转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr02G004447; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00027346-RA_Salv SmilChr02G004447 HD-ZIP XP_057797242.1 MP00200 AAAAGTAATGATTAC

可能结合的靶基因

9930 个结合位点 6661 个候选靶基因 第 90 / 134 下载 TSV

上一页 90 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr01G002820 Chr01 NC_080387.1:46760154-46760168promoter 内 3782-3796 bp + 205 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 46760373-46763928(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 AATGGTTATGATTAT
SmilChr01G002452 Chr01 NC_080387.1:42123786-42123800promoter 内 3661-3675 bp + 326 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 42122634-42123460(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 ACCATCATTAACTCT
SmilChr03G002979 Chr03 NC_080389.1:46626146-46626160promoter 内 3648-3662 bp - 339 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 46624053-46625807(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 GATGATAATGATTTT
SmilChr02G002357 Chr02 NC_080388.1:41361469-41361483promoter 内 3547-3561 bp - 440 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 41361923-41365429(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 GAAATCATTATTTTA
SmilChr02G003746 Chr02 NC_080388.1:59119606-59119620promoter 内 3500-3514 bp - 487 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 59117599-59119119(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 GTTCACGATGATTAT
SmilChr02G000097 Chr02 NC_080388.1:1265358-1265372promoter 内 3392-3406 bp - 595 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 1265967-1268801(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 GCAATCATTTCAATG
SmilChr01G001425 Chr01 NC_080387.1:27879671-27879685promoter 内 3353-3367 bp - 634 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 27875044-27879037(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 TATCGTAATGATAAT
SmilChr03G003048 Chr03 NC_080389.1:47384695-47384709promoter 内 3349-3363 bp - 638 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 47385347-47389171(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 TTAATCATTGATTTC
SmilChr03G000809 Chr03 NC_080389.1:9251122-9251136promoter 内 3232-3246 bp + 755 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 9251891-9255960(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 TCCTACAATGATTAC
SmilChr02G005540 Chr02 NC_080388.1:75417883-75417897promoter 内 3220-3234 bp - 767 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 75418664-75420406(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 CTCATCATTAATTAT
SmilChr02G003202 Chr02 NC_080388.1:53173503-53173517promoter 内 3211-3225 bp + 776 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 53172149-53172727(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 TTAATCATTTTCTTC
SmilChr03G000484 Chr03 NC_080389.1:5168011-5168025promoter 内 3188-3202 bp - 799 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 5163205-5167212(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 TCCTACAATGATTAC
SmilChr03G000779 Chr03 NC_080389.1:8881184-8881198promoter 内 3184-3198 bp - 803 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 8876744-8880381(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 CCAGCTAATGATGAA
SmilChr02G004089 Chr02 NC_080388.1:63170846-63170860promoter 内 3148-3162 bp + 839 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 63165024-63170007(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 ATCATCATTAAACCC
SmilChr03G002593 Chr03 NC_080389.1:41235933-41235947promoter 内 3095-3109 bp + 892 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 41233848-41235041(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 AACATCATTATCATT
SmilChr01G004084 Chr01 NC_080387.1:59260686-59260700promoter 内 3054-3068 bp + 933 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 59257511-59259753(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 AAAATCATTACACTT
SmilChr02G003724 Chr02 NC_080388.1:58861415-58861429promoter 内 3046-3060 bp - 941 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 58858677-58860474(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 ATTATTAATGATTAT
SmilChr03G000394 Chr03 NC_080389.1:4313903-4313917promoter 内 2938-2952 bp - 1049 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 4314966-4315644(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 TTAATCATTTTCTTC
SmilChr03G001684 Chr03 NC_080389.1:22221172-22221186promoter 内 2936-2950 bp - 1051 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 22222237-22223700(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 GCCATCATTAATCCT
SmilChr01G005660 Chr01 NC_080387.1:72940315-72940329promoter 内 2885-2899 bp + 1102 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 72941431-72945167(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 ATTGGTAATGATGTT
SmilChr02G004840 Chr02 NC_080388.1:70535078-70535092promoter 内 2879-2893 bp - 1108 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 70524776-70533970(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 GGATTTAATGATTAA
SmilChr02G000910 Chr02 NC_080388.1:15745921-15745935promoter 内 2775-2789 bp + 1212 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 15743999-15744709(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 AAAATCATTACCAAC
SmilChr03G000388 Chr03 NC_080389.1:4293324-4293338promoter 内 2761-2775 bp - 1226 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 4294564-4296912(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 TTAATCATTTTCTTC
SmilChr01G004781 Chr01 NC_080387.1:66000770-66000784promoter 内 2750-2764 bp + 1237 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 66002021-66005290(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 ATAAGTAATAATTAG
SmilChr02G001799 Chr02 NC_080388.1:32842222-32842236promoter 内 2719-2733 bp + 1268 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 32839932-32840954(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 CCCATCATTAAATTT
SmilChr02G000713 Chr02 NC_080388.1:11492055-11492069promoter 内 2669-2683 bp - 1318 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 11493387-11495761(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 CACATCATTACTCTT
SmilChr02G004601 Chr02 NC_080388.1:68530718-68530732promoter 内 2637-2651 bp - 1350 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 68532082-68534809(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 GTAATCATTTGCTTA
SmilChr01G003331 Chr01 NC_080387.1:52023396-52023410promoter 内 2443-2457 bp + 1544 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 52024954-52026587(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 AACTGTAATGATAAT
SmilChr03G001802 Chr03 NC_080389.1:24617058-24617072promoter 内 2432-2446 bp + 1555 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 24614628-24615503(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 TTAATCATTTTCTTC
SmilChr02G000558 Chr02 NC_080388.1:7862286-7862300promoter 内 2392-2406 bp + 1595 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 7863895-7865043(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 AGCGATGATGATTAA
SmilChr01G004219 Chr01 NC_080387.1:60579883-60579897promoter 内 2383-2397 bp + 1604 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 60576167-60578279(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 ATAATCATCAGTCAC
SmilChr01G003689 Chr01 NC_080387.1:55271471-55271485promoter 内 2311-2325 bp - 1676 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 55267026-55269795(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 GAAAACAATGATTTC
SmilChr03G002513 Chr03 NC_080389.1:39993326-39993340promoter 内 2253-2267 bp + 1734 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 39988747-39991592(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 CCCATCATTAGATGT
SmilChr03G002053 Chr03 NC_080389.1:31119890-31119904promoter 内 2231-2245 bp - 1756 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 31115117-31118134(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 AAAATTGATGATTAT
SmilChr01G005394 Chr01 NC_080387.1:71213079-71213093promoter 内 2221-2235 bp - 1766 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 71211241-71211313(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 GATATTGATGATTAT
SmilChr03G003023 Chr03 NC_080389.1:47143433-47143447promoter 内 2209-2223 bp + 1778 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 47138749-47141655(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 TTAATCATCATCAAA
SmilChr02G003161 Chr02 NC_080388.1:52652871-52652885promoter 内 2163-2177 bp + 1824 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 52654709-52656442(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 GTGTGTAATGATTTC
SmilChr02G002006 Chr02 NC_080388.1:36193977-36193991promoter 内 2139-2153 bp + 1848 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 36195839-36196471(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 GAAAGTAATGATGCT
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SmilChr02G002005 Chr02 NC_080388.1:36193977-36193991promoter 内 1847-1861 bp + 2140 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 36188049-36191837(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 AGCATCATTACTTTC
SmilChr03G002950 Chr03 NC_080389.1:46229524-46229538promoter 内 1795-1809 bp - 2192 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 46223676-46227332(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 GAGAGTAATGATTCC
SmilChr02G002259 Chr02 NC_080388.1:40027577-40027591promoter 内 1704-1718 bp - 2283 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 40022937-40025294(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 ATTATTAATGATTAT
SmilChr01G001532 Chr01 NC_080387.1:29343265-29343279promoter 内 1674-1688 bp + 2313 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 29340528-29340952(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 TTCATAATTACTTTA
SmilChr03G003024 Chr03 NC_080389.1:47143433-47143447promoter 内 1623-1637 bp + 2364 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 47145811-47146548(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 TTTGATGATGATTAA
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SmilChr02G002921 Chr02 NC_080388.1:49583924-49583938promoter 内 1586-1600 bp - 2401 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 49586339-49591276(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 GACATCATTACAACG
SmilChr03G001630 Chr03 NC_080389.1:20999931-20999945promoter 内 1556-1570 bp + 2431 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 20995491-20997500(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 TTAATCATTGTTGAC
SmilChr03G001814 Chr03 NC_080389.1:24807930-24807944promoter 内 1326-1340 bp - 2661 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 24802597-24805269(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 TGAATTAATGATGAT
SmilChr02G002225 Chr02 NC_080388.1:39572356-39572370promoter 内 1303-1317 bp - 2684 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 39567398-39569672(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 GTATCTGATGATTAA
SmilChr01G003049 Chr01 NC_080387.1:49459844-49459858promoter 内 1243-1257 bp - 2744 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 49452411-49457100(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 TGAGTTAATGATTAT