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转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family，查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中，并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因，不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif；应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引，可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card，点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
SmilChr04G003117 XP_057809539.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr04G003114 XP_057809538.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr01G005298 XP_057788621.1
ARR-B 1
MP00010
 8344 9778 查靶基因
SmilChr03G003924 XP_057798851.1
NAC 1
MP00059
 8333 9940 查靶基因
SmilChr01G005344 XP_057788686.1
MYB 1
MP00296
 8304 9873 查靶基因
SmilChr08G004408 XP_057780613.1
MYB 1
MP00114
 8151 9897 查靶基因
SmilChr04G001094 XP_057804404.1
WRKY 1
MP00408
 8149 9902 查靶基因
SmilChr07G003597 XP_057773587.1
Nin-like 1
MP00449
 8096 9453 查靶基因
SmilChr02G005433 XP_057792682.1
WRKY 1
MP00209
 8083 9910 查靶基因
SmilChr04G004136 XP_057806072.1
MYB 1
MP00627
 8075 9835 查靶基因
SmilChr01G003955 XP_057779712.1
WRKY 1
MP00450
 8044 9901 查靶基因
SmilChr03G003685 XP_057798538.1
ERF 1
MP00558
 8044 9762 查靶基因
SmilChr07G002937 XP_057777490.1
MIKC_MADS 1
MP00096
 8019 9914 查靶基因
SmilChr02G003833 XP_057794421.1
MYB 1
MP00476
 7981 9904 查靶基因
SmilChr07G002803 XP_057777238.1
NAC 1
MP00221
 7965 9903 查靶基因
SmilChr05G002364 XP_057809766.1
WRKY 1
MP00069
 7882 9917 查靶基因
SmilChr08G003267 XP_057779249.1
MYB 1
MP00406
 7839 9917 查靶基因
SmilChr02G005012 XP_057792191.1
TALE 1
MP00670
 7758 9906 查靶基因
SmilChr07G001978 XP_057776996.1
SBP 1
MP00555
 7648 9805 查靶基因
SmilChr05G000741 XP_057764423.1
ARF 1
MP00021
 7629 9812 查靶基因
SmilChr01G004579 XP_057787263.1
MYB 1
MP00132
 7583 9926 查靶基因
SmilChr05G000593 XP_057764223.1
MIKC_MADS 1
MP00609
 7575 9941 查靶基因
SmilChr03G004518 XP_057799834.1
ERF 1
MP00529
 7559 9247 查靶基因
SmilChr06G001829 XP_057766988.1
MYB 1
MP00510
 7526 9799 查靶基因
SmilChr05G000830 XP_057764550.1
NAC 1
MP00058
 7440 9855 查靶基因
SmilChr08G002543 XP_057778423.1
bZIP 1
MP00303
 7416 9868 查靶基因
SmilChr01G002743 XP_057765725.1
MYB_related 1
MP00565
 7412 9785 查靶基因
SmilChr04G002704 XP_057807081.1
ERF 1
MP00026
 7408 9854 查靶基因
SmilChr05G001395 XP_057765344.1
WRKY 1
MP00071
 7408 9764 查靶基因
SmilChr04G002953 XP_057809314.1
ARF 1
MP00033
 7406 9827 查靶基因
SmilChr01G004199 XP_057782208.1
bHLH 1
MP00074
 7396 9969 查靶基因
SmilChr05G004009 XP_057810662.1
MYB 1
MP00216
 7342 9832 查靶基因
SmilChr03G001606 XP_057802772.1
WRKY 1
MP00539
 7338 9848 查靶基因
SmilChr02G004600 XP_057791481.1
ARF 1
MP00574
 7302 9846 查靶基因
SmilChr03G004179 XP_057799230.1
WRKY 1
MP00464
 7299 9864 查靶基因
SmilChr04G003805 XP_057805691.1
MIKC_MADS 1
MP00315
 7291 9567 查靶基因
SmilChr03G003761 XP_057798625.1
WRKY 1
MP00525
 7235 9838 查靶基因
SmilChr01G001885 XP_057806790.1
WRKY 1
MP00171
 7182 9833 查靶基因
SmilChr05G004392 XP_057811204.1
WRKY 1
MP00506
 7173 9818 查靶基因
SmilChr04G002757 XP_057807158.1
MIKC_MADS 1
MP00272
 7172 9889 查靶基因
SmilChr01G003404 XP_057773670.1
bZIP 1
MP00184
 7147 9840 查靶基因
SmilChr03G002335 XP_057801256.1
bZIP 1
MP00647
 7133 9953 查靶基因
SmilChr07G002075 XP_057773918.1
C2H2 1
MP00485
 7130 8059 查靶基因
SmilChr04G000162 XP_057807467.1
MYB 1
MP00134
 7078 8676 查靶基因
SmilChr04G000040 XP_057808382.1
ERF 1
MP00312
 7006 8490 查靶基因
SmilChr08G001896 XP_057783815.1
MYB 1
MP00564
 6984 9893 查靶基因
SmilChr02G005217 XP_057792502.1
G2-like 1
MP00022
 6959 9720 查靶基因
SmilChr05G000260 XP_057763683.1
bZIP 1
MP00040
 6920 9919 查靶基因
SmilChr01G002885 XP_057767601.1
ERF 1
MP00151
 6907 9976 查靶基因
SmilChr05G001518 XP_057765511.1
WRKY 1
MP00455
 6900 9792 查靶基因
SmilChr03G002503 XP_057801356.1
MYB 1
MP00482
 6899 8940 查靶基因
SmilChr03G001252 XP_057802461.1
bZIP 1
MP00291
 6894 9321 查靶基因
SmilChr06G001365 XP_057768799.1
SBP 1
MP00307
 6893 9755 查靶基因
SmilChr03G003439 XP_057798243.1
bHLH 1
MP00195
 6878 9832 查靶基因
SmilChr06G001111 XP_057768512.1
MYB 1
MP00388
 6870 9774 查靶基因
SmilChr02G000949 XP_057795176.1
bZIP 1
MP00318
 6849 9413 查靶基因
SmilChr01G000025 XP_057790305.1
SBP 1
MP00633
 6833 8026 查靶基因
SmilChr01G004313 XP_057783598.1
bHLH 1
MP00308
 6805 9826 查靶基因
SmilChr02G005502 XP_057792768.1
bHLH 1
MP00082
 6784 9435 查靶基因
SmilChr03G004274 XP_057799397.1
MIKC_MADS 1
MP00080
 6766 9850 查靶基因
SmilChr02G003688 XP_057794248.1
MYB 1
MP00028
 6764 9024 查靶基因
SmilChr04G003367 XP_057804957.1
MYB 1
MP00191
 6736 9690 查靶基因
SmilChr04G000157 XP_057807462.1
bHLH 1
MP00081
 6729 9942 查靶基因
SmilChr07G002147 XP_057774045.1
MYB 1
MP00500
 6697 9681 查靶基因
SmilChr05G002277 XP_057809665.1
ERF 1
MP00452
 6671 7783 查靶基因
SmilChr07G004480 XP_057776222.1
WRKY 1
MP00531
 6663 9784 查靶基因
SmilChr02G004447 XP_057797242.1
HD-ZIP 1
MP00200
 6661 9930 查靶基因
SmilChr04G000070 XP_057807324.1
bHLH 1
MP00034
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G002039 XP_057808459.1
bHLH 1
MP00660
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G005851 XP_057789306.1
MYB 1
MP00055
 6638 9685 查靶基因
SmilChr02G005238 XP_057792594.1
SBP 1
MP00634
 6619 7771 查靶基因
SmilChr06G002048 XP_057770293.1
bHLH 1
MP00035
 6618 9903 查靶基因
SmilChr07G000836 XP_057772437.1
MYB_related 1
MP00568
 6611 9696 查靶基因
SmilChr04G003119 XP_057809542.1
bZIP 1
MP00039
 6610 9936 查靶基因
SmilChr01G004114 XP_057781125.1
WRKY 1
MP00284
 6552 9774 查靶基因
SmilChr08G004246 XP_057780410.1
WRKY 1
MP00422
 6535 9791 查靶基因
SmilChr05G001980 XP_057766076.1
ARF 1
MP00153
 6534 9706 查靶基因
SmilChr04G000094 XP_057807365.1
YABBY 1
MP00620
 6504 9844 查靶基因
SmilChr02G002534 XP_057797741.1
TCP 1
MP00169
 6498 7295 查靶基因
SmilChr05G001269 XP_057765199.1
G2-like 1
MP00252
 6478 9780 查靶基因
SmilChr07G003441 XP_057773618.1
NAC 1
MP00108
 6458 9810 查靶基因
SmilChr02G001791 XP_057795933.1
TCP 1
MP00062
 6454 7249 查靶基因
SmilChr05G003285 XP_057810127.1
RAV 1
MP00024
 6450 9853 查靶基因
SmilChr05G000619 XP_057764205.1
WRKY 1
MP00167
 6439 9756 查靶基因
SmilChr04G003745 XP_057809144.1
C2H2 1
MP00416
 6433 9716 查靶基因
SmilChr02G004607 XP_057791470.1
C2H2 1
MP00608
 6398 9817 查靶基因
SmilChr02G003399 XP_057793859.1
ERF 1
MP00240
 6368 9978 查靶基因
SmilChr01G004920 XP_057788125.1
MYB_related 1
MP00607
 6362 9718 查靶基因
SmilChr06G001059 XP_057768449.1
Dof 1
MP00402
 6278 9875 查靶基因
SmilChr01G004552 XP_057786668.1
bZIP 1
MP00409
 6252 8429 查靶基因
SmilChr01G006187 XP_057798078.1
GRAS 1
MP00611
 6232 9807 查靶基因
SmilChr01G001516 XP_057803325.1
bZIP 1
MP00648
 6170 9939 查靶基因
SmilChr04G003955 XP_057805828.1
ERF 1
MP00120
 6144 7514 查靶基因
SmilChr01G004708 XP_057787833.1
WRKY 1
MP00251
 6140 9713 查靶基因
SmilChr05G001961 XP_057766054.1
MIKC_MADS 1
MP00077
 6125 9815 查靶基因
SmilChr08G000478 XP_057781809.1
GATA 1
MP00130
 6015 9821 查靶基因
SmilChr01G000943 XP_057790035.1
MIKC_MADS 1
MP00508
 5979 7481 查靶基因
SmilChr05G004106 XP_057810779.1
WRKY 1
MP00260
 5932 9706 查靶基因
SmilChr04G003973 XP_057805857.1
HD-ZIP 1
MP00013
 5927 9712 查靶基因
SmilChr03G002207 XP_057801109.1
WRKY 1
MP00299
 5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr04G000040; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00000579-RA_Salv SmilChr04G000040 ERF XP_057808382.1 MP00312 AATTGTCGGTGGAGT

可能结合的靶基因

8490 个结合位点 7006 个候选靶基因 第 74 / 141 下载 TSV

上一页 74 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr01G003806 Chr01 NC_080387.1:56449152-56449166promoter 内 2909-2923 bp + 1078 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 2 56446152-56448074(-) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 CCTCCACCGCCATCC
SmilChr05G003087 Chr05 NC_080391.1:39068054-39068068promoter 内 2711-2725 bp + 1276 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 2 39069344-39070778(+) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 CTATGTCGGTTGTGG
SmilChr04G002112 Chr04 NC_080390.1:34100867-34100881promoter 内 2701-2715 bp - 1286 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 2 34094599-34099581(-) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 CTATGTCGGTTGTGG
SmilChr04G003024 Chr04 NC_080390.1:46659190-46659204promoter 内 2415-2429 bp + 1572 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 2 46660776-46661287(+) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 CTATGTCGGTTGTGG
SmilChr01G005306 Chr01 NC_080387.1:70323158-70323172promoter 内 2376-2390 bp + 1611 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 2 70324783-70325698(+) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 CTATGTCGGTTGTGG
SmilChr04G003195 Chr04 NC_080390.1:48750216-48750230promoter 内 2332-2346 bp - 1655 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 2 48748113-48748561(-) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 CTATGTCGGTTGTGG
SmilChr03G002182 Chr03 NC_080389.1:33897504-33897518promoter 内 1831-1845 bp - 2156 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 2 33894567-33895348(-) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 TTCTGTCGGTGATTA
SmilChr07G002622 Chr07 NC_080393.1:25288033-25288047promoter 内 1513-1527 bp + 2474 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 2 25282843-25285559(-) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 CCTCCACCGCCATCC
SmilChr01G000715 Chr01 NC_080387.1:16034696-16034710promoter 内 1417-1431 bp - 2570 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 2 16037280-16040077(+) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 GGCTCACCGACGGCG
SmilChr08G004208 Chr08 NC_080394.1:51491332-51491346promoter 内 1352-1366 bp + 2635 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 2 51486291-51488697(-) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 ACGACACCGACGATT
SmilChr07G003590 Chr07 NC_080393.1:41924086-41924100promoter 内 1256-1270 bp - 2731 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 2 41918258-41921355(-) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 TTCTGTCGGTGATTA
SmilChr03G000349 Chr03 NC_080389.1:3923542-3923556promoter 内 1235-1249 bp - 2752 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 2 3919408-3920790(-) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 GGATGGCGGTGGAGG
SmilChr02G004425 Chr02 NC_080388.1:66583232-66583246promoter 内 1013-1027 bp + 2974 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 2 66586220-66589870(+) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 CTATGTCGGTTGTGG
SmilChr05G001221 Chr05 NC_080391.1:10246060-10246074promoter 内 888-902 bp + 3099 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 2 10249173-10254623(+) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 CTATGTCGGTTGTGG
SmilChr02G003512 Chr02 NC_080388.1:56314977-56314991promoter 内 866-880 bp - 3121 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 2 56318112-56320627(+) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 GGCTCACCGACGGCG
SmilChr03G000350 Chr03 NC_080389.1:3923542-3923556promoter 内 814-828 bp - 3173 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 2 3926729-3927735(+) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 CCTCCACCGCCATCC
SmilChr04G003023 Chr04 NC_080390.1:46659190-46659204promoter 内 392-406 bp + 3595 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 2 46655141-46655595(-) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 CCACAACCGACATAG
SmilChr07G004605 Chr07 NC_080393.1:58857302-58857316promoter 内 301-315 bp + 3686 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 2 58850431-58853616(-) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 GGAACACCGACACCA
SmilChr05G004340 Chr05 NC_080391.1:57054219-57054233promoter 内 3976-3990 bp + 11 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 57054244-57059014(+) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 TTTTGTCGGTTGGGG
SmilChr07G002471 Chr07 NC_080393.1:23233747-23233761promoter 内 3949-3963 bp + 38 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 23228882-23233709(-) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 ACTCCACCGCCAATT
SmilChr02G003312 Chr02 NC_080388.1:54363400-54363414promoter 内 3904-3918 bp - 83 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 54362925-54363317(-) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 CATCGTCGGTGATAT
SmilChr01G000635 Chr01 NC_080387.1:14277129-14277143promoter 内 3901-3915 bp - 86 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 14277229-14280357(+) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 CATGCACCGACATTC
SmilChr01G003274 Chr01 NC_080387.1:51458754-51458768promoter 内 3859-3873 bp - 128 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 51453792-51458626(-) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 TTTTGTCGGTGCGAC
SmilChr02G002678 Chr02 NC_080388.1:46349404-46349418promoter 内 3816-3830 bp + 171 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 46349589-46352170(+) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 AATTGGCGGTGGAGT
SmilChr01G003275 Chr01 NC_080387.1:51458754-51458768promoter 内 3790-3804 bp - 197 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 51458965-51463055(+) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 GTCGCACCGACAAAA
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SmilChr08G004099 Chr08 NC_080394.1:49681552-49681566promoter 内 3705-3719 bp - 282 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 49680341-49681270(-) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 CACCGTCGGTGCAAT
SmilChr05G002418 Chr05 NC_080391.1:26698333-26698347promoter 内 3631-3645 bp - 356 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 26697171-26697977(-) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 TATCGTCGGTGACAT
SmilChr02G005125 Chr02 NC_080388.1:72714476-72714490promoter 内 3598-3612 bp - 389 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 72714879-72730812(+) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 TATGCACCGACAATC
SmilChr06G000732 Chr06 NC_080392.1:6752844-6752858promoter 内 3449-3463 bp + 538 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 6753396-6755476(+) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 GTCTGTCGGTGAAAA
SmilChr05G002240 Chr05 NC_080391.1:24046193-24046207promoter 内 3409-3423 bp + 578 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 24046785-24048737(+) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 ATTCGTCGGTGAACG
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SmilChr05G002223 Chr05 NC_080391.1:23754090-23754104promoter 内 3300-3314 bp - 687 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 23754791-23754863(+) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 GCATCGCCGACAAGC
SmilChr05G002239 Chr05 NC_080391.1:24046193-24046207promoter 内 3203-3217 bp + 784 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 24042618-24045409(-) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 CGTTCACCGACGAAT
SmilChr01G003048 Chr01 NC_080387.1:49450074-49450088promoter 内 3172-3186 bp + 815 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 49450903-49452158(+) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 AAACGTCGGTGGATT
SmilChr08G002086 Chr08 NC_080394.1:18745730-18745744promoter 内 3156-3170 bp - 831 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 18742299-18744899(-) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 GGATGGCGGTGGAGG
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SmilChr04G003808 Chr04 NC_080390.1:54251830-54251844promoter 内 2900-2914 bp + 1087 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 54248608-54250743(-) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 AGCACACCGACACCT
SmilChr04G003809 Chr04 NC_080390.1:54251830-54251844promoter 内 2898-2912 bp + 1089 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 54252933-54255552(+) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 AGGTGTCGGTGTGCT
SmilChr07G001018 Chr07 NC_080393.1:7404605-7404619promoter 内 2866-2880 bp + 1121 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 7402622-7403484(-) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 CCTCCACCGCCAGGA
SmilChr07G002105 Chr07 NC_080393.1:19150843-19150857promoter 内 2841-2855 bp - 1146 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 19152003-19156324(+) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 ACACCACCGACTAGG
SmilChr01G003581 Chr01 NC_080387.1:54379824-54379838promoter 内 2835-2849 bp + 1152 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 54376761-54378672(-) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 CACTCACCGACGCGA
SmilChr04G003052 Chr04 NC_080390.1:47088192-47088206promoter 内 2713-2727 bp - 1274 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 47083231-47086918(-) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 CGCCGTCGGTGAGCC
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SmilChr02G001635 Chr02 NC_080388.1:30335344-30335358promoter 内 2653-2667 bp + 1334 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 30331034-30334010(-) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 CCACAACCGACATAG
SmilChr08G000716 Chr08 NC_080394.1:5314432-5314446promoter 内 2588-2602 bp + 1399 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 5308116-5313033(-) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 TAGCTACCGACAGCT