转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr08G002543; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00020892-RA_Salv SmilChr08G002543 bZIP XP_057778423.1 MP00303 ACCAGCTGTCA

可能结合的靶基因

9868 个结合位点 7416 个候选靶基因 第 69 / 149 下载 TSV

上一页 69 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr07G002889 Chr07 NC_080393.1:29186991-29187001promoter 内 1107-1117 bp - 2884 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 29178772-29184107(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 ATCAGCTGTCC
SmilChr01G001823 Chr01 NC_080387.1:33172781-33172791promoter 内 1032-1042 bp + 2959 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 33175750-33178273(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 ACCAGCTGGAG
SmilChr01G002194 Chr01 NC_080387.1:38108709-38108719promoter 内 1022-1032 bp - 2969 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 38103707-38105740(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GAAAGCTGTCG
SmilChr02G000476 Chr02 NC_080388.1:6551230-6551240promoter 内 980-990 bp - 3011 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 6554251-6560125(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CGACAGCTTTC
SmilChr04G002686 Chr04 NC_080390.1:42291491-42291501promoter 内 924-934 bp - 3067 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 42294568-42297970(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CGACAGCTGAA
SmilChr02G000470 Chr02 NC_080388.1:6348804-6348814promoter 内 890-900 bp + 3101 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 6351915-6354749(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 ACCAGCTGGAG
SmilChr04G001457 Chr04 NC_080390.1:23982189-23982199promoter 内 856-866 bp - 3135 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 23974953-23979054(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 ACCAGCTGGAG
SmilChr03G004197 Chr03 NC_080389.1:60616215-60616225promoter 内 790-800 bp + 3201 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 60611047-60613014(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CGACAGCTGAA
SmilChr02G002158 Chr02 NC_080388.1:38808688-38808698promoter 内 682-692 bp - 3309 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 38804041-38805379(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 ACCAGCTGGAG
SmilChr06G002342 Chr06 NC_080392.1:34074527-34074537promoter 内 677-687 bp - 3314 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 34070740-34071213(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GTCAGCTGTCT
SmilChr02G002357 Chr02 NC_080388.1:41358589-41358599promoter 内 667-677 bp - 3324 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 41361923-41365429(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCCTAC
SmilChr05G003328 Chr05 NC_080391.1:43638325-43638335promoter 内 653-663 bp - 3338 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 43633233-43634987(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GCCAGCTGCCA
SmilChr06G003153 Chr06 NC_080392.1:44540899-44540909promoter 内 648-658 bp + 3343 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 44533848-44537556(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AGACAGCTGAC
SmilChr05G001280 Chr05 NC_080391.1:10956120-10956130promoter 内 632-642 bp + 3359 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 10959489-10962672(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GTAGGCTGTCA
SmilChr06G002841 Chr06 NC_080392.1:41182733-41182743promoter 内 569-579 bp + 3422 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 41173428-41179311(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCCTAC
SmilChr02G004928 Chr02 NC_080388.1:71289416-71289426promoter 内 506-516 bp + 3485 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 71292911-71295909(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TTCAGCTGTCG
SmilChr04G003685 Chr04 NC_080390.1:53263519-53263529promoter 内 492-502 bp - 3499 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 53267028-53269126(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CTCCAGCTGGT
SmilChr04G000261 Chr04 NC_080390.1:2380677-2380687promoter 内 481-491 bp + 3510 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 2384197-2391461(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 ACCAGCTGGAG
SmilChr03G001306 Chr03 NC_080389.1:15322072-15322082promoter 内 377-387 bp - 3614 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 15309028-15318458(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GTCAGCTGTCT
SmilChr05G003908 Chr05 NC_080391.1:52806925-52806935promoter 内 373-383 bp + 3618 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 52810553-52814762(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 ACCAGCTGGAG
SmilChr01G000480 Chr01 NC_080387.1:9873277-9873287promoter 内 372-382 bp + 3619 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 9876906-9879740(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GTCAGCTGTCT
SmilChr06G001433 Chr06 NC_080392.1:15146133-15146143promoter 内 285-295 bp - 3706 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 15149849-15153251(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCCTAC
SmilChr01G002678 Chr01 NC_080387.1:44979970-44979980promoter 内 272-282 bp + 3719 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 44983699-44992343(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 ACCAGCTGGAG
SmilChr01G001634 Chr01 NC_080387.1:30401280-30401290promoter 内 231-241 bp + 3760 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 30392990-30397520(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AGACAGCTGAC
SmilChr05G001017 Chr05 NC_080391.1:8332763-8332773promoter 内 214-224 bp - 3777 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 8323661-8328986(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GTAGGCTGTCA
SmilChr05G003876 Chr05 NC_080391.1:52339466-52339476promoter 内 201-211 bp + 3790 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 52343266-52345595(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 ACCAGCTGGAG
SmilChr04G001128 Chr04 NC_080390.1:16374308-16374318promoter 内 194-204 bp - 3797 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 16369144-16370511(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 ACCAGCTGGAG
SmilChr06G000881 Chr06 NC_080392.1:8379410-8379420promoter 内 194-204 bp + 3797 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 8373926-8375613(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CTCCAGCTGGT
SmilChr03G003932 Chr03 NC_080389.1:58394114-58394124promoter 内 190-200 bp + 3801 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 58380573-58390313(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CTCCAGCTGGT
SmilChr07G002455 Chr07 NC_080393.1:23069640-23069650promoter 内 162-172 bp - 3829 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 23061821-23065811(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TTCAGCTGTCG
SmilChr03G000861 Chr03 NC_080389.1:9823558-9823568promoter 内 101-111 bp - 3890 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 9827458-9829853(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CGACAGCTGAA
SmilChr04G001120 Chr04 NC_080390.1:16257868-16257878promoter 内 92-102 bp - 3899 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 16252777-16253969(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 ACCAGCTGGAG
SmilChr05G002994 Chr05 NC_080391.1:36756244-36756254promoter 内 80-90 bp + 3911 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 36760165-36762168(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 ACCAGCTGGAG
SmilChr05G004228 Chr05 NC_080391.1:56103822-56103832promoter 内 78-88 bp + 3913 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 56107745-56108543(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 ACCAGCTGGAG
SmilChr04G003151 Chr04 NC_080390.1:48129822-48129832promoter 内 32-42 bp + 3959 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 48124911-48125863(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CGACAGCTGAA
SmilChr02G000801 Chr02 NC_080388.1:13397567-13397577promoter 内 2796-2806 bp - 1195 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 6 13392078-13396372(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TACAGCTGTCT
SmilChr05G000432 Chr05 NC_080391.1:3253736-3253746promoter 内 3968-3978 bp + 23 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 3 3252292-3253713(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AGACAGCTGTA
SmilChr03G001729 Chr03 NC_080389.1:23242882-23242892promoter 内 3543-3553 bp - 448 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 3 23241387-23242434(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TACAGCTGTCT
SmilChr06G000011 Chr06 NC_080392.1:198490-198500promoter 内 3523-3533 bp + 468 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 3 198968-211177(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AATAGCTGTCA
SmilChr05G002161 Chr05 NC_080391.1:22852891-22852901promoter 内 3447-3457 bp - 544 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 3 22845596-22852347(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TACAGCTGTCT
SmilChr05G003075 Chr05 NC_080391.1:38819588-38819598promoter 内 3021-3031 bp + 970 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 3 38816599-38818618(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AGACAGCTGTA
SmilChr06G002234 Chr06 NC_080392.1:31610234-31610244promoter 内 2996-3006 bp + 995 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 3 31607576-31609239(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AGACAGCTGTA
SmilChr01G000455 Chr01 NC_080387.1:9256735-9256745promoter 内 2930-2940 bp + 1061 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 3 9247288-9255674(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AGACAGCTGTA
SmilChr04G000829 Chr04 NC_080390.1:10446818-10446828promoter 内 2637-2647 bp + 1354 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 3 10448182-10451174(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TACAGCTGTCT
SmilChr02G005346 Chr02 NC_080388.1:74277348-74277358promoter 内 2602-2612 bp + 1389 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 3 74278747-74282868(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TACAGCTGTCT
SmilChr03G002112 Chr03 NC_080389.1:32866918-32866928promoter 内 2325-2335 bp - 1666 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 3 32862369-32865252(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TACAGCTGTCT
SmilChr04G003858 Chr04 NC_080390.1:54526405-54526415promoter 内 2267-2277 bp + 1724 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 3 54518280-54524681(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AGACAGCTGTA
SmilChr01G000259 Chr01 NC_080387.1:4967096-4967106promoter 内 2090-2100 bp - 1901 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 3 4969007-4969875(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AGACAGCTGTA
SmilChr02G001353 Chr02 NC_080388.1:25296440-25296450promoter 内 1997-2007 bp + 1994 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 3 25292448-25294446(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AGACAGCTGTA
SmilChr04G001012 Chr04 NC_080390.1:14113023-14113033promoter 内 1896-1906 bp + 2095 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 3 14115128-14116548(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TACAGCTGTCT