转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr07G002147; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00004577-RA_Salv SmilChr07G002147 MYB XP_057774045.1 MP00500 AATATGGATAAGG

可能结合的靶基因

9681 个结合位点 6697 个候选靶基因 第 92 / 134 下载 TSV

上一页 92 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr02G002548 Chr02 NC_080388.1:44342702-44342714promoter 内 1096-1108 bp - 2893 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 44337856-44339809(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 GTTTTGGATAATA
SmilChr02G003421 Chr02 NC_080388.1:55427986-55427998promoter 内 967-979 bp - 3022 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 55424065-55424964(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 AATATGGATAATA
SmilChr02G002496 Chr02 NC_080388.1:43388864-43388876promoter 内 901-913 bp - 3088 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 43391964-43392782(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 ACTTATCCATTGC
SmilChr02G000897 Chr02 NC_080388.1:15405780-15405792promoter 内 877-889 bp - 3112 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 15408904-15409815(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 TATTATCCATTAC
SmilChr01G001739 Chr01 NC_080387.1:32022781-32022793promoter 内 778-790 bp + 3211 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 32015658-32019570(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 ACTTATCCTGTTA
SmilChr02G003310 Chr02 NC_080388.1:54347501-54347513promoter 内 766-778 bp - 3223 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 54350736-54351601(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 TCTTATCCTGGAC
SmilChr03G000810 Chr03 NC_080389.1:9285671-9285683promoter 内 673-685 bp - 3316 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 9279643-9282355(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 AATATGGATAATA
SmilChr01G005397 Chr01 NC_080387.1:71232714-71232726promoter 内 638-650 bp + 3351 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 71236077-71238633(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 GTAATGGATAATA
SmilChr03G001528 Chr03 NC_080389.1:19046369-19046381promoter 内 576-588 bp - 3413 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 19040345-19042956(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CTTTTGGATAACA
SmilChr02G001835 Chr02 NC_080388.1:33442971-33442983promoter 内 565-577 bp - 3424 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 33436143-33439547(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 AGCATAGATAAGG
SmilChr01G000893 Chr01 NC_080387.1:18975790-18975802promoter 内 525-537 bp + 3464 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 18979266-18980289(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 TTTAATGATAAGG
SmilChr01G001388 Chr01 NC_080387.1:27293448-27293460promoter 内 500-512 bp + 3489 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 27283075-27289959(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 TCTTATCCTACAT
SmilChr01G005676 Chr01 NC_080387.1:73041964-73041976promoter 内 482-494 bp - 3507 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 73045483-73045929(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CCTTATCTTATGG
SmilChr01G003743 Chr01 NC_080387.1:55731558-55731570promoter 内 437-449 bp + 3552 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 55735122-55758638(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 TTTCGAGATAAGG
SmilChr01G000543 Chr01 NC_080387.1:11128175-11128187promoter 内 435-447 bp + 3554 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 11131741-11134705(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 AATATGGATAATA
SmilChr01G001170 Chr01 NC_080387.1:23798533-23798545promoter 内 406-418 bp + 3583 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 23750700-23794950(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 GGTTATCCATATT
SmilChr03G002198 Chr03 NC_080389.1:34592758-34592770promoter 内 300-312 bp + 3689 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 34588198-34589069(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 TATTATCCATTAC
SmilChr02G005035 Chr02 NC_080388.1:72065271-72065283promoter 内 292-304 bp + 3697 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 72059711-72061574(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 ACTTATCCACTGT
SmilChr01G003898 Chr01 NC_080387.1:57264218-57264230promoter 内 142-154 bp - 3847 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 57254068-57260371(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 ATGAAAGATAAGG
SmilChr01G002962 Chr01 NC_080387.1:48523577-48523589promoter 内 38-50 bp - 3951 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 48514321-48519626(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 AACATGGATAAGC
SmilChr02G001962 Chr02 NC_080388.1:35409138-35409150promoter 内 169-181 bp - 3820 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 4 35402068-35405318(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 ATAAATGATAAGG
SmilChr01G003988 Chr01 NC_080387.1:58304490-58304502promoter 内 100-112 bp - 3889 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 4 58308391-58311924(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CCTTATCTGCGAA
SmilChr02G004103 Chr02 NC_080388.1:63342589-63342601promoter 内 3690-3702 bp + 299 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 3 63340346-63342290(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 TGTTATCCATTCT
SmilChr02G004102 Chr02 NC_080388.1:63342589-63342601promoter 内 1693-1705 bp + 2296 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 3 63337866-63340293(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 TGTTATCCATTCT
SmilChr02G002425 Chr02 NC_080388.1:42238196-42238208promoter 内 3796-3808 bp + 193 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 2 42238401-42241061(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 GTCGGAGATAAGG
SmilChr03G000536 Chr03 NC_080389.1:5779461-5779473promoter 内 3377-3389 bp - 612 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 2 5780085-5827863(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CCTTATCTCCGAC
SmilChr01G000355 Chr01 NC_080387.1:7353716-7353728promoter 内 3178-3190 bp + 811 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 2 7344787-7352905(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CCTTATCAAATAT
SmilChr01G005166 Chr01 NC_080387.1:69430663-69430675promoter 内 3104-3116 bp + 885 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 2 69431560-69432940(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 TTATTGGATAACA
SmilChr03G001870 Chr03 NC_080389.1:25910621-25910633promoter 内 2855-2867 bp + 1134 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 2 25911767-25912783(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 AGCAAGGATAAGA
SmilChr01G002364 Chr01 NC_080387.1:40804360-40804372promoter 内 2122-2134 bp - 1867 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 2 40806239-40815704(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CCTTATCATTTAT
SmilChr02G002167 Chr02 NC_080388.1:38873905-38873917promoter 内 2098-2110 bp - 1891 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 2 38871318-38872014(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 GATGACGATAAGG
SmilChr03G000524 Chr03 NC_080389.1:5620039-5620051promoter 内 1644-1656 bp - 2345 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 2 5622396-5628473(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CCTTATCTCCGAC
SmilChr03G000535 Chr03 NC_080389.1:5779461-5779473promoter 内 653-665 bp - 3336 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 2 5773432-5776125(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 GTCGGAGATAAGG
SmilChr02G003180 Chr02 NC_080388.1:52965080-52965092promoter 内 529-541 bp + 3460 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 2 52957826-52961620(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 TCTTATCCATCCA
SmilChr03G001716 Chr03 NC_080389.1:23012101-23012113promoter 内 526-538 bp - 3463 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 2 23006394-23008638(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 TCTGGAGATAAGG
SmilChr02G003181 Chr02 NC_080388.1:52965080-52965092promoter 内 339-351 bp + 3650 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 2 52968742-52974121(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 TGGATGGATAAGA
SmilChr01G001344 Chr01 NC_080387.1:26697533-26697545promoter 内 230-242 bp + 3759 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 2 26701304-26704417(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 AAGACGGATAAGA
SmilChr02G004561 Chr02 NC_080388.1:68123108-68123120promoter 内 3843-3855 bp + 146 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 68123266-68124433(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 TTGAGGGATAAGG
SmilChr02G003334 Chr02 NC_080388.1:54579087-54579099promoter 内 3787-3799 bp + 202 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 54579301-54582613(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 TGGATGGATAAGA
SmilChr03G002355 Chr03 NC_080389.1:37177783-37177795promoter 内 3724-3736 bp + 265 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 37173624-37177518(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CCTTATCATTTAT
SmilChr02G004721 Chr02 NC_080388.1:69458954-69458966promoter 内 3719-3731 bp - 270 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 69458613-69458684(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 ATAAATGATAAGG
SmilChr01G000029 Chr01 NC_080387.1:544848-544860promoter 内 3711-3723 bp - 278 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 543996-544570(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 ACATTGGATAAGC
SmilChr02G004967 Chr02 NC_080388.1:71575656-71575668promoter 内 3697-3709 bp + 292 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 71575960-71577118(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CAAAATGATAAGG
SmilChr01G004112 Chr01 NC_080387.1:59636364-59636376promoter 内 3583-3595 bp + 406 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 59633189-59635958(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 GCTTATCCTCGTG
SmilChr03G001869 Chr03 NC_080389.1:25902315-25902327promoter 内 3473-3485 bp + 516 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 25901693-25901799(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CCTTATCATTTTG
SmilChr03G000420 Chr03 NC_080389.1:4568863-4568875promoter 内 3431-3443 bp - 558 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 4567390-4568305(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 ATAAATGATAAGG
SmilChr02G000652 Chr02 NC_080388.1:9870059-9870071promoter 内 3409-3421 bp - 580 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 9870651-9875685(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CCTTATCATTTAT
SmilChr02G001694 Chr02 NC_080388.1:31232129-31232141promoter 内 3384-3396 bp + 605 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 31232746-31233429(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 TTGGTGGATAAGC
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SmilChr01G002757 Chr01 NC_080387.1:45910876-45910888promoter 内 3162-3174 bp + 827 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 45909943-45910049(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CCTTATCATTTTG