转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr06G001829; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00004434-RA_Salv SmilChr06G001829 MYB XP_057766988.1 MP00510 TTTACCTACCTTT

可能结合的靶基因

9799 个结合位点 7526 个候选靶基因 第 72 / 151 下载 TSV

上一页 72 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr04G000025 Chr04 NC_080390.1:269947-269959promoter 内 2928-2940 bp - 1061 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 1 264758-268886(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CATACCTACCAAT
SmilChr05G001286 Chr05 NC_080391.1:11002295-11002307promoter 内 2924-2936 bp + 1065 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 1 11003372-11005941(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CTTACCTAAATCC
SmilChr02G002635 Chr02 NC_080388.1:45724178-45724190promoter 内 2819-2831 bp + 1170 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 1 45721229-45723008(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CGTTGTAGGTAGG
SmilChr01G004297 Chr01 NC_080387.1:61156795-61156807promoter 内 2810-2822 bp - 1179 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 1 61157986-61163010(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GTTGTTAGGTAAT
SmilChr01G003860 Chr01 NC_080387.1:56879735-56879747promoter 内 2801-2813 bp + 1188 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 1 56874432-56878547(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TAAGTTAGGTAAT
SmilChr03G000152 Chr03 NC_080389.1:1645487-1645499promoter 内 2780-2792 bp + 1209 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 1 1640738-1644278(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TTAATTAGGTAAC
SmilChr01G004133 Chr01 NC_080387.1:59844213-59844225promoter 内 2776-2788 bp - 1213 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 1 59842130-59843000(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TGTACCTACTGCT
SmilChr01G000507 Chr01 NC_080387.1:10234807-10234819promoter 内 2647-2659 bp - 1342 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 1 10236161-10239270(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 AACAGTAGGTACA
SmilChr02G001303 Chr02 NC_080388.1:24175709-24175721promoter 内 2608-2620 bp + 1381 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 1 24174222-24174328(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TAAGTTAGGTAAT
SmilChr02G003126 Chr02 NC_080388.1:52290372-52290384promoter 内 2511-2523 bp + 1478 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 1 52291862-52296540(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GCAACCTACCCCT
SmilChr04G000326 Chr04 NC_080390.1:3004713-3004725promoter 内 2471-2483 bp - 1518 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 1 3006243-3007817(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TCGGGTAGGTGAT
SmilChr04G000648 Chr04 NC_080390.1:7314755-7314767promoter 内 2391-2403 bp + 1598 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 1 7309589-7313157(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 ACAGGTAGGTTAG
SmilChr01G005977 Chr01 NC_080387.1:75437937-75437949promoter 内 2191-2203 bp + 1798 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 1 75433252-75436139(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TTAATTAGGTAAC
SmilChr01G004389 Chr01 NC_080387.1:62052119-62052131promoter 内 1780-1792 bp + 2209 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 1 62054340-62056294(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 ATTACCTAACTTA
SmilChr02G000234 Chr02 NC_080388.1:3014941-3014953promoter 内 1727-1739 bp - 2262 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 1 3011464-3012679(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CGTACCTACCCGG
SmilChr02G002772 Chr02 NC_080388.1:47792295-47792307promoter 内 1505-1517 bp - 2484 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 1 47788873-47789811(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TTAACCTACCCAT
SmilChr02G004392 Chr02 NC_080388.1:66268632-66268644promoter 内 1427-1439 bp + 2562 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 1 66261374-66266070(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GTCATTAGGTAAC
SmilChr01G003459 Chr01 NC_080387.1:53163160-53163172promoter 内 1381-1393 bp + 2608 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 1 53157546-53160552(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GAAGGTAGGCGAA
SmilChr03G002105 Chr03 NC_080389.1:32766805-32766817promoter 内 1341-1353 bp - 2648 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 1 32761755-32764157(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 ATTACCTACTAAC
SmilChr04G003528 Chr04 NC_080390.1:51648210-51648222promoter 内 1248-1260 bp + 2741 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 1 51650963-51651042(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CCTACCTACAGTT
SmilChr04G000111 Chr04 NC_080390.1:969861-969873promoter 内 1234-1246 bp + 2755 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 1 972628-975632(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GTTACCTACAATC
SmilChr02G004249 Chr02 NC_080388.1:64665639-64665651promoter 内 1170-1182 bp - 2819 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 1 64668470-64669673(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GAAGGTAGGCGAA
SmilChr05G000602 Chr05 NC_080391.1:4536763-4536775promoter 内 1142-1154 bp + 2847 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 1 4531464-4533916(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 AGCTGTAGGTAAG
SmilChr01G004508 Chr01 NC_080387.1:63178681-63178693promoter 内 1057-1069 bp - 2932 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 1 63172594-63175749(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GTTACCTAATTAA
SmilChr03G001974 Chr03 NC_080389.1:28492815-28492827promoter 内 1000-1012 bp + 2989 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 1 28487679-28489826(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 ATTAGTAGGTACA
SmilChr04G002579 Chr04 NC_080390.1:41154430-41154442promoter 内 986-998 bp - 3003 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 1 41157445-41162504(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 ATTGGTAGGTATG
SmilChr01G005229 Chr01 NC_080387.1:69853901-69853913promoter 内 964-976 bp + 3025 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 1 69856938-69857458(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TGTACCTACTGCT
SmilChr01G004724 Chr01 NC_080387.1:65432916-65432928promoter 内 954-966 bp + 3035 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 1 65426068-65429881(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TTAATTAGGTAAC
SmilChr01G002570 Chr01 NC_080387.1:43798061-43798073promoter 内 844-856 bp - 3145 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 1 43790527-43794916(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 ATTACCTAACAAC
SmilChr04G000670 Chr04 NC_080390.1:7572256-7572268promoter 内 787-799 bp + 3202 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 1 7566103-7569054(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TTTGGTAGGTGTG
SmilChr01G001684 Chr01 NC_080387.1:31070031-31070043promoter 内 666-678 bp + 3323 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 1 31073366-31074461(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GTTACCTAATTAA
SmilChr01G006170 Chr01 NC_080387.1:77212378-77212390promoter 内 565-577 bp + 3424 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 1 77205882-77208954(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 ATGGGTAGGTTAA
SmilChr01G002177 Chr01 NC_080387.1:37857133-37857145promoter 内 544-556 bp - 3445 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 1 37860590-37862542(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 AGGGGTAGGTTAC
SmilChr04G001939 Chr04 NC_080390.1:31506780-31506792promoter 内 536-548 bp + 3453 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 1 31501114-31503327(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 ATTAGTAGGTACA
SmilChr05G000788 Chr05 NC_080391.1:6154892-6154904promoter 内 483-495 bp + 3506 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 1 6150259-6151386(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 ATTAGTAGGTACA
SmilChr01G004685 Chr01 NC_080387.1:64927789-64927801promoter 内 255-267 bp - 3734 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 1 64921586-64924055(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GGTACCTACCGTA
SmilChr03G001501 Chr03 NC_080389.1:18359654-18359666promoter 内 125-137 bp + 3864 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 1 18355401-18355790(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 ATTAGTAGGTACA
SmilChr03G000846 Chr03 NC_080389.1:9650084-9650096promoter 内 1986-1998 bp + 2003 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 5 9652099-9653931(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 ATTACCTACTTTA
SmilChr03G000845 Chr03 NC_080389.1:9650084-9650096promoter 内 3373-3385 bp + 616 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 4 9637415-9649468(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TAAAGTAGGTAAT
SmilChr03G000370 Chr03 NC_080389.1:4145567-4145579promoter 内 3588-3600 bp + 401 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 3 4143797-4145166(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TAAAGTAGGTAAT
SmilChr03G000372 Chr03 NC_080389.1:4160092-4160104promoter 内 3161-3173 bp + 828 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 3 4158434-4159264(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TAAAGTAGGTAAT
SmilChr02G003340 Chr02 NC_080388.1:54618587-54618599promoter 内 963-975 bp - 3026 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 3 54613186-54615561(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TCTACCTACATCA
SmilChr02G000018 Chr02 NC_080388.1:140908-140920promoter 内 678-690 bp + 3311 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 3 133440-137597(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TAAAGTAGGTAAT
SmilChr04G002592 Chr04 NC_080390.1:41334417-41334429promoter 内 3726-3738 bp + 263 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 2 41334692-41339669(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 ACTACCTACTTTA
SmilChr02G002364 Chr02 NC_080388.1:41419649-41419661promoter 内 3599-3611 bp + 390 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 2 41417183-41419259(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 ACTGGTAGGTTGG
SmilChr04G002898 Chr04 NC_080390.1:45268425-45268437promoter 内 3528-3540 bp + 461 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 2 45266190-45267964(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TTGGGTAGGTTAG
SmilChr02G001052 Chr02 NC_080388.1:18775747-18775759promoter 内 2903-2915 bp - 1086 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 2 18772030-18774661(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TTTACCTACAATA
SmilChr05G000990 Chr05 NC_080391.1:8046123-8046135promoter 内 2781-2793 bp - 1208 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 2 8042929-8044915(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GTTACCTAATGTA
SmilChr04G004165 Chr04 NC_080390.1:56305832-56305844promoter 内 2732-2744 bp + 1257 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 2 56307101-56309170(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TTTACCTAATAGA
SmilChr02G001132 Chr02 NC_080388.1:20460904-20460916promoter 内 2704-2716 bp - 1285 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 2 20462201-20463244(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GAGGGTAGGTGCT