转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr08G002543; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00020892-RA_Salv SmilChr08G002543 bZIP XP_057778423.1 MP00303 ACCAGCTGTCA

可能结合的靶基因

9868 个结合位点 7416 个候选靶基因 第 93 / 149 下载 TSV

上一页 93 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr06G000718 Chr06 NC_080392.1:6541126-6541136promoter 内 3714-3724 bp - 277 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 3 6540075-6540849(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CAGAGCTGTCC
SmilChr05G003414 Chr05 NC_080391.1:45361178-45361188promoter 内 1863-1873 bp + 2128 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 3 45356841-45359050(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GGACAGCTCTG
SmilChr02G000965 Chr02 NC_080388.1:16876085-16876095promoter 内 1146-1156 bp + 2845 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 3 16870304-16873240(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GGACAGCTCTG
SmilChr05G003415 Chr05 NC_080391.1:45361178-45361188promoter 内 510-520 bp + 3481 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 3 45364669-45371631(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CAGAGCTGTCC
SmilChr06G000270 Chr06 NC_080392.1:1833684-1833694promoter 内 392-402 bp - 3599 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 3 1825123-1830085(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AATGGCTGTCA
SmilChr04G003777 Chr04 NC_080390.1:53976896-53976906promoter 内 3468-3478 bp - 523 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 2 53967675-53976373(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GCCAGCTGTAC
SmilChr01G004396 Chr01 NC_080387.1:62111344-62111354promoter 内 3072-3082 bp - 919 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 2 62112273-62113970(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GTACAGCTGGC
SmilChr05G001282 Chr05 NC_080391.1:10967917-10967927promoter 内 2732-2742 bp - 1259 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 2 10969186-10969259(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AGACAGCTAGC
SmilChr07G000714 Chr07 NC_080393.1:4967610-4967620promoter 内 2623-2633 bp + 1368 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 2 4968988-4972128(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GCCAGCTGTAC
SmilChr07G002003 Chr07 NC_080393.1:17768027-17768037promoter 内 1975-1985 bp + 2016 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 2 17761598-17766011(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AGACAGCTAGC
SmilChr06G002277 Chr06 NC_080392.1:32665040-32665050promoter 内 1949-1959 bp + 2042 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 2 32660867-32662998(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CGACAGCTAGA
SmilChr01G006140 Chr01 NC_080387.1:76915798-76915808promoter 内 1476-1486 bp + 2515 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 2 76909055-76913283(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CGACAGCTAGA
SmilChr02G004620 Chr02 NC_080388.1:68727127-68727137promoter 内 1042-1052 bp - 2949 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 2 68730086-68732756(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCCATT
SmilChr01G004054 Chr01 NC_080387.1:58979912-58979922promoter 内 1039-1049 bp + 2952 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 2 58982874-58984511(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CAGAGCTGTCC
SmilChr04G003413 Chr04 NC_080390.1:50766515-50766525promoter 内 668-678 bp + 3323 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 2 50755390-50763192(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GGACAGCTCTG
SmilChr07G001186 Chr07 NC_080393.1:9013938-9013948promoter 内 271-281 bp - 3720 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 2 9017668-9018883(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GGACAGCTCTG
SmilChr05G001876 Chr05 NC_080391.1:18993982-18993992promoter 内 203-213 bp - 3788 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 2 18997780-19004354(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCCATT
SmilChr05G002318 Chr05 NC_080391.1:24996658-24996668promoter 内 3956-3966 bp - 35 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 24994515-24996623(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CAGAGCTGTCC
SmilChr04G003752 Chr04 NC_080390.1:53796054-53796064promoter 内 3883-3893 bp - 108 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 53796172-53797181(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AGACAGCTAGC
SmilChr05G001565 Chr05 NC_080391.1:14322340-14322350promoter 内 3877-3887 bp - 114 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 14322464-14325647(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AGACAGCTAGC
SmilChr06G002720 Chr06 NC_080392.1:39283634-39283644promoter 内 3838-3848 bp + 153 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 39280669-39283481(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GTACAGCTGGC
SmilChr01G000997 Chr01 NC_080387.1:21009314-21009324promoter 内 3762-3772 bp - 229 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 21002777-21009085(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GCCAGCTGTAC
SmilChr01G000238 Chr01 NC_080387.1:4462142-4462152promoter 内 3713-3723 bp + 278 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 4460922-4461864(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCCATT
SmilChr06G001625 Chr06 NC_080392.1:18105786-18105796promoter 内 3521-3531 bp + 470 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 18106266-18109855(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CAGAGCTGTCC
SmilChr02G002445 Chr02 NC_080388.1:42686665-42686675promoter 内 3502-3512 bp + 489 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 42687164-42687237(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AATGGCTGTCA
SmilChr02G005416 Chr02 NC_080388.1:74623963-74623973promoter 内 3373-3383 bp - 618 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 74624591-74625604(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCCATT
SmilChr02G004974 Chr02 NC_080388.1:71631479-71631489promoter 内 3314-3324 bp + 677 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 71629200-71630802(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CGACAGCTTAC
SmilChr04G002209 Chr04 NC_080390.1:35756551-35756561promoter 内 3299-3309 bp + 692 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 35755075-35755859(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCCATT
SmilChr01G000072 Chr01 NC_080387.1:1235151-1235161promoter 内 3270-3280 bp + 721 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 1235882-1236703(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CAGAGCTGTCC
SmilChr01G004971 Chr01 NC_080387.1:67808858-67808868promoter 内 3197-3207 bp - 794 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 67801578-67808064(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AATGGCTGTCA
SmilChr04G003416 Chr04 NC_080390.1:50766515-50766525promoter 内 3153-3163 bp + 838 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 50765606-50765677(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GGACAGCTCTG
SmilChr02G001548 Chr02 NC_080388.1:28774236-28774246promoter 内 3144-3154 bp + 847 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 28775093-28778230(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TCTAGCTGTCG
SmilChr03G004691 Chr03 NC_080389.1:64284808-64284818promoter 内 3135-3145 bp + 856 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 64285674-64285745(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AATGGCTGTCA
SmilChr01G001107 Chr01 NC_080387.1:22681257-22681267promoter 内 3099-3109 bp + 892 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 22682159-22689602(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GCCAGCTGTAC
SmilChr06G001541 Chr06 NC_080392.1:16688136-16688146promoter 内 3064-3074 bp - 927 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 16689073-16696046(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CGACAGCTTAC
SmilChr05G003797 Chr05 NC_080391.1:51294677-51294687promoter 内 3058-3068 bp - 933 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 51295620-51298508(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCCATT
SmilChr02G000726 Chr02 NC_080388.1:11796226-11796236promoter 内 3004-3014 bp - 987 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 11793787-11795239(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TCTAGCTGTCG
SmilChr05G001281 Chr05 NC_080391.1:10967917-10967927promoter 内 2733-2743 bp - 1258 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 10966167-10966659(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GCTAGCTGTCT
SmilChr01G005795 Chr01 NC_080387.1:74043662-74043672promoter 内 2631-2641 bp - 1360 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 74040133-74042302(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AATGGCTGTCA
SmilChr05G003711 Chr05 NC_080391.1:50200968-50200978promoter 内 2516-2526 bp + 1475 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 50197485-50199493(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCCATT
SmilChr01G004103 Chr01 NC_080387.1:59507211-59507221promoter 内 2483-2493 bp + 1508 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 59503982-59505703(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AGACAGCTAGC
SmilChr04G000935 Chr04 NC_080390.1:12218462-12218472promoter 内 2419-2429 bp - 1572 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 12215541-12216890(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CAGAGCTGTCC
SmilChr05G004269 Chr05 NC_080391.1:56474900-56474910promoter 内 2358-2368 bp + 1633 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 56468369-56473267(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GGACAGCTCTG
SmilChr03G003285 Chr03 NC_080389.1:50902403-50902413promoter 内 2347-2357 bp - 1644 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 50899609-50900759(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TCTAGCTGTCG
SmilChr04G003197 Chr04 NC_080390.1:48804311-48804321promoter 内 2295-2305 bp - 1696 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 48806017-48806436(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCCATT
SmilChr04G000901 Chr04 NC_080390.1:11733712-11733722promoter 内 2245-2255 bp - 1746 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 11735468-11741559(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GGACAGCTCTG
SmilChr05G002339 Chr05 NC_080391.1:25325639-25325649promoter 内 2225-2235 bp + 1766 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 25327415-25333624(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AATGGCTGTCA
SmilChr01G005973 Chr01 NC_080387.1:75405385-75405395promoter 内 2155-2165 bp + 1836 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 75400437-75403549(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GTACAGCTGGC
SmilChr04G003020 Chr04 NC_080390.1:46607064-46607074promoter 内 2022-2032 bp + 1969 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 46603619-46605095(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCCATT
SmilChr02G004401 Chr02 NC_080388.1:66352317-66352327promoter 内 2012-2022 bp - 1979 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 66348931-66350338(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GCTAGCTGTCT