转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr05G000260; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00013647-RA_Salv SmilChr05G000260 bZIP XP_057763683.1 MP00040 TGCTGACGTGGC

可能结合的靶基因

9919 个结合位点 6920 个候选靶基因 第 70 / 139 下载 TSV

上一页 70 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr02G001169 Chr02 NC_080388.1:21444876-21444887promoter 内 3200-3211 bp - 790 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 2 21445677-21452087(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GCCGCGTCAGCT
SmilChr03G000640 Chr03 NC_080389.1:7047548-7047559promoter 内 3182-3193 bp - 808 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 2 7043582-7046740(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 ATCAGACGTGGG
SmilChr03G000773 Chr03 NC_080389.1:8811653-8811664promoter 内 2879-2890 bp - 1111 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 2 8812775-8814487(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TCCACGTCGTCA
SmilChr04G004119 Chr04 NC_080390.1:56066688-56066699promoter 内 2480-2491 bp - 1510 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 2 56068209-56070531(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 CCCCCGTCAGCA
SmilChr03G004445 Chr03 NC_080389.1:62589663-62589674promoter 内 2210-2221 bp - 1780 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 2 62583977-62587883(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GGCGGACGTGGT
SmilChr04G001964 Chr04 NC_080390.1:31864675-31864686promoter 内 2151-2162 bp - 1839 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 2 31859525-31862836(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GGCGGACGTGGT
SmilChr01G001866 Chr01 NC_080387.1:33641446-33641457promoter 内 2019-2030 bp + 1971 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 2 33643428-33644575(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 CGCGGACGTGGT
SmilChr02G002142 Chr02 NC_080388.1:38541198-38541209promoter 内 1859-1870 bp - 2131 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 2 38543340-38546017(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 ACCACGTCCGCG
SmilChr01G000630 Chr01 NC_080387.1:14081882-14081893promoter 内 1777-1788 bp + 2213 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 2 14084106-14086762(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TGCTGACGGGGG
SmilChr04G004117 Chr04 NC_080390.1:56066688-56066699promoter 内 1413-1424 bp - 2577 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 2 56060212-56064111(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TGCTGACGGGGG
SmilChr04G000376 Chr04 NC_080390.1:3785786-3785797promoter 内 1016-1027 bp - 2974 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 2 3788771-3790013(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GCCTCGTCAGCG
SmilChr01G000775 Chr01 NC_080387.1:16875772-16875783promoter 内 510-521 bp - 3480 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 2 16869258-16872292(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TGACGACGTGGT
SmilChr02G005379 Chr02 NC_080388.1:74471900-74471911promoter 内 95-106 bp + 3895 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 2 74461454-74468005(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TCCACGTCTGAG
SmilChr03G004674 Chr03 NC_080389.1:64176826-64176837promoter 内 3933-3944 bp - 57 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 64176894-64183309(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TCCACGTCTGAC
SmilChr03G000266 Chr03 NC_080389.1:3079523-3079534promoter 内 3925-3936 bp - 65 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 3077461-3079458(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TGACGACGTGGT
SmilChr02G003875 Chr02 NC_080388.1:60804057-60804068promoter 内 3722-3733 bp - 268 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 60804336-60805807(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TCCACGTCGTCA
SmilChr02G001387 Chr02 NC_080388.1:26364847-26364858promoter 内 3661-3672 bp + 329 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 26364027-26364518(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TCCACGTCGTCA
SmilChr03G001794 Chr03 NC_080389.1:24506923-24506934promoter 内 3474-3485 bp + 516 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 24507450-24508299(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 CGCGGACGTGGT
SmilChr03G002221 Chr03 NC_080389.1:34982956-34982967promoter 内 3403-3414 bp - 587 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 34983554-35016343(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 ACCACGTCCGCC
SmilChr03G004673 Chr03 NC_080389.1:64176826-64176837promoter 内 3324-3335 bp - 666 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 64175484-64176160(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GTCAGACGTGGA
SmilChr04G002556 Chr04 NC_080390.1:40873254-40873265promoter 内 3286-3297 bp - 704 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 40871294-40872550(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 CGCGGACGTGGT
SmilChr04G003443 Chr04 NC_080390.1:50947751-50947762promoter 内 3156-3167 bp - 834 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 50945181-50946917(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TGACGACGTGGT
SmilChr02G001388 Chr02 NC_080388.1:26364847-26364858promoter 内 3137-3148 bp + 853 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 26365711-26367457(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TGACGACGTGGA
SmilChr02G001386 Chr02 NC_080388.1:26364847-26364858promoter 内 2960-2971 bp + 1030 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 26358554-26363817(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TCCACGTCGTCA
SmilChr01G005540 Chr01 NC_080387.1:72231416-72231427promoter 内 2959-2970 bp - 1031 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 72229168-72230385(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TGACGACGTGGT
SmilChr03G001835 Chr03 NC_080389.1:25182029-25182040promoter 内 2900-2911 bp + 1090 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 25179806-25180939(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 ACCACGTCCGCG
SmilChr02G000737 Chr02 NC_080388.1:11950481-11950492promoter 内 2898-2909 bp + 1092 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 11948946-11949389(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 ACCACGTCGTCA
SmilChr01G001854 Chr01 NC_080387.1:33475617-33475628promoter 内 2853-2864 bp - 1137 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 33471818-33474480(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 CGCGGACGTGGT
SmilChr03G004384 Chr03 NC_080389.1:62052701-62052712promoter 内 2627-2638 bp + 1363 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 62054075-62056403(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TGACGACGTGGT
SmilChr01G002625 Chr01 NC_080387.1:44533531-44533542promoter 内 2617-2628 bp - 1373 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 44534915-44543927(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TCCACGTCGTCA
SmilChr03G003375 Chr03 NC_080389.1:52100467-52100478promoter 内 2587-2598 bp - 1403 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 52101881-52107522(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 CCCACGTCTGAT
SmilChr04G001588 Chr04 NC_080390.1:26396363-26396374promoter 内 2558-2569 bp - 1432 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 26389526-26394931(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 CGCGGACGTGGT
SmilChr01G001368 Chr01 NC_080387.1:27036019-27036030promoter 内 2535-2546 bp - 1455 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 27037485-27040166(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TCCACGTCTGGT
SmilChr03G000641 Chr03 NC_080389.1:7047548-7047559promoter 内 2534-2545 bp - 1456 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 7049015-7051076(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 CCCACGTCTGAT
SmilChr01G001797 Chr01 NC_080387.1:32832218-32832229promoter 内 2456-2467 bp + 1534 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 32828472-32830684(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TCCACGTCTGTG
SmilChr03G003374 Chr03 NC_080389.1:52100467-52100478promoter 内 2443-2454 bp - 1547 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 52097480-52098920(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 ATCAGACGTGGG
SmilChr03G002393 Chr03 NC_080389.1:37884789-37884800promoter 内 2442-2453 bp + 1548 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 37886348-37891336(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TGCTGACGCGGG
SmilChr01G002227 Chr01 NC_080387.1:38740524-38740535promoter 内 2365-2376 bp - 1625 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 38742160-38743032(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 ACCACGTCCGCG
SmilChr05G000040 Chr05 NC_080391.1:197522-197533promoter 内 2258-2269 bp + 1732 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 188773-195790(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TCCACGTCGTCA
SmilChr02G002063 Chr02 NC_080388.1:37192395-37192406promoter 内 2250-2261 bp + 1740 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 37194146-37199064(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GGCGGACGTGGA
SmilChr02G003598 Chr02 NC_080388.1:57169613-57169624promoter 内 2167-2178 bp - 1823 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 57171447-57173363(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 ACCACGTCCGCG
SmilChr04G002027 Chr04 NC_080390.1:32957738-32957749promoter 内 2136-2147 bp + 1854 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 32959603-32963568(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TGACGACGTGGT
SmilChr01G001686 Chr01 NC_080387.1:31091472-31091483promoter 内 2087-2098 bp + 1903 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 31086192-31089569(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 ACCACGTCTGAC
SmilChr02G001498 Chr02 NC_080388.1:27938433-27938444promoter 内 2070-2081 bp - 1920 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 27933258-27936513(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 CGCGGACGTGGT
SmilChr01G003812 Chr01 NC_080387.1:56496253-56496264promoter 内 2028-2039 bp - 1962 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 56492209-56494291(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 CGCGGACGTGGT
SmilChr03G002683 Chr03 NC_080389.1:42602440-42602451promoter 内 1978-1989 bp + 2012 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 42604463-42611829(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GGCGGACGTGGT
SmilChr01G005501 Chr01 NC_080387.1:71889369-71889380promoter 内 1937-1948 bp - 2053 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 71891433-71893414(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 CCCGCGTCAGCA
SmilChr04G001139 Chr04 NC_080390.1:16801815-16801826promoter 内 1847-1858 bp - 2143 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 16803969-16804074(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 ACCACGTCGTCA
SmilChr01G003478 Chr01 NC_080387.1:53337347-53337358promoter 内 1843-1854 bp + 2147 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 53339505-53343594(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TGACGACGTGGT
SmilChr01G002766 Chr01 NC_080387.1:46058559-46058570promoter 内 1772-1783 bp - 2218 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 46051009-46056341(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 CGCGGACGTGGT