promoter 内 1344-1353 bp + 2648 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 69738297-69738806(-) SMil_00011986-RA_Salv MP00013 GCAATCATTT
SmilChr01G005616 Chr01 NC_080387.1:72675683-72675692promoter 内 1344-1353 bp - 2648 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 72672952-72673035(-) SMil_00011986-RA_Salv MP00013 AAATGATTGC
SmilChr01G004218 Chr01 NC_080387.1:60569291-60569300promoter 内 1340-1349 bp - 2652 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 60571952-60575509(+) SMil_00011986-RA_Salv MP00013 GCAATCATTT
SmilChr01G003867 Chr01 NC_080387.1:56919504-56919513promoter 内 1178-1187 bp + 2814 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 56913994-56916690(-) SMil_00011986-RA_Salv MP00013 GCAATCATTT
SmilChr01G006193 Chr01 NC_080387.1:77545839-77545848promoter 内 912-921 bp - 3080 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 77540519-77542759(-) SMil_00011986-RA_Salv MP00013 AAATGATTGC
SmilChr02G003418 Chr02 NC_080388.1:55412252-55412261promoter 内 819-828 bp - 3173 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 55406754-55409079(-) SMil_00011986-RA_Salv MP00013 AAATGATTGC
SmilChr01G005389 Chr01 NC_080387.1:71176316-71176325promoter 内 792-801 bp + 3200 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 71179525-71182556(+) SMil_00011986-RA_Salv MP00013 AAATGATTGC
SmilChr02G002210 Chr02 NC_080388.1:39349911-39349920promoter 内 786-795 bp + 3206 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 39353126-39355654(+) SMil_00011986-RA_Salv MP00013 AAATGATTGC
SmilChr02G000074 Chr02 NC_080388.1:952021-952030promoter 内 743-752 bp - 3249 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 945915-948772(-) SMil_00011986-RA_Salv MP00013 AAATGATTGC
SmilChr02G000565 Chr02 NC_080388.1:7959200-7959209promoter 内 698-707 bp + 3294 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 7962503-7964742(+) SMil_00011986-RA_Salv MP00013 AAATGATTGC
SmilChr01G006179 Chr01 NC_080387.1:77332313-77332322promoter 内 674-683 bp - 3318 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 77323374-77328995(-) SMil_00011986-RA_Salv MP00013 AAATGATTGC
SmilChr01G004742 Chr01 NC_080387.1:65613145-65613154promoter 内 667-676 bp - 3325 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 65603892-65609820(-) SMil_00011986-RA_Salv MP00013 AAATGATTGC
SmilChr01G005754 Chr01 NC_080387.1:73642770-73642779promoter 内 626-635 bp - 3366 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 73631093-73639404(-) SMil_00011986-RA_Salv MP00013 AAATGATTGC
SmilChr02G002000 Chr02 NC_080388.1:36162505-36162514promoter 内 486-495 bp - 3506 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 36158124-36158999(-) SMil_00011986-RA_Salv MP00013 AAATGATTGC
SmilChr01G003807 Chr01 NC_080387.1:56446394-56446403promoter 内 462-471 bp - 3530 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 56449933-56452544(+) SMil_00011986-RA_Salv MP00013 GCAATCATTT
SmilChr02G001964 Chr02 NC_080388.1:35450139-35450148promoter 内 446-455 bp - 3546 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 35453694-35454591(+) SMil_00011986-RA_Salv MP00013 GCAATCATTT
SmilChr01G004763 Chr01 NC_080387.1:65807089-65807098promoter 内 410-419 bp + 3582 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 65799425-65803507(-) SMil_00011986-RA_Salv MP00013 GCAATCATTT
SmilChr02G000412 Chr02 NC_080388.1:5245683-5245692promoter 内 331-340 bp - 3661 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 5239474-5242022(-) SMil_00011986-RA_Salv MP00013 AAATGATTGC
SmilChr01G000949 Chr01 NC_080387.1:20119358-20119367promoter 内 280-289 bp + 3712 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 20107984-20115646(-) SMil_00011986-RA_Salv MP00013 GCAATCATTT
SmilChr01G004752 Chr01 NC_080387.1:65695977-65695986promoter 内 169-178 bp - 3823 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 65687230-65692154(-) SMil_00011986-RA_Salv MP00013 AAATGATTGC
SmilChr01G005621 Chr01 NC_080387.1:72700476-72700485promoter 内 713-722 bp - 3279 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 6 72703764-72706336(+) SMil_00011986-RA_Salv MP00013 TCAATCATGG
SmilChr01G002129 Chr01 NC_080387.1:37297016-37297025promoter 内 3483-3492 bp - 509 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 5 37297534-37299100(+) SMil_00011986-RA_Salv MP00013 TCAATCATGA
SmilChr02G000266 Chr02 NC_080388.1:3436775-3436784promoter 内 2890-2899 bp + 1102 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 4 3437886-3447368(+) SMil_00011986-RA_Salv MP00013 CCATGATTGA
SmilChr02G000684 Chr02 NC_080388.1:10812053-10812062promoter 内 2876-2885 bp - 1116 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 4 10813178-10815951(+) SMil_00011986-RA_Salv MP00013 TCAATCATGA
SmilChr01G001299 Chr01 NC_080387.1:25857964-25857973promoter 内 2453-2462 bp + 1539 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 4 25859512-25865599(+) SMil_00011986-RA_Salv MP00013 TCATGATTGA
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SmilChr01G005131 Chr01 NC_080387.1:69105570-69105579promoter 内 942-951 bp + 3050 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 4 69108629-69110085(+) SMil_00011986-RA_Salv MP00013 TCATGATTGA
SmilChr02G002302 Chr02 NC_080388.1:40614936-40614945promoter 内 839-848 bp + 3153 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 4 40607092-40611783(-) SMil_00011986-RA_Salv MP00013 TCAATCATGA
SmilChr01G004899 Chr01 NC_080387.1:67068890-67068899promoter 内 73-82 bp - 3919 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 4 67057716-67064971(-) SMil_00011986-RA_Salv MP00013 TCATGATTGA
SmilChr01G002310 Chr01 NC_080387.1:40072328-40072337promoter 内 3991-4000 bp + 1 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 3 40072338-40074027(+) SMil_00011986-RA_Salv MP00013 CCATGATTGA
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SmilChr01G004298 Chr01 NC_080387.1:61168438-61168447promoter 内 3654-3663 bp + 338 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 3 61168785-61172798(+) SMil_00011986-RA_Salv MP00013 CCATGATTGA
SmilChr01G000125 Chr01 NC_080387.1:2100057-2100066promoter 内 3647-3656 bp - 345 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 3 2098596-2099712(-) SMil_00011986-RA_Salv MP00013 TACTGATTGG
SmilChr02G002323 Chr02 NC_080388.1:40921552-40921561promoter 内 2856-2865 bp + 1136 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 3 40919547-40920416(-) SMil_00011986-RA_Salv MP00013 TCAATCATGG
SmilChr02G001443 Chr02 NC_080388.1:27115118-27115127promoter 内 2640-2649 bp - 1352 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 3 27111418-27113766(-) SMil_00011986-RA_Salv MP00013 CCATGATTGA
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SmilChr02G002367 Chr02 NC_080388.1:41461801-41461810promoter 内 2320-2329 bp + 1672 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 3 41463482-41465278(+) SMil_00011986-RA_Salv MP00013 CCATGATTGA
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SmilChr01G004308 Chr01 NC_080387.1:61270024-61270033promoter 内 2064-2073 bp + 1928 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 3 61261478-61268096(-) SMil_00011986-RA_Salv MP00013 TCAATCATGA
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SmilChr01G005803 Chr01 NC_080387.1:74095031-74095040promoter 内 1936-1945 bp - 2056 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 3 74097096-74099868(+) SMil_00011986-RA_Salv MP00013 TCAATCATGA