转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr01G004199; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00010571-RA_Salv SmilChr01G004199 bHLH XP_057782208.1 MP00074 AGAAGGTCACGTGG

可能结合的靶基因

9969 个结合位点 7396 个候选靶基因 第 79 / 148 下载 TSV

上一页 79 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr01G004939 Chr01 NC_080387.1:67501694-67501707promoter 内 1959-1972 bp + 2029 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 2 67503736-67512271(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 TAATTGTCACGTGG
SmilChr03G001139 Chr03 NC_080389.1:13121391-13121404promoter 内 956-969 bp + 3032 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 2 13116341-13118359(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGTACCATT
SmilChr04G001485 Chr04 NC_080390.1:24293434-24293447promoter 内 833-846 bp + 3155 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 2 24289586-24290279(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 TCACGTGATTTCCC
SmilChr06G001550 Chr06 NC_080392.1:16825161-16825174promoter 内 784-797 bp + 3204 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 2 16828378-16832531(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 AAGAGAACACGTGG
SmilChr02G003241 Chr02 NC_080388.1:53678816-53678829promoter 内 3986-3999 bp + 2 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 53678831-53681910(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 GACCGTACACGTGG
SmilChr04G003907 Chr04 NC_080390.1:54819739-54819752promoter 内 3984-3997 bp + 4 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 54819756-54824337(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 ATCATTACACGTGG
SmilChr01G002329 Chr01 NC_080387.1:40448374-40448387promoter 内 3951-3964 bp + 37 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 40448424-40449277(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 AATTCGGCACGTGG
SmilChr02G000600 Chr02 NC_080388.1:8669372-8669385promoter 内 3931-3944 bp + 57 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 8665607-8669315(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGCGTGGCG
SmilChr04G001995 Chr04 NC_080390.1:32247353-32247366promoter 内 3919-3932 bp + 69 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 32247435-32248851(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 AAGCCCACACGTGG
SmilChr01G004105 Chr01 NC_080387.1:59555967-59555980promoter 内 3909-3922 bp + 79 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 59556059-59559717(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 AAACTGCCACGTGG
SmilChr03G004538 Chr03 NC_080389.1:63407960-63407973promoter 内 3900-3913 bp + 88 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 63403026-63407872(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 ACACGTCACCTTCT
SmilChr01G002076 Chr01 NC_080387.1:36709971-36709984promoter 内 3873-3886 bp + 115 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 36708310-36709856(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGATTTTCA
SmilChr01G002940 Chr01 NC_080387.1:48181564-48181577promoter 内 3813-3826 bp + 175 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 48181752-48185923(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 TGATGTTCACGTGG
SmilChr01G004238 Chr01 NC_080387.1:60710060-60710073promoter 内 3516-3529 bp + 472 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 60710545-60711123(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 GTCAACTCACGTGT
SmilChr01G004237 Chr01 NC_080387.1:60710060-60710073promoter 内 3487-3500 bp + 501 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 60709018-60709559(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 ACACGTGAGTTGAC
SmilChr08G001641 Chr08 NC_080394.1:13621999-13622012promoter 内 3321-3334 bp + 667 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 13618463-13621332(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGATCACCA
SmilChr03G003053 Chr03 NC_080389.1:47418121-47418134promoter 内 3258-3271 bp - 730 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 47413081-47417391(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CACAAGTCACGTGT
SmilChr03G000224 Chr03 NC_080389.1:2624960-2624973promoter 内 3174-3187 bp - 814 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 2625787-2628468(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 TCACGTGATGCCAC
SmilChr08G001187 Chr08 NC_080394.1:9505773-9505786promoter 内 3113-3126 bp + 875 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 9506661-9517408(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 GATCCCTCACGTGG
SmilChr04G003906 Chr04 NC_080390.1:54819739-54819752promoter 内 3109-3122 bp + 879 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 54815526-54818860(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGTAATGAT
SmilChr01G003585 Chr01 NC_080387.1:54422105-54422118promoter 内 3055-3068 bp - 933 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 54423051-54425934(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGAAATCAA
SmilChr01G004236 Chr01 NC_080387.1:60710060-60710073promoter 内 3033-3046 bp + 955 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 60708292-60709105(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 ACACGTGAGTTGAC
SmilChr02G004460 Chr02 NC_080388.1:67032902-67032915promoter 内 2960-2973 bp - 1028 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 67024212-67031874(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 TTACGCTCACGTGG
SmilChr04G001419 Chr04 NC_080390.1:23048908-23048921promoter 内 2872-2885 bp + 1116 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 23040339-23047792(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGTGCAGAA
SmilChr08G000980 Chr08 NC_080394.1:7353722-7353735promoter 内 2862-2875 bp - 1126 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 7349676-7352596(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 ATGAATACACGTGG
SmilChr08G001633 Chr08 NC_080394.1:13527319-13527332promoter 内 2834-2847 bp - 1154 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 13528486-13529143(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGCGAACCA
SmilChr02G002607 Chr02 NC_080388.1:45238664-45238677promoter 内 2830-2843 bp + 1158 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 45236292-45237506(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGCACACCA
SmilChr02G000208 Chr02 NC_080388.1:2740031-2740044promoter 内 2758-2771 bp - 1230 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 2741274-2744026(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 TCACGTGAGACCAT
SmilChr01G001630 Chr01 NC_080387.1:30365319-30365332promoter 内 2699-2712 bp - 1289 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 30366621-30368468(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 TCACGTGAAACCCA
SmilChr08G000294 Chr08 NC_080394.1:2013754-2013767promoter 内 2606-2619 bp - 1382 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 2015149-2019541(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGATCTATC
SmilChr02G001788 Chr02 NC_080388.1:32657432-32657445promoter 内 2541-2554 bp + 1447 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 32653735-32655985(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGAAGCATT
SmilChr01G000658 Chr01 NC_080387.1:14685638-14685651promoter 内 2469-2482 bp + 1519 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 14687170-14689566(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 AGAAATTCACGTGC
SmilChr07G004394 Chr07 NC_080393.1:56537434-56537447promoter 内 2464-2477 bp + 1524 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 56533269-56535910(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGCCTAATC
SmilChr03G001079 Chr03 NC_080389.1:12479136-12479149promoter 内 2453-2466 bp - 1535 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 12480684-12481652(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGTACCATT
SmilChr06G001582 Chr06 NC_080392.1:17261483-17261496promoter 内 2393-2406 bp + 1595 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 17242700-17259888(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGCACGTCT
SmilChr05G001575 Chr05 NC_080391.1:14405729-14405742promoter 内 2385-2398 bp - 1603 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 14407345-14408772(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACCTGACCTTCC
SmilChr03G003042 Chr03 NC_080389.1:47321289-47321302promoter 内 2334-2347 bp - 1654 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 47322956-47324529(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGGAGGGCA
SmilChr07G002683 Chr07 NC_080393.1:26239745-26239758promoter 内 2278-2291 bp + 1710 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 26237298-26238035(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGCACACCA
SmilChr04G000887 Chr04 NC_080390.1:11355292-11355305promoter 内 2228-2241 bp + 1760 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 11357065-11366190(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 TTGATTTCACGTGG
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SmilChr02G002513 Chr02 NC_080388.1:43630596-43630609promoter 内 2116-2129 bp - 1872 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 43632481-43634332(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 ACACGTCACCTTCT
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SmilChr01G004235 Chr01 NC_080387.1:60710060-60710073promoter 内 2010-2023 bp + 1978 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 60707062-60708082(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 ACACGTGAGTTGAC
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SmilChr01G004340 Chr01 NC_080387.1:61575752-61575765promoter 内 1796-1809 bp + 2192 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 61577957-61579945(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 GATAGATCACGTGG
SmilChr05G003603 Chr05 NC_080391.1:48110545-48110558promoter 内 1730-1743 bp + 2258 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 48107091-48108287(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGCTGGTCC
SmilChr01G003723 Chr01 NC_080387.1:55554461-55554474promoter 内 1661-1674 bp + 2327 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 55542510-55552134(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 TCACGTGAGCTGTT