转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr04G001094; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00021820-RA_Salv SmilChr04G001094 WRKY XP_057804404.1 MP00408 AGCGTTGACTTTT

可能结合的靶基因

9902 个结合位点 8149 个候选靶基因 第 79 / 163 下载 TSV

上一页 79 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr03G003193 Chr03 NC_080389.1:49394816-49394828promoter 内 2563-2575 bp + 1426 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 1 49396254-49396766(+) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 TCAGTTGACTATG
SmilChr03G003693 Chr03 NC_080389.1:55865107-55865119promoter 内 2476-2488 bp - 1513 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 1 55866632-55868608(+) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 ACGAGTCAACGTT
SmilChr04G001272 Chr04 NC_080390.1:20237054-20237066promoter 内 2473-2485 bp + 1516 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 1 20234331-20235538(-) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 TTGAGTCAACGGT
SmilChr02G000230 Chr02 NC_080388.1:2979511-2979523promoter 内 2469-2481 bp - 1520 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 1 2981043-2982776(+) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 AGAAGTCAACTTT
SmilChr07G003475 Chr07 NC_080393.1:38970082-38970094promoter 内 2450-2462 bp + 1539 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 1 38971633-38982211(+) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 CATGTTGACTTTG
SmilChr01G001652 Chr01 NC_080387.1:30589037-30589049promoter 内 2321-2333 bp - 1668 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 1 30584215-30587369(-) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 TTTGTTGACTTTG
SmilChr01G002250 Chr01 NC_080387.1:39126541-39126553promoter 内 2301-2313 bp + 1688 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 1 39124182-39124853(-) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 CGGAGTCAACGAT
SmilChr06G001743 Chr06 NC_080392.1:20151791-20151803promoter 内 2290-2302 bp - 1699 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 1 20153502-20164577(+) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 GGAGGTCAACGTG
SmilChr05G003166 Chr05 NC_080391.1:40456669-40456681promoter 内 2271-2283 bp - 1718 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 1 40452279-40454951(-) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 GACGTTGACCCTC
SmilChr03G002778 Chr03 NC_080389.1:44214094-44214106promoter 内 2256-2268 bp + 1733 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 1 44215839-44216903(+) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 TTTGTTGACTTTG
SmilChr03G001006 Chr03 NC_080389.1:11389609-11389621promoter 内 2250-2262 bp + 1739 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 1 11391360-11392626(+) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 ATCGTTGACTCCG
SmilChr03G000520 Chr03 NC_080389.1:5594892-5594904promoter 内 2225-2237 bp + 1764 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 1 5596668-5597834(+) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 ATCGTTGACTCCG
SmilChr03G000242 Chr03 NC_080389.1:2863803-2863815promoter 内 2199-2211 bp + 1790 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 1 2865605-2869423(+) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 TTTGTTGACTTTG
SmilChr05G003721 Chr05 NC_080391.1:50330270-50330282promoter 内 2142-2154 bp - 1847 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 1 50319174-50328423(-) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 ACTGTTGACTTCT
SmilChr07G000799 Chr07 NC_080393.1:5639215-5639227promoter 内 2102-2114 bp + 1887 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 1 5635633-5637328(-) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 TTGAGTCAACGGT
SmilChr03G001001 Chr03 NC_080389.1:11332617-11332629promoter 内 2061-2073 bp + 1928 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 1 11334557-11335675(+) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 ATCGTTGACTCCG
SmilChr06G001526 Chr06 NC_080392.1:16443088-16443100promoter 内 2059-2071 bp - 1930 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 1 16445030-16449309(+) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 AAGAGTCAACTCA
SmilChr06G000338 Chr06 NC_080392.1:2537872-2537884promoter 内 1977-1989 bp + 2012 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 1 2539896-2542631(+) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 TGAGTTGACTCTT
SmilChr04G001683 Chr04 NC_080390.1:27865281-27865293promoter 内 1965-1977 bp - 2024 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 1 27861115-27863257(-) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 TTTGTTGACTTTG
SmilChr03G003996 Chr03 NC_080389.1:59001525-59001537promoter 内 1956-1968 bp + 2033 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 1 59003570-59004740(+) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 TCCGTTGACTAAA
SmilChr03G000984 Chr03 NC_080389.1:11146541-11146553promoter 内 1949-1961 bp - 2040 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 1 11148593-11149969(+) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 ATAAGTCAACACT
SmilChr02G005204 Chr02 NC_080388.1:73295502-73295514promoter 内 1937-1949 bp + 2052 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 1 73290936-73293450(-) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 CTAAGTCAACCTC
SmilChr02G005212 Chr02 NC_080388.1:73339776-73339788promoter 内 1887-1899 bp + 2102 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 1 73335162-73337674(-) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 CTAAGTCAACCTC
SmilChr05G002522 Chr05 NC_080391.1:28063700-28063712promoter 内 1886-1898 bp + 2103 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 1 28061525-28061597(-) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 AGAAGTCAACTTT
SmilChr03G000527 Chr03 NC_080389.1:5642612-5642624promoter 内 1868-1880 bp + 2121 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 1 5644745-5645521(+) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 ATCGTTGACTCCG
SmilChr01G005163 Chr01 NC_080387.1:69406748-69406760promoter 内 1718-1730 bp - 2271 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 1 69409031-69438236(+) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 CAAAGTCAACAAA
SmilChr01G000338 Chr01 NC_080387.1:6928704-6928716promoter 内 1706-1718 bp - 2283 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 1 6930999-6934624(+) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 AAGGGTCAACGAG
SmilChr01G006011 Chr01 NC_080387.1:75667505-75667517promoter 内 1666-1678 bp - 2323 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 1 75669840-75713567(+) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 GGAGGTCAACGTG
SmilChr01G004357 Chr01 NC_080387.1:61762080-61762092promoter 内 1616-1628 bp + 2373 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 1 61756501-61759707(-) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 CAAAGTCAACAAA
SmilChr01G003607 Chr01 NC_080387.1:54613804-54613816promoter 内 1599-1611 bp + 2390 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 1 54610428-54611414(-) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 GATAGTCAACTCT
SmilChr04G003945 Chr04 NC_080390.1:55047976-55047988promoter 内 1596-1608 bp - 2393 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 1 55040290-55045583(-) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 TTTGTTGACTTTG
SmilChr02G001391 Chr02 NC_080388.1:26408102-26408114promoter 内 1507-1519 bp + 2482 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 1 26402064-26405620(-) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 GAAAGTCAATGCT
SmilChr06G001605 Chr06 NC_080392.1:17887512-17887524promoter 内 1485-1497 bp + 2504 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 1 17890028-17893975(+) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 TTTGTTGACTTTG
SmilChr07G001994 Chr07 NC_080393.1:17612825-17612837promoter 内 1458-1470 bp - 2531 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 1 17615368-17619499(+) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 AGAAGTCAACAGT
SmilChr05G000541 Chr05 NC_080391.1:4148358-4148370promoter 内 1433-1445 bp + 2556 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 1 4139977-4145802(-) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 CATAGTCAACTGA
SmilChr03G000510 Chr03 NC_080389.1:5488737-5488749promoter 内 1417-1429 bp - 2572 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 1 5491321-5492306(+) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 ATAAGTCAACACT
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SmilChr07G003474 Chr07 NC_080393.1:38970082-38970094promoter 内 1341-1353 bp + 2648 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 1 38965895-38967434(-) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 CAAAGTCAACATG
SmilChr05G000623 Chr05 NC_080391.1:4703533-4703545promoter 内 1255-1267 bp - 2734 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 1 4706279-4715947(+) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 AGAAGTCAACTTT
SmilChr05G000763 Chr05 NC_080391.1:5901097-5901109promoter 内 1228-1240 bp + 2761 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 1 5903870-5908440(+) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 GTCGTTGACTACA
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SmilChr05G002466 Chr05 NC_080391.1:27179103-27179115promoter 内 1213-1225 bp + 2776 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 1 27174343-27176327(-) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 TTTAGTCAACGGA
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SmilChr02G004670 Chr02 NC_080388.1:69058921-69058933promoter 内 1080-1092 bp + 2909 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 1 69053031-69056012(-) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 GCAAGTCAACCCT
SmilChr02G000789 Chr02 NC_080388.1:12989155-12989167promoter 内 1014-1026 bp - 2975 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 1 12985385-12986180(-) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 TCCATTGACTTTG
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