Red Sage Omics 丹参基因组信息平台
首页 基因查询 ID 对照表 功能注释 结构域预测 Pfam 基因组工具 蛋白互作 亚细胞定位 表达量 共表达 同源/共线性 GO/KEGG 注释 TF 结合位点 TF 靶基因 EMS 突变 JBrowse BLAST 下载 关于 帮助
数据资源
ID 对照表 功能注释 功能检索 次生代谢专题 文献证据 结构域预测 Pfam 同源/共线性
分析工具
基因组工具 引物设计 同源重组引物设计 核酸翻译 BLAST 蛋白互作 亚细胞定位 共表达 GO/KEGG 注释 功能检索
调控/突变
TF 结合位点 TF 靶基因 EMS 突变
帮助
关于 帮助 资源与版本
中文 EN

转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family，查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中，并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因，不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif；应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引，可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card，点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
SmilChr04G003117 XP_057809539.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr04G003114 XP_057809538.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr01G005298 XP_057788621.1
ARR-B 1
MP00010
 8344 9778 查靶基因
SmilChr03G003924 XP_057798851.1
NAC 1
MP00059
 8333 9940 查靶基因
SmilChr01G005344 XP_057788686.1
MYB 1
MP00296
 8304 9873 查靶基因
SmilChr08G004408 XP_057780613.1
MYB 1
MP00114
 8151 9897 查靶基因
SmilChr04G001094 XP_057804404.1
WRKY 1
MP00408
 8149 9902 查靶基因
SmilChr07G003597 XP_057773587.1
Nin-like 1
MP00449
 8096 9453 查靶基因
SmilChr02G005433 XP_057792682.1
WRKY 1
MP00209
 8083 9910 查靶基因
SmilChr04G004136 XP_057806072.1
MYB 1
MP00627
 8075 9835 查靶基因
SmilChr01G003955 XP_057779712.1
WRKY 1
MP00450
 8044 9901 查靶基因
SmilChr03G003685 XP_057798538.1
ERF 1
MP00558
 8044 9762 查靶基因
SmilChr07G002937 XP_057777490.1
MIKC_MADS 1
MP00096
 8019 9914 查靶基因
SmilChr02G003833 XP_057794421.1
MYB 1
MP00476
 7981 9904 查靶基因
SmilChr07G002803 XP_057777238.1
NAC 1
MP00221
 7965 9903 查靶基因
SmilChr05G002364 XP_057809766.1
WRKY 1
MP00069
 7882 9917 查靶基因
SmilChr08G003267 XP_057779249.1
MYB 1
MP00406
 7839 9917 查靶基因
SmilChr02G005012 XP_057792191.1
TALE 1
MP00670
 7758 9906 查靶基因
SmilChr07G001978 XP_057776996.1
SBP 1
MP00555
 7648 9805 查靶基因
SmilChr05G000741 XP_057764423.1
ARF 1
MP00021
 7629 9812 查靶基因
SmilChr01G004579 XP_057787263.1
MYB 1
MP00132
 7583 9926 查靶基因
SmilChr05G000593 XP_057764223.1
MIKC_MADS 1
MP00609
 7575 9941 查靶基因
SmilChr03G004518 XP_057799834.1
ERF 1
MP00529
 7559 9247 查靶基因
SmilChr06G001829 XP_057766988.1
MYB 1
MP00510
 7526 9799 查靶基因
SmilChr05G000830 XP_057764550.1
NAC 1
MP00058
 7440 9855 查靶基因
SmilChr08G002543 XP_057778423.1
bZIP 1
MP00303
 7416 9868 查靶基因
SmilChr01G002743 XP_057765725.1
MYB_related 1
MP00565
 7412 9785 查靶基因
SmilChr04G002704 XP_057807081.1
ERF 1
MP00026
 7408 9854 查靶基因
SmilChr05G001395 XP_057765344.1
WRKY 1
MP00071
 7408 9764 查靶基因
SmilChr04G002953 XP_057809314.1
ARF 1
MP00033
 7406 9827 查靶基因
SmilChr01G004199 XP_057782208.1
bHLH 1
MP00074
 7396 9969 查靶基因
SmilChr05G004009 XP_057810662.1
MYB 1
MP00216
 7342 9832 查靶基因
SmilChr03G001606 XP_057802772.1
WRKY 1
MP00539
 7338 9848 查靶基因
SmilChr02G004600 XP_057791481.1
ARF 1
MP00574
 7302 9846 查靶基因
SmilChr03G004179 XP_057799230.1
WRKY 1
MP00464
 7299 9864 查靶基因
SmilChr04G003805 XP_057805691.1
MIKC_MADS 1
MP00315
 7291 9567 查靶基因
SmilChr03G003761 XP_057798625.1
WRKY 1
MP00525
 7235 9838 查靶基因
SmilChr01G001885 XP_057806790.1
WRKY 1
MP00171
 7182 9833 查靶基因
SmilChr05G004392 XP_057811204.1
WRKY 1
MP00506
 7173 9818 查靶基因
SmilChr04G002757 XP_057807158.1
MIKC_MADS 1
MP00272
 7172 9889 查靶基因
SmilChr01G003404 XP_057773670.1
bZIP 1
MP00184
 7147 9840 查靶基因
SmilChr03G002335 XP_057801256.1
bZIP 1
MP00647
 7133 9953 查靶基因
SmilChr07G002075 XP_057773918.1
C2H2 1
MP00485
 7130 8059 查靶基因
SmilChr04G000162 XP_057807467.1
MYB 1
MP00134
 7078 8676 查靶基因
SmilChr04G000040 XP_057808382.1
ERF 1
MP00312
 7006 8490 查靶基因
SmilChr08G001896 XP_057783815.1
MYB 1
MP00564
 6984 9893 查靶基因
SmilChr02G005217 XP_057792502.1
G2-like 1
MP00022
 6959 9720 查靶基因
SmilChr05G000260 XP_057763683.1
bZIP 1
MP00040
 6920 9919 查靶基因
SmilChr01G002885 XP_057767601.1
ERF 1
MP00151
 6907 9976 查靶基因
SmilChr05G001518 XP_057765511.1
WRKY 1
MP00455
 6900 9792 查靶基因
SmilChr03G002503 XP_057801356.1
MYB 1
MP00482
 6899 8940 查靶基因
SmilChr03G001252 XP_057802461.1
bZIP 1
MP00291
 6894 9321 查靶基因
SmilChr06G001365 XP_057768799.1
SBP 1
MP00307
 6893 9755 查靶基因
SmilChr03G003439 XP_057798243.1
bHLH 1
MP00195
 6878 9832 查靶基因
SmilChr06G001111 XP_057768512.1
MYB 1
MP00388
 6870 9774 查靶基因
SmilChr02G000949 XP_057795176.1
bZIP 1
MP00318
 6849 9413 查靶基因
SmilChr01G000025 XP_057790305.1
SBP 1
MP00633
 6833 8026 查靶基因
SmilChr01G004313 XP_057783598.1
bHLH 1
MP00308
 6805 9826 查靶基因
SmilChr02G005502 XP_057792768.1
bHLH 1
MP00082
 6784 9435 查靶基因
SmilChr03G004274 XP_057799397.1
MIKC_MADS 1
MP00080
 6766 9850 查靶基因
SmilChr02G003688 XP_057794248.1
MYB 1
MP00028
 6764 9024 查靶基因
SmilChr04G003367 XP_057804957.1
MYB 1
MP00191
 6736 9690 查靶基因
SmilChr04G000157 XP_057807462.1
bHLH 1
MP00081
 6729 9942 查靶基因
SmilChr07G002147 XP_057774045.1
MYB 1
MP00500
 6697 9681 查靶基因
SmilChr05G002277 XP_057809665.1
ERF 1
MP00452
 6671 7783 查靶基因
SmilChr07G004480 XP_057776222.1
WRKY 1
MP00531
 6663 9784 查靶基因
SmilChr02G004447 XP_057797242.1
HD-ZIP 1
MP00200
 6661 9930 查靶基因
SmilChr04G000070 XP_057807324.1
bHLH 1
MP00034
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G002039 XP_057808459.1
bHLH 1
MP00660
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G005851 XP_057789306.1
MYB 1
MP00055
 6638 9685 查靶基因
SmilChr02G005238 XP_057792594.1
SBP 1
MP00634
 6619 7771 查靶基因
SmilChr06G002048 XP_057770293.1
bHLH 1
MP00035
 6618 9903 查靶基因
SmilChr07G000836 XP_057772437.1
MYB_related 1
MP00568
 6611 9696 查靶基因
SmilChr04G003119 XP_057809542.1
bZIP 1
MP00039
 6610 9936 查靶基因
SmilChr01G004114 XP_057781125.1
WRKY 1
MP00284
 6552 9774 查靶基因
SmilChr08G004246 XP_057780410.1
WRKY 1
MP00422
 6535 9791 查靶基因
SmilChr05G001980 XP_057766076.1
ARF 1
MP00153
 6534 9706 查靶基因
SmilChr04G000094 XP_057807365.1
YABBY 1
MP00620
 6504 9844 查靶基因
SmilChr02G002534 XP_057797741.1
TCP 1
MP00169
 6498 7295 查靶基因
SmilChr05G001269 XP_057765199.1
G2-like 1
MP00252
 6478 9780 查靶基因
SmilChr07G003441 XP_057773618.1
NAC 1
MP00108
 6458 9810 查靶基因
SmilChr02G001791 XP_057795933.1
TCP 1
MP00062
 6454 7249 查靶基因
SmilChr05G003285 XP_057810127.1
RAV 1
MP00024
 6450 9853 查靶基因
SmilChr05G000619 XP_057764205.1
WRKY 1
MP00167
 6439 9756 查靶基因
SmilChr04G003745 XP_057809144.1
C2H2 1
MP00416
 6433 9716 查靶基因
SmilChr02G004607 XP_057791470.1
C2H2 1
MP00608
 6398 9817 查靶基因
SmilChr02G003399 XP_057793859.1
ERF 1
MP00240
 6368 9978 查靶基因
SmilChr01G004920 XP_057788125.1
MYB_related 1
MP00607
 6362 9718 查靶基因
SmilChr06G001059 XP_057768449.1
Dof 1
MP00402
 6278 9875 查靶基因
SmilChr01G004552 XP_057786668.1
bZIP 1
MP00409
 6252 8429 查靶基因
SmilChr01G006187 XP_057798078.1
GRAS 1
MP00611
 6232 9807 查靶基因
SmilChr01G001516 XP_057803325.1
bZIP 1
MP00648
 6170 9939 查靶基因
SmilChr04G003955 XP_057805828.1
ERF 1
MP00120
 6144 7514 查靶基因
SmilChr01G004708 XP_057787833.1
WRKY 1
MP00251
 6140 9713 查靶基因
SmilChr05G001961 XP_057766054.1
MIKC_MADS 1
MP00077
 6125 9815 查靶基因
SmilChr08G000478 XP_057781809.1
GATA 1
MP00130
 6015 9821 查靶基因
SmilChr01G000943 XP_057790035.1
MIKC_MADS 1
MP00508
 5979 7481 查靶基因
SmilChr05G004106 XP_057810779.1
WRKY 1
MP00260
 5932 9706 查靶基因
SmilChr04G003973 XP_057805857.1
HD-ZIP 1
MP00013
 5927 9712 查靶基因
SmilChr03G002207 XP_057801109.1
WRKY 1
MP00299
 5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr01G006187; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00027306-RA_Salv SmilChr01G006187 GRAS XP_057798078.1 MP00611 AAGAAAAAGACAAAAAAAAA

可能结合的靶基因

9807 个结合位点 6232 个候选靶基因 第 67 / 125 下载 TSV

上一页 67 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr03G001352 Chr03 NC_080389.1:15779045-15779064promoter 内 2747-2766 bp - 1235 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 3 15780299-15782533(+) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 CTTCTTTTTGTTGTCTTTTC
SmilChr02G004089 Chr02 NC_080388.1:63172048-63172067promoter 内 1941-1960 bp - 2041 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 3 63165024-63170007(-) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 TAGAAAAAAAGAAAAAAAAA
SmilChr02G003788 Chr02 NC_080388.1:59524593-59524612promoter 内 1562-1581 bp + 2420 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 3 59527032-59529805(+) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 AAGTCAAAGACAGAAAAAGT
SmilChr02G000243 Chr02 NC_080388.1:3132446-3132465promoter 内 1321-1340 bp + 2661 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 3 3135126-3138047(+) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 AAAAAAAAGAAAAAAGAAAG
SmilChr03G001222 Chr03 NC_080389.1:14085667-14085686promoter 内 948-967 bp + 3034 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 3 14078360-14082633(-) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 GTTTTTTTTGTTTCTTTGTT
SmilChr02G000345 Chr02 NC_080388.1:4507877-4507896promoter 内 330-349 bp + 3652 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 3 4492503-4504225(-) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 TTTTCTTTTGTCTCTAACGC
SmilChr02G000291 Chr02 NC_080388.1:3694319-3694338promoter 内 303-322 bp - 3679 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 3 3698017-3723614(+) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 TTTTCTTTTGTCTCTAACGC
SmilChr03G000856 Chr03 NC_080389.1:9792878-9792897promoter 内 278-297 bp - 3704 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 3 9788275-9789174(-) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 AAGAAAAAAAGAGAGAAAAA
SmilChr03G001177 Chr03 NC_080389.1:13521144-13521163promoter 内 76-95 bp + 3906 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 3 13525069-13537051(+) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 AAGAAAAAAAGAGAGAAAAA
SmilChr03G002255 Chr03 NC_080389.1:35496393-35496412promoter 内 3959-3978 bp + 23 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 2 35496435-35498673(+) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 CAGAAAAAGAAAAGAAAAAG
SmilChr01G005497 Chr01 NC_080387.1:71874076-71874095promoter 内 3935-3954 bp - 47 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 2 71870273-71874029(-) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 TCCAAAAAGACAAAAGAAAT
SmilChr01G000792 Chr01 NC_080387.1:17213127-17213146promoter 内 3881-3900 bp - 101 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 2 17210660-17213026(-) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 AAAAAAAAGAAAAAAAAAGG
SmilChr02G003242 Chr02 NC_080388.1:53699489-53699508promoter 内 3788-3807 bp - 194 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 2 53699702-53702986(+) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 TTTAATTTTGTCTTTTAGTT
SmilChr01G000191 Chr01 NC_080387.1:3279940-3279959promoter 内 3742-3761 bp - 240 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 2 3280199-3282033(+) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 CTTTTTCTTTTCTTTTTCTG
SmilChr03G003050 Chr03 NC_080389.1:47398314-47398333promoter 内 3691-3710 bp + 291 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 2 47393487-47398023(-) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 CTCTTTTTGCTCTTTTTCTA
SmilChr02G004664 Chr02 NC_080388.1:69028352-69028371promoter 内 3560-3579 bp - 422 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 2 69028793-69031788(+) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 CTTTTTTTTGTTTTCTTTTT
SmilChr02G004338 Chr02 NC_080388.1:65630671-65630690promoter 内 3451-3470 bp - 531 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 2 65619917-65630140(-) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 TAGAAAAAAAGAAAAAAAAA
SmilChr02G003679 Chr02 NC_080388.1:58162091-58162110promoter 内 3183-3202 bp - 799 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 2 58159880-58161292(-) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 AAAACAAAGACAAGAGAAAA
SmilChr01G002092 Chr01 NC_080387.1:36938315-36938334promoter 内 2971-2990 bp - 1011 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 2 36939345-36943434(+) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 GTGTCGTTTGTCTTCTTCGG
SmilChr03G000802 Chr03 NC_080389.1:9181184-9181203promoter 内 2940-2959 bp - 1042 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 2 9178241-9180142(-) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 AAGAAAAAGAAAAAGGAATA
SmilChr03G002547 Chr03 NC_080389.1:40628685-40628704promoter 内 2836-2855 bp + 1146 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 2 40629850-40631590(+) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 AAAAAAAAGAAAAAAAAAGG
SmilChr02G004369 Chr02 NC_080388.1:66013385-66013404promoter 内 2819-2838 bp - 1163 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 2 66010727-66012222(-) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 AAAAAAAAGACAGAAAATGC
SmilChr02G004373 Chr02 NC_080388.1:66080103-66080122promoter 内 2813-2832 bp - 1169 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 2 66077448-66078934(-) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 AAAAAAAAGACAGAAAATGC
SmilChr03G002177 Chr03 NC_080389.1:33829555-33829574promoter 内 2799-2818 bp - 1183 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 2 33826747-33828372(-) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 AACAAAAAAAGAAAAAAAAA
SmilChr02G002713 Chr02 NC_080388.1:46978322-46978341promoter 内 2788-2807 bp - 1194 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 2 46975061-46977128(-) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 AAGGCACAGACAAAAACTGA
SmilChr01G002508 Chr01 NC_080387.1:42968979-42968998promoter 内 2765-2784 bp - 1217 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 2 42964801-42967762(-) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 GAGAAAAAAACGAAATGAAA
SmilChr02G001094 Chr02 NC_080388.1:19739140-19739159promoter 内 2536-2555 bp - 1446 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 2 19735577-19737694(-) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 ACAAGGGAGACAAAACAGGG
SmilChr03G001288 Chr03 NC_080389.1:15096694-15096713promoter 内 2532-2551 bp - 1450 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 2 15089338-15095244(-) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 GAAGAAGAGAGAAAAAAATG
SmilChr02G004214 Chr02 NC_080388.1:64388911-64388930promoter 内 2403-2422 bp - 1579 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 2 64384833-64387332(-) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 GTGGGAAAGACAAAAAATGA
SmilChr01G005671 Chr01 NC_080387.1:72988495-72988514promoter 内 2275-2294 bp - 1707 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 2 72990221-72990890(+) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 CTCCTTTTCCTCTTTTTTTT
SmilChr01G002136 Chr01 NC_080387.1:37342689-37342708promoter 内 2251-2270 bp + 1731 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 2 37344439-37346896(+) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 AAAAAAAAAACAAAAAGGAA
SmilChr02G005538 Chr02 NC_080388.1:75413695-75413714promoter 内 2169-2188 bp - 1813 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 2 75408257-75411882(-) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 TGGAGAAAGAGAAAAAAACC
SmilChr01G004325 Chr01 NC_080387.1:61409658-61409677promoter 内 2163-2182 bp + 1819 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 2 61404681-61407839(-) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 GTGTTTCTTGTCTTTTCCTT
SmilChr01G001395 Chr01 NC_080387.1:27441123-27441142promoter 内 2159-2178 bp + 1823 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 2 27439228-27439300(-) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 GTGTTTTCTGTTTTTTTCTC
SmilChr01G002313 Chr01 NC_080387.1:40123456-40123475promoter 内 2117-2136 bp + 1865 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 2 40115931-40121591(-) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 TTCTTTTTTGTCTTTCTTGT
SmilChr03G001332 Chr03 NC_080389.1:15561260-15561279promoter 内 2095-2114 bp + 1887 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 2 15559292-15559373(-) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 TTTCTCTCTCTCATTTTCTT
SmilChr02G005144 Chr02 NC_080388.1:72844409-72844428promoter 内 2036-2055 bp - 1946 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 2 72840117-72842463(-) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 CAGAATAAGACAAAAGTTCG
SmilChr01G004089 Chr01 NC_080387.1:59290581-59290600promoter 内 1939-1958 bp + 2043 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 2 59292643-59294781(+) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 AACAAAAAAACAAAAAAAAT
SmilChr03G003239 Chr03 NC_080389.1:50284722-50284741promoter 内 1833-1852 bp - 2149 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 2 50286890-50290839(+) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 TCTCTTTTTGTCAGTATCTC
SmilChr02G000282 Chr02 NC_080388.1:3619377-3619396promoter 内 1832-1851 bp - 2150 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 2 3615066-3617227(-) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 AGGGCGGAGACAAAAAAAAT
SmilChr03G000059 Chr03 NC_080389.1:629027-629046promoter 内 1572-1591 bp - 2410 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 2 624084-626617(-) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 CAAAAAAAAAGAAAAAAAAG
SmilChr01G000791 Chr01 NC_080387.1:17213127-17213146promoter 内 1492-1511 bp - 2490 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 2 17205651-17210637(-) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 AAAAAAAAGAAAAAAAAAGG
SmilChr02G003297 Chr02 NC_080388.1:54247954-54247973promoter 内 1394-1413 bp + 2588 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 2 54243482-54245366(-) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 GTTTTTTCTCTCTTTTTTCC
SmilChr02G001145 Chr02 NC_080388.1:20837038-20837057promoter 内 979-998 bp - 3003 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 2 20831301-20834035(-) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 AAAAAAAAGAGAAAAAAGTA
SmilChr02G002831 Chr02 NC_080388.1:48443174-48443193promoter 内 939-958 bp - 3043 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 2 48438113-48440131(-) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 AGGAAAAAGAAAAAAACACA
SmilChr02G000140 Chr02 NC_080388.1:1870421-1870440promoter 内 932-951 bp + 3050 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 2 1873490-1874531(+) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 CCCAAAATGACAAAAAAAGA
SmilChr02G003680 Chr02 NC_080388.1:58162091-58162110promoter 内 804-823 bp - 3178 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 2 58165288-58170625(+) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 TTTTCTCTTGTCTTTGTTTT
SmilChr02G005031 Chr02 NC_080388.1:72029544-72029563promoter 内 723-742 bp + 3259 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 2 72032822-72037578(+) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 TAAATGAGGACAAAAGCGGG
SmilChr01G002830 Chr01 NC_080387.1:46906539-46906558promoter 内 616-635 bp + 3366 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 2 46901493-46903173(-) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 GTTTTCTTTTTCTTTTTCCC
SmilChr01G002437 Chr01 NC_080387.1:41966856-41966875promoter 内 461-480 bp - 3521 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 2 41959720-41963335(-) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 AAAAAAAAGAAAAAAAAAGG