转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

下载包含当前查询和阈值下的全部候选靶基因,每个基因保留一个最佳位点及命中位点数。0–100 标准化 motif 得分不代表结合概率。

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr06G001829; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00004434-RA_Salv SmilChr06G001829 MYB XP_057766988.1 MP00510 TTTACCTACCTTT

可能结合的靶基因

9799 个结合位点 7526 个候选靶基因 第 83 / 151 下载 TSV

上一页 83 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 标准化 motif 得分 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr02G002673 Chr02 NC_080388.1:46329794-46329806promoter 内 1797-1809 bp + 2192 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 46331998-46335353(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TTTACCTAAATTC
SmilChr02G003242 Chr02 NC_080388.1:53697422-53697434promoter 内 1721-1733 bp + 2268 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 53699702-53702986(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 ATTACCTACCGAA
SmilChr01G005553 Chr01 NC_080387.1:72365372-72365384promoter 内 1698-1710 bp - 2291 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 72359681-72363081(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GTAACCTACCAAT
SmilChr03G000520 Chr03 NC_080389.1:5594318-5594330promoter 内 1651-1663 bp + 2338 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 5596668-5597834(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CTTGCCTACCTTT
SmilChr04G002900 Chr04 NC_080390.1:45271007-45271019promoter 内 1630-1642 bp + 2359 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 45273378-45273800(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TTTACCTAAAACC
SmilChr05G001685 Chr05 NC_080391.1:16011342-16011354promoter 内 1561-1573 bp - 2428 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 16007418-16008914(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TTTACCTAATGAG
SmilChr01G003239 Chr01 NC_080387.1:51129855-51129867promoter 内 1436-1448 bp - 2553 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 51132420-51135151(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GATTTTAGGTAAA
SmilChr03G003946 Chr03 NC_080389.1:58524328-58524340promoter 内 1412-1424 bp - 2577 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 58518743-58521751(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CCTGCCTACCTCT
SmilChr01G000934 Chr01 NC_080387.1:19817234-19817246promoter 内 1394-1406 bp - 2595 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 19803718-19814639(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CATACCTACCTAA
SmilChr01G000933 Chr01 NC_080387.1:19788779-19788791promoter 内 1392-1404 bp - 2597 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 19775261-19786182(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CATACCTACCTAA
SmilChr02G002072 Chr02 NC_080388.1:37303739-37303751promoter 内 1175-1187 bp + 2814 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 37306565-37312550(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CCTACCTACAAAA
SmilChr04G003515 Chr04 NC_080390.1:51529321-51529333promoter 内 1070-1082 bp + 2919 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 51514880-51526402(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GGAATTAGGTAAT
SmilChr01G001444 Chr01 NC_080387.1:28140742-28140754promoter 内 1047-1059 bp - 2942 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 28136280-28137800(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CATACCTACTTTT
SmilChr03G001813 Chr03 NC_080389.1:24749213-24749225promoter 内 915-927 bp + 3074 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 24752299-24755588(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TTTACCTAATGAG
SmilChr02G002292 Chr02 NC_080388.1:40454133-40454145promoter 内 882-894 bp - 3107 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 40457252-40460983(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GAATTTAGGTAAA
SmilChr02G002659 Chr02 NC_080388.1:46023245-46023257promoter 内 833-845 bp - 3156 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 46018745-46020089(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TTTACCTAAATCC
SmilChr03G001276 Chr03 NC_080389.1:14934754-14934766promoter 内 791-803 bp + 3198 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 14929106-14931556(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TTTTGTAGGTAGG
SmilChr03G001257 Chr03 NC_080389.1:14489142-14489154promoter 内 522-534 bp - 3467 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 14485083-14485675(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TTTACCTAAAATC
SmilChr03G003451 Chr03 NC_080389.1:52863583-52863595promoter 内 338-350 bp + 3651 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 52867246-52867917(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CCTACCTACAAAA
SmilChr04G003687 Chr04 NC_080390.1:53287647-53287659promoter 内 309-321 bp - 3680 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 53277045-53283967(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 ATTACCTAATACC
SmilChr02G000838 Chr02 NC_080388.1:14211095-14211107promoter 内 298-310 bp + 3691 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 14204480-14207404(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GATATTAGGTAAT
SmilChr01G003392 Chr01 NC_080387.1:52648481-52648493promoter 内 293-305 bp + 3696 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 52644354-52644785(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 ACTGGTAGGTTAA
SmilChr01G005398 Chr01 NC_080387.1:71246980-71246992promoter 内 287-299 bp - 3702 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 71250694-71253099(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GAATTTAGGTAAA
SmilChr05G000611 Chr05 NC_080391.1:4609265-4609277promoter 内 245-257 bp - 3744 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 4602489-4605521(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TTTACCTAAAATC
SmilChr05G000856 Chr05 NC_080391.1:6765028-6765040promoter 内 200-212 bp + 3789 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 6768829-6771109(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 ATTACCTAATATC
SmilChr01G001445 Chr01 NC_080387.1:28140742-28140754promoter 内 171-183 bp - 3818 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 28144572-28148054(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 AAAAGTAGGTATG
SmilChr02G000999 Chr02 NC_080388.1:17621366-17621378promoter 内 79-91 bp + 3910 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 17625288-17627802(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TATACCTACCGTT
SmilChr04G002599 Chr04 NC_080390.1:41405951-41405963promoter 内 2291-2303 bp + 1698 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 5 41407661-41410285(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 ATTACCTACTCAT
SmilChr04G002643 Chr04 NC_080390.1:41807547-41807559promoter 内 1794-1806 bp + 2195 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 5 41809754-41812283(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 ATTACCTACTCAT
SmilChr01G003692 Chr01 NC_080387.1:55294442-55294454promoter 内 2650-2662 bp + 1339 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 4 55288840-55293103(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 ATGTGTAGGTAAA
SmilChr03G002897 Chr03 NC_080389.1:45696008-45696020promoter 内 2359-2371 bp + 1630 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 4 45697650-45700954(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TTTACCTACACAT
SmilChr02G003523 Chr02 NC_080388.1:56397994-56398006promoter 内 1299-1311 bp + 2690 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 4 56400696-56404506(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TTTACCTACACAT
SmilChr01G003693 Chr01 NC_080387.1:55294645-55294657promoter 内 1162-1174 bp + 2827 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 4 55297484-55299992(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TTTACCTACACAT
SmilChr05G001102 Chr05 NC_080391.1:9163471-9163483promoter 内 1144-1156 bp - 2845 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 4 9166328-9170099(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 ATGTGTAGGTAAA
SmilChr05G001709 Chr05 NC_080391.1:16337434-16337446promoter 内 672-684 bp + 3317 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 4 16340763-16343441(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TTTACCTACACAT
SmilChr01G001537 Chr01 NC_080387.1:29396323-29396335promoter 内 3644-3656 bp - 345 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 3 29394965-29395978(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TTTACCTACACAT
SmilChr02G003040 Chr02 NC_080388.1:51145939-51145951promoter 内 3567-3579 bp - 422 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 3 51146373-51148060(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 ATGTGTAGGTAAA
SmilChr01G003581 Chr01 NC_080387.1:54379187-54379199promoter 内 3474-3486 bp + 515 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 3 54376761-54378672(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 ATGTGTAGGTAAA
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SmilChr03G003297 Chr03 NC_080389.1:51094565-51094577promoter 内 2132-2144 bp - 1857 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 3 51096434-51098033(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 ATGTGTAGGTAAA
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SmilChr01G003218 Chr01 NC_080387.1:50954636-50954648promoter 内 3829-3841 bp - 160 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 2 50954808-50957390(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 ATGTGTAGGTAAA
SmilChr04G003610 Chr04 NC_080390.1:52588223-52588235promoter 内 3442-3454 bp + 547 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 2 52585272-52587676(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 ATGTGTAGGTAAA
SmilChr01G004013 Chr01 NC_080387.1:58545441-58545453promoter 内 3394-3406 bp + 595 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 2 58544466-58544846(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 ATGTGTAGGTAAA
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SmilChr03G000889 Chr03 NC_080389.1:10163909-10163921promoter 内 2935-2947 bp - 1054 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 2 10157737-10162855(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TTTACCTACACAT
SmilChr05G000877 Chr05 NC_080391.1:6962507-6962519promoter 内 2711-2723 bp - 1278 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 2 6963797-6969234(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 AAGTGTAGGTAGC
SmilChr03G000890 Chr03 NC_080389.1:10163960-10163972promoter 内 2612-2624 bp - 1377 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 2 10165349-10166841(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 ATGTGTAGGTAAA