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转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family，查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中，并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因，不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif；应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引，可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card，点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
SmilChr04G003117 XP_057809539.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr04G003114 XP_057809538.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr01G005298 XP_057788621.1
ARR-B 1
MP00010
 8344 9778 查靶基因
SmilChr03G003924 XP_057798851.1
NAC 1
MP00059
 8333 9940 查靶基因
SmilChr01G005344 XP_057788686.1
MYB 1
MP00296
 8304 9873 查靶基因
SmilChr08G004408 XP_057780613.1
MYB 1
MP00114
 8151 9897 查靶基因
SmilChr04G001094 XP_057804404.1
WRKY 1
MP00408
 8149 9902 查靶基因
SmilChr07G003597 XP_057773587.1
Nin-like 1
MP00449
 8096 9453 查靶基因
SmilChr02G005433 XP_057792682.1
WRKY 1
MP00209
 8083 9910 查靶基因
SmilChr04G004136 XP_057806072.1
MYB 1
MP00627
 8075 9835 查靶基因
SmilChr01G003955 XP_057779712.1
WRKY 1
MP00450
 8044 9901 查靶基因
SmilChr03G003685 XP_057798538.1
ERF 1
MP00558
 8044 9762 查靶基因
SmilChr07G002937 XP_057777490.1
MIKC_MADS 1
MP00096
 8019 9914 查靶基因
SmilChr02G003833 XP_057794421.1
MYB 1
MP00476
 7981 9904 查靶基因
SmilChr07G002803 XP_057777238.1
NAC 1
MP00221
 7965 9903 查靶基因
SmilChr05G002364 XP_057809766.1
WRKY 1
MP00069
 7882 9917 查靶基因
SmilChr08G003267 XP_057779249.1
MYB 1
MP00406
 7839 9917 查靶基因
SmilChr02G005012 XP_057792191.1
TALE 1
MP00670
 7758 9906 查靶基因
SmilChr07G001978 XP_057776996.1
SBP 1
MP00555
 7648 9805 查靶基因
SmilChr05G000741 XP_057764423.1
ARF 1
MP00021
 7629 9812 查靶基因
SmilChr01G004579 XP_057787263.1
MYB 1
MP00132
 7583 9926 查靶基因
SmilChr05G000593 XP_057764223.1
MIKC_MADS 1
MP00609
 7575 9941 查靶基因
SmilChr03G004518 XP_057799834.1
ERF 1
MP00529
 7559 9247 查靶基因
SmilChr06G001829 XP_057766988.1
MYB 1
MP00510
 7526 9799 查靶基因
SmilChr05G000830 XP_057764550.1
NAC 1
MP00058
 7440 9855 查靶基因
SmilChr08G002543 XP_057778423.1
bZIP 1
MP00303
 7416 9868 查靶基因
SmilChr01G002743 XP_057765725.1
MYB_related 1
MP00565
 7412 9785 查靶基因
SmilChr04G002704 XP_057807081.1
ERF 1
MP00026
 7408 9854 查靶基因
SmilChr05G001395 XP_057765344.1
WRKY 1
MP00071
 7408 9764 查靶基因
SmilChr04G002953 XP_057809314.1
ARF 1
MP00033
 7406 9827 查靶基因
SmilChr01G004199 XP_057782208.1
bHLH 1
MP00074
 7396 9969 查靶基因
SmilChr05G004009 XP_057810662.1
MYB 1
MP00216
 7342 9832 查靶基因
SmilChr03G001606 XP_057802772.1
WRKY 1
MP00539
 7338 9848 查靶基因
SmilChr02G004600 XP_057791481.1
ARF 1
MP00574
 7302 9846 查靶基因
SmilChr03G004179 XP_057799230.1
WRKY 1
MP00464
 7299 9864 查靶基因
SmilChr04G003805 XP_057805691.1
MIKC_MADS 1
MP00315
 7291 9567 查靶基因
SmilChr03G003761 XP_057798625.1
WRKY 1
MP00525
 7235 9838 查靶基因
SmilChr01G001885 XP_057806790.1
WRKY 1
MP00171
 7182 9833 查靶基因
SmilChr05G004392 XP_057811204.1
WRKY 1
MP00506
 7173 9818 查靶基因
SmilChr04G002757 XP_057807158.1
MIKC_MADS 1
MP00272
 7172 9889 查靶基因
SmilChr01G003404 XP_057773670.1
bZIP 1
MP00184
 7147 9840 查靶基因
SmilChr03G002335 XP_057801256.1
bZIP 1
MP00647
 7133 9953 查靶基因
SmilChr07G002075 XP_057773918.1
C2H2 1
MP00485
 7130 8059 查靶基因
SmilChr04G000162 XP_057807467.1
MYB 1
MP00134
 7078 8676 查靶基因
SmilChr04G000040 XP_057808382.1
ERF 1
MP00312
 7006 8490 查靶基因
SmilChr08G001896 XP_057783815.1
MYB 1
MP00564
 6984 9893 查靶基因
SmilChr02G005217 XP_057792502.1
G2-like 1
MP00022
 6959 9720 查靶基因
SmilChr05G000260 XP_057763683.1
bZIP 1
MP00040
 6920 9919 查靶基因
SmilChr01G002885 XP_057767601.1
ERF 1
MP00151
 6907 9976 查靶基因
SmilChr05G001518 XP_057765511.1
WRKY 1
MP00455
 6900 9792 查靶基因
SmilChr03G002503 XP_057801356.1
MYB 1
MP00482
 6899 8940 查靶基因
SmilChr03G001252 XP_057802461.1
bZIP 1
MP00291
 6894 9321 查靶基因
SmilChr06G001365 XP_057768799.1
SBP 1
MP00307
 6893 9755 查靶基因
SmilChr03G003439 XP_057798243.1
bHLH 1
MP00195
 6878 9832 查靶基因
SmilChr06G001111 XP_057768512.1
MYB 1
MP00388
 6870 9774 查靶基因
SmilChr02G000949 XP_057795176.1
bZIP 1
MP00318
 6849 9413 查靶基因
SmilChr01G000025 XP_057790305.1
SBP 1
MP00633
 6833 8026 查靶基因
SmilChr01G004313 XP_057783598.1
bHLH 1
MP00308
 6805 9826 查靶基因
SmilChr02G005502 XP_057792768.1
bHLH 1
MP00082
 6784 9435 查靶基因
SmilChr03G004274 XP_057799397.1
MIKC_MADS 1
MP00080
 6766 9850 查靶基因
SmilChr02G003688 XP_057794248.1
MYB 1
MP00028
 6764 9024 查靶基因
SmilChr04G003367 XP_057804957.1
MYB 1
MP00191
 6736 9690 查靶基因
SmilChr04G000157 XP_057807462.1
bHLH 1
MP00081
 6729 9942 查靶基因
SmilChr07G002147 XP_057774045.1
MYB 1
MP00500
 6697 9681 查靶基因
SmilChr05G002277 XP_057809665.1
ERF 1
MP00452
 6671 7783 查靶基因
SmilChr07G004480 XP_057776222.1
WRKY 1
MP00531
 6663 9784 查靶基因
SmilChr02G004447 XP_057797242.1
HD-ZIP 1
MP00200
 6661 9930 查靶基因
SmilChr04G000070 XP_057807324.1
bHLH 1
MP00034
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G002039 XP_057808459.1
bHLH 1
MP00660
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G005851 XP_057789306.1
MYB 1
MP00055
 6638 9685 查靶基因
SmilChr02G005238 XP_057792594.1
SBP 1
MP00634
 6619 7771 查靶基因
SmilChr06G002048 XP_057770293.1
bHLH 1
MP00035
 6618 9903 查靶基因
SmilChr07G000836 XP_057772437.1
MYB_related 1
MP00568
 6611 9696 查靶基因
SmilChr04G003119 XP_057809542.1
bZIP 1
MP00039
 6610 9936 查靶基因
SmilChr01G004114 XP_057781125.1
WRKY 1
MP00284
 6552 9774 查靶基因
SmilChr08G004246 XP_057780410.1
WRKY 1
MP00422
 6535 9791 查靶基因
SmilChr05G001980 XP_057766076.1
ARF 1
MP00153
 6534 9706 查靶基因
SmilChr04G000094 XP_057807365.1
YABBY 1
MP00620
 6504 9844 查靶基因
SmilChr02G002534 XP_057797741.1
TCP 1
MP00169
 6498 7295 查靶基因
SmilChr05G001269 XP_057765199.1
G2-like 1
MP00252
 6478 9780 查靶基因
SmilChr07G003441 XP_057773618.1
NAC 1
MP00108
 6458 9810 查靶基因
SmilChr02G001791 XP_057795933.1
TCP 1
MP00062
 6454 7249 查靶基因
SmilChr05G003285 XP_057810127.1
RAV 1
MP00024
 6450 9853 查靶基因
SmilChr05G000619 XP_057764205.1
WRKY 1
MP00167
 6439 9756 查靶基因
SmilChr04G003745 XP_057809144.1
C2H2 1
MP00416
 6433 9716 查靶基因
SmilChr02G004607 XP_057791470.1
C2H2 1
MP00608
 6398 9817 查靶基因
SmilChr02G003399 XP_057793859.1
ERF 1
MP00240
 6368 9978 查靶基因
SmilChr01G004920 XP_057788125.1
MYB_related 1
MP00607
 6362 9718 查靶基因
SmilChr06G001059 XP_057768449.1
Dof 1
MP00402
 6278 9875 查靶基因
SmilChr01G004552 XP_057786668.1
bZIP 1
MP00409
 6252 8429 查靶基因
SmilChr01G006187 XP_057798078.1
GRAS 1
MP00611
 6232 9807 查靶基因
SmilChr01G001516 XP_057803325.1
bZIP 1
MP00648
 6170 9939 查靶基因
SmilChr04G003955 XP_057805828.1
ERF 1
MP00120
 6144 7514 查靶基因
SmilChr01G004708 XP_057787833.1
WRKY 1
MP00251
 6140 9713 查靶基因
SmilChr05G001961 XP_057766054.1
MIKC_MADS 1
MP00077
 6125 9815 查靶基因
SmilChr08G000478 XP_057781809.1
GATA 1
MP00130
 6015 9821 查靶基因
SmilChr01G000943 XP_057790035.1
MIKC_MADS 1
MP00508
 5979 7481 查靶基因
SmilChr05G004106 XP_057810779.1
WRKY 1
MP00260
 5932 9706 查靶基因
SmilChr04G003973 XP_057805857.1
HD-ZIP 1
MP00013
 5927 9712 查靶基因
SmilChr03G002207 XP_057801109.1
WRKY 1
MP00299
 5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr03G004274; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00001114-RA_Salv SmilChr03G004274 MIKC_MADS XP_057799397.1 MP00080 CCAAAAAAGGAAAA

可能结合的靶基因

9850 个结合位点 6766 个候选靶基因 第 72 / 136 下载 TSV

上一页 72 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr02G002724 Chr02 NC_080388.1:47134625-47134638promoter 内 1577-1590 bp + 2411 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 47137049-47139241(+) SMil_00001114-RA_Salv MP00080 CCAAAAAGGGAATG
SmilChr02G000336 Chr02 NC_080388.1:4255403-4255416promoter 内 1505-1518 bp + 2483 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 4249585-4252920(-) SMil_00001114-RA_Salv MP00080 CTTTCCTTTTTTTT
SmilChr03G003902 Chr03 NC_080389.1:58119878-58119891promoter 内 1409-1422 bp + 2579 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 58122470-58125884(+) SMil_00001114-RA_Salv MP00080 GCCAAAAAGGCAAG
SmilChr03G002798 Chr03 NC_080389.1:44478689-44478702promoter 内 1391-1404 bp - 2597 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 44481299-44481996(+) SMil_00001114-RA_Salv MP00080 TTTTCCTTTTTTCT
SmilChr04G000433 Chr04 NC_080390.1:4599437-4599450promoter 内 1230-1243 bp - 2758 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 4602208-4604343(+) SMil_00001114-RA_Salv MP00080 CTTTCCTTTTTTTT
SmilChr03G001445 Chr03 NC_080389.1:17235957-17235970promoter 内 1210-1223 bp - 2778 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 17238748-17244183(+) SMil_00001114-RA_Salv MP00080 TTTTCCTTTTTTCT
SmilChr01G005322 Chr01 NC_080387.1:70447995-70448008promoter 内 1130-1143 bp + 2858 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 70442007-70445137(-) SMil_00001114-RA_Salv MP00080 CATTCCCTTTTTGG
SmilChr02G003987 Chr02 NC_080388.1:62122864-62122877promoter 内 1084-1097 bp + 2904 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 62125781-62129586(+) SMil_00001114-RA_Salv MP00080 CGGGAAAAGGAAAG
SmilChr04G000859 Chr04 NC_080390.1:10900781-10900794promoter 内 1040-1053 bp - 2948 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 10903742-10905247(+) SMil_00001114-RA_Salv MP00080 ATTTCCTTTTTTGC
SmilChr02G002020 Chr02 NC_080388.1:36432470-36432483promoter 内 1033-1046 bp - 2955 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 36426847-36429515(-) SMil_00001114-RA_Salv MP00080 AGAAAAAAGGAAAA
SmilChr03G002852 Chr03 NC_080389.1:45113526-45113539promoter 内 939-952 bp - 3049 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 45106738-45110477(-) SMil_00001114-RA_Salv MP00080 AGAAAAAAGGAAAA
SmilChr01G003398 Chr01 NC_080387.1:52690073-52690086promoter 内 935-948 bp - 3053 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 52693139-52695815(+) SMil_00001114-RA_Salv MP00080 CCTACCATTTTTGG
SmilChr02G004307 Chr02 NC_080388.1:65453036-65453049promoter 内 914-927 bp + 3074 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 65445620-65449962(-) SMil_00001114-RA_Salv MP00080 TTTACCTTTTTTGT
SmilChr01G002400 Chr01 NC_080387.1:41352964-41352977promoter 内 900-913 bp + 3088 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 41356065-41357075(+) SMil_00001114-RA_Salv MP00080 CCCAAAAAGGAATG
SmilChr02G005504 Chr02 NC_080388.1:75166439-75166452promoter 内 806-819 bp + 3182 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 75169634-75173680(+) SMil_00001114-RA_Salv MP00080 CCAAAAAGGGAATG
SmilChr03G002646 Chr03 NC_080389.1:42103139-42103152promoter 内 608-621 bp + 3380 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 42095707-42099759(-) SMil_00001114-RA_Salv MP00080 CTTTCCTTTTTTTT
SmilChr03G001681 Chr03 NC_080389.1:22158561-22158574promoter 内 599-612 bp + 3389 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 22161963-22169280(+) SMil_00001114-RA_Salv MP00080 CCACAAAAGGAAAC
SmilChr02G005434 Chr02 NC_080388.1:74761994-74762007promoter 内 558-571 bp + 3430 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 74755413-74758564(-) SMil_00001114-RA_Salv MP00080 TTTTCCTCTTAGGG
SmilChr03G002602 Chr03 NC_080389.1:41332362-41332375promoter 内 542-555 bp + 3446 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 41328038-41328916(-) SMil_00001114-RA_Salv MP00080 TTTTCCTTTTTTCT
SmilChr02G003445 Chr02 NC_080388.1:55719534-55719547promoter 内 444-457 bp + 3544 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 55713959-55715990(-) SMil_00001114-RA_Salv MP00080 TTTTCCTTTTTTCT
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SmilChr03G003263 Chr03 NC_080389.1:50542936-50542949promoter 内 396-409 bp - 3592 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 50546541-50558684(+) SMil_00001114-RA_Salv MP00080 TTTTCCTTTTTTCT
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SmilChr02G002843 Chr02 NC_080388.1:48570798-48570811promoter 内 196-209 bp + 3792 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 48574603-48577977(+) SMil_00001114-RA_Salv MP00080 CCGAAAAAGGATAA
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SmilChr03G002800 Chr03 NC_080389.1:44478689-44478702promoter 内 83-96 bp - 3905 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 44482607-44483331(+) SMil_00001114-RA_Salv MP00080 TTTTCCTTTTTTCT
SmilChr01G001416 Chr01 NC_080387.1:27753530-27753543promoter 内 22-35 bp - 3966 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 27748842-27749564(-) SMil_00001114-RA_Salv MP00080 ACCAAAAAGGCAAA
SmilChr03G003716 Chr03 NC_080389.1:56152918-56152931promoter 内 21-34 bp - 3967 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 56147032-56148951(-) SMil_00001114-RA_Salv MP00080 CCGAAAAAGGATAA
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