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转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family，查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中，并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因，不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif；应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引，可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card，点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
SmilChr04G003117 XP_057809539.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr04G003114 XP_057809538.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr01G005298 XP_057788621.1
ARR-B 1
MP00010
 8344 9778 查靶基因
SmilChr03G003924 XP_057798851.1
NAC 1
MP00059
 8333 9940 查靶基因
SmilChr01G005344 XP_057788686.1
MYB 1
MP00296
 8304 9873 查靶基因
SmilChr08G004408 XP_057780613.1
MYB 1
MP00114
 8151 9897 查靶基因
SmilChr04G001094 XP_057804404.1
WRKY 1
MP00408
 8149 9902 查靶基因
SmilChr07G003597 XP_057773587.1
Nin-like 1
MP00449
 8096 9453 查靶基因
SmilChr02G005433 XP_057792682.1
WRKY 1
MP00209
 8083 9910 查靶基因
SmilChr04G004136 XP_057806072.1
MYB 1
MP00627
 8075 9835 查靶基因
SmilChr01G003955 XP_057779712.1
WRKY 1
MP00450
 8044 9901 查靶基因
SmilChr03G003685 XP_057798538.1
ERF 1
MP00558
 8044 9762 查靶基因
SmilChr07G002937 XP_057777490.1
MIKC_MADS 1
MP00096
 8019 9914 查靶基因
SmilChr02G003833 XP_057794421.1
MYB 1
MP00476
 7981 9904 查靶基因
SmilChr07G002803 XP_057777238.1
NAC 1
MP00221
 7965 9903 查靶基因
SmilChr05G002364 XP_057809766.1
WRKY 1
MP00069
 7882 9917 查靶基因
SmilChr08G003267 XP_057779249.1
MYB 1
MP00406
 7839 9917 查靶基因
SmilChr02G005012 XP_057792191.1
TALE 1
MP00670
 7758 9906 查靶基因
SmilChr07G001978 XP_057776996.1
SBP 1
MP00555
 7648 9805 查靶基因
SmilChr05G000741 XP_057764423.1
ARF 1
MP00021
 7629 9812 查靶基因
SmilChr01G004579 XP_057787263.1
MYB 1
MP00132
 7583 9926 查靶基因
SmilChr05G000593 XP_057764223.1
MIKC_MADS 1
MP00609
 7575 9941 查靶基因
SmilChr03G004518 XP_057799834.1
ERF 1
MP00529
 7559 9247 查靶基因
SmilChr06G001829 XP_057766988.1
MYB 1
MP00510
 7526 9799 查靶基因
SmilChr05G000830 XP_057764550.1
NAC 1
MP00058
 7440 9855 查靶基因
SmilChr08G002543 XP_057778423.1
bZIP 1
MP00303
 7416 9868 查靶基因
SmilChr01G002743 XP_057765725.1
MYB_related 1
MP00565
 7412 9785 查靶基因
SmilChr04G002704 XP_057807081.1
ERF 1
MP00026
 7408 9854 查靶基因
SmilChr05G001395 XP_057765344.1
WRKY 1
MP00071
 7408 9764 查靶基因
SmilChr04G002953 XP_057809314.1
ARF 1
MP00033
 7406 9827 查靶基因
SmilChr01G004199 XP_057782208.1
bHLH 1
MP00074
 7396 9969 查靶基因
SmilChr05G004009 XP_057810662.1
MYB 1
MP00216
 7342 9832 查靶基因
SmilChr03G001606 XP_057802772.1
WRKY 1
MP00539
 7338 9848 查靶基因
SmilChr02G004600 XP_057791481.1
ARF 1
MP00574
 7302 9846 查靶基因
SmilChr03G004179 XP_057799230.1
WRKY 1
MP00464
 7299 9864 查靶基因
SmilChr04G003805 XP_057805691.1
MIKC_MADS 1
MP00315
 7291 9567 查靶基因
SmilChr03G003761 XP_057798625.1
WRKY 1
MP00525
 7235 9838 查靶基因
SmilChr01G001885 XP_057806790.1
WRKY 1
MP00171
 7182 9833 查靶基因
SmilChr05G004392 XP_057811204.1
WRKY 1
MP00506
 7173 9818 查靶基因
SmilChr04G002757 XP_057807158.1
MIKC_MADS 1
MP00272
 7172 9889 查靶基因
SmilChr01G003404 XP_057773670.1
bZIP 1
MP00184
 7147 9840 查靶基因
SmilChr03G002335 XP_057801256.1
bZIP 1
MP00647
 7133 9953 查靶基因
SmilChr07G002075 XP_057773918.1
C2H2 1
MP00485
 7130 8059 查靶基因
SmilChr04G000162 XP_057807467.1
MYB 1
MP00134
 7078 8676 查靶基因
SmilChr04G000040 XP_057808382.1
ERF 1
MP00312
 7006 8490 查靶基因
SmilChr08G001896 XP_057783815.1
MYB 1
MP00564
 6984 9893 查靶基因
SmilChr02G005217 XP_057792502.1
G2-like 1
MP00022
 6959 9720 查靶基因
SmilChr05G000260 XP_057763683.1
bZIP 1
MP00040
 6920 9919 查靶基因
SmilChr01G002885 XP_057767601.1
ERF 1
MP00151
 6907 9976 查靶基因
SmilChr05G001518 XP_057765511.1
WRKY 1
MP00455
 6900 9792 查靶基因
SmilChr03G002503 XP_057801356.1
MYB 1
MP00482
 6899 8940 查靶基因
SmilChr03G001252 XP_057802461.1
bZIP 1
MP00291
 6894 9321 查靶基因
SmilChr06G001365 XP_057768799.1
SBP 1
MP00307
 6893 9755 查靶基因
SmilChr03G003439 XP_057798243.1
bHLH 1
MP00195
 6878 9832 查靶基因
SmilChr06G001111 XP_057768512.1
MYB 1
MP00388
 6870 9774 查靶基因
SmilChr02G000949 XP_057795176.1
bZIP 1
MP00318
 6849 9413 查靶基因
SmilChr01G000025 XP_057790305.1
SBP 1
MP00633
 6833 8026 查靶基因
SmilChr01G004313 XP_057783598.1
bHLH 1
MP00308
 6805 9826 查靶基因
SmilChr02G005502 XP_057792768.1
bHLH 1
MP00082
 6784 9435 查靶基因
SmilChr03G004274 XP_057799397.1
MIKC_MADS 1
MP00080
 6766 9850 查靶基因
SmilChr02G003688 XP_057794248.1
MYB 1
MP00028
 6764 9024 查靶基因
SmilChr04G003367 XP_057804957.1
MYB 1
MP00191
 6736 9690 查靶基因
SmilChr04G000157 XP_057807462.1
bHLH 1
MP00081
 6729 9942 查靶基因
SmilChr07G002147 XP_057774045.1
MYB 1
MP00500
 6697 9681 查靶基因
SmilChr05G002277 XP_057809665.1
ERF 1
MP00452
 6671 7783 查靶基因
SmilChr07G004480 XP_057776222.1
WRKY 1
MP00531
 6663 9784 查靶基因
SmilChr02G004447 XP_057797242.1
HD-ZIP 1
MP00200
 6661 9930 查靶基因
SmilChr04G000070 XP_057807324.1
bHLH 1
MP00034
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G002039 XP_057808459.1
bHLH 1
MP00660
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G005851 XP_057789306.1
MYB 1
MP00055
 6638 9685 查靶基因
SmilChr02G005238 XP_057792594.1
SBP 1
MP00634
 6619 7771 查靶基因
SmilChr06G002048 XP_057770293.1
bHLH 1
MP00035
 6618 9903 查靶基因
SmilChr07G000836 XP_057772437.1
MYB_related 1
MP00568
 6611 9696 查靶基因
SmilChr04G003119 XP_057809542.1
bZIP 1
MP00039
 6610 9936 查靶基因
SmilChr01G004114 XP_057781125.1
WRKY 1
MP00284
 6552 9774 查靶基因
SmilChr08G004246 XP_057780410.1
WRKY 1
MP00422
 6535 9791 查靶基因
SmilChr05G001980 XP_057766076.1
ARF 1
MP00153
 6534 9706 查靶基因
SmilChr04G000094 XP_057807365.1
YABBY 1
MP00620
 6504 9844 查靶基因
SmilChr02G002534 XP_057797741.1
TCP 1
MP00169
 6498 7295 查靶基因
SmilChr05G001269 XP_057765199.1
G2-like 1
MP00252
 6478 9780 查靶基因
SmilChr07G003441 XP_057773618.1
NAC 1
MP00108
 6458 9810 查靶基因
SmilChr02G001791 XP_057795933.1
TCP 1
MP00062
 6454 7249 查靶基因
SmilChr05G003285 XP_057810127.1
RAV 1
MP00024
 6450 9853 查靶基因
SmilChr05G000619 XP_057764205.1
WRKY 1
MP00167
 6439 9756 查靶基因
SmilChr04G003745 XP_057809144.1
C2H2 1
MP00416
 6433 9716 查靶基因
SmilChr02G004607 XP_057791470.1
C2H2 1
MP00608
 6398 9817 查靶基因
SmilChr02G003399 XP_057793859.1
ERF 1
MP00240
 6368 9978 查靶基因
SmilChr01G004920 XP_057788125.1
MYB_related 1
MP00607
 6362 9718 查靶基因
SmilChr06G001059 XP_057768449.1
Dof 1
MP00402
 6278 9875 查靶基因
SmilChr01G004552 XP_057786668.1
bZIP 1
MP00409
 6252 8429 查靶基因
SmilChr01G006187 XP_057798078.1
GRAS 1
MP00611
 6232 9807 查靶基因
SmilChr01G001516 XP_057803325.1
bZIP 1
MP00648
 6170 9939 查靶基因
SmilChr04G003955 XP_057805828.1
ERF 1
MP00120
 6144 7514 查靶基因
SmilChr01G004708 XP_057787833.1
WRKY 1
MP00251
 6140 9713 查靶基因
SmilChr05G001961 XP_057766054.1
MIKC_MADS 1
MP00077
 6125 9815 查靶基因
SmilChr08G000478 XP_057781809.1
GATA 1
MP00130
 6015 9821 查靶基因
SmilChr01G000943 XP_057790035.1
MIKC_MADS 1
MP00508
 5979 7481 查靶基因
SmilChr05G004106 XP_057810779.1
WRKY 1
MP00260
 5932 9706 查靶基因
SmilChr04G003973 XP_057805857.1
HD-ZIP 1
MP00013
 5927 9712 查靶基因
SmilChr03G002207 XP_057801109.1
WRKY 1
MP00299
 5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr03G002207; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00022278-RA_Salv SmilChr03G002207 WRKY XP_057801109.1 MP00299 AAAAGTCAACG

可能结合的靶基因

9699 个结合位点 5919 个候选靶基因 第 80 / 119 下载 TSV

上一页 80 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr02G002163 Chr02 NC_080388.1:38862169-38862179promoter 内 1476-1486 bp - 2515 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 1 38852543-38859654(-) SMil_00022278-RA_Salv MP00299 TGGAGTCAACG
SmilChr01G005155 Chr01 NC_080387.1:69321953-69321963promoter 内 1321-1331 bp + 2670 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 1 69324633-69326962(+) SMil_00022278-RA_Salv MP00299 GAAAGTCAAAA
SmilChr01G002603 Chr01 NC_080387.1:44235551-44235561promoter 内 1301-1311 bp - 2690 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 1 44231924-44232861(-) SMil_00022278-RA_Salv MP00299 GAAAGTCAAAA
SmilChr02G001916 Chr02 NC_080388.1:34494373-34494383promoter 内 1301-1311 bp - 2690 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 1 34487721-34491683(-) SMil_00022278-RA_Salv MP00299 GAAAGTCAAAA
SmilChr01G000844 Chr01 NC_080387.1:18277599-18277609promoter 内 1293-1303 bp + 2698 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 1 18280307-18281844(+) SMil_00022278-RA_Salv MP00299 GAAAGTCAAAA
SmilChr02G000163 Chr02 NC_080388.1:2121407-2121417promoter 内 1247-1257 bp - 2744 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 1 2124161-2124677(+) SMil_00022278-RA_Salv MP00299 AGTTGACTGTC
SmilChr01G000960 Chr01 NC_080387.1:20313372-20313382promoter 内 1126-1136 bp - 2865 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 1 20316247-20317386(+) SMil_00022278-RA_Salv MP00299 TTTTGACTTTC
SmilChr02G002353 Chr02 NC_080388.1:41320111-41320121promoter 内 840-850 bp + 3151 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 1 41314921-41316960(-) SMil_00022278-RA_Salv MP00299 TGTTGACTACT
SmilChr02G002102 Chr02 NC_080388.1:37697745-37697755promoter 内 685-695 bp + 3306 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 1 37690636-37694439(-) SMil_00022278-RA_Salv MP00299 TGTTGACTACG
SmilChr01G000631 Chr01 NC_080387.1:14187413-14187423promoter 内 663-673 bp + 3328 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 1 14190751-14204563(+) SMil_00022278-RA_Salv MP00299 GAAAGTCAAAA
SmilChr01G006192 Chr01 NC_080387.1:77532874-77532884promoter 内 625-635 bp + 3366 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 1 77523699-77529508(-) SMil_00022278-RA_Salv MP00299 AGTTGACTGTC
SmilChr02G004159 Chr02 NC_080388.1:63913485-63913495promoter 内 448-458 bp - 3543 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 1 63905106-63909942(-) SMil_00022278-RA_Salv MP00299 TAGAGTCAACC
SmilChr02G000361 Chr02 NC_080388.1:4654911-4654921promoter 内 427-437 bp + 3564 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 1 4647722-4651347(-) SMil_00022278-RA_Salv MP00299 TGTTGACTACT
SmilChr02G000093 Chr02 NC_080388.1:1222119-1222129promoter 内 303-313 bp + 3688 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 1 1215198-1218431(-) SMil_00022278-RA_Salv MP00299 TTTTGACTTTC
SmilChr02G000889 Chr02 NC_080388.1:15323543-15323553promoter 内 293-303 bp - 3698 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 1 15327251-15329273(+) SMil_00022278-RA_Salv MP00299 TGTTGACTACT
SmilChr02G000059 Chr02 NC_080388.1:760032-760042promoter 内 231-241 bp + 3760 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 1 755774-756272(-) SMil_00022278-RA_Salv MP00299 AGTTGACTGTC
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SmilChr01G001437 Chr01 NC_080387.1:28032508-28032518promoter 内 3448-3458 bp - 543 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 3 28031849-28031965(-) SMil_00022278-RA_Salv MP00299 TAAAGTCAAAT
SmilChr02G003464 Chr02 NC_080388.1:55932349-55932359promoter 内 3944-3954 bp + 47 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 2 55932406-55936660(+) SMil_00022278-RA_Salv MP00299 TAAAGTCAAAT
SmilChr01G002951 Chr01 NC_080387.1:48394992-48395002promoter 内 3807-3817 bp - 184 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 2 48389141-48394808(-) SMil_00022278-RA_Salv MP00299 TAAAGTCAAAT
SmilChr01G005688 Chr01 NC_080387.1:73171038-73171048promoter 内 3634-3644 bp + 357 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 2 73168441-73170681(-) SMil_00022278-RA_Salv MP00299 ATTTGACTTTA
SmilChr01G003520 Chr01 NC_080387.1:53843598-53843608promoter 内 3607-3617 bp + 384 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 2 53843992-53848842(+) SMil_00022278-RA_Salv MP00299 TAAAGTCAAAT
SmilChr01G005911 Chr01 NC_080387.1:74965037-74965047promoter 内 3426-3436 bp + 565 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 2 74963277-74964472(-) SMil_00022278-RA_Salv MP00299 ATTTGACTTTA
SmilChr02G002995 Chr02 NC_080388.1:50640446-50640456promoter 内 3301-3311 bp + 690 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 2 50641146-50644974(+) SMil_00022278-RA_Salv MP00299 TAAAGTCAAAT
SmilChr02G002324 Chr02 NC_080388.1:40923034-40923044promoter 内 2599-2609 bp - 1392 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 2 40920720-40921642(-) SMil_00022278-RA_Salv MP00299 TAAAGTCAAAT
SmilChr02G001312 Chr02 NC_080388.1:24349077-24349087promoter 内 2580-2590 bp - 1411 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 2 24346163-24347666(-) SMil_00022278-RA_Salv MP00299 TAAAGTCAAAT
SmilChr01G001960 Chr01 NC_080387.1:34861081-34861091promoter 内 2367-2377 bp + 1624 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 2 34853780-34859457(-) SMil_00022278-RA_Salv MP00299 ATTTGACTTTA
SmilChr01G001436 Chr01 NC_080387.1:28032508-28032518promoter 内 2283-2293 bp - 1708 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 2 28030640-28030800(-) SMil_00022278-RA_Salv MP00299 TAAAGTCAAAT
SmilChr01G002523 Chr01 NC_080387.1:43194605-43194615promoter 内 2092-2102 bp + 1899 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 2 43196514-43200220(+) SMil_00022278-RA_Salv MP00299 TAAAGTCAAAT
SmilChr01G003224 Chr01 NC_080387.1:51006404-51006414promoter 内 1986-1996 bp + 2005 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 2 51008419-51009645(+) SMil_00022278-RA_Salv MP00299 TAAAGTCAAAT
SmilChr01G005913 Chr01 NC_080387.1:74965037-74965047promoter 内 1906-1916 bp + 2085 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 2 74967132-74968905(+) SMil_00022278-RA_Salv MP00299 TAAAGTCAAAT
SmilChr02G002325 Chr02 NC_080388.1:40923034-40923044promoter 内 1672-1682 bp - 2319 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 2 40925363-40926307(+) SMil_00022278-RA_Salv MP00299 ATTTGACTTTA
SmilChr02G002883 Chr02 NC_080388.1:49104804-49104814promoter 内 1006-1016 bp - 2985 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 2 49099623-49101819(-) SMil_00022278-RA_Salv MP00299 GAGAGTCAACC
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SmilChr02G001296 Chr02 NC_080388.1:23977233-23977243promoter 内 50-60 bp + 3941 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 2 23972360-23973292(-) SMil_00022278-RA_Salv MP00299 ATTTGACTTTA
SmilChr01G005903 Chr01 NC_080387.1:74915870-74915880promoter 内 3987-3997 bp + 4 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 74913834-74915866(-) SMil_00022278-RA_Salv MP00299 ATTTGACTTTA
SmilChr01G005919 Chr01 NC_080387.1:75027441-75027451promoter 内 3882-3892 bp + 109 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 75025207-75027332(-) SMil_00022278-RA_Salv MP00299 ATTTGACTTTA
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SmilChr02G000031 Chr02 NC_080388.1:387826-387836promoter 内 3849-3859 bp + 142 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 387978-389068(+) SMil_00022278-RA_Salv MP00299 TAAAGTCAAAT
SmilChr01G003799 Chr01 NC_080387.1:56373468-56373478promoter 内 3785-3795 bp + 206 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 56370038-56373262(-) SMil_00022278-RA_Salv MP00299 ATTTGACTTTA
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SmilChr02G003199 Chr02 NC_080388.1:53151210-53151220promoter 内 3551-3561 bp + 440 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 53146247-53150770(-) SMil_00022278-RA_Salv MP00299 GGTTGACTCTC
SmilChr02G002379 Chr02 NC_080388.1:41699975-41699985promoter 内 3469-3479 bp - 522 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 41698427-41699453(-) SMil_00022278-RA_Salv MP00299 TAAAGTCAAAT
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SmilChr01G005582 Chr01 NC_080387.1:72525836-72525846promoter 内 2250-2260 bp + 1741 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 72523486-72524095(-) SMil_00022278-RA_Salv MP00299 ATTTGACTTTA