转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr01G003404; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00027732-RA_Salv SmilChr01G003404 bZIP XP_057773670.1 MP00184 TTGACAGCTGTA

可能结合的靶基因

9840 个结合位点 7147 个候选靶基因 第 77 / 143 下载 TSV

上一页 77 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr04G000661 Chr04 NC_080390.1:7476872-7476883promoter 内 1488-1499 bp - 2502 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 2 7471540-7474370(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GTACCAGCTGTA
SmilChr02G002899 Chr02 NC_080388.1:49257183-49257194promoter 内 1487-1498 bp + 2503 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 2 49259697-49261085(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GTACCAGCTGTA
SmilChr01G004409 Chr01 NC_080387.1:62183120-62183131promoter 内 1381-1392 bp - 2609 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 2 62185740-62186561(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AACAGCTGGATA
SmilChr08G003474 Chr08 NC_080394.1:37348572-37348583promoter 内 1236-1247 bp + 2754 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 2 37351337-37352979(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TATCCAGCTGTT
SmilChr04G000663 Chr04 NC_080390.1:7495863-7495874promoter 内 1192-1203 bp - 2798 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 2 7490554-7493065(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GTACCAGCTGTA
SmilChr04G002525 Chr04 NC_080390.1:40281841-40281852promoter 内 1191-1202 bp + 2799 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 2 40284651-40287196(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GTACCAGCTGTA
SmilChr02G003206 Chr02 NC_080388.1:53199662-53199673promoter 内 1157-1168 bp + 2833 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 2 53202506-53205087(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GTACCAGCTGTA
SmilChr05G000023 Chr05 NC_080391.1:102111-102122promoter 内 1116-1127 bp - 2874 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 2 104996-116536(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AACAGCTGGATA
SmilChr01G000167 Chr01 NC_080387.1:2740933-2740944promoter 内 1111-1122 bp + 2879 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 2 2737290-2738054(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TCTAGCTGTCTC
SmilChr03G000663 Chr03 NC_080389.1:7433984-7433995promoter 内 987-998 bp + 3003 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 2 7436998-7438713(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TATCCAGCTGTT
SmilChr03G001547 Chr03 NC_080389.1:19481987-19481998promoter 内 970-981 bp + 3020 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 2 19485018-19486593(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TATCCAGCTGTT
SmilChr03G000571 Chr03 NC_080389.1:6223236-6223247promoter 内 784-795 bp + 3206 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 2 6217100-6220030(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AACAGCTGGATA
SmilChr02G000581 Chr02 NC_080388.1:8378038-8378049promoter 内 775-786 bp - 3215 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 2 8373689-8374823(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TATCCAGCTGTT
SmilChr06G002985 Chr06 NC_080392.1:42640875-42640886promoter 内 698-709 bp + 3292 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 2 42644178-42645632(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TATCCAGCTGTT
SmilChr02G001677 Chr02 NC_080388.1:31008500-31008511promoter 内 674-685 bp - 3316 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 2 31003685-31005184(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TATCCAGCTGTT
SmilChr03G003061 Chr03 NC_080389.1:47554736-47554747promoter 内 665-676 bp - 3325 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 2 47558072-47559707(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AACAGCTGGATA
SmilChr05G002779 Chr05 NC_080391.1:32479777-32479788promoter 内 581-592 bp + 3409 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 2 32475326-32476368(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AACAGCTGGATA
SmilChr05G003940 Chr05 NC_080391.1:53168190-53168201promoter 内 529-540 bp - 3461 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 2 53171662-53178336(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CACAGCTGGATT
SmilChr02G000225 Chr02 NC_080388.1:2937262-2937273promoter 内 526-537 bp - 3464 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 2 2940737-2943803(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AACAGCTGGATA
SmilChr03G000001 Chr03 NC_080389.1:46107-46118promoter 内 504-515 bp - 3486 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 2 40523-42621(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TATCCAGCTGTT
SmilChr01G000128 Chr01 NC_080387.1:2162152-2162163promoter 内 474-485 bp - 3516 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 2 2150771-2158636(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TATCCAGCTGTT
SmilChr01G000421 Chr01 NC_080387.1:8466803-8466814promoter 内 267-278 bp - 3723 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 2 8470537-8474719(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AACAGCTGGATA
SmilChr02G004314 Chr02 NC_080388.1:65481487-65481498promoter 内 109-120 bp + 3881 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 2 65475690-65477606(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AACAGCTGGATA
SmilChr07G003644 Chr07 NC_080393.1:43193612-43193623promoter 内 98-109 bp + 3892 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 2 43185987-43189720(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TACAGCTGTAGG
SmilChr06G000739 Chr06 NC_080392.1:6830936-6830947promoter 内 5-16 bp - 3985 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 2 6825335-6826951(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TATCCAGCTGTT
SmilChr05G000894 Chr05 NC_080391.1:7075343-7075354promoter 内 3919-3930 bp - 71 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 7075425-7078319(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CCCAACTGTCAA
SmilChr03G003459 Chr03 NC_080389.1:52970872-52970883promoter 内 3898-3909 bp - 92 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 52970975-52976716(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CCCAACTGTCAA
SmilChr05G000957 Chr05 NC_080391.1:7723951-7723962promoter 内 3842-3853 bp - 148 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 7724110-7726892(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CCCAACTGTCAA
SmilChr05G001844 Chr05 NC_080391.1:18482655-18482666promoter 内 3806-3817 bp - 184 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 18480474-18482471(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CCGACAGCTCAC
SmilChr02G005144 Chr02 NC_080388.1:72842676-72842687promoter 内 3777-3788 bp - 213 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 72840117-72842463(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AATCCAGCTGTG
SmilChr03G004331 Chr03 NC_080389.1:61668764-61668775promoter 内 3630-3641 bp - 360 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 61669135-61676778(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CCCAACTGTCAA
SmilChr04G003968 Chr04 NC_080390.1:55156450-55156461promoter 内 3607-3618 bp - 383 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 55156844-55158172(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CCCAACTGTCAA
SmilChr02G000856 Chr02 NC_080388.1:14604892-14604903promoter 内 3551-3562 bp + 439 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 14605342-14605797(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGTTGGG
SmilChr07G000285 Chr07 NC_080393.1:1851032-1851043promoter 内 3479-3490 bp + 511 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 1851554-1854430(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GAGACAGCTAGA
SmilChr06G001440 Chr06 NC_080392.1:15214189-15214200promoter 内 3320-3331 bp + 670 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 15208420-15213519(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GATAGCTGTCCA
SmilChr01G001543 Chr01 NC_080387.1:29442248-29442259promoter 内 3319-3330 bp - 671 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 29442930-29445692(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GTTAGCTGTCGT
SmilChr06G002005 Chr06 NC_080392.1:25724633-25724644promoter 内 3312-3323 bp - 678 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 25725322-25727894(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GCTAGCTGTCCT
SmilChr03G004522 Chr03 NC_080389.1:63280051-63280062promoter 内 3096-3107 bp + 894 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 63280956-63286000(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ACTACAGCTGAC
SmilChr06G001780 Chr06 NC_080392.1:20823955-20823966promoter 内 2923-2934 bp + 1067 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 20825033-20829097(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CCGACAGCTCAC
SmilChr01G000926 Chr01 NC_080387.1:19642627-19642638promoter 内 2894-2905 bp - 1096 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 19638550-19641531(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GAGACAGCTAGA
SmilChr03G001392 Chr03 NC_080389.1:16503060-16503071promoter 内 2789-2800 bp + 1201 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 16504272-16507413(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TGGACAGCTATC
SmilChr07G003637 Chr07 NC_080393.1:43086113-43086124promoter 内 2747-2758 bp + 1243 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 43083464-43084870(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CACAGCTGGATT
SmilChr04G004127 Chr04 NC_080390.1:56104846-56104857promoter 内 2746-2757 bp + 1244 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 56106101-56108163(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AATCCAGCTGTG
SmilChr08G000530 Chr08 NC_080394.1:3862998-3863009promoter 内 2716-2727 bp - 1274 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 3860127-3861724(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGTTGGG
SmilChr08G000954 Chr08 NC_080394.1:7110360-7110371promoter 内 2638-2649 bp + 1352 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 7106469-7109008(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TCTAGCTGTCTC
SmilChr02G003180 Chr02 NC_080388.1:52962983-52962994promoter 内 2627-2638 bp - 1363 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 52957826-52961620(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ACTACAGCTGAC
SmilChr02G000209 Chr02 NC_080388.1:2747203-2747214promoter 内 2499-2510 bp + 1491 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 2743985-2745712(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ACGAGCTGTCCT
SmilChr01G005697 Chr01 NC_080387.1:73240319-73240330promoter 内 2442-2453 bp - 1548 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 73241878-73242772(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TCTAGCTGTCTC
SmilChr02G004371 Chr02 NC_080388.1:66045272-66045283promoter 内 2381-2392 bp - 1609 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 66042505-66043663(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GTGACAGCTGCC
SmilChr02G004368 Chr02 NC_080388.1:65978445-65978456promoter 内 2372-2383 bp - 1618 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 65974899-65976827(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GTGACAGCTGCC