转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr02G003688; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00003637-RA_Salv SmilChr02G003688 MYB XP_057794248.1 MP00028 GGCTCAGCGCG

可能结合的靶基因

9024 个结合位点 6764 个候选靶基因 第 77 / 136 下载 TSV

上一页 77 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr02G004674 Chr02 NC_080388.1:69099953-69099963promoter 内 3851-3861 bp - 140 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 69099466-69099813(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCTCAGCACC
SmilChr04G000907 Chr04 NC_080390.1:11801072-11801082promoter 内 3851-3861 bp - 140 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 11800549-11800932(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCTCAGCACC
SmilChr05G002714 Chr05 NC_080391.1:31255995-31256005promoter 内 3753-3763 bp + 238 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 31251947-31255757(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GACGCTGAGTT
SmilChr06G002631 Chr06 NC_080392.1:37872679-37872689promoter 内 3722-3732 bp - 269 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 37872958-37874121(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GCCGCTGAGAC
SmilChr02G003512 Chr02 NC_080388.1:56317825-56317835promoter 内 3714-3724 bp - 277 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 56318112-56320627(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GCGGCTGAGCT
SmilChr04G002513 Chr04 NC_080390.1:40126897-40126907promoter 内 3710-3720 bp - 281 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 40127188-40128867(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GCCGCTGAGAC
SmilChr03G000333 Chr03 NC_080389.1:3777187-3777197promoter 内 3687-3697 bp - 304 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 3777501-3780755(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGTGCTGAGCT
SmilChr08G001634 Chr08 NC_080394.1:13548148-13548158promoter 内 3682-3692 bp - 309 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 13548467-13550176(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GCCGCTGAGAC
SmilChr06G002651 Chr06 NC_080392.1:38330477-38330487promoter 内 3670-3680 bp - 321 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 38330808-38332529(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GCCGCTGAGAC
SmilChr01G001373 Chr01 NC_080387.1:27058133-27058143promoter 内 3641-3651 bp - 350 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 27058493-27061257(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGCGCTGACGA
SmilChr03G004196 Chr03 NC_080389.1:60605922-60605932promoter 内 3624-3634 bp + 367 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 60606299-60608585(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGCTCAGCCTG
SmilChr03G003755 Chr03 NC_080389.1:56661800-56661810promoter 内 3622-3632 bp - 369 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 56660572-56661431(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCTCAGCACC
SmilChr05G002926 Chr05 NC_080391.1:35264921-35264931promoter 内 3596-3606 bp - 395 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 35265326-35266288(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GACGCTGAGTT
SmilChr07G003466 Chr07 NC_080393.1:38751763-38751773promoter 内 3566-3576 bp - 425 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 38752198-38754479(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGCGCTGACGA
SmilChr01G003528 Chr01 NC_080387.1:53916560-53916570promoter 内 3533-3543 bp - 458 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 53913710-53916102(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TCGTCAGCGCG
SmilChr01G003472 Chr01 NC_080387.1:53257899-53257909promoter 内 3529-3539 bp - 462 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 53255097-53257437(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TCGTCAGCGCG
SmilChr08G004618 Chr08 NC_080394.1:55735091-55735101promoter 内 3483-3493 bp + 508 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 55732002-55734583(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGTGCTGAGCT
SmilChr06G000905 Chr06 NC_080392.1:8540254-8540264promoter 内 3471-3481 bp + 520 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 8537803-8539734(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGCGCTGACGT
SmilChr03G000900 Chr03 NC_080389.1:10292051-10292061promoter 内 3445-3455 bp - 546 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 10290789-10291505(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGCTCAGCCTG
SmilChr04G002932 Chr04 NC_080390.1:45582436-45582446promoter 内 3444-3454 bp + 547 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 45582993-45584207(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCTCAGCCGC
SmilChr02G004968 Chr02 NC_080388.1:71583987-71583997promoter 内 3400-3410 bp - 591 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 71584588-71591206(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGTGCTGAGCT
SmilChr01G003047 Chr01 NC_080387.1:49451123-49451133promoter 内 3369-3379 bp + 622 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 49448957-49450501(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GCGGCTGAGCT
SmilChr05G004395 Chr05 NC_080391.1:57373664-57373674promoter 内 3291-3301 bp - 700 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 57374374-57374445(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GCGGCTGAGCT
SmilChr07G000557 Chr07 NC_080393.1:3844490-3844500promoter 内 3219-3229 bp - 772 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 3841007-3843718(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCTCAGCAGG
SmilChr07G004652 Chr07 NC_080393.1:59335385-59335395promoter 内 3161-3171 bp - 830 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 59336225-59368218(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGTGCTGAGCT
SmilChr08G004701 Chr08 NC_080394.1:56441530-56441540promoter 内 3137-3147 bp + 854 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 56439186-56440676(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGTGCTGAGCT
SmilChr05G002024 Chr05 NC_080391.1:21006276-21006286promoter 内 3090-3100 bp + 901 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 21007187-21010120(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AACTCAGCGTC
SmilChr05G003152 Chr05 NC_080391.1:40246772-40246782promoter 内 3021-3031 bp + 970 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 40247752-40248903(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGCTCAGCCTG
SmilChr07G002120 Chr07 NC_080393.1:19325355-19325365promoter 内 3018-3028 bp - 973 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 19326338-19329515(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GACGCTGAGTT
SmilChr02G003560 Chr02 NC_080388.1:56773096-56773106promoter 内 2978-2988 bp + 1013 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 56768452-56772083(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGTGCTGAGCT
SmilChr08G000695 Chr08 NC_080394.1:5169232-5169242promoter 内 2951-2961 bp - 1040 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 5167355-5168192(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCTCAGCAGG
SmilChr04G002628 Chr04 NC_080390.1:41690815-41690825promoter 内 2947-2957 bp - 1044 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 41691869-41691942(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CCTGCTGAGCT
SmilChr04G002672 Chr04 NC_080390.1:42118817-42118827promoter 内 2947-2957 bp - 1044 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 42119871-42119944(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CCTGCTGAGCT
SmilChr01G001986 Chr01 NC_080387.1:35294715-35294725promoter 内 2904-2914 bp - 1087 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 35291055-35293628(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCTCAGCCGC
SmilChr01G003846 Chr01 NC_080387.1:56777971-56777981promoter 内 2872-2882 bp + 1119 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 56773403-56776852(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CCTGCTGAGCT
SmilChr02G001338 Chr02 NC_080388.1:24878071-24878081promoter 内 2709-2719 bp + 1282 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 24879363-24893876(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCTCAGCACC
SmilChr05G001456 Chr05 NC_080391.1:13296791-13296801promoter 内 2705-2715 bp + 1286 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 13294361-13295505(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GCGGCTGAGCT
SmilChr01G004167 Chr01 NC_080387.1:60183446-60183456promoter 内 2646-2656 bp - 1345 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 60180378-60182101(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GTCTCAGCGGC
SmilChr04G003590 Chr04 NC_080390.1:52324508-52324518promoter 内 2626-2636 bp + 1365 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 52325883-52336260(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 ACGTCAGCGCC
SmilChr07G000371 Chr07 NC_080393.1:2525025-2525035promoter 内 2585-2595 bp - 1406 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 2526441-2528632(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CCTGCTGAGCT
SmilChr05G003217 Chr05 NC_080391.1:41276652-41276662promoter 内 2556-2566 bp + 1435 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 41278097-41279596(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 ACGTCAGCGCC
SmilChr03G003030 Chr03 NC_080389.1:47217348-47217358promoter 内 2547-2557 bp + 1444 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 47218802-47222273(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCTCAGCCGC
SmilChr05G000377 Chr05 NC_080391.1:2830170-2830180promoter 内 2547-2557 bp - 1444 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 2831624-2833390(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGCGCTGACGT
SmilChr05G002158 Chr05 NC_080391.1:22824496-22824506promoter 内 2497-2507 bp + 1494 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 22826000-22831103(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCTCAGCCGC
SmilChr02G001930 Chr02 NC_080388.1:34704152-34704162promoter 内 2465-2475 bp - 1526 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 34701680-34702626(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GTCTCAGCGGC
SmilChr01G003820 Chr01 NC_080387.1:56545073-56545083promoter 内 2454-2464 bp - 1537 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 56546620-56550205(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CCTGCTGAGCT
SmilChr02G003504 Chr02 NC_080388.1:56225055-56225065promoter 内 2372-2382 bp + 1619 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 56226684-56230646(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCTCAGCAGG
SmilChr06G002559 Chr06 NC_080392.1:36765117-36765127promoter 内 2348-2358 bp + 1643 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 36761610-36763474(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GCGGCTGAGCT
SmilChr06G000022 Chr06 NC_080392.1:266154-266164promoter 内 2316-2326 bp + 1675 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 262934-264479(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CCTGCTGAGCT
SmilChr04G003100 Chr04 NC_080390.1:47598361-47598371promoter 内 2305-2315 bp - 1686 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 47590595-47596675(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TCGTCAGCGCG