转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr02G005217; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00006334-RA_Salv SmilChr02G005217 G2-like XP_057792502.1 MP00022 GAGAATCTGT

可能结合的靶基因

9720 个结合位点 6959 个候选靶基因 第 93 / 140 下载 TSV

上一页 93 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr01G003413 Chr01 NC_080387.1:52782632-52782641promoter 内 1810-1819 bp + 2182 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 52784823-52784893(+) SMil_00006334-RA_Salv MP00022 CAGAATCTAT
SmilChr02G000542 Chr02 NC_080388.1:7471203-7471212promoter 内 1791-1800 bp - 2201 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 7473413-7474540(+) SMil_00006334-RA_Salv MP00022 GAAGATTCTC
SmilChr03G000791 Chr03 NC_080389.1:9015862-9015871promoter 内 1791-1800 bp + 2201 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 9008587-9013661(-) SMil_00006334-RA_Salv MP00022 ATAGATTCTG
SmilChr01G004745 Chr01 NC_080387.1:65630061-65630070promoter 内 1771-1780 bp - 2221 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 65626950-65627840(-) SMil_00006334-RA_Salv MP00022 GAGAATCTTC
SmilChr01G005679 Chr01 NC_080387.1:73058229-73058238promoter 内 1769-1778 bp - 2223 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 73060461-73061805(+) SMil_00006334-RA_Salv MP00022 GAAGATTCTC
SmilChr03G001969 Chr03 NC_080389.1:28367090-28367099promoter 内 1762-1771 bp + 2230 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 28369329-28369772(+) SMil_00006334-RA_Salv MP00022 GAGAATCTTC
SmilChr02G001757 Chr02 NC_080388.1:32306451-32306460promoter 内 1749-1758 bp - 2243 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 32308703-32310653(+) SMil_00006334-RA_Salv MP00022 ATAGATTCTG
SmilChr01G002787 Chr01 NC_080387.1:46340963-46340972promoter 内 1666-1675 bp + 2326 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 46343298-46347117(+) SMil_00006334-RA_Salv MP00022 GAGAATCTTC
SmilChr01G002857 Chr01 NC_080387.1:47159260-47159269promoter 内 1634-1643 bp + 2358 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 47154333-47156902(-) SMil_00006334-RA_Salv MP00022 GAAGATTCTC
SmilChr03G000959 Chr03 NC_080389.1:10836769-10836778promoter 内 1634-1643 bp + 2358 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 10833250-10834411(-) SMil_00006334-RA_Salv MP00022 GAAGATTCTC
SmilChr02G004237 Chr02 NC_080388.1:64550400-64550409promoter 内 1625-1634 bp + 2367 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 64552776-64556602(+) SMil_00006334-RA_Salv MP00022 GAGAATCTTC
SmilChr01G002042 Chr01 NC_080387.1:36096678-36096687promoter 内 1599-1608 bp - 2393 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 36091412-36094285(-) SMil_00006334-RA_Salv MP00022 CAGAATCTAT
SmilChr02G001546 Chr02 NC_080388.1:28723981-28723990promoter 内 1575-1584 bp + 2417 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 28726407-28730706(+) SMil_00006334-RA_Salv MP00022 GAGAATCTTC
SmilChr01G004505 Chr01 NC_080387.1:63168813-63168822promoter 内 1572-1581 bp - 2420 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 63164368-63166393(-) SMil_00006334-RA_Salv MP00022 GAGAATCTTC
SmilChr02G002868 Chr02 NC_080388.1:48874929-48874938promoter 内 1547-1556 bp + 2445 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 48877383-48880617(+) SMil_00006334-RA_Salv MP00022 GAGAATCTTC
SmilChr03G000922 Chr03 NC_080389.1:10530574-10530583promoter 内 1540-1549 bp + 2452 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 10533035-10533944(+) SMil_00006334-RA_Salv MP00022 CAGAATCTAT
SmilChr01G000192 Chr01 NC_080387.1:3289201-3289210promoter 内 1466-1475 bp - 2526 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 3285237-3286675(-) SMil_00006334-RA_Salv MP00022 CAGAATCTAT
SmilChr01G001450 Chr01 NC_080387.1:28194199-28194208promoter 内 1454-1463 bp + 2538 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 28196746-28198342(+) SMil_00006334-RA_Salv MP00022 GAGAATCTTC
SmilChr04G000786 Chr04 NC_080390.1:9681247-9681256promoter 内 1445-1454 bp + 2547 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 9676495-9678700(-) SMil_00006334-RA_Salv MP00022 ATAGATTCTG
SmilChr02G004574 Chr02 NC_080388.1:68249806-68249815promoter 内 1424-1433 bp - 2568 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 68246240-68247238(-) SMil_00006334-RA_Salv MP00022 GAGAATCTTC
SmilChr01G000496 Chr01 NC_080387.1:10108285-10108294promoter 内 1313-1322 bp + 2679 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 10102018-10105606(-) SMil_00006334-RA_Salv MP00022 GAAGATTCTC
SmilChr01G005621 Chr01 NC_080387.1:72701070-72701079promoter 内 1307-1316 bp + 2685 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 72703764-72706336(+) SMil_00006334-RA_Salv MP00022 GAGAATCTTC
SmilChr02G004263 Chr02 NC_080388.1:64836261-64836270promoter 内 1300-1309 bp - 2692 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 64828012-64833569(-) SMil_00006334-RA_Salv MP00022 CAGAATCTAT
SmilChr03G000629 Chr03 NC_080389.1:6952441-6952450promoter 内 1292-1301 bp + 2700 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 6955150-6955676(+) SMil_00006334-RA_Salv MP00022 CAGAATCTAT
SmilChr01G003029 Chr01 NC_080387.1:49343347-49343356promoter 内 1279-1288 bp - 2713 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 49346069-49350693(+) SMil_00006334-RA_Salv MP00022 ATAGATTCTG
SmilChr02G001308 Chr02 NC_080388.1:24324671-24324680promoter 内 1278-1287 bp + 2714 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 24321407-24321957(-) SMil_00006334-RA_Salv MP00022 GAAGATTCTC
SmilChr02G002064 Chr02 NC_080388.1:37204565-37204574promoter 内 1277-1286 bp - 2715 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 37199198-37201850(-) SMil_00006334-RA_Salv MP00022 GAGAATCTTC
SmilChr03G003193 Chr03 NC_080389.1:49393523-49393532promoter 内 1270-1279 bp - 2722 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 49396254-49396766(+) SMil_00006334-RA_Salv MP00022 GAAGATTCTC
SmilChr01G004645 Chr01 NC_080387.1:64506316-64506325promoter 内 1263-1272 bp - 2729 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 64509054-64510628(+) SMil_00006334-RA_Salv MP00022 GAAGATTCTC
SmilChr01G001049 Chr01 NC_080387.1:21824494-21824503promoter 内 1214-1223 bp - 2778 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 21827281-21829393(+) SMil_00006334-RA_Salv MP00022 ATAGATTCTG
SmilChr03G000497 Chr03 NC_080389.1:5313822-5313831promoter 内 1194-1203 bp - 2798 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 5316629-5320251(+) SMil_00006334-RA_Salv MP00022 ATAGATTCTG
SmilChr01G001547 Chr01 NC_080387.1:29459749-29459758promoter 内 1180-1189 bp + 2812 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 29455509-29456937(-) SMil_00006334-RA_Salv MP00022 ATAGATTCTG
SmilChr02G005179 Chr02 NC_080388.1:73090372-73090381promoter 内 1177-1186 bp + 2815 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 73085208-73087557(-) SMil_00006334-RA_Salv MP00022 ATAGATTCTG
SmilChr03G004647 Chr03 NC_080389.1:64025962-64025971promoter 内 1163-1172 bp - 2829 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 64020398-64023133(-) SMil_00006334-RA_Salv MP00022 CAGAATCTAT
SmilChr02G001200 Chr02 NC_080388.1:22144283-22144292promoter 内 1153-1162 bp + 2839 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 22140193-22141444(-) SMil_00006334-RA_Salv MP00022 GAAGATTCTC
SmilChr02G002120 Chr02 NC_080388.1:37963602-37963611promoter 内 1142-1151 bp + 2850 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 37958598-37960752(-) SMil_00006334-RA_Salv MP00022 GAAGATTCTC
SmilChr04G000205 Chr04 NC_080390.1:1828504-1828513promoter 内 1138-1147 bp - 2854 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 1822967-1825650(-) SMil_00006334-RA_Salv MP00022 GAGAATCTTC
SmilChr03G003976 Chr03 NC_080389.1:58779738-58779747promoter 内 1132-1141 bp - 2860 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 58776776-58776878(-) SMil_00006334-RA_Salv MP00022 CAGAATCTAT
SmilChr04G000334 Chr04 NC_080390.1:3089719-3089728promoter 内 1097-1106 bp + 2895 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 3073698-3086824(-) SMil_00006334-RA_Salv MP00022 ATAGATTCTG
SmilChr03G000891 Chr03 NC_080389.1:10175197-10175206promoter 内 1093-1102 bp + 2899 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 10171108-10172298(-) SMil_00006334-RA_Salv MP00022 GAAGATTCTC
SmilChr03G000676 Chr03 NC_080389.1:7547146-7547155promoter 内 1072-1081 bp + 2920 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 7550075-7552020(+) SMil_00006334-RA_Salv MP00022 GAGAATCTTC
SmilChr03G003192 Chr03 NC_080389.1:49393523-49393532promoter 内 1070-1079 bp - 2922 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 49377779-49390601(-) SMil_00006334-RA_Salv MP00022 GAGAATCTTC
SmilChr03G000418 Chr03 NC_080389.1:4509088-4509097promoter 内 1055-1064 bp + 2937 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 4505141-4506151(-) SMil_00006334-RA_Salv MP00022 ATAGATTCTG
SmilChr02G003282 Chr02 NC_080388.1:54137313-54137322promoter 内 1035-1044 bp - 2957 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 54133913-54134356(-) SMil_00006334-RA_Salv MP00022 GAGAATCTTC
SmilChr03G003027 Chr03 NC_080389.1:47193279-47193288promoter 内 1016-1025 bp + 2976 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 47196264-47197202(+) SMil_00006334-RA_Salv MP00022 CAGAATCTAT
SmilChr02G004241 Chr02 NC_080388.1:64606250-64606259promoter 内 1000-1009 bp - 2992 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 64609251-64610499(+) SMil_00006334-RA_Salv MP00022 ATAGATTCTG
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SmilChr02G004225 Chr02 NC_080388.1:64465383-64465392promoter 内 994-1003 bp - 2998 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 64453264-64462385(-) SMil_00006334-RA_Salv MP00022 GAGAATCTTC
SmilChr01G003607 Chr01 NC_080387.1:54614417-54614426promoter 内 989-998 bp + 3003 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 54610428-54611414(-) SMil_00006334-RA_Salv MP00022 GAAGATTCTC
SmilChr03G000577 Chr03 NC_080389.1:6397219-6397228promoter 内 939-948 bp + 3053 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 6390720-6394166(-) SMil_00006334-RA_Salv MP00022 GAAGATTCTC