Red Sage Omics 丹参基因组信息平台
首页 基因查询 ID 对照表 功能注释 结构域预测 Pfam 基因组工具 蛋白互作 亚细胞定位 表达量 共表达 同源/共线性 GO/KEGG 注释 TF 结合位点 TF 靶基因 EMS 突变 JBrowse BLAST 下载 关于 帮助
数据资源
ID 对照表 功能注释 功能检索 次生代谢专题 文献证据 结构域预测 Pfam 同源/共线性
分析工具
基因组工具 引物设计 同源重组引物设计 核酸翻译 BLAST 蛋白互作 亚细胞定位 共表达 GO/KEGG 注释 功能检索
调控/突变
TF 结合位点 TF 靶基因 EMS 突变
帮助
关于 帮助 资源与版本
中文 EN

转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family，查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中，并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因，不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif；应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引，可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card，点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
SmilChr04G003117 XP_057809539.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr04G003114 XP_057809538.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr01G005298 XP_057788621.1
ARR-B 1
MP00010
 8344 9778 查靶基因
SmilChr03G003924 XP_057798851.1
NAC 1
MP00059
 8333 9940 查靶基因
SmilChr01G005344 XP_057788686.1
MYB 1
MP00296
 8304 9873 查靶基因
SmilChr08G004408 XP_057780613.1
MYB 1
MP00114
 8151 9897 查靶基因
SmilChr04G001094 XP_057804404.1
WRKY 1
MP00408
 8149 9902 查靶基因
SmilChr07G003597 XP_057773587.1
Nin-like 1
MP00449
 8096 9453 查靶基因
SmilChr02G005433 XP_057792682.1
WRKY 1
MP00209
 8083 9910 查靶基因
SmilChr04G004136 XP_057806072.1
MYB 1
MP00627
 8075 9835 查靶基因
SmilChr01G003955 XP_057779712.1
WRKY 1
MP00450
 8044 9901 查靶基因
SmilChr03G003685 XP_057798538.1
ERF 1
MP00558
 8044 9762 查靶基因
SmilChr07G002937 XP_057777490.1
MIKC_MADS 1
MP00096
 8019 9914 查靶基因
SmilChr02G003833 XP_057794421.1
MYB 1
MP00476
 7981 9904 查靶基因
SmilChr07G002803 XP_057777238.1
NAC 1
MP00221
 7965 9903 查靶基因
SmilChr05G002364 XP_057809766.1
WRKY 1
MP00069
 7882 9917 查靶基因
SmilChr08G003267 XP_057779249.1
MYB 1
MP00406
 7839 9917 查靶基因
SmilChr02G005012 XP_057792191.1
TALE 1
MP00670
 7758 9906 查靶基因
SmilChr07G001978 XP_057776996.1
SBP 1
MP00555
 7648 9805 查靶基因
SmilChr05G000741 XP_057764423.1
ARF 1
MP00021
 7629 9812 查靶基因
SmilChr01G004579 XP_057787263.1
MYB 1
MP00132
 7583 9926 查靶基因
SmilChr05G000593 XP_057764223.1
MIKC_MADS 1
MP00609
 7575 9941 查靶基因
SmilChr03G004518 XP_057799834.1
ERF 1
MP00529
 7559 9247 查靶基因
SmilChr06G001829 XP_057766988.1
MYB 1
MP00510
 7526 9799 查靶基因
SmilChr05G000830 XP_057764550.1
NAC 1
MP00058
 7440 9855 查靶基因
SmilChr08G002543 XP_057778423.1
bZIP 1
MP00303
 7416 9868 查靶基因
SmilChr01G002743 XP_057765725.1
MYB_related 1
MP00565
 7412 9785 查靶基因
SmilChr04G002704 XP_057807081.1
ERF 1
MP00026
 7408 9854 查靶基因
SmilChr05G001395 XP_057765344.1
WRKY 1
MP00071
 7408 9764 查靶基因
SmilChr04G002953 XP_057809314.1
ARF 1
MP00033
 7406 9827 查靶基因
SmilChr01G004199 XP_057782208.1
bHLH 1
MP00074
 7396 9969 查靶基因
SmilChr05G004009 XP_057810662.1
MYB 1
MP00216
 7342 9832 查靶基因
SmilChr03G001606 XP_057802772.1
WRKY 1
MP00539
 7338 9848 查靶基因
SmilChr02G004600 XP_057791481.1
ARF 1
MP00574
 7302 9846 查靶基因
SmilChr03G004179 XP_057799230.1
WRKY 1
MP00464
 7299 9864 查靶基因
SmilChr04G003805 XP_057805691.1
MIKC_MADS 1
MP00315
 7291 9567 查靶基因
SmilChr03G003761 XP_057798625.1
WRKY 1
MP00525
 7235 9838 查靶基因
SmilChr01G001885 XP_057806790.1
WRKY 1
MP00171
 7182 9833 查靶基因
SmilChr05G004392 XP_057811204.1
WRKY 1
MP00506
 7173 9818 查靶基因
SmilChr04G002757 XP_057807158.1
MIKC_MADS 1
MP00272
 7172 9889 查靶基因
SmilChr01G003404 XP_057773670.1
bZIP 1
MP00184
 7147 9840 查靶基因
SmilChr03G002335 XP_057801256.1
bZIP 1
MP00647
 7133 9953 查靶基因
SmilChr07G002075 XP_057773918.1
C2H2 1
MP00485
 7130 8059 查靶基因
SmilChr04G000162 XP_057807467.1
MYB 1
MP00134
 7078 8676 查靶基因
SmilChr04G000040 XP_057808382.1
ERF 1
MP00312
 7006 8490 查靶基因
SmilChr08G001896 XP_057783815.1
MYB 1
MP00564
 6984 9893 查靶基因
SmilChr02G005217 XP_057792502.1
G2-like 1
MP00022
 6959 9720 查靶基因
SmilChr05G000260 XP_057763683.1
bZIP 1
MP00040
 6920 9919 查靶基因
SmilChr01G002885 XP_057767601.1
ERF 1
MP00151
 6907 9976 查靶基因
SmilChr05G001518 XP_057765511.1
WRKY 1
MP00455
 6900 9792 查靶基因
SmilChr03G002503 XP_057801356.1
MYB 1
MP00482
 6899 8940 查靶基因
SmilChr03G001252 XP_057802461.1
bZIP 1
MP00291
 6894 9321 查靶基因
SmilChr06G001365 XP_057768799.1
SBP 1
MP00307
 6893 9755 查靶基因
SmilChr03G003439 XP_057798243.1
bHLH 1
MP00195
 6878 9832 查靶基因
SmilChr06G001111 XP_057768512.1
MYB 1
MP00388
 6870 9774 查靶基因
SmilChr02G000949 XP_057795176.1
bZIP 1
MP00318
 6849 9413 查靶基因
SmilChr01G000025 XP_057790305.1
SBP 1
MP00633
 6833 8026 查靶基因
SmilChr01G004313 XP_057783598.1
bHLH 1
MP00308
 6805 9826 查靶基因
SmilChr02G005502 XP_057792768.1
bHLH 1
MP00082
 6784 9435 查靶基因
SmilChr03G004274 XP_057799397.1
MIKC_MADS 1
MP00080
 6766 9850 查靶基因
SmilChr02G003688 XP_057794248.1
MYB 1
MP00028
 6764 9024 查靶基因
SmilChr04G003367 XP_057804957.1
MYB 1
MP00191
 6736 9690 查靶基因
SmilChr04G000157 XP_057807462.1
bHLH 1
MP00081
 6729 9942 查靶基因
SmilChr07G002147 XP_057774045.1
MYB 1
MP00500
 6697 9681 查靶基因
SmilChr05G002277 XP_057809665.1
ERF 1
MP00452
 6671 7783 查靶基因
SmilChr07G004480 XP_057776222.1
WRKY 1
MP00531
 6663 9784 查靶基因
SmilChr02G004447 XP_057797242.1
HD-ZIP 1
MP00200
 6661 9930 查靶基因
SmilChr04G000070 XP_057807324.1
bHLH 1
MP00034
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G002039 XP_057808459.1
bHLH 1
MP00660
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G005851 XP_057789306.1
MYB 1
MP00055
 6638 9685 查靶基因
SmilChr02G005238 XP_057792594.1
SBP 1
MP00634
 6619 7771 查靶基因
SmilChr06G002048 XP_057770293.1
bHLH 1
MP00035
 6618 9903 查靶基因
SmilChr07G000836 XP_057772437.1
MYB_related 1
MP00568
 6611 9696 查靶基因
SmilChr04G003119 XP_057809542.1
bZIP 1
MP00039
 6610 9936 查靶基因
SmilChr01G004114 XP_057781125.1
WRKY 1
MP00284
 6552 9774 查靶基因
SmilChr08G004246 XP_057780410.1
WRKY 1
MP00422
 6535 9791 查靶基因
SmilChr05G001980 XP_057766076.1
ARF 1
MP00153
 6534 9706 查靶基因
SmilChr04G000094 XP_057807365.1
YABBY 1
MP00620
 6504 9844 查靶基因
SmilChr02G002534 XP_057797741.1
TCP 1
MP00169
 6498 7295 查靶基因
SmilChr05G001269 XP_057765199.1
G2-like 1
MP00252
 6478 9780 查靶基因
SmilChr07G003441 XP_057773618.1
NAC 1
MP00108
 6458 9810 查靶基因
SmilChr02G001791 XP_057795933.1
TCP 1
MP00062
 6454 7249 查靶基因
SmilChr05G003285 XP_057810127.1
RAV 1
MP00024
 6450 9853 查靶基因
SmilChr05G000619 XP_057764205.1
WRKY 1
MP00167
 6439 9756 查靶基因
SmilChr04G003745 XP_057809144.1
C2H2 1
MP00416
 6433 9716 查靶基因
SmilChr02G004607 XP_057791470.1
C2H2 1
MP00608
 6398 9817 查靶基因
SmilChr02G003399 XP_057793859.1
ERF 1
MP00240
 6368 9978 查靶基因
SmilChr01G004920 XP_057788125.1
MYB_related 1
MP00607
 6362 9718 查靶基因
SmilChr06G001059 XP_057768449.1
Dof 1
MP00402
 6278 9875 查靶基因
SmilChr01G004552 XP_057786668.1
bZIP 1
MP00409
 6252 8429 查靶基因
SmilChr01G006187 XP_057798078.1
GRAS 1
MP00611
 6232 9807 查靶基因
SmilChr01G001516 XP_057803325.1
bZIP 1
MP00648
 6170 9939 查靶基因
SmilChr04G003955 XP_057805828.1
ERF 1
MP00120
 6144 7514 查靶基因
SmilChr01G004708 XP_057787833.1
WRKY 1
MP00251
 6140 9713 查靶基因
SmilChr05G001961 XP_057766054.1
MIKC_MADS 1
MP00077
 6125 9815 查靶基因
SmilChr08G000478 XP_057781809.1
GATA 1
MP00130
 6015 9821 查靶基因
SmilChr01G000943 XP_057790035.1
MIKC_MADS 1
MP00508
 5979 7481 查靶基因
SmilChr05G004106 XP_057810779.1
WRKY 1
MP00260
 5932 9706 查靶基因
SmilChr04G003973 XP_057805857.1
HD-ZIP 1
MP00013
 5927 9712 查靶基因
SmilChr03G002207 XP_057801109.1
WRKY 1
MP00299
 5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr01G004552; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00011094-RA_Salv SmilChr01G004552 bZIP XP_057786668.1 MP00409 AATGGACACGTGGCA

可能结合的靶基因

8429 个结合位点 6252 个候选靶基因 第 82 / 126 下载 TSV

上一页 82 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr06G003277 Chr06 NC_080392.1:45346852-45346866promoter 内 3922-3936 bp + 65 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 45346931-45354017(+) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 TAGGGACACGTGTAA
SmilChr07G001501 Chr07 NC_080393.1:11977623-11977637promoter 内 3915-3929 bp + 72 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 11977709-11985359(+) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 AAACTCGACGTGGCA
SmilChr03G000989 Chr03 NC_080389.1:11220080-11220094promoter 内 3893-3907 bp + 94 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 11220188-11227976(+) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 ATACAAGACGTGGCC
SmilChr03G003562 Chr03 NC_080389.1:54265496-54265510promoter 内 3886-3900 bp - 101 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 54260703-54265395(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 GTTCAACACGTGTCG
SmilChr07G001135 Chr07 NC_080393.1:8526856-8526870promoter 内 3831-3845 bp - 156 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 8524402-8526700(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 GACGCTTACGTGGCA
SmilChr08G004493 Chr08 NC_080394.1:54544597-54544611promoter 内 3814-3828 bp + 173 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 54544784-54546910(+) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 AGAAGACACGTGGAA
SmilChr01G000118 Chr01 NC_080387.1:2033357-2033371promoter 内 3811-3825 bp - 176 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 2032181-2033181(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 AGAAGACACGTGGAA
SmilChr06G002906 Chr06 NC_080392.1:41862462-41862476promoter 内 3804-3818 bp + 183 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 41858253-41862279(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 TGCCACGTAGGCGCC
SmilChr07G001114 Chr07 NC_080393.1:8268624-8268638promoter 内 3803-3817 bp + 184 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 8266267-8268440(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 TGCCACGTATCAGCT
SmilChr06G003066 Chr06 NC_080392.1:43550476-43550490promoter 内 3767-3781 bp - 220 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 43547665-43550256(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 TAGGGACACGTGTAA
SmilChr04G003258 Chr04 NC_080390.1:49302022-49302036promoter 内 3755-3769 bp - 232 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 49301026-49301790(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 AGAAGACACGTGGAA
SmilChr02G004437 Chr02 NC_080388.1:66752883-66752897promoter 内 3738-3752 bp + 249 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 66753146-66754326(+) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 CCTGCAGACGTGGCT
SmilChr08G004355 Chr08 NC_080394.1:53251605-53251619promoter 内 3574-3588 bp + 413 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 53245753-53251192(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 TGCCACGTAGGCGCC
SmilChr06G001455 Chr06 NC_080392.1:15397393-15397407promoter 内 3573-3587 bp - 414 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 15397821-15401897(+) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 TGCCACGTAGGCGCC
SmilChr03G004472 Chr03 NC_080389.1:62821126-62821140promoter 内 3568-3582 bp + 419 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 62821559-62829024(+) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 TAGGGACACGTGTAA
SmilChr03G001743 Chr03 NC_080389.1:23517733-23517747promoter 内 3531-3545 bp + 456 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 23515333-23517277(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 TGACACGTGTTTAAG
SmilChr06G002695 Chr06 NC_080392.1:38875643-38875657promoter 内 3499-3513 bp - 488 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 38873357-38875155(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 AGAAGACACGTGGAA
SmilChr07G003146 Chr07 NC_080393.1:33366833-33366847promoter 内 3492-3506 bp + 495 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 33367342-33369404(+) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 GGCGCCTACGTGGCA
SmilChr02G005010 Chr02 NC_080388.1:71901701-71901715promoter 内 3489-3503 bp - 498 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 71902213-71908333(+) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 TGCCACGTAGGCGCC
SmilChr07G003127 Chr07 NC_080393.1:33184892-33184906promoter 内 3422-3436 bp + 565 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 33185471-33187782(+) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 GGCGCCTACGTGGCA
SmilChr06G003276 Chr06 NC_080392.1:45346852-45346866promoter 内 3343-3357 bp + 644 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 45341977-45346208(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 TTACACGTGTCCCTA
SmilChr08G002637 Chr08 NC_080394.1:25818565-25818579promoter 内 3327-3341 bp + 660 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 25814539-25817905(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 TGCCACGTCGAATAA
SmilChr02G000774 Chr02 NC_080388.1:12717485-12717499promoter 内 3250-3264 bp + 737 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 12714141-12716748(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 TGACACGTGTAAATT
SmilChr08G004620 Chr08 NC_080394.1:55744529-55744543promoter 内 3054-3068 bp - 933 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 55740666-55743596(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 GGCATCCACGTGGCA
SmilChr07G004131 Chr07 NC_080393.1:53041022-53041036promoter 内 2965-2979 bp - 1022 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 53042058-53044386(+) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 TGCCACGTAGGCGCC
SmilChr06G002839 Chr06 NC_080392.1:41157481-41157495promoter 内 2937-2951 bp + 1050 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 41158545-41159776(+) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 CGGGGTCACGTGGAG
SmilChr08G004304 Chr08 NC_080394.1:52739858-52739872promoter 内 2873-2887 bp - 1114 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 52736015-52738744(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 GGCGCCTACGTGGCA
SmilChr06G002133 Chr06 NC_080392.1:28729065-28729079promoter 内 2869-2883 bp - 1118 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 28726910-28727947(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 ACTGGTTACGTGGCC
SmilChr01G001475 Chr01 NC_080387.1:28534862-28534876promoter 内 2804-2818 bp + 1183 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 28536059-28538387(+) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 TAAATCCACGTGGCA
SmilChr08G000545 Chr08 NC_080394.1:3974663-3974677promoter 内 2800-2814 bp + 1187 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 3975864-3979938(+) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 TTCTCACACGTGTCA
SmilChr02G005118 Chr02 NC_080388.1:72680925-72680939promoter 内 2778-2792 bp - 1209 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 72677708-72679716(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 GAATTTGACGTGGCG
SmilChr03G004519 Chr03 NC_080389.1:63264257-63264271promoter 内 2648-2662 bp - 1339 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 63265610-63268258(+) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 TGCCACGTGAAGGCT
SmilChr03G001267 Chr03 NC_080389.1:14703579-14703593promoter 内 2443-2457 bp + 1544 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 14705137-14707418(+) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 AATTTACACGTGTCA
SmilChr03G001579 Chr03 NC_080389.1:19953326-19953340promoter 内 2283-2297 bp - 1704 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 19955044-19956198(+) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 CGCCACGTCAGTCTG
SmilChr07G002561 Chr07 NC_080393.1:24353030-24353044promoter 内 2263-2277 bp + 1724 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 24349118-24351306(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 TGCCACGTAGGCTTA
SmilChr05G002707 Chr05 NC_080391.1:31122875-31122889promoter 内 2228-2242 bp - 1759 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 31115632-31121116(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 CCTGCTGACGTGGCT
SmilChr04G001925 Chr04 NC_080390.1:31358417-31358431promoter 内 2195-2209 bp - 1792 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 31360223-31361483(+) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 TGCCACGTAGGCGCC
SmilChr01G000845 Chr01 NC_080387.1:18295460-18295474promoter 内 2159-2173 bp + 1828 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 18297302-18299187(+) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 GGCGCCTACGTGGCA
SmilChr04G001082 Chr04 NC_080390.1:15500019-15500033promoter 内 2099-2113 bp - 1888 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 15497688-15498131(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 TCACGACACGTGGCT
SmilChr01G000991 Chr01 NC_080387.1:20929069-20929083promoter 内 1890-1904 bp - 2097 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 20931180-20931512(+) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 CGCCACGTCGGGATG
SmilChr06G002969 Chr06 NC_080392.1:42514332-42514346promoter 内 1856-1870 bp - 2131 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 42516477-42517256(+) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 TGCCACGTAGGCGCC
SmilChr02G005009 Chr02 NC_080388.1:71901701-71901715promoter 内 1731-1745 bp - 2256 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 71896415-71899445(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 GGCGCCTACGTGGCA
SmilChr04G001614 Chr04 NC_080390.1:26889191-26889205promoter 内 1696-1710 bp - 2291 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 26862887-26886900(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 TAAATCCACGTGGCA
SmilChr08G001681 Chr08 NC_080394.1:14036787-14036801promoter 内 1625-1639 bp - 2362 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 14039163-14040107(+) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 TGCCACGTCGAATAA
SmilChr03G003377 Chr03 NC_080389.1:52118872-52118886promoter 内 1536-1550 bp + 2451 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 52113362-52116421(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 TGACACGTGTAAATT
SmilChr01G002417 Chr01 NC_080387.1:41587615-41587629promoter 内 1530-1544 bp - 2457 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 41561379-41585158(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 TAGGGACACGTGTAA
SmilChr02G002867 Chr02 NC_080388.1:48846620-48846634promoter 内 1483-1497 bp - 2504 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 48826093-48844116(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 GGCGCCTACGTGGCA
SmilChr07G001035 Chr07 NC_080393.1:7558116-7558130promoter 内 1323-1337 bp - 2664 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 7551094-7555452(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 TTGTGATACGTGGCA
SmilChr04G003447 Chr04 NC_080390.1:50983600-50983614promoter 内 1269-1283 bp + 2718 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 50978497-50980882(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 TTACACGTGTCCCTA
SmilChr03G003378 Chr03 NC_080389.1:52118872-52118886promoter 内 1128-1142 bp + 2859 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 52121745-52127255(+) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 AATTTACACGTGTCA