转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr05G004392; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00022653-RA_Salv SmilChr05G004392 WRKY XP_057811204.1 MP00506 AAAAGTCAACGAC

可能结合的靶基因

9818 个结合位点 7173 个候选靶基因 第 71 / 144 下载 TSV

上一页 71 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr01G005990 Chr01 NC_080387.1:75512509-75512521promoter 内 1243-1255 bp - 2746 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 75506859-75509763(-) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 CCAAGTCAACCAT
SmilChr01G000737 Chr01 NC_080387.1:16343418-16343430promoter 内 1222-1234 bp - 2767 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 16337692-16340651(-) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 GGAAGTCAACAAT
SmilChr01G001398 Chr01 NC_080387.1:27479479-27479491promoter 内 1218-1230 bp + 2771 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 27475464-27476708(-) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 ACTGTTGACTTCA
SmilChr02G001703 Chr02 NC_080388.1:31333509-31333521promoter 内 1190-1202 bp - 2799 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 31328881-31330710(-) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 AAAAGTCAAGGTC
SmilChr01G003994 Chr01 NC_080387.1:58369617-58369629promoter 内 1111-1123 bp + 2878 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 58363258-58366739(-) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 CAGGTTGACTATT
SmilChr03G001507 Chr03 NC_080389.1:18431018-18431030promoter 内 1012-1024 bp - 2977 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 18434007-18436379(+) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 GACCTTGACTTTT
SmilChr02G002883 Chr02 NC_080388.1:49104802-49104814promoter 内 1006-1018 bp - 2983 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 49099623-49101819(-) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 GAGAGTCAACCCT
SmilChr03G002284 Chr03 NC_080389.1:36029392-36029404promoter 内 1006-1018 bp - 2983 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 36025166-36026409(-) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 CAAAGTCAAACAC
SmilChr03G000487 Chr03 NC_080389.1:5191800-5191812promoter 内 981-993 bp + 3008 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 5194820-5202987(+) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 GGCGGTCAACGGA
SmilChr02G004713 Chr02 NC_080388.1:69397237-69397249promoter 内 924-936 bp - 3065 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 69400314-69401812(+) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 AACATTGACTTTG
SmilChr01G000740 Chr01 NC_080387.1:16396296-16396308promoter 内 923-935 bp + 3066 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 16399374-16400258(+) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 AAAAGTCAAGGTC
SmilChr04G000891 Chr04 NC_080390.1:11430430-11430442promoter 内 857-869 bp + 3132 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 11425226-11427298(-) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 GCCGTTGACCAAA
SmilChr03G001532 Chr03 NC_080389.1:19128374-19128386promoter 内 852-864 bp + 3137 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 19123567-19125237(-) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 ATCGTTGACCACG
SmilChr01G004397 Chr01 NC_080387.1:62112498-62112510promoter 内 799-811 bp - 3190 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 62115700-62117532(+) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 GTGGTTGACTTGA
SmilChr04G000852 Chr04 NC_080390.1:10769369-10769381promoter 内 781-793 bp + 3208 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 10772589-10778509(+) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 TGAAGTCAACAGT
SmilChr03G002544 Chr03 NC_080389.1:40617315-40617327promoter 内 721-733 bp + 3268 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 40620595-40622823(+) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 CAGAGTCAACCCG
SmilChr02G004286 Chr02 NC_080388.1:65164283-65164295promoter 内 701-713 bp - 3288 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 65167583-65167655(+) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 GTTGTTGACTCTC
SmilChr03G002083 Chr03 NC_080389.1:32044264-32044276promoter 内 685-697 bp + 3304 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 32047580-32052217(+) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 CGTGGTCAACGAT
SmilChr01G000839 Chr01 NC_080387.1:18137514-18137526promoter 内 622-634 bp + 3367 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 18111466-18134147(-) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 GACCTTGACTTTT
SmilChr04G000828 Chr04 NC_080390.1:10433556-10433568promoter 内 596-608 bp - 3393 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 10436961-10437734(+) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 ACCTTTGACTTGC
SmilChr01G004774 Chr01 NC_080387.1:65932235-65932247promoter 内 510-522 bp - 3479 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 65926426-65928756(-) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 TCAGGTCAACGTG
SmilChr03G002325 Chr03 NC_080389.1:36599361-36599373promoter 内 509-521 bp - 3480 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 36602853-36603350(+) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 GACCTTGACTTTT
SmilChr01G005708 Chr01 NC_080387.1:73312010-73312022promoter 内 473-485 bp - 3516 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 73315538-73316278(+) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 TGTGTTGACTTAG
SmilChr02G002002 Chr02 NC_080388.1:36167060-36167072promoter 内 463-475 bp - 3526 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 36170598-36172024(+) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 TGCGTTGACCCCG
SmilChr02G004834 Chr02 NC_080388.1:70455872-70455884promoter 内 447-459 bp + 3542 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 70459426-70471260(+) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 AGAAGTCAACTCG
SmilChr02G001973 Chr02 NC_080388.1:35707452-35707464promoter 内 394-406 bp - 3595 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 35711059-35711140(+) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 TCCGTTGACTAAA
SmilChr04G001317 Chr04 NC_080390.1:21100456-21100468promoter 内 355-367 bp - 3634 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 21104102-21109945(+) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 TCCGTTGACTAAA
SmilChr01G001898 Chr01 NC_080387.1:34086316-34086328promoter 内 341-353 bp - 3648 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 34089976-34090299(+) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 AATGTTGACTTCG
SmilChr01G004963 Chr01 NC_080387.1:67712470-67712482promoter 内 325-337 bp - 3664 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 67706278-67708806(-) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 AAGAGTCAACAGG
SmilChr02G004333 Chr02 NC_080388.1:65599112-65599124promoter 内 308-320 bp - 3681 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 65593541-65595431(-) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 TCGAGTCAACGAC
SmilChr01G004805 Chr01 NC_080387.1:66245322-66245334promoter 内 258-270 bp - 3731 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 66249065-66252509(+) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 GACCTTGACTTTT
SmilChr03G000611 Chr03 NC_080389.1:6790177-6790189promoter 内 231-243 bp - 3758 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 6785116-6786419(-) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 AGAAGTCAAAGAG
SmilChr03G004038 Chr03 NC_080389.1:59390934-59390946promoter 内 184-196 bp - 3805 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 59383426-59387129(-) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 CTAAGTCAACACA
SmilChr02G005313 Chr02 NC_080388.1:74021860-74021872promoter 内 174-186 bp - 3815 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 74015848-74018045(-) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 CAAAGTCAAACAC
SmilChr03G001097 Chr03 NC_080389.1:12646764-12646776promoter 内 160-172 bp + 3829 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 12650605-12651730(+) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 TATAGTCAACCTC
SmilChr02G001117 Chr02 NC_080388.1:20138893-20138905promoter 内 148-160 bp - 3841 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 20132853-20135052(-) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 AAGAGTCAACACG
SmilChr03G003183 Chr03 NC_080389.1:49282930-49282942promoter 内 95-107 bp - 3894 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 49286836-49291900(+) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 TGCTTTGACTTAT
SmilChr02G005322 Chr02 NC_080388.1:74105148-74105160promoter 内 92-104 bp - 3897 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 74109057-74110040(+) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 TTTGTTGACTATT
SmilChr03G000380 Chr03 NC_080389.1:4251758-4251770promoter 内 67-79 bp + 3922 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 4255692-4259229(+) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 CCAAGTCAACCAT
SmilChr01G000729 Chr01 NC_080387.1:16221516-16221528promoter 内 40-52 bp - 3949 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 16225477-16227754(+) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 GACATTGACTTTA
SmilChr01G000632 Chr01 NC_080387.1:14213169-14213181promoter 内 39-51 bp - 3950 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 14206604-14209219(-) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 AATAGTCAACAAA
SmilChr04G000880 Chr04 NC_080390.1:11195555-11195567promoter 内 13-25 bp + 3976 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 11199543-11203389(+) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 AAAAGTCAATGTG
SmilChr01G000469 Chr01 NC_080387.1:9584008-9584020promoter 内 1987-1999 bp - 2002 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 4 9586022-9587586(+) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 CTCGTTGACCTAA
SmilChr03G000934 Chr03 NC_080389.1:10650828-10650840promoter 内 1958-1970 bp + 2031 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 4 10647369-10648797(-) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 AGTGTTGACTCTG
SmilChr04G001404 Chr04 NC_080390.1:22865638-22865650promoter 内 3771-3783 bp + 218 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 3 22863697-22865420(-) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 GTTGTTGACTATA
SmilChr02G000987 Chr02 NC_080388.1:17362421-17362433promoter 内 2953-2965 bp - 1036 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 3 17363469-17366231(+) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 AGCATTGACTTTA
SmilChr02G002714 Chr02 NC_080388.1:46982649-46982661promoter 内 2846-2858 bp + 1143 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 3 46983804-46987494(+) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 CTCAGTCAACGAT
SmilChr02G003646 Chr02 NC_080388.1:57841939-57841951promoter 内 2644-2656 bp + 1345 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 3 57829536-57840594(-) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 ATGGTTGACTATC
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SmilChr02G000548 Chr02 NC_080388.1:7597593-7597605promoter 内 3914-3926 bp + 75 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 2 7596257-7597518(-) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 GTTTTTGACTTTT