转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr01G002743; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00022510-RA_Salv SmilChr01G002743 MYB_related XP_057765725.1 MP00565 AACCTTATCCATAAA

可能结合的靶基因

9785 个结合位点 7412 个候选靶基因 第 7 / 149 下载 TSV

上一页 7 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr01G004579 Chr01 NC_080387.1:63848153-63848167promoter 内 1181-1195 bp + 2806 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 2 63843623-63845347(-) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 GAATTGGATAAGATC
SmilChr04G003663 Chr04 NC_080390.1:53093164-53093178promoter 内 46-60 bp + 3941 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 2 53087306-53089223(-) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 TTATTGGATAATGTT
SmilChr01G001436 Chr01 NC_080387.1:28031432-28031446promoter 内 3355-3369 bp - 632 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 28030640-28030800(-) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 GATCTTATCCAATTC
SmilChr01G005499 Chr01 NC_080387.1:71882617-71882631promoter 内 3259-3273 bp - 728 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 71883359-71887955(+) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 CATATGGATAAGACT
SmilChr04G000648 Chr04 NC_080390.1:7314212-7314226promoter 内 2932-2946 bp - 1055 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 7309589-7313157(-) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 AACATTATCCAATAA
SmilChr01G000301 Chr01 NC_080387.1:5911231-5911245promoter 内 2641-2655 bp + 1346 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 5906524-5909885(-) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 ATTATGGATAAGCTT
SmilChr04G003807 Chr04 NC_080390.1:54249549-54249563promoter 内 2619-2633 bp + 1368 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 54243606-54248181(-) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 TATTTGGATAAGCTT
SmilChr02G000498 Chr02 NC_080388.1:6862733-6862747promoter 内 2496-2510 bp - 1491 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 6864238-6867223(+) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 ATTATGGATAAGCTT
SmilChr02G005551 Chr02 NC_080388.1:75488446-75488460promoter 内 2495-2509 bp + 1492 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 75489952-75493024(+) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 TACATTATCCAAATC
SmilChr02G001816 Chr02 NC_080388.1:33026345-33026359promoter 内 1884-1898 bp + 2103 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 33020235-33024242(-) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 GATGTGGATAAGAAT
SmilChr02G003481 Chr02 NC_080388.1:56088896-56088910promoter 内 1560-1574 bp + 2427 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 56091337-56093015(+) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 AACCTTATCTAAATA
SmilChr04G002697 Chr04 NC_080390.1:42471122-42471136promoter 内 1108-1122 bp + 2879 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 42474015-42475474(+) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 TACCTTATCCAGATT
SmilChr02G001683 Chr02 NC_080388.1:31070739-31070753promoter 内 746-760 bp + 3241 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 31066005-31067498(-) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 CAATTGGATAAGGAA
SmilChr02G001316 Chr02 NC_080388.1:24477291-24477305promoter 内 673-687 bp + 3314 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 24470867-24473977(-) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 ATTATGGATAAGCTT
SmilChr04G003809 Chr04 NC_080390.1:54249549-54249563promoter 内 617-631 bp + 3370 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 54252933-54255552(+) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 AAGCTTATCCAAATA
SmilChr01G004467 Chr01 NC_080387.1:62762375-62762389promoter 内 612-626 bp + 3375 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 62755636-62759000(-) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 GGATTGGATAAGGCA
SmilChr02G003267 Chr02 NC_080388.1:53936158-53936172promoter 内 3280-3294 bp + 707 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 4 53936879-53938637(+) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 ACCCTTATCCAAATA
SmilChr02G000494 Chr02 NC_080388.1:6811290-6811304promoter 内 1607-1621 bp + 2380 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 3 6813684-6815029(+) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 TATCTTATCCAATTA
SmilChr02G002861 Chr02 NC_080388.1:48786330-48786344promoter 内 3628-3642 bp + 359 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 2 48786703-48790314(+) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 TTCCTTATCCAATTT
SmilChr01G003933 Chr01 NC_080387.1:57625822-57625836promoter 内 3309-3323 bp + 678 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 2 57626514-57635669(+) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 TATCTTATCCATTAT
SmilChr03G003520 Chr03 NC_080389.1:53809909-53809923promoter 内 3165-3179 bp - 822 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 2 53805883-53809087(-) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 TATCTTATCCATTTT
SmilChr03G004077 Chr03 NC_080389.1:59708148-59708162promoter 内 2168-2182 bp - 1819 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 2 59705038-59706329(-) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 TTCCTTATCCACAAT
SmilChr02G005232 Chr02 NC_080388.1:73513160-73513174promoter 内 2106-2120 bp + 1881 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 2 73515055-73516164(+) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 AATCTTATCCAATCG
SmilChr04G003180 Chr04 NC_080390.1:48519872-48519886promoter 内 1737-1751 bp + 2250 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 2 48515885-48517622(-) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 ATTGTGGATAAGGAA
SmilChr02G002860 Chr02 NC_080388.1:48786330-48786344promoter 内 1696-1710 bp + 2291 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 2 48782144-48784039(-) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 AAATTGGATAAGGAA
SmilChr01G001114 Chr01 NC_080387.1:22795510-22795524promoter 内 1654-1668 bp + 2333 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 2 22783024-22793177(-) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 TAATTGGATAAGATA
SmilChr01G000749 Chr01 NC_080387.1:16566286-16566300promoter 内 1207-1221 bp + 2780 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 2 16569080-16570541(+) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 TATCTTATCCAATTA
SmilChr01G001611 Chr01 NC_080387.1:30259598-30259612promoter 内 1151-1165 bp + 2836 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 2 30255606-30256762(-) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 GATGAGGATAAGGAT
SmilChr02G001158 Chr02 NC_080388.1:21149239-21149253promoter 内 980-994 bp - 3007 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 2 21145507-21146232(-) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 TATCTTATCCAATTA
SmilChr04G001105 Chr04 NC_080390.1:15833234-15833248promoter 内 3971-3985 bp + 16 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 1 15833264-15834025(+) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 CACCTTATCCATTCT
SmilChr04G001216 Chr04 NC_080390.1:18986649-18986663promoter 内 3912-3926 bp - 75 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 1 18986738-18987849(+) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 TAATTGGATAAGATA
SmilChr04G001888 Chr04 NC_080390.1:30826392-30826406promoter 内 3882-3896 bp - 105 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 1 30826511-30827499(+) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 TAATTGGATAAGATA
SmilChr03G002117 Chr03 NC_080389.1:32918033-32918047promoter 内 3830-3844 bp + 157 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 1 32916940-32917876(-) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 TAATTGGATAAGATA
SmilChr04G001887 Chr04 NC_080390.1:30815912-30815926promoter 内 3816-3830 bp - 171 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 1 30816097-30817013(+) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 TAATTGGATAAGATA
SmilChr01G000318 Chr01 NC_080387.1:6172865-6172879promoter 内 3813-3827 bp - 174 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 1 6173053-6173990(+) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 TAATTGGATAAGATA
SmilChr01G003112 Chr01 NC_080387.1:49925939-49925953promoter 内 3142-3156 bp - 845 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 1 49926798-49930025(+) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 ATAATGGATAAGATA
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