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转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family，查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中，并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因，不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif；应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引，可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card，点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
SmilChr04G003117 XP_057809539.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr04G003114 XP_057809538.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr01G005298 XP_057788621.1
ARR-B 1
MP00010
 8344 9778 查靶基因
SmilChr03G003924 XP_057798851.1
NAC 1
MP00059
 8333 9940 查靶基因
SmilChr01G005344 XP_057788686.1
MYB 1
MP00296
 8304 9873 查靶基因
SmilChr08G004408 XP_057780613.1
MYB 1
MP00114
 8151 9897 查靶基因
SmilChr04G001094 XP_057804404.1
WRKY 1
MP00408
 8149 9902 查靶基因
SmilChr07G003597 XP_057773587.1
Nin-like 1
MP00449
 8096 9453 查靶基因
SmilChr02G005433 XP_057792682.1
WRKY 1
MP00209
 8083 9910 查靶基因
SmilChr04G004136 XP_057806072.1
MYB 1
MP00627
 8075 9835 查靶基因
SmilChr01G003955 XP_057779712.1
WRKY 1
MP00450
 8044 9901 查靶基因
SmilChr03G003685 XP_057798538.1
ERF 1
MP00558
 8044 9762 查靶基因
SmilChr07G002937 XP_057777490.1
MIKC_MADS 1
MP00096
 8019 9914 查靶基因
SmilChr02G003833 XP_057794421.1
MYB 1
MP00476
 7981 9904 查靶基因
SmilChr07G002803 XP_057777238.1
NAC 1
MP00221
 7965 9903 查靶基因
SmilChr05G002364 XP_057809766.1
WRKY 1
MP00069
 7882 9917 查靶基因
SmilChr08G003267 XP_057779249.1
MYB 1
MP00406
 7839 9917 查靶基因
SmilChr02G005012 XP_057792191.1
TALE 1
MP00670
 7758 9906 查靶基因
SmilChr07G001978 XP_057776996.1
SBP 1
MP00555
 7648 9805 查靶基因
SmilChr05G000741 XP_057764423.1
ARF 1
MP00021
 7629 9812 查靶基因
SmilChr01G004579 XP_057787263.1
MYB 1
MP00132
 7583 9926 查靶基因
SmilChr05G000593 XP_057764223.1
MIKC_MADS 1
MP00609
 7575 9941 查靶基因
SmilChr03G004518 XP_057799834.1
ERF 1
MP00529
 7559 9247 查靶基因
SmilChr06G001829 XP_057766988.1
MYB 1
MP00510
 7526 9799 查靶基因
SmilChr05G000830 XP_057764550.1
NAC 1
MP00058
 7440 9855 查靶基因
SmilChr08G002543 XP_057778423.1
bZIP 1
MP00303
 7416 9868 查靶基因
SmilChr01G002743 XP_057765725.1
MYB_related 1
MP00565
 7412 9785 查靶基因
SmilChr04G002704 XP_057807081.1
ERF 1
MP00026
 7408 9854 查靶基因
SmilChr05G001395 XP_057765344.1
WRKY 1
MP00071
 7408 9764 查靶基因
SmilChr04G002953 XP_057809314.1
ARF 1
MP00033
 7406 9827 查靶基因
SmilChr01G004199 XP_057782208.1
bHLH 1
MP00074
 7396 9969 查靶基因
SmilChr05G004009 XP_057810662.1
MYB 1
MP00216
 7342 9832 查靶基因
SmilChr03G001606 XP_057802772.1
WRKY 1
MP00539
 7338 9848 查靶基因
SmilChr02G004600 XP_057791481.1
ARF 1
MP00574
 7302 9846 查靶基因
SmilChr03G004179 XP_057799230.1
WRKY 1
MP00464
 7299 9864 查靶基因
SmilChr04G003805 XP_057805691.1
MIKC_MADS 1
MP00315
 7291 9567 查靶基因
SmilChr03G003761 XP_057798625.1
WRKY 1
MP00525
 7235 9838 查靶基因
SmilChr01G001885 XP_057806790.1
WRKY 1
MP00171
 7182 9833 查靶基因
SmilChr05G004392 XP_057811204.1
WRKY 1
MP00506
 7173 9818 查靶基因
SmilChr04G002757 XP_057807158.1
MIKC_MADS 1
MP00272
 7172 9889 查靶基因
SmilChr01G003404 XP_057773670.1
bZIP 1
MP00184
 7147 9840 查靶基因
SmilChr03G002335 XP_057801256.1
bZIP 1
MP00647
 7133 9953 查靶基因
SmilChr07G002075 XP_057773918.1
C2H2 1
MP00485
 7130 8059 查靶基因
SmilChr04G000162 XP_057807467.1
MYB 1
MP00134
 7078 8676 查靶基因
SmilChr04G000040 XP_057808382.1
ERF 1
MP00312
 7006 8490 查靶基因
SmilChr08G001896 XP_057783815.1
MYB 1
MP00564
 6984 9893 查靶基因
SmilChr02G005217 XP_057792502.1
G2-like 1
MP00022
 6959 9720 查靶基因
SmilChr05G000260 XP_057763683.1
bZIP 1
MP00040
 6920 9919 查靶基因
SmilChr01G002885 XP_057767601.1
ERF 1
MP00151
 6907 9976 查靶基因
SmilChr05G001518 XP_057765511.1
WRKY 1
MP00455
 6900 9792 查靶基因
SmilChr03G002503 XP_057801356.1
MYB 1
MP00482
 6899 8940 查靶基因
SmilChr03G001252 XP_057802461.1
bZIP 1
MP00291
 6894 9321 查靶基因
SmilChr06G001365 XP_057768799.1
SBP 1
MP00307
 6893 9755 查靶基因
SmilChr03G003439 XP_057798243.1
bHLH 1
MP00195
 6878 9832 查靶基因
SmilChr06G001111 XP_057768512.1
MYB 1
MP00388
 6870 9774 查靶基因
SmilChr02G000949 XP_057795176.1
bZIP 1
MP00318
 6849 9413 查靶基因
SmilChr01G000025 XP_057790305.1
SBP 1
MP00633
 6833 8026 查靶基因
SmilChr01G004313 XP_057783598.1
bHLH 1
MP00308
 6805 9826 查靶基因
SmilChr02G005502 XP_057792768.1
bHLH 1
MP00082
 6784 9435 查靶基因
SmilChr03G004274 XP_057799397.1
MIKC_MADS 1
MP00080
 6766 9850 查靶基因
SmilChr02G003688 XP_057794248.1
MYB 1
MP00028
 6764 9024 查靶基因
SmilChr04G003367 XP_057804957.1
MYB 1
MP00191
 6736 9690 查靶基因
SmilChr04G000157 XP_057807462.1
bHLH 1
MP00081
 6729 9942 查靶基因
SmilChr07G002147 XP_057774045.1
MYB 1
MP00500
 6697 9681 查靶基因
SmilChr05G002277 XP_057809665.1
ERF 1
MP00452
 6671 7783 查靶基因
SmilChr07G004480 XP_057776222.1
WRKY 1
MP00531
 6663 9784 查靶基因
SmilChr02G004447 XP_057797242.1
HD-ZIP 1
MP00200
 6661 9930 查靶基因
SmilChr04G000070 XP_057807324.1
bHLH 1
MP00034
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G002039 XP_057808459.1
bHLH 1
MP00660
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G005851 XP_057789306.1
MYB 1
MP00055
 6638 9685 查靶基因
SmilChr02G005238 XP_057792594.1
SBP 1
MP00634
 6619 7771 查靶基因
SmilChr06G002048 XP_057770293.1
bHLH 1
MP00035
 6618 9903 查靶基因
SmilChr07G000836 XP_057772437.1
MYB_related 1
MP00568
 6611 9696 查靶基因
SmilChr04G003119 XP_057809542.1
bZIP 1
MP00039
 6610 9936 查靶基因
SmilChr01G004114 XP_057781125.1
WRKY 1
MP00284
 6552 9774 查靶基因
SmilChr08G004246 XP_057780410.1
WRKY 1
MP00422
 6535 9791 查靶基因
SmilChr05G001980 XP_057766076.1
ARF 1
MP00153
 6534 9706 查靶基因
SmilChr04G000094 XP_057807365.1
YABBY 1
MP00620
 6504 9844 查靶基因
SmilChr02G002534 XP_057797741.1
TCP 1
MP00169
 6498 7295 查靶基因
SmilChr05G001269 XP_057765199.1
G2-like 1
MP00252
 6478 9780 查靶基因
SmilChr07G003441 XP_057773618.1
NAC 1
MP00108
 6458 9810 查靶基因
SmilChr02G001791 XP_057795933.1
TCP 1
MP00062
 6454 7249 查靶基因
SmilChr05G003285 XP_057810127.1
RAV 1
MP00024
 6450 9853 查靶基因
SmilChr05G000619 XP_057764205.1
WRKY 1
MP00167
 6439 9756 查靶基因
SmilChr04G003745 XP_057809144.1
C2H2 1
MP00416
 6433 9716 查靶基因
SmilChr02G004607 XP_057791470.1
C2H2 1
MP00608
 6398 9817 查靶基因
SmilChr02G003399 XP_057793859.1
ERF 1
MP00240
 6368 9978 查靶基因
SmilChr01G004920 XP_057788125.1
MYB_related 1
MP00607
 6362 9718 查靶基因
SmilChr06G001059 XP_057768449.1
Dof 1
MP00402
 6278 9875 查靶基因
SmilChr01G004552 XP_057786668.1
bZIP 1
MP00409
 6252 8429 查靶基因
SmilChr01G006187 XP_057798078.1
GRAS 1
MP00611
 6232 9807 查靶基因
SmilChr01G001516 XP_057803325.1
bZIP 1
MP00648
 6170 9939 查靶基因
SmilChr04G003955 XP_057805828.1
ERF 1
MP00120
 6144 7514 查靶基因
SmilChr01G004708 XP_057787833.1
WRKY 1
MP00251
 6140 9713 查靶基因
SmilChr05G001961 XP_057766054.1
MIKC_MADS 1
MP00077
 6125 9815 查靶基因
SmilChr08G000478 XP_057781809.1
GATA 1
MP00130
 6015 9821 查靶基因
SmilChr01G000943 XP_057790035.1
MIKC_MADS 1
MP00508
 5979 7481 查靶基因
SmilChr05G004106 XP_057810779.1
WRKY 1
MP00260
 5932 9706 查靶基因
SmilChr04G003973 XP_057805857.1
HD-ZIP 1
MP00013
 5927 9712 查靶基因
SmilChr03G002207 XP_057801109.1
WRKY 1
MP00299
 5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr07G002147; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00004577-RA_Salv SmilChr07G002147 MYB XP_057774045.1 MP00500 AATATGGATAAGG

可能结合的靶基因

9681 个结合位点 6697 个候选靶基因 第 81 / 134 下载 TSV

上一页 81 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr02G002903 Chr02 NC_080388.1:49344378-49344390promoter 内 1373-1385 bp - 2616 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 49347006-49348582(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 ACTTATCCAGATG
SmilChr01G004332 Chr01 NC_080387.1:61464393-61464405promoter 内 1247-1259 bp - 2742 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 61460341-61461651(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 TATTCGGATAAGT
SmilChr01G000421 Chr01 NC_080387.1:8467721-8467733promoter 内 1185-1197 bp - 2804 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 8470537-8474719(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 TATTATCCAAATC
SmilChr02G002204 Chr02 NC_080388.1:39262710-39262722promoter 内 1171-1183 bp - 2818 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 39257977-39259892(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 TACTTAGATAAGG
SmilChr02G003192 Chr02 NC_080388.1:53080059-53080071promoter 内 1087-1099 bp + 2902 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 53075701-53077157(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 TATTATCCAAATC
SmilChr02G005416 Chr02 NC_080388.1:74621651-74621663promoter 内 1061-1073 bp + 2928 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 74624591-74625604(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 GACATGGATAACG
SmilChr03G001810 Chr03 NC_080389.1:24713954-24713966promoter 内 1049-1061 bp + 2940 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 24703512-24711014(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 TATTATCCAAATC
SmilChr02G004541 Chr02 NC_080388.1:67982773-67982785promoter 内 917-929 bp + 3072 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 67977113-67979701(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 TCTTATCCATCAA
SmilChr02G000993 Chr02 NC_080388.1:17441735-17441747promoter 内 893-905 bp + 3096 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 17444843-17447884(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CATACGGATAAGT
SmilChr02G000444 Chr02 NC_080388.1:5820216-5820228promoter 内 892-904 bp - 3097 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 5816373-5817119(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CCTTGGGATAAGG
SmilChr02G000130 Chr02 NC_080388.1:1760525-1760537promoter 内 831-843 bp - 3158 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 1756019-1757367(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 TTGATGGATAAGA
SmilChr02G002638 Chr02 NC_080388.1:45776013-45776025promoter 内 694-706 bp + 3295 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 45779320-45788747(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 AGTTAGGATAAGT
SmilChr01G003700 Chr01 NC_080387.1:55386994-55387006promoter 内 685-697 bp + 3304 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 55374162-55383690(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 TCTTATCCTTGAT
SmilChr02G004035 Chr02 NC_080388.1:62648814-62648826promoter 内 652-664 bp + 3337 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 62652163-62655801(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 TATAATGATAAGG
SmilChr02G002173 Chr02 NC_080388.1:38959906-38959918promoter 内 644-656 bp - 3345 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 38956013-38956561(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 AAAGGGGATAAGT
SmilChr01G000459 Chr01 NC_080387.1:9398321-9398333promoter 内 615-627 bp - 3374 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 9401707-9405133(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CCTTATCACCATC
SmilChr01G004695 Chr01 NC_080387.1:65018714-65018726promoter 内 597-609 bp - 3392 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 65009907-65015322(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 AGTCAGGATAAGC
SmilChr01G001511 Chr01 NC_080387.1:28938098-28938110promoter 内 596-608 bp + 3393 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 28941503-28945444(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 ATAATGGATAACA
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SmilChr02G005053 Chr02 NC_080388.1:72235916-72235928promoter 内 430-442 bp - 3559 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 72239487-72242550(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CCTTATCACCATC
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SmilChr03G001856 Chr03 NC_080389.1:25585098-25585110promoter 内 155-167 bp + 3834 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 25588944-25589594(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 AAGAGGGATAAGG
SmilChr02G003255 Chr02 NC_080388.1:53845384-53845396promoter 内 89-101 bp + 3900 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 53836245-53841484(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CCTTATCTCTACG
SmilChr01G003533 Chr01 NC_080387.1:53947163-53947175promoter 内 82-94 bp - 3907 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 53951082-53956762(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 TATTATCCACTTT
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SmilChr02G000934 Chr02 NC_080388.1:16265183-16265195promoter 内 1701-1713 bp + 2288 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 3 16267483-16270555(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 TAATTGGATAACA
SmilChr01G000272 Chr01 NC_080387.1:5411664-5411676promoter 内 1458-1470 bp + 2531 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 3 5414207-5415073(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 GACCAGGATAAGA
SmilChr02G001392 Chr02 NC_080388.1:26449501-26449513promoter 内 1117-1129 bp - 2872 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 3 26442907-26446629(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 ATTGTGGATAATA
SmilChr01G005849 Chr01 NC_080387.1:74440588-74440600promoter 内 412-424 bp + 3577 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 3 74436940-74437011(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 GCTTATCCCTTCC
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SmilChr01G004516 Chr01 NC_080387.1:63287887-63287899promoter 内 3876-3888 bp - 113 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 2 63281065-63287774(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 TTTATTGATAAGG
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SmilChr02G000990 Chr02 NC_080388.1:17419779-17419791promoter 内 3632-3644 bp + 357 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 2 17418789-17419422(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 TCTTATCCGACTC
SmilChr03G001696 Chr03 NC_080389.1:22518370-22518382promoter 内 3551-3563 bp - 438 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 2 22514800-22517932(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 TGATGGGATAAGA
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SmilChr02G001138 Chr02 NC_080388.1:20512702-20512714promoter 内 3512-3524 bp + 477 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 2 20509831-20512225(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 TCTTATCCGACTC
SmilChr01G005850 Chr01 NC_080387.1:74440588-74440600promoter 内 3488-3500 bp + 501 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 2 74438105-74440087(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 GCTTATCCCTTCC
SmilChr03G000779 Chr03 NC_080389.1:8881168-8881180promoter 内 3202-3214 bp + 787 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 2 8876744-8880381(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CCTTATCATTTTT
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SmilChr01G005854 Chr01 NC_080387.1:74486214-74486226promoter 内 3049-3061 bp + 940 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 2 74487166-74489373(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 TGAAGAGATAAGG
SmilChr03G000421 Chr03 NC_080389.1:4566546-4566558promoter 内 2935-2947 bp + 1054 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 2 4567612-4568583(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 GAAAGGGATAAGT