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转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family，查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中，并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因，不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif；应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引，可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card，点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
SmilChr04G003117 XP_057809539.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr04G003114 XP_057809538.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr01G005298 XP_057788621.1
ARR-B 1
MP00010
 8344 9778 查靶基因
SmilChr03G003924 XP_057798851.1
NAC 1
MP00059
 8333 9940 查靶基因
SmilChr01G005344 XP_057788686.1
MYB 1
MP00296
 8304 9873 查靶基因
SmilChr08G004408 XP_057780613.1
MYB 1
MP00114
 8151 9897 查靶基因
SmilChr04G001094 XP_057804404.1
WRKY 1
MP00408
 8149 9902 查靶基因
SmilChr07G003597 XP_057773587.1
Nin-like 1
MP00449
 8096 9453 查靶基因
SmilChr02G005433 XP_057792682.1
WRKY 1
MP00209
 8083 9910 查靶基因
SmilChr04G004136 XP_057806072.1
MYB 1
MP00627
 8075 9835 查靶基因
SmilChr01G003955 XP_057779712.1
WRKY 1
MP00450
 8044 9901 查靶基因
SmilChr03G003685 XP_057798538.1
ERF 1
MP00558
 8044 9762 查靶基因
SmilChr07G002937 XP_057777490.1
MIKC_MADS 1
MP00096
 8019 9914 查靶基因
SmilChr02G003833 XP_057794421.1
MYB 1
MP00476
 7981 9904 查靶基因
SmilChr07G002803 XP_057777238.1
NAC 1
MP00221
 7965 9903 查靶基因
SmilChr05G002364 XP_057809766.1
WRKY 1
MP00069
 7882 9917 查靶基因
SmilChr08G003267 XP_057779249.1
MYB 1
MP00406
 7839 9917 查靶基因
SmilChr02G005012 XP_057792191.1
TALE 1
MP00670
 7758 9906 查靶基因
SmilChr07G001978 XP_057776996.1
SBP 1
MP00555
 7648 9805 查靶基因
SmilChr05G000741 XP_057764423.1
ARF 1
MP00021
 7629 9812 查靶基因
SmilChr01G004579 XP_057787263.1
MYB 1
MP00132
 7583 9926 查靶基因
SmilChr05G000593 XP_057764223.1
MIKC_MADS 1
MP00609
 7575 9941 查靶基因
SmilChr03G004518 XP_057799834.1
ERF 1
MP00529
 7559 9247 查靶基因
SmilChr06G001829 XP_057766988.1
MYB 1
MP00510
 7526 9799 查靶基因
SmilChr05G000830 XP_057764550.1
NAC 1
MP00058
 7440 9855 查靶基因
SmilChr08G002543 XP_057778423.1
bZIP 1
MP00303
 7416 9868 查靶基因
SmilChr01G002743 XP_057765725.1
MYB_related 1
MP00565
 7412 9785 查靶基因
SmilChr04G002704 XP_057807081.1
ERF 1
MP00026
 7408 9854 查靶基因
SmilChr05G001395 XP_057765344.1
WRKY 1
MP00071
 7408 9764 查靶基因
SmilChr04G002953 XP_057809314.1
ARF 1
MP00033
 7406 9827 查靶基因
SmilChr01G004199 XP_057782208.1
bHLH 1
MP00074
 7396 9969 查靶基因
SmilChr05G004009 XP_057810662.1
MYB 1
MP00216
 7342 9832 查靶基因
SmilChr03G001606 XP_057802772.1
WRKY 1
MP00539
 7338 9848 查靶基因
SmilChr02G004600 XP_057791481.1
ARF 1
MP00574
 7302 9846 查靶基因
SmilChr03G004179 XP_057799230.1
WRKY 1
MP00464
 7299 9864 查靶基因
SmilChr04G003805 XP_057805691.1
MIKC_MADS 1
MP00315
 7291 9567 查靶基因
SmilChr03G003761 XP_057798625.1
WRKY 1
MP00525
 7235 9838 查靶基因
SmilChr01G001885 XP_057806790.1
WRKY 1
MP00171
 7182 9833 查靶基因
SmilChr05G004392 XP_057811204.1
WRKY 1
MP00506
 7173 9818 查靶基因
SmilChr04G002757 XP_057807158.1
MIKC_MADS 1
MP00272
 7172 9889 查靶基因
SmilChr01G003404 XP_057773670.1
bZIP 1
MP00184
 7147 9840 查靶基因
SmilChr03G002335 XP_057801256.1
bZIP 1
MP00647
 7133 9953 查靶基因
SmilChr07G002075 XP_057773918.1
C2H2 1
MP00485
 7130 8059 查靶基因
SmilChr04G000162 XP_057807467.1
MYB 1
MP00134
 7078 8676 查靶基因
SmilChr04G000040 XP_057808382.1
ERF 1
MP00312
 7006 8490 查靶基因
SmilChr08G001896 XP_057783815.1
MYB 1
MP00564
 6984 9893 查靶基因
SmilChr02G005217 XP_057792502.1
G2-like 1
MP00022
 6959 9720 查靶基因
SmilChr05G000260 XP_057763683.1
bZIP 1
MP00040
 6920 9919 查靶基因
SmilChr01G002885 XP_057767601.1
ERF 1
MP00151
 6907 9976 查靶基因
SmilChr05G001518 XP_057765511.1
WRKY 1
MP00455
 6900 9792 查靶基因
SmilChr03G002503 XP_057801356.1
MYB 1
MP00482
 6899 8940 查靶基因
SmilChr03G001252 XP_057802461.1
bZIP 1
MP00291
 6894 9321 查靶基因
SmilChr06G001365 XP_057768799.1
SBP 1
MP00307
 6893 9755 查靶基因
SmilChr03G003439 XP_057798243.1
bHLH 1
MP00195
 6878 9832 查靶基因
SmilChr06G001111 XP_057768512.1
MYB 1
MP00388
 6870 9774 查靶基因
SmilChr02G000949 XP_057795176.1
bZIP 1
MP00318
 6849 9413 查靶基因
SmilChr01G000025 XP_057790305.1
SBP 1
MP00633
 6833 8026 查靶基因
SmilChr01G004313 XP_057783598.1
bHLH 1
MP00308
 6805 9826 查靶基因
SmilChr02G005502 XP_057792768.1
bHLH 1
MP00082
 6784 9435 查靶基因
SmilChr03G004274 XP_057799397.1
MIKC_MADS 1
MP00080
 6766 9850 查靶基因
SmilChr02G003688 XP_057794248.1
MYB 1
MP00028
 6764 9024 查靶基因
SmilChr04G003367 XP_057804957.1
MYB 1
MP00191
 6736 9690 查靶基因
SmilChr04G000157 XP_057807462.1
bHLH 1
MP00081
 6729 9942 查靶基因
SmilChr07G002147 XP_057774045.1
MYB 1
MP00500
 6697 9681 查靶基因
SmilChr05G002277 XP_057809665.1
ERF 1
MP00452
 6671 7783 查靶基因
SmilChr07G004480 XP_057776222.1
WRKY 1
MP00531
 6663 9784 查靶基因
SmilChr02G004447 XP_057797242.1
HD-ZIP 1
MP00200
 6661 9930 查靶基因
SmilChr04G000070 XP_057807324.1
bHLH 1
MP00034
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G002039 XP_057808459.1
bHLH 1
MP00660
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G005851 XP_057789306.1
MYB 1
MP00055
 6638 9685 查靶基因
SmilChr02G005238 XP_057792594.1
SBP 1
MP00634
 6619 7771 查靶基因
SmilChr06G002048 XP_057770293.1
bHLH 1
MP00035
 6618 9903 查靶基因
SmilChr07G000836 XP_057772437.1
MYB_related 1
MP00568
 6611 9696 查靶基因
SmilChr04G003119 XP_057809542.1
bZIP 1
MP00039
 6610 9936 查靶基因
SmilChr01G004114 XP_057781125.1
WRKY 1
MP00284
 6552 9774 查靶基因
SmilChr08G004246 XP_057780410.1
WRKY 1
MP00422
 6535 9791 查靶基因
SmilChr05G001980 XP_057766076.1
ARF 1
MP00153
 6534 9706 查靶基因
SmilChr04G000094 XP_057807365.1
YABBY 1
MP00620
 6504 9844 查靶基因
SmilChr02G002534 XP_057797741.1
TCP 1
MP00169
 6498 7295 查靶基因
SmilChr05G001269 XP_057765199.1
G2-like 1
MP00252
 6478 9780 查靶基因
SmilChr07G003441 XP_057773618.1
NAC 1
MP00108
 6458 9810 查靶基因
SmilChr02G001791 XP_057795933.1
TCP 1
MP00062
 6454 7249 查靶基因
SmilChr05G003285 XP_057810127.1
RAV 1
MP00024
 6450 9853 查靶基因
SmilChr05G000619 XP_057764205.1
WRKY 1
MP00167
 6439 9756 查靶基因
SmilChr04G003745 XP_057809144.1
C2H2 1
MP00416
 6433 9716 查靶基因
SmilChr02G004607 XP_057791470.1
C2H2 1
MP00608
 6398 9817 查靶基因
SmilChr02G003399 XP_057793859.1
ERF 1
MP00240
 6368 9978 查靶基因
SmilChr01G004920 XP_057788125.1
MYB_related 1
MP00607
 6362 9718 查靶基因
SmilChr06G001059 XP_057768449.1
Dof 1
MP00402
 6278 9875 查靶基因
SmilChr01G004552 XP_057786668.1
bZIP 1
MP00409
 6252 8429 查靶基因
SmilChr01G006187 XP_057798078.1
GRAS 1
MP00611
 6232 9807 查靶基因
SmilChr01G001516 XP_057803325.1
bZIP 1
MP00648
 6170 9939 查靶基因
SmilChr04G003955 XP_057805828.1
ERF 1
MP00120
 6144 7514 查靶基因
SmilChr01G004708 XP_057787833.1
WRKY 1
MP00251
 6140 9713 查靶基因
SmilChr05G001961 XP_057766054.1
MIKC_MADS 1
MP00077
 6125 9815 查靶基因
SmilChr08G000478 XP_057781809.1
GATA 1
MP00130
 6015 9821 查靶基因
SmilChr01G000943 XP_057790035.1
MIKC_MADS 1
MP00508
 5979 7481 查靶基因
SmilChr05G004106 XP_057810779.1
WRKY 1
MP00260
 5932 9706 查靶基因
SmilChr04G003973 XP_057805857.1
HD-ZIP 1
MP00013
 5927 9712 查靶基因
SmilChr03G002207 XP_057801109.1
WRKY 1
MP00299
 5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr01G004199; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00010571-RA_Salv SmilChr01G004199 bHLH XP_057782208.1 MP00074 AGAAGGTCACGTGG

可能结合的靶基因

9969 个结合位点 7396 个候选靶基因 第 90 / 148 下载 TSV

上一页 90 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr06G000802 Chr06 NC_080392.1:7489053-7489066promoter 内 3813-3826 bp + 175 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 7489241-7490513(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 GAGTAGTCACGTGT
SmilChr05G003395 Chr05 NC_080391.1:44983097-44983110promoter 内 3685-3698 bp - 303 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 44981094-44982794(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 ATAACAACACGTGG
SmilChr03G002768 Chr03 NC_080389.1:44037437-44037450promoter 内 3533-3546 bp + 455 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 44035273-44036982(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGAATACCA
SmilChr07G001891 Chr07 NC_080393.1:16339707-16339720promoter 内 3514-3527 bp + 474 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 16340194-16343054(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 GGAGAATCACGTGT
SmilChr07G004677 Chr07 NC_080393.1:59716558-59716571promoter 内 3493-3506 bp - 495 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 59712701-59716063(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 ATCCTCACACGTGG
SmilChr04G003918 Chr04 NC_080390.1:54876036-54876049promoter 内 3473-3486 bp - 515 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 54876564-54879780(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGAATTTAT
SmilChr03G004593 Chr03 NC_080389.1:63755512-63755525promoter 内 3367-3380 bp - 621 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 63756146-63757335(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 TCACGTGACTTAAA
SmilChr04G001162 Chr04 NC_080390.1:17275729-17275742promoter 内 3257-3270 bp + 731 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 17273771-17274998(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGAGAACAT
SmilChr06G000142 Chr06 NC_080392.1:996497-996510promoter 内 3061-3074 bp + 927 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 997437-1001380(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 AAGAGAGCACGTGG
SmilChr03G001916 Chr03 NC_080389.1:26837151-26837164promoter 内 2958-2971 bp - 1030 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 26838194-26840759(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGTCAAAAA
SmilChr07G004704 Chr07 NC_080393.1:59919701-59919714promoter 内 2923-2936 bp - 1065 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 59920779-59923438(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 GCACGTGAGTAGCA
SmilChr04G000597 Chr04 NC_080390.1:6720508-6720521promoter 内 2802-2815 bp + 1186 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 6715491-6719322(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGAAAGTCT
SmilChr01G004596 Chr01 NC_080387.1:63939759-63939772promoter 内 2779-2792 bp - 1209 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 63940981-63944699(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGTGAATAC
SmilChr07G004247 Chr07 NC_080393.1:54906282-54906295promoter 内 2729-2742 bp - 1259 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 54907554-54909794(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGAGAACAT
SmilChr01G002186 Chr01 NC_080387.1:37989487-37989500promoter 内 2702-2715 bp - 1286 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 37987439-37988201(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 TGATTGTCACGTGT
SmilChr03G003089 Chr03 NC_080389.1:47918937-47918950promoter 内 2699-2712 bp + 1289 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 47920239-47922296(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 AACTCGTCACGTGT
SmilChr02G000590 Chr02 NC_080388.1:8460634-8460647promoter 内 2518-2531 bp + 1470 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 8462117-8462620(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 TATGGTACACGTGG
SmilChr02G000410 Chr02 NC_080388.1:5154336-5154349promoter 内 2506-2519 bp - 1482 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 5155831-5158826(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGAGAACAT
SmilChr06G002342 Chr06 NC_080392.1:34072701-34072714promoter 内 2500-2513 bp - 1488 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 34070740-34071213(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 GGAGAATCACGTGT
SmilChr07G002730 Chr07 NC_080393.1:26748493-26748506promoter 内 2466-2479 bp + 1522 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 26750028-26750577(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 GTGTGAACACGTGG
SmilChr07G002225 Chr07 NC_080393.1:20475997-20476010promoter 内 2459-2472 bp - 1529 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 20477539-20479968(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 ACACGTGACATTTA
SmilChr07G000223 Chr07 NC_080393.1:1427785-1427798promoter 内 2422-2435 bp - 1566 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 1422921-1426219(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 ATCCTCACACGTGG
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SmilChr02G004297 Chr02 NC_080388.1:65340511-65340524promoter 内 2148-2161 bp + 1840 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 65342364-65344829(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 GGTTTTTCACGTGG
SmilChr04G001368 Chr04 NC_080390.1:22205042-22205055promoter 内 2142-2155 bp - 1846 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 22206901-22214303(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 ACACGTGATTCTCC
SmilChr01G004416 Chr01 NC_080387.1:62303530-62303543promoter 内 2140-2153 bp + 1848 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 62305391-62306368(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 TACAGCTCACGTGA
SmilChr03G002996 Chr03 NC_080389.1:46777653-46777666promoter 内 2124-2137 bp - 1864 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 46773343-46775789(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 TGAATCTCACGTGT
SmilChr07G002498 Chr07 NC_080393.1:23715309-23715322promoter 内 2113-2126 bp + 1875 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 23709151-23713434(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGTGAGGAT
SmilChr02G005530 Chr02 NC_080388.1:75365120-75365133promoter 内 2081-2094 bp - 1907 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 75359946-75363213(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 AGACACTCACGTGC
SmilChr04G001116 Chr04 NC_080390.1:16013299-16013312promoter 内 2071-2084 bp + 1917 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 16009970-16011382(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGTCAAAAA
SmilChr06G002774 Chr06 NC_080392.1:40357968-40357981promoter 内 2001-2014 bp + 1987 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 40348053-40355981(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGTATTGAA
SmilChr01G002895 Chr01 NC_080387.1:47652022-47652035promoter 内 1781-1794 bp + 2207 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 47654242-47656712(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 ATAAATTCACGTGG
SmilChr07G003830 Chr07 NC_080393.1:47359171-47359184promoter 内 1748-1761 bp - 2240 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 47361424-47365257(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGAATAACC
SmilChr08G000575 Chr08 NC_080394.1:4181562-4181575promoter 内 1718-1731 bp + 2270 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 4183845-4185362(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 AGTAGTTCACGTGA
SmilChr04G003665 Chr04 NC_080390.1:53101002-53101015promoter 内 1686-1699 bp + 2302 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 53095125-53098700(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGCAGAGCG
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SmilChr04G001195 Chr04 NC_080390.1:18305135-18305148promoter 内 1617-1630 bp + 2371 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 18300691-18302764(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGAGAACAT
SmilChr07G000471 Chr07 NC_080393.1:3303737-3303750promoter 内 1613-1626 bp + 2375 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 3298301-3301362(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGTCAAAAA
SmilChr05G002850 Chr05 NC_080391.1:33996254-33996267promoter 内 1495-1508 bp + 2493 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 33998760-33998865(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 ATGTTCTCACGTGG
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SmilChr07G003557 Chr07 NC_080393.1:41428499-41428512promoter 内 1461-1474 bp - 2527 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 41431039-41432247(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGAGAACAT
SmilChr03G002016 Chr03 NC_080389.1:30098744-30098757promoter 内 1419-1432 bp + 2569 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 30095714-30096175(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGAGAACAT
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SmilChr02G005518 Chr02 NC_080388.1:75293799-75293812promoter 内 1170-1183 bp - 2818 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 75289006-75290981(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 AGACACTCACGTGC
SmilChr03G001988 Chr03 NC_080389.1:29134272-29134285promoter 内 1159-1172 bp + 2829 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 29124350-29131443(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGAGAACAT
SmilChr01G003970 Chr01 NC_080387.1:58145833-58145846promoter 内 1120-1133 bp - 2868 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 58141071-58142965(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 TATGGTACACGTGG
SmilChr02G005078 Chr02 NC_080388.1:72415513-72415526promoter 内 1103-1116 bp - 2885 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 72406534-72412628(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 TTTTTGACACGTGG