转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr02G003688; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00003637-RA_Salv SmilChr02G003688 MYB XP_057794248.1 MP00028 GGCTCAGCGCG

可能结合的靶基因

9024 个结合位点 6764 个候选靶基因 第 92 / 136 下载 TSV

上一页 92 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr02G001348 Chr02 NC_080388.1:25180082-25180092promoter 内 1230-1240 bp - 2761 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 2 25182853-25183197(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCGCTGACCT
SmilChr03G002554 Chr03 NC_080389.1:40723118-40723128promoter 内 1181-1191 bp - 2810 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 2 40717137-40720308(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGGTCAGCGCT
SmilChr06G002049 Chr06 NC_080392.1:26901176-26901186promoter 内 1092-1102 bp + 2899 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 2 26904085-26905230(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGCTCAGCGAT
SmilChr01G002768 Chr01 NC_080387.1:46135584-46135594promoter 内 930-940 bp - 3061 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 2 46131516-46132523(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCTCAGCCCT
SmilChr07G003194 Chr07 NC_080393.1:34072357-34072367promoter 内 885-895 bp - 3106 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 2 34068249-34069251(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AAGTCAGCGCG
SmilChr04G001156 Chr04 NC_080390.1:17072367-17072377promoter 内 860-870 bp - 3131 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 2 17067232-17069236(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGGTCAGCGCT
SmilChr04G002470 Chr04 NC_080390.1:39518996-39519006promoter 内 461-471 bp + 3530 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 2 39508606-39515466(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGGGCTGAGCT
SmilChr07G003681 Chr07 NC_080393.1:44283045-44283055promoter 内 377-387 bp - 3614 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 2 44278286-44279431(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGCTCAGCGAT
SmilChr03G003284 Chr03 NC_080389.1:50874145-50874155promoter 内 3979-3989 bp - 12 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 50874167-50874983(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGGGCTGAGCT
SmilChr03G002731 Chr03 NC_080389.1:43372917-43372927promoter 内 3967-3977 bp + 24 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 43368980-43372893(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CTCGCTGAGTC
SmilChr04G001746 Chr04 NC_080390.1:28743690-28743700promoter 内 3914-3924 bp - 77 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 28743777-28751452(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CTCGCTGAGTC
SmilChr06G000068 Chr06 NC_080392.1:533413-533423promoter 内 3909-3919 bp + 82 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 533505-537233(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGGTCAGCGCT
SmilChr08G003942 Chr08 NC_080394.1:47172202-47172212promoter 内 3756-3766 bp - 235 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 47168078-47171967(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AAGTCAGCGCG
SmilChr01G001976 Chr01 NC_080387.1:35167767-35167777promoter 内 3693-3703 bp + 298 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 35163307-35167469(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGCGCTGGGTT
SmilChr06G001939 Chr06 NC_080392.1:23753641-23753651promoter 内 3592-3602 bp + 399 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 23749703-23753242(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCGCTGACCT
SmilChr05G001857 Chr05 NC_080391.1:18594574-18594584promoter 内 3539-3549 bp + 452 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 18595036-18599335(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GACTCAGCGAG
SmilChr01G005542 Chr01 NC_080387.1:72240254-72240264promoter 内 3434-3444 bp + 557 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 72239299-72239697(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGCGCTGGGTT
SmilChr04G000063 Chr04 NC_080390.1:576570-576580promoter 内 3418-3428 bp + 573 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 571834-575997(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGGGCTGAGCT
SmilChr01G000283 Chr01 NC_080387.1:5558278-5558288promoter 内 3290-3300 bp + 701 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 5558989-5562387(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGCTCAGCGAT
SmilChr07G004192 Chr07 NC_080393.1:53951257-53951267promoter 内 3267-3277 bp + 724 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 53947162-53950533(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 ATCGCTGAGCC
SmilChr03G001288 Chr03 NC_080389.1:15095972-15095982promoter 内 3263-3273 bp + 728 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 15089338-15095244(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCGCTGACCT
SmilChr08G003994 Chr08 NC_080394.1:48209309-48209319promoter 内 3227-3237 bp - 764 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 48205975-48208545(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCTCAGCCCT
SmilChr02G004027 Chr02 NC_080388.1:62547195-62547205promoter 内 3217-3227 bp - 774 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 62542073-62546421(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCTCAGCCCT
SmilChr04G000552 Chr04 NC_080390.1:6170621-6170631promoter 内 3208-3218 bp + 783 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 6171414-6172768(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGGTCAGCGCT
SmilChr08G004423 Chr08 NC_080394.1:53931484-53931494promoter 内 3136-3146 bp + 855 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 53930006-53930629(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGGGCTGAGCT
SmilChr07G000163 Chr07 NC_080393.1:968038-968048promoter 内 3114-3124 bp + 877 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 968925-970815(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GACTCAGCGAG
SmilChr03G002400 Chr03 NC_080389.1:38064544-38064554promoter 内 3030-3040 bp + 961 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 38065515-38065859(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCTCAGCCCT
SmilChr04G000469 Chr04 NC_080390.1:5017286-5017296promoter 内 2945-2955 bp + 1046 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 5018342-5019145(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCTCAGCCCT
SmilChr08G001673 Chr08 NC_080394.1:13951703-13951713promoter 内 2891-2901 bp - 1100 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 13952813-13956348(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGGGCTGAGCT
SmilChr04G001077 Chr04 NC_080390.1:15455979-15455989promoter 内 2840-2850 bp - 1151 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 15457140-15458507(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCGCTGACCT
SmilChr05G004324 Chr05 NC_080391.1:56880613-56880623promoter 内 2838-2848 bp + 1153 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 56877416-56879460(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGGGCTGAGCT
SmilChr01G002163 Chr01 NC_080387.1:37671497-37671507promoter 内 2738-2748 bp - 1253 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 37672760-37675854(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGCGCTGACTT
SmilChr03G001582 Chr03 NC_080389.1:20015181-20015191promoter 内 2721-2731 bp - 1270 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 20012117-20013911(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCTCAGCCCT
SmilChr08G002433 Chr08 NC_080394.1:23134425-23134435promoter 内 2718-2728 bp - 1273 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 23132235-23133152(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCTCAGCCCT
SmilChr03G004029 Chr03 NC_080389.1:59304490-59304500promoter 内 2674-2684 bp + 1317 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 59298837-59303173(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCGCTGACCT
SmilChr07G003672 Chr07 NC_080393.1:44053829-44053839promoter 内 2670-2680 bp - 1321 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 44055160-44060307(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGGGCTGAGCT
SmilChr04G000262 Chr04 NC_080390.1:2386069-2386079promoter 内 2624-2634 bp + 1367 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 2387446-2388214(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AAGTCAGCGCG
SmilChr05G002056 Chr05 NC_080391.1:21413619-21413629promoter 内 2611-2621 bp + 1380 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 21415009-21418285(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCTCAGCCCT
SmilChr05G002676 Chr05 NC_080391.1:30234899-30234909promoter 内 2505-2515 bp - 1486 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 30236395-30243411(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGGGCTGAGCT
SmilChr01G002429 Chr01 NC_080387.1:41831985-41831995promoter 内 2481-2491 bp + 1510 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 41833505-41837531(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGGTCAGCGCT
SmilChr01G006027 Chr01 NC_080387.1:75833337-75833347promoter 内 2480-2490 bp + 1511 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 75834858-75837255(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GACTCAGCGAG
SmilChr08G001672 Chr08 NC_080394.1:13951703-13951713promoter 内 2405-2415 bp - 1586 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 13949898-13950117(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCTCAGCCCT
SmilChr01G000509 Chr01 NC_080387.1:10348010-10348020promoter 内 2298-2308 bp + 1693 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 10339985-10346317(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CTCGCTGAGTC
SmilChr07G003877 Chr07 NC_080393.1:48361459-48361469promoter 内 2195-2205 bp - 1796 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 48363265-48363826(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGGGCTGAGCT
SmilChr01G003024 Chr01 NC_080387.1:49298919-49298929promoter 内 1985-1995 bp - 2006 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 49291554-49296913(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCTCAGCCCT
SmilChr05G004057 Chr05 NC_080391.1:54532324-54532334promoter 内 1970-1980 bp + 2021 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 54528253-54530303(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGGGCTGAGCT
SmilChr03G001307 Chr03 NC_080389.1:15335169-15335179promoter 内 1879-1889 bp + 2112 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 15330344-15333057(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGGGCTGAGCT
SmilChr05G001545 Chr05 NC_080391.1:14142640-14142650promoter 内 1849-1859 bp + 2142 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 14144792-14148924(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GACTCAGCGAG
SmilChr08G003846 Chr08 NC_080394.1:44813284-44813294promoter 内 1797-1807 bp - 2194 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 44815488-44818643(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCGCTGACCT
SmilChr01G005282 Chr01 NC_080387.1:70206846-70206856promoter 内 1693-1703 bp + 2298 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 70209154-70210012(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGCTCAGCGAT