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转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family，查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中，并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因，不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif；应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引，可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card，点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
SmilChr04G003117 XP_057809539.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr04G003114 XP_057809538.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr01G005298 XP_057788621.1
ARR-B 1
MP00010
 8344 9778 查靶基因
SmilChr03G003924 XP_057798851.1
NAC 1
MP00059
 8333 9940 查靶基因
SmilChr01G005344 XP_057788686.1
MYB 1
MP00296
 8304 9873 查靶基因
SmilChr08G004408 XP_057780613.1
MYB 1
MP00114
 8151 9897 查靶基因
SmilChr04G001094 XP_057804404.1
WRKY 1
MP00408
 8149 9902 查靶基因
SmilChr07G003597 XP_057773587.1
Nin-like 1
MP00449
 8096 9453 查靶基因
SmilChr02G005433 XP_057792682.1
WRKY 1
MP00209
 8083 9910 查靶基因
SmilChr04G004136 XP_057806072.1
MYB 1
MP00627
 8075 9835 查靶基因
SmilChr01G003955 XP_057779712.1
WRKY 1
MP00450
 8044 9901 查靶基因
SmilChr03G003685 XP_057798538.1
ERF 1
MP00558
 8044 9762 查靶基因
SmilChr07G002937 XP_057777490.1
MIKC_MADS 1
MP00096
 8019 9914 查靶基因
SmilChr02G003833 XP_057794421.1
MYB 1
MP00476
 7981 9904 查靶基因
SmilChr07G002803 XP_057777238.1
NAC 1
MP00221
 7965 9903 查靶基因
SmilChr05G002364 XP_057809766.1
WRKY 1
MP00069
 7882 9917 查靶基因
SmilChr08G003267 XP_057779249.1
MYB 1
MP00406
 7839 9917 查靶基因
SmilChr02G005012 XP_057792191.1
TALE 1
MP00670
 7758 9906 查靶基因
SmilChr07G001978 XP_057776996.1
SBP 1
MP00555
 7648 9805 查靶基因
SmilChr05G000741 XP_057764423.1
ARF 1
MP00021
 7629 9812 查靶基因
SmilChr01G004579 XP_057787263.1
MYB 1
MP00132
 7583 9926 查靶基因
SmilChr05G000593 XP_057764223.1
MIKC_MADS 1
MP00609
 7575 9941 查靶基因
SmilChr03G004518 XP_057799834.1
ERF 1
MP00529
 7559 9247 查靶基因
SmilChr06G001829 XP_057766988.1
MYB 1
MP00510
 7526 9799 查靶基因
SmilChr05G000830 XP_057764550.1
NAC 1
MP00058
 7440 9855 查靶基因
SmilChr08G002543 XP_057778423.1
bZIP 1
MP00303
 7416 9868 查靶基因
SmilChr01G002743 XP_057765725.1
MYB_related 1
MP00565
 7412 9785 查靶基因
SmilChr04G002704 XP_057807081.1
ERF 1
MP00026
 7408 9854 查靶基因
SmilChr05G001395 XP_057765344.1
WRKY 1
MP00071
 7408 9764 查靶基因
SmilChr04G002953 XP_057809314.1
ARF 1
MP00033
 7406 9827 查靶基因
SmilChr01G004199 XP_057782208.1
bHLH 1
MP00074
 7396 9969 查靶基因
SmilChr05G004009 XP_057810662.1
MYB 1
MP00216
 7342 9832 查靶基因
SmilChr03G001606 XP_057802772.1
WRKY 1
MP00539
 7338 9848 查靶基因
SmilChr02G004600 XP_057791481.1
ARF 1
MP00574
 7302 9846 查靶基因
SmilChr03G004179 XP_057799230.1
WRKY 1
MP00464
 7299 9864 查靶基因
SmilChr04G003805 XP_057805691.1
MIKC_MADS 1
MP00315
 7291 9567 查靶基因
SmilChr03G003761 XP_057798625.1
WRKY 1
MP00525
 7235 9838 查靶基因
SmilChr01G001885 XP_057806790.1
WRKY 1
MP00171
 7182 9833 查靶基因
SmilChr05G004392 XP_057811204.1
WRKY 1
MP00506
 7173 9818 查靶基因
SmilChr04G002757 XP_057807158.1
MIKC_MADS 1
MP00272
 7172 9889 查靶基因
SmilChr01G003404 XP_057773670.1
bZIP 1
MP00184
 7147 9840 查靶基因
SmilChr03G002335 XP_057801256.1
bZIP 1
MP00647
 7133 9953 查靶基因
SmilChr07G002075 XP_057773918.1
C2H2 1
MP00485
 7130 8059 查靶基因
SmilChr04G000162 XP_057807467.1
MYB 1
MP00134
 7078 8676 查靶基因
SmilChr04G000040 XP_057808382.1
ERF 1
MP00312
 7006 8490 查靶基因
SmilChr08G001896 XP_057783815.1
MYB 1
MP00564
 6984 9893 查靶基因
SmilChr02G005217 XP_057792502.1
G2-like 1
MP00022
 6959 9720 查靶基因
SmilChr05G000260 XP_057763683.1
bZIP 1
MP00040
 6920 9919 查靶基因
SmilChr01G002885 XP_057767601.1
ERF 1
MP00151
 6907 9976 查靶基因
SmilChr05G001518 XP_057765511.1
WRKY 1
MP00455
 6900 9792 查靶基因
SmilChr03G002503 XP_057801356.1
MYB 1
MP00482
 6899 8940 查靶基因
SmilChr03G001252 XP_057802461.1
bZIP 1
MP00291
 6894 9321 查靶基因
SmilChr06G001365 XP_057768799.1
SBP 1
MP00307
 6893 9755 查靶基因
SmilChr03G003439 XP_057798243.1
bHLH 1
MP00195
 6878 9832 查靶基因
SmilChr06G001111 XP_057768512.1
MYB 1
MP00388
 6870 9774 查靶基因
SmilChr02G000949 XP_057795176.1
bZIP 1
MP00318
 6849 9413 查靶基因
SmilChr01G000025 XP_057790305.1
SBP 1
MP00633
 6833 8026 查靶基因
SmilChr01G004313 XP_057783598.1
bHLH 1
MP00308
 6805 9826 查靶基因
SmilChr02G005502 XP_057792768.1
bHLH 1
MP00082
 6784 9435 查靶基因
SmilChr03G004274 XP_057799397.1
MIKC_MADS 1
MP00080
 6766 9850 查靶基因
SmilChr02G003688 XP_057794248.1
MYB 1
MP00028
 6764 9024 查靶基因
SmilChr04G003367 XP_057804957.1
MYB 1
MP00191
 6736 9690 查靶基因
SmilChr04G000157 XP_057807462.1
bHLH 1
MP00081
 6729 9942 查靶基因
SmilChr07G002147 XP_057774045.1
MYB 1
MP00500
 6697 9681 查靶基因
SmilChr05G002277 XP_057809665.1
ERF 1
MP00452
 6671 7783 查靶基因
SmilChr07G004480 XP_057776222.1
WRKY 1
MP00531
 6663 9784 查靶基因
SmilChr02G004447 XP_057797242.1
HD-ZIP 1
MP00200
 6661 9930 查靶基因
SmilChr04G000070 XP_057807324.1
bHLH 1
MP00034
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G002039 XP_057808459.1
bHLH 1
MP00660
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G005851 XP_057789306.1
MYB 1
MP00055
 6638 9685 查靶基因
SmilChr02G005238 XP_057792594.1
SBP 1
MP00634
 6619 7771 查靶基因
SmilChr06G002048 XP_057770293.1
bHLH 1
MP00035
 6618 9903 查靶基因
SmilChr07G000836 XP_057772437.1
MYB_related 1
MP00568
 6611 9696 查靶基因
SmilChr04G003119 XP_057809542.1
bZIP 1
MP00039
 6610 9936 查靶基因
SmilChr01G004114 XP_057781125.1
WRKY 1
MP00284
 6552 9774 查靶基因
SmilChr08G004246 XP_057780410.1
WRKY 1
MP00422
 6535 9791 查靶基因
SmilChr05G001980 XP_057766076.1
ARF 1
MP00153
 6534 9706 查靶基因
SmilChr04G000094 XP_057807365.1
YABBY 1
MP00620
 6504 9844 查靶基因
SmilChr02G002534 XP_057797741.1
TCP 1
MP00169
 6498 7295 查靶基因
SmilChr05G001269 XP_057765199.1
G2-like 1
MP00252
 6478 9780 查靶基因
SmilChr07G003441 XP_057773618.1
NAC 1
MP00108
 6458 9810 查靶基因
SmilChr02G001791 XP_057795933.1
TCP 1
MP00062
 6454 7249 查靶基因
SmilChr05G003285 XP_057810127.1
RAV 1
MP00024
 6450 9853 查靶基因
SmilChr05G000619 XP_057764205.1
WRKY 1
MP00167
 6439 9756 查靶基因
SmilChr04G003745 XP_057809144.1
C2H2 1
MP00416
 6433 9716 查靶基因
SmilChr02G004607 XP_057791470.1
C2H2 1
MP00608
 6398 9817 查靶基因
SmilChr02G003399 XP_057793859.1
ERF 1
MP00240
 6368 9978 查靶基因
SmilChr01G004920 XP_057788125.1
MYB_related 1
MP00607
 6362 9718 查靶基因
SmilChr06G001059 XP_057768449.1
Dof 1
MP00402
 6278 9875 查靶基因
SmilChr01G004552 XP_057786668.1
bZIP 1
MP00409
 6252 8429 查靶基因
SmilChr01G006187 XP_057798078.1
GRAS 1
MP00611
 6232 9807 查靶基因
SmilChr01G001516 XP_057803325.1
bZIP 1
MP00648
 6170 9939 查靶基因
SmilChr04G003955 XP_057805828.1
ERF 1
MP00120
 6144 7514 查靶基因
SmilChr01G004708 XP_057787833.1
WRKY 1
MP00251
 6140 9713 查靶基因
SmilChr05G001961 XP_057766054.1
MIKC_MADS 1
MP00077
 6125 9815 查靶基因
SmilChr08G000478 XP_057781809.1
GATA 1
MP00130
 6015 9821 查靶基因
SmilChr01G000943 XP_057790035.1
MIKC_MADS 1
MP00508
 5979 7481 查靶基因
SmilChr05G004106 XP_057810779.1
WRKY 1
MP00260
 5932 9706 查靶基因
SmilChr04G003973 XP_057805857.1
HD-ZIP 1
MP00013
 5927 9712 查靶基因
SmilChr03G002207 XP_057801109.1
WRKY 1
MP00299
 5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr05G002277; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00003292-RA_Salv SmilChr05G002277 ERF XP_057809665.1 MP00452 TCTTTGCCGACATCA

可能结合的靶基因

7783 个结合位点 6671 个候选靶基因 第 77 / 134 下载 TSV

上一页 77 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr05G000352 Chr05 NC_080391.1:2631551-2631565promoter 内 1220-1234 bp - 2767 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 2 2634332-2635873(+) SMil_00003292-RA_Salv MP00452 CCTTGTCGGCCTGAG
SmilChr05G004198 Chr05 NC_080391.1:55843679-55843693promoter 内 1151-1165 bp - 2836 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 2 55836468-55840843(-) SMil_00003292-RA_Salv MP00452 CCCTTGCCGACGCTG
SmilChr04G001849 Chr04 NC_080390.1:30149446-30149460promoter 内 986-1000 bp - 3001 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 2 30152461-30154423(+) SMil_00003292-RA_Salv MP00452 TGAGGTCGGCAGATT
SmilChr03G000013 Chr03 NC_080389.1:132663-132677promoter 内 805-819 bp - 3182 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 2 135859-140121(+) SMil_00003292-RA_Salv MP00452 AGATGTCGGCTCTGC
SmilChr02G005590 Chr02 NC_080388.1:75691822-75691836promoter 内 559-573 bp + 3428 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 2 75687281-75688394(-) SMil_00003292-RA_Salv MP00452 CCATGTCGGTTCATG
SmilChr03G002911 Chr03 NC_080389.1:45856009-45856023promoter 内 289-303 bp - 3698 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 2 45859721-45861379(+) SMil_00003292-RA_Salv MP00452 CGTTGTCGGCCCCAT
SmilChr02G005592 Chr02 NC_080388.1:75691822-75691836promoter 内 156-170 bp + 3831 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 2 75687908-75687991(-) SMil_00003292-RA_Salv MP00452 CCATGTCGGTTCATG
SmilChr08G001538 Chr08 NC_080394.1:12522819-12522833promoter 内 3985-3999 bp - 2 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 12522835-12522905(+) SMil_00003292-RA_Salv MP00452 AAATGTCGGTCATGT
SmilChr05G003411 Chr05 NC_080391.1:45270749-45270763promoter 内 3973-3987 bp - 14 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 45266697-45270735(-) SMil_00003292-RA_Salv MP00452 GCAGAGCCGACATCT
SmilChr01G001777 Chr01 NC_080387.1:32663773-32663787promoter 内 3960-3974 bp + 27 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 32663814-32665195(+) SMil_00003292-RA_Salv MP00452 CTGTTGCCGACCCCG
SmilChr06G000768 Chr06 NC_080392.1:7162858-7162872promoter 内 3952-3966 bp - 35 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 7160755-7162823(-) SMil_00003292-RA_Salv MP00452 TGGGAGCCGACATGA
SmilChr03G001389 Chr03 NC_080389.1:16471346-16471360promoter 内 3940-3954 bp + 47 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 16471407-16494841(+) SMil_00003292-RA_Salv MP00452 TAGTGGCCGACAAAG
SmilChr04G002817 Chr04 NC_080390.1:44229368-44229382promoter 内 3916-3930 bp - 71 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 44228394-44229297(-) SMil_00003292-RA_Salv MP00452 GTGAGACCGACATAA
SmilChr02G000582 Chr02 NC_080388.1:8382434-8382448promoter 内 3734-3748 bp + 253 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 8382701-8383882(+) SMil_00003292-RA_Salv MP00452 TCGGTGCCGACAACT
SmilChr03G002394 Chr03 NC_080389.1:37895064-37895078promoter 内 3671-3685 bp - 316 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 37891304-37894748(-) SMil_00003292-RA_Salv MP00452 CAACTGCCGACAACT
SmilChr02G005515 Chr02 NC_080388.1:75263163-75263177promoter 内 3590-3604 bp - 397 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 75255863-75262766(-) SMil_00003292-RA_Salv MP00452 ATTTGGCCGACAACA
SmilChr04G000605 Chr04 NC_080390.1:6851582-6851596promoter 内 3555-3569 bp - 432 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 6849602-6851150(-) SMil_00003292-RA_Salv MP00452 TCCAGGCCGACACCT
SmilChr08G000144 Chr08 NC_080394.1:941092-941106promoter 内 3542-3556 bp - 445 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 941551-958105(+) SMil_00003292-RA_Salv MP00452 AGGTGTCGGCAAATA
SmilChr06G002278 Chr06 NC_080392.1:32671185-32671199promoter 内 3532-3546 bp + 455 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 32671654-32673118(+) SMil_00003292-RA_Salv MP00452 CCTCTGCCGACTTTC
SmilChr03G002175 Chr03 NC_080389.1:33795170-33795184promoter 内 3423-3437 bp - 564 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 33788937-33794606(-) SMil_00003292-RA_Salv MP00452 GGTAAGCCGACATGG
SmilChr02G001914 Chr02 NC_080388.1:34445830-34445844promoter 内 3408-3422 bp - 579 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 34443481-34445251(-) SMil_00003292-RA_Salv MP00452 TCACTGCCGACACTC
SmilChr02G002788 Chr02 NC_080388.1:47946887-47946901promoter 内 3331-3345 bp - 656 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 47945171-47946231(-) SMil_00003292-RA_Salv MP00452 AAGACACCGACATAT
SmilChr03G003281 Chr03 NC_080389.1:50830059-50830073promoter 内 3219-3233 bp + 768 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 50828233-50829291(-) SMil_00003292-RA_Salv MP00452 CGGGGTCGGCAACAG
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SmilChr05G003746 Chr05 NC_080391.1:50582120-50582134promoter 内 3156-3170 bp - 831 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 50579835-50581289(-) SMil_00003292-RA_Salv MP00452 ACCATGCCGACAACA
SmilChr04G001667 Chr04 NC_080390.1:27637469-27637483promoter 内 3155-3169 bp + 832 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 27638315-27644091(+) SMil_00003292-RA_Salv MP00452 GTTTGACCGACATTC
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SmilChr08G003204 Chr08 NC_080394.1:32852206-32852220promoter 内 3058-3072 bp - 929 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 32848773-32851277(-) SMil_00003292-RA_Salv MP00452 TCACTGCCGACACTC
SmilChr05G001171 Chr05 NC_080391.1:9805133-9805147promoter 内 3040-3054 bp + 947 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 9806094-9809339(+) SMil_00003292-RA_Salv MP00452 CAGCAGCCGACATTT
SmilChr02G000145 Chr02 NC_080388.1:1937346-1937360promoter 内 2938-2952 bp - 1049 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 1938409-1944296(+) SMil_00003292-RA_Salv MP00452 CGGCGTCGGCAGCTC
SmilChr04G000264 Chr04 NC_080390.1:2402254-2402268promoter 内 2916-2930 bp - 1071 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 2403339-2403971(+) SMil_00003292-RA_Salv MP00452 CAGTGTCGGCAAGCC
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SmilChr03G003041 Chr03 NC_080389.1:47310194-47310208promoter 内 2850-2864 bp + 1137 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 47311345-47321670(+) SMil_00003292-RA_Salv MP00452 TGGGAGCCGACATGA
SmilChr01G000386 Chr01 NC_080387.1:7970489-7970503promoter 内 2821-2835 bp + 1166 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 7966289-7969323(-) SMil_00003292-RA_Salv MP00452 CCTTGTCGGCCTGCG
SmilChr05G004242 Chr05 NC_080391.1:56240752-56240766promoter 内 2721-2735 bp + 1266 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 56237003-56239486(-) SMil_00003292-RA_Salv MP00452 TTGTGTCGGCGCTTG
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SmilChr02G003721 Chr02 NC_080388.1:58832816-58832830promoter 内 2463-2477 bp + 1524 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 58834354-58834426(+) SMil_00003292-RA_Salv MP00452 GACGAGCCGACATCA
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