转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr05G000260; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00013647-RA_Salv SmilChr05G000260 bZIP XP_057763683.1 MP00040 TGCTGACGTGGC

可能结合的靶基因

9919 个结合位点 6920 个候选靶基因 第 96 / 139 下载 TSV

上一页 96 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr04G001934 Chr04 NC_080390.1:31437344-31437355promoter 内 925-936 bp + 3065 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 2 31440420-31444948(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TGTAGACGTGGT
SmilChr03G001141 Chr03 NC_080389.1:13137337-13137348promoter 内 901-912 bp + 3089 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 2 13140437-13141153(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TAGTGACGTGTC
SmilChr03G004728 Chr03 NC_080389.1:64452515-64452526promoter 内 687-698 bp - 3303 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 2 64455829-64458642(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GACACGTCACTA
SmilChr02G002325 Chr02 NC_080388.1:40922016-40922027promoter 内 654-665 bp + 3336 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 2 40925363-40926307(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 AGTTGACGTGTG
SmilChr05G000061 Chr05 NC_080391.1:285112-285123promoter 内 650-661 bp - 3340 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 2 288463-291452(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GTCACGTCAAGC
SmilChr04G001933 Chr04 NC_080390.1:31428073-31428084promoter 内 397-408 bp + 3593 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 2 31423419-31424480(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 ACCACGTCTACA
SmilChr04G002260 Chr04 NC_080390.1:36571213-36571224promoter 内 3944-3955 bp + 46 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 36567529-36571167(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TACACGTCATCG
SmilChr01G005717 Chr01 NC_080387.1:73369510-73369521promoter 内 3934-3945 bp + 56 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 73368484-73369454(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GACACGTCATGA
SmilChr04G000424 Chr04 NC_080390.1:4500354-4500365promoter 内 3920-3931 bp + 70 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 4496291-4500284(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GACACGTCACTA
SmilChr01G003085 Chr01 NC_080387.1:49689616-49689627promoter 内 3889-3900 bp + 101 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 49689728-49693147(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TTGTGACGTGTC
SmilChr02G002675 Chr02 NC_080388.1:46343968-46343979promoter 内 3616-3627 bp + 374 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 46342933-46343594(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 CACACGTCAACT
SmilChr04G000118 Chr04 NC_080390.1:1020305-1020316promoter 内 3515-3526 bp + 475 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 1020791-1025315(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GCTTGACGTGAC
SmilChr02G003166 Chr02 NC_080388.1:52692130-52692141promoter 内 3500-3511 bp - 490 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 52684719-52691640(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 AGATGACGTGTG
SmilChr05G000267 Chr05 NC_080391.1:2030203-2030214promoter 内 3421-3432 bp + 569 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 2030783-2033065(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 AGGTGACGTGTT
SmilChr03G001931 Chr03 NC_080389.1:27136122-27136133promoter 内 3219-3230 bp + 771 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 27131868-27135351(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 AACACGTCATCC
SmilChr01G002938 Chr01 NC_080387.1:48157571-48157582promoter 内 3202-3213 bp + 788 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 48158370-48164782(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TGAAGACGTGGT
SmilChr05G000440 Chr05 NC_080391.1:3323626-3323637promoter 内 3169-3180 bp + 821 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 3324458-3328456(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 CGATGACGTGTT
SmilChr01G005776 Chr01 NC_080387.1:73872093-73872104promoter 内 3160-3171 bp - 830 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 73849965-73871263(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 CCATGACGTGAC
SmilChr03G003775 Chr03 NC_080389.1:56921480-56921491promoter 内 3150-3161 bp + 840 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 56917900-56920640(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GTCACGTCATGG
SmilChr03G004559 Chr03 NC_080389.1:63552756-63552767promoter 内 2877-2888 bp + 1113 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 63546477-63551643(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 CACACGTCAACT
SmilChr01G002347 Chr01 NC_080387.1:40616301-40616312promoter 内 2659-2670 bp + 1331 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 40608642-40614970(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 AACACGTCAACG
SmilChr02G000471 Chr02 NC_080388.1:6383107-6383118promoter 内 2627-2638 bp - 1363 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 6376046-6381744(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TGTAGACGTGGT
SmilChr02G005532 Chr02 NC_080388.1:75371381-75371392promoter 内 2546-2557 bp + 1444 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 75367749-75369937(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TCCACGTCTTCA
SmilChr01G001112 Chr01 NC_080387.1:22736692-22736703promoter 内 2538-2549 bp + 1452 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 22734524-22735240(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TACACGTCATCC
SmilChr01G002908 Chr01 NC_080387.1:47799951-47799962promoter 内 2464-2475 bp + 1526 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 47797201-47798425(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TACACGTCAACG
SmilChr03G000903 Chr03 NC_080389.1:10328686-10328697promoter 内 2453-2464 bp + 1537 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 10330234-10331421(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TGTAGACGTGGA
SmilChr03G002259 Chr03 NC_080389.1:35584110-35584121promoter 内 2376-2387 bp - 1614 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 35581768-35582496(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TGTAGACGTGGA
SmilChr02G002676 Chr02 NC_080388.1:46343968-46343979promoter 内 2358-2369 bp + 1632 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 46345611-46348957(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 AGTTGACGTGTG
SmilChr01G000225 Chr01 NC_080387.1:3997452-3997463promoter 内 2286-2297 bp + 1704 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 3999167-4000736(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GGATGACGTGTT
SmilChr03G000374 Chr03 NC_080389.1:4185534-4185545promoter 内 2176-2187 bp + 1814 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 4181939-4183720(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 ACCACGTCTACA
SmilChr02G003467 Chr02 NC_080388.1:55970917-55970928promoter 内 2124-2135 bp - 1866 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 55972794-55975525(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GACACGTCAAGA
SmilChr03G000464 Chr03 NC_080389.1:4969628-4969639promoter 内 2113-2124 bp + 1877 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 4966111-4967751(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 ACCACGTCTACA
SmilChr02G003540 Chr02 NC_080388.1:56561783-56561794promoter 内 2002-2013 bp - 1988 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 56563782-56564552(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GTCACGTCAAGG
SmilChr02G000208 Chr02 NC_080388.1:2739255-2739266promoter 内 1982-1993 bp - 2008 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 2741274-2744026(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GTCACGTCACAG
SmilChr03G004252 Chr03 NC_080389.1:60993259-60993270promoter 内 1925-1936 bp - 2065 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 60995335-61000124(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GACACGTCATGA
SmilChr04G000289 Chr04 NC_080390.1:2688126-2688137promoter 内 1880-1891 bp - 2110 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 2690247-2693195(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TACACGTCAACG
SmilChr01G001511 Chr01 NC_080387.1:28939361-28939372promoter 内 1859-1870 bp + 2131 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 28941503-28945444(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TTGTGACGTGTC
SmilChr01G002909 Chr01 NC_080387.1:47799951-47799962promoter 内 1840-1851 bp + 2150 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 47802112-47805860(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 CGTTGACGTGTA
SmilChr02G004002 Chr02 NC_080388.1:62349296-62349307promoter 内 1799-1810 bp + 2191 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 62351498-62356060(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 ACGTGACGTGAC
SmilChr01G004851 Chr01 NC_080387.1:66665780-66665791promoter 内 1769-1780 bp + 2221 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 66662766-66663559(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 AACACGTCACCT
SmilChr03G004560 Chr03 NC_080389.1:63552756-63552767promoter 内 1744-1755 bp + 2246 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 63555013-63557126(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 AGTTGACGTGTG
SmilChr02G004882 Chr02 NC_080388.1:70910432-70910443promoter 内 1646-1657 bp - 2344 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 70904446-70908088(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 ACGTGACGTGAC
SmilChr01G001006 Chr01 NC_080387.1:21186810-21186821promoter 内 1600-1611 bp + 2390 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 21189211-21192925(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TGTAGACGTGGT
SmilChr01G000993 Chr01 NC_080387.1:20952660-20952671promoter 内 1575-1586 bp + 2415 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 20955086-20964596(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 CGTTGACGTGTT
SmilChr03G001680 Chr03 NC_080389.1:22084863-22084874promoter 内 1488-1499 bp - 2502 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 22076687-22082361(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TGTAGACGTGGT
SmilChr04G002871 Chr04 NC_080390.1:44836366-44836377promoter 内 1477-1488 bp + 2513 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 44828995-44833853(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GTCACGTCATGC
SmilChr01G001798 Chr01 NC_080387.1:32838481-32838492promoter 内 1465-1476 bp - 2525 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 32833863-32835956(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 CGTTGACGTGTT
SmilChr03G002039 Chr03 NC_080389.1:30776832-30776843promoter 内 1404-1415 bp + 2586 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 30779429-30780497(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TGTAGACGTGGT
SmilChr02G000565 Chr02 NC_080388.1:7959811-7959822promoter 内 1309-1320 bp - 2681 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 7962503-7964742(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GACACGTCACAA
SmilChr04G002624 Chr04 NC_080390.1:41637027-41637038promoter 内 1186-1197 bp + 2804 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 41639842-41642949(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 CCTTGACGTGAC