转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr05G000260; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00013647-RA_Salv SmilChr05G000260 bZIP XP_057763683.1 MP00040 TGCTGACGTGGC

可能结合的靶基因

9919 个结合位点 6920 个候选靶基因 第 80 / 139 下载 TSV

上一页 80 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr02G003926 Chr02 NC_080388.1:61331581-61331592promoter 内 3842-3853 bp + 148 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 61331740-61332604(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GCGTGACGTGAG
SmilChr05G000451 Chr05 NC_080391.1:3428410-3428421promoter 内 3777-3788 bp - 213 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 3428634-3434449(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 AGCACGTCAGCT
SmilChr02G004610 Chr02 NC_080388.1:68602622-68602633promoter 内 3757-3768 bp + 233 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 68602866-68627040(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GCATGACGTGTC
SmilChr02G004185 Chr02 NC_080388.1:64178219-64178230promoter 内 3741-3752 bp - 249 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 64178479-64179812(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 CCCACGTCGCTT
SmilChr02G001672 Chr02 NC_080388.1:30985338-30985349promoter 内 3715-3726 bp + 275 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 30984290-30985063(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 CCCACGTCGATG
SmilChr01G002291 Chr01 NC_080387.1:39751089-39751100promoter 内 3709-3720 bp + 281 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 39751381-39754707(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GCGTGACGTGAG
SmilChr03G001928 Chr03 NC_080389.1:27064120-27064131promoter 内 3654-3665 bp - 336 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 27064467-27066676(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 CCCACGTCGAAC
SmilChr04G003531 Chr04 NC_080390.1:51664816-51664827promoter 内 3609-3620 bp - 381 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 51665208-51667618(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TCCACGTCGCAG
SmilChr03G004374 Chr03 NC_080389.1:61957206-61957217promoter 内 3603-3614 bp + 387 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 61957604-61961053(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TCTCCACGTGGC
SmilChr01G000723 Chr01 NC_080387.1:16169296-16169307promoter 内 3597-3608 bp - 393 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 16168191-16168903(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GCGTGACGTGAG
SmilChr02G001487 Chr02 NC_080388.1:27841121-27841132promoter 内 3597-3608 bp - 393 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 27840192-27840728(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TCAAGACGTGGC
SmilChr04G000794 Chr04 NC_080390.1:9813156-9813167promoter 内 3574-3585 bp - 416 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 9813583-9816042(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GACACGTCACAC
SmilChr01G001572 Chr01 NC_080387.1:29764605-29764616promoter 内 3539-3550 bp - 451 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 29765067-29765138(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TCCACGTCGCTG
SmilChr01G000950 Chr01 NC_080387.1:20134755-20134766promoter 内 3456-3467 bp + 534 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 20135300-20137758(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GCTCGACGTGGA
SmilChr01G003205 Chr01 NC_080387.1:50813947-50813958promoter 内 3452-3463 bp + 538 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 50811557-50813409(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GACACGTCACTC
SmilChr03G002075 Chr03 NC_080389.1:31725598-31725609promoter 内 3422-3433 bp + 568 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 31726177-31727992(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 AAGCGACGTGGG
SmilChr01G004416 Chr01 NC_080387.1:62304752-62304763promoter 内 3362-3373 bp + 628 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 62305391-62306368(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GTGTGACGTGTC
SmilChr02G001425 Chr02 NC_080388.1:26914645-26914656promoter 内 3355-3366 bp + 635 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 26915291-26916539(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TCTCCACGTGGC
SmilChr04G001892 Chr04 NC_080390.1:30892422-30892433promoter 内 3354-3365 bp - 636 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 30883867-30891786(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GCCGCACGTGGC
SmilChr02G004212 Chr02 NC_080388.1:64381305-64381316promoter 内 3283-3294 bp - 707 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 64377780-64380598(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GAGCGACGTGGA
SmilChr02G005152 Chr02 NC_080388.1:72886572-72886583promoter 内 3217-3228 bp - 773 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 72887356-72893574(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 ACCACGTCGTGC
SmilChr02G000235 Chr02 NC_080388.1:3013611-3013622promoter 内 3166-3177 bp + 824 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 3014446-3015135(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GAGCGACGTGGT
SmilChr01G001648 Chr01 NC_080387.1:30541007-30541018promoter 内 3114-3125 bp + 876 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 30538737-30540131(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 ACCACGTCGAGC
SmilChr01G002081 Chr01 NC_080387.1:36755476-36755487promoter 内 3108-3119 bp + 882 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 36756369-36761002(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 CAACGACGTGGG
SmilChr04G002307 Chr04 NC_080390.1:37361879-37361890promoter 内 3098-3109 bp + 892 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 37362782-37366210(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GCGTGACGTGAG
SmilChr02G000234 Chr02 NC_080388.1:3013611-3013622promoter 内 3058-3069 bp + 932 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 3011464-3012679(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 ACCACGTCGCTC
SmilChr02G001599 Chr02 NC_080388.1:29824318-29824329promoter 内 3057-3068 bp - 933 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 29825262-29827982(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GCCACGTGGAGA
SmilChr02G003129 Chr02 NC_080388.1:52320962-52320973promoter 内 3044-3055 bp - 946 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 52318231-52320016(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GCTCGACGTGGA
SmilChr04G000837 Chr04 NC_080390.1:10540326-10540337promoter 内 3033-3044 bp + 957 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 10536248-10539369(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GCCACGTGGAGA
SmilChr03G004725 Chr03 NC_080389.1:64444835-64444846promoter 内 2960-2971 bp - 1030 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 64445876-64448146(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TCCACGTCGCGT
SmilChr02G001306 Chr02 NC_080388.1:24257719-24257730promoter 内 2841-2852 bp + 1149 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 24254933-24256570(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TCCACGTCGCTC
SmilChr03G002207 Chr03 NC_080389.1:34771473-34771484promoter 内 2831-2842 bp + 1159 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 34772643-34776230(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TCACCACGTGGC
SmilChr04G001113 Chr04 NC_080390.1:15977336-15977347promoter 内 2787-2798 bp + 1203 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 15973468-15976133(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 CTCACGTCACGC
SmilChr02G005198 Chr02 NC_080388.1:73247261-73247272promoter 内 2759-2770 bp + 1231 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 73248503-73250639(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GAGCGACGTGGA
SmilChr03G003623 Chr03 NC_080389.1:54905342-54905353promoter 内 2589-2600 bp + 1401 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 54903235-54903941(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 CTCACGTCACGC
SmilChr02G003546 Chr02 NC_080388.1:56616971-56616982promoter 内 2461-2472 bp - 1529 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 56612498-56615442(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 CTTCGACGTGGG
SmilChr01G003521 Chr01 NC_080387.1:53850021-53850032promoter 内 2424-2435 bp + 1566 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 53851598-53855012(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 AGCTGACGTGCA
SmilChr02G002913 Chr02 NC_080388.1:49435210-49435221promoter 内 2407-2418 bp - 1583 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 49428195-49433627(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 CCGTGACGTGAG
SmilChr03G001872 Chr03 NC_080389.1:25932127-25932138promoter 内 2322-2333 bp - 1668 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 25933806-25940905(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GCCACGTGGAGA
SmilChr02G005149 Chr02 NC_080388.1:72873394-72873405promoter 内 2284-2295 bp - 1706 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 72875111-72879373(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 ACCACGTCGTGC
SmilChr01G005957 Chr01 NC_080387.1:75258264-75258275promoter 内 2219-2230 bp + 1771 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 75260046-75263014(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 ACGCGACGTGGT
SmilChr03G000926 Chr03 NC_080389.1:10602665-10602676promoter 内 2214-2225 bp + 1776 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 10604452-10607730(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GAGCGACGTGGA
SmilChr03G000686 Chr03 NC_080389.1:7669384-7669395promoter 内 2172-2183 bp + 1818 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 7671213-7673668(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GCCGCACGTGGC
SmilChr02G003547 Chr02 NC_080388.1:56616971-56616982promoter 内 2135-2146 bp - 1855 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 56618837-56620398(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 CCCACGTCGAAG
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SmilChr04G001850 Chr04 NC_080390.1:30170421-30170432promoter 内 1942-1953 bp - 2048 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 30172480-30175004(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GACACGTCACAG
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SmilChr01G003289 Chr01 NC_080387.1:51590620-51590631promoter 内 1920-1931 bp + 2070 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 51592701-51596225(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GTGCGACGTGGA