转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr02G001791; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00007112-RA_Salv SmilChr02G001791 TCP XP_057795933.1 MP00062 GGGACCAC

可能结合的靶基因

7249 个结合位点 6454 个候选靶基因 第 98 / 130 下载 TSV

上一页 98 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr06G002217 Chr06 NC_080392.1:31019878-31019885promoter 内 1548-1555 bp + 2446 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 1 31013419-31017432(-) SMil_00007112-RA_Salv MP00062 GTGGTCCT
SmilChr02G005009 Chr02 NC_080388.1:71901892-71901899promoter 内 1547-1554 bp + 2447 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 1 71896415-71899445(-) SMil_00007112-RA_Salv MP00062 GTGGTCCA
SmilChr06G001250 Chr06 NC_080392.1:13003452-13003459promoter 内 1547-1554 bp - 2447 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 1 12999972-13001005(-) SMil_00007112-RA_Salv MP00062 AGGACCAC
SmilChr01G002233 Chr01 NC_080387.1:38810744-38810751promoter 内 1544-1551 bp + 2450 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 1 38807842-38808294(-) SMil_00007112-RA_Salv MP00062 GTGGTCCT
SmilChr08G004077 Chr08 NC_080394.1:49390884-49390891promoter 内 1544-1551 bp + 2450 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 1 49393341-49395215(+) SMil_00007112-RA_Salv MP00062 TGGACCAC
SmilChr02G003281 Chr02 NC_080388.1:54117191-54117198promoter 内 1543-1550 bp + 2451 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 1 54119649-54123277(+) SMil_00007112-RA_Salv MP00062 TGGACCAC
SmilChr04G003545 Chr04 NC_080390.1:51804014-51804021promoter 内 1543-1550 bp + 2451 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 1 51806472-51810664(+) SMil_00007112-RA_Salv MP00062 TGGACCAC
SmilChr05G002668 Chr05 NC_080391.1:30167826-30167833promoter 内 1543-1550 bp + 2451 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 1 30170284-30172952(+) SMil_00007112-RA_Salv MP00062 AGGACCAC
SmilChr01G003468 Chr01 NC_080387.1:53231036-53231043promoter 内 1542-1549 bp + 2452 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 1 53233495-53234247(+) SMil_00007112-RA_Salv MP00062 TGGACCAC
SmilChr02G004278 Chr02 NC_080388.1:64973803-64973810promoter 内 1541-1548 bp + 2453 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 1 64976263-64976652(+) SMil_00007112-RA_Salv MP00062 TGGACCAC
SmilChr08G003942 Chr08 NC_080394.1:47174420-47174427promoter 内 1541-1548 bp + 2453 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 1 47168078-47171967(-) SMil_00007112-RA_Salv MP00062 GTGGTCCA
SmilChr02G000591 Chr02 NC_080388.1:8463394-8463401promoter 内 1540-1547 bp + 2454 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 1 8465855-8466898(+) SMil_00007112-RA_Salv MP00062 AGGACCAC
SmilChr02G004762 Chr02 NC_080388.1:69798271-69798278promoter 内 1540-1547 bp + 2454 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 1 69800732-69803068(+) SMil_00007112-RA_Salv MP00062 AGGACCAC
SmilChr05G001632 Chr05 NC_080391.1:15251279-15251286promoter 内 1540-1547 bp - 2454 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 1 15253740-15258311(+) SMil_00007112-RA_Salv MP00062 GTGGTCCA
SmilChr01G005109 Chr01 NC_080387.1:68887049-68887056promoter 内 1539-1546 bp - 2455 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 1 68889511-68891477(+) SMil_00007112-RA_Salv MP00062 GTGGTCCA
SmilChr08G002565 Chr08 NC_080394.1:24996680-24996687promoter 内 1539-1546 bp - 2455 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 1 24991426-24994225(-) SMil_00007112-RA_Salv MP00062 TGGACCAC
SmilChr01G002462 Chr01 NC_080387.1:42296263-42296270promoter 内 1537-1544 bp + 2457 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 1 42298727-42301733(+) SMil_00007112-RA_Salv MP00062 TGGACCAC
SmilChr07G000514 Chr07 NC_080393.1:3607774-3607781promoter 内 1536-1543 bp + 2458 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 1 3610239-3612450(+) SMil_00007112-RA_Salv MP00062 TGGACCAC
SmilChr07G002167 Chr07 NC_080393.1:19846919-19846926promoter 内 1536-1543 bp - 2458 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 1 19842915-19844461(-) SMil_00007112-RA_Salv MP00062 AGGACCAC
SmilChr08G002646 Chr08 NC_080394.1:25933115-25933122promoter 内 1536-1543 bp + 2458 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 1 25935580-25936688(+) SMil_00007112-RA_Salv MP00062 AGGACCAC
SmilChr01G006019 Chr01 NC_080387.1:75778376-75778383promoter 内 1535-1542 bp + 2459 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 1 75780842-75781189(+) SMil_00007112-RA_Salv MP00062 AGGACCAC
SmilChr03G003335 Chr03 NC_080389.1:51621008-51621015promoter 内 1535-1542 bp + 2459 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 1 51614051-51618549(-) SMil_00007112-RA_Salv MP00062 GTGGTCCA
SmilChr05G002015 Chr05 NC_080391.1:20897662-20897669promoter 内 1534-1541 bp + 2460 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 1 20900129-20900494(+) SMil_00007112-RA_Salv MP00062 TGGACCAC
SmilChr02G001830 Chr02 NC_080388.1:33318489-33318496promoter 内 1532-1539 bp + 2462 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 1 33311729-33316027(-) SMil_00007112-RA_Salv MP00062 GTGGTCCT
SmilChr03G001146 Chr03 NC_080389.1:13213907-13213914promoter 内 1531-1538 bp - 2463 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 1 13208625-13211444(-) SMil_00007112-RA_Salv MP00062 AGGACCAC
SmilChr06G002132 Chr06 NC_080392.1:28706744-28706751promoter 内 1531-1538 bp - 2463 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 1 28701691-28704281(-) SMil_00007112-RA_Salv MP00062 AGGACCAC
SmilChr01G000223 Chr01 NC_080387.1:3958219-3958226promoter 内 1529-1536 bp + 2465 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 1 3953812-3955754(-) SMil_00007112-RA_Salv MP00062 GTGGTCCT
SmilChr03G002791 Chr03 NC_080389.1:44411069-44411076promoter 内 1529-1536 bp - 2465 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 1 44406262-44408604(-) SMil_00007112-RA_Salv MP00062 AGGACCAC
SmilChr04G002059 Chr04 NC_080390.1:33336425-33336432promoter 内 1529-1536 bp - 2465 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 1 33338897-33344546(+) SMil_00007112-RA_Salv MP00062 GTGGTCCT
SmilChr08G003369 Chr08 NC_080394.1:35308079-35308086promoter 内 1529-1536 bp - 2465 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 1 35304985-35305614(-) SMil_00007112-RA_Salv MP00062 TGGACCAC
SmilChr01G000360 Chr01 NC_080387.1:7428248-7428255promoter 内 1528-1535 bp + 2466 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 1 7425677-7425782(-) SMil_00007112-RA_Salv MP00062 GTGGTCCT
SmilChr01G004595 Chr01 NC_080387.1:63937204-63937211promoter 内 1528-1535 bp - 2466 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 1 63932171-63934738(-) SMil_00007112-RA_Salv MP00062 AGGACCAC
SmilChr04G001021 Chr04 NC_080390.1:14302828-14302835promoter 内 1527-1534 bp - 2467 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 1 14305302-14306364(+) SMil_00007112-RA_Salv MP00062 GTGGTCCT
SmilChr04G002432 Chr04 NC_080390.1:38964308-38964315promoter 内 1527-1534 bp + 2467 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 1 38966782-38968770(+) SMil_00007112-RA_Salv MP00062 AGGACCAC
SmilChr02G005085 Chr02 NC_080388.1:72478452-72478459promoter 内 1526-1533 bp - 2468 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 1 72474431-72475984(-) SMil_00007112-RA_Salv MP00062 AGGACCAC
SmilChr03G000286 Chr03 NC_080389.1:3261329-3261336promoter 内 1526-1533 bp - 2468 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 1 3256730-3258861(-) SMil_00007112-RA_Salv MP00062 AGGACCAC
SmilChr08G002261 Chr08 NC_080394.1:20873679-20873686promoter 内 1526-1533 bp - 2468 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 1 20876154-20877303(+) SMil_00007112-RA_Salv MP00062 GTGGTCCT
SmilChr02G005156 Chr02 NC_080388.1:72925733-72925740promoter 内 1524-1531 bp + 2470 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 1 72920166-72923263(-) SMil_00007112-RA_Salv MP00062 GTGGTCCA
SmilChr06G002019 Chr06 NC_080392.1:26009357-26009364promoter 内 1523-1530 bp + 2471 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 1 26006024-26006886(-) SMil_00007112-RA_Salv MP00062 GTGGTCCT
SmilChr04G003507 Chr04 NC_080390.1:51455265-51455272promoter 内 1521-1528 bp + 2473 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 1 51452705-51452792(-) SMil_00007112-RA_Salv MP00062 GTGGTCCA
SmilChr04G003230 Chr04 NC_080390.1:49128435-49128442promoter 内 1520-1527 bp - 2474 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 1 49130916-49131502(+) SMil_00007112-RA_Salv MP00062 GTGGTCCT
SmilChr08G001212 Chr08 NC_080394.1:9796361-9796368promoter 内 1519-1526 bp - 2475 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 1 9798843-9800981(+) SMil_00007112-RA_Salv MP00062 GTGGTCCA
SmilChr05G000914 Chr05 NC_080391.1:7246659-7246666promoter 内 1516-1523 bp - 2478 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 1 7249144-7252026(+) SMil_00007112-RA_Salv MP00062 GTGGTCCA
SmilChr02G004402 Chr02 NC_080388.1:66356082-66356089promoter 内 1515-1522 bp - 2479 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 1 66353008-66353603(-) SMil_00007112-RA_Salv MP00062 AGGACCAC
SmilChr02G002170 Chr02 NC_080388.1:38910494-38910501promoter 内 1514-1521 bp - 2480 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 1 38912981-38915528(+) SMil_00007112-RA_Salv MP00062 GTGGTCCA
SmilChr03G003210 Chr03 NC_080389.1:49697929-49697936promoter 内 1513-1520 bp - 2481 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 1 49693296-49695448(-) SMil_00007112-RA_Salv MP00062 AGGACCAC
SmilChr01G000053 Chr01 NC_080387.1:846135-846142promoter 内 1511-1518 bp - 2483 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 1 848625-850513(+) SMil_00007112-RA_Salv MP00062 GTGGTCCT
SmilChr03G001224 Chr03 NC_080389.1:14130374-14130381promoter 内 1511-1518 bp + 2483 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 1 14127820-14127891(-) SMil_00007112-RA_Salv MP00062 GTGGTCCT
SmilChr02G002668 Chr02 NC_080388.1:46184434-46184441promoter 内 1510-1517 bp + 2484 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 1 46186925-46187875(+) SMil_00007112-RA_Salv MP00062 AGGACCAC
SmilChr02G005401 Chr02 NC_080388.1:74564312-74564319promoter 内 1509-1516 bp + 2485 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.4/ 100 1 74566804-74569571(+) SMil_00007112-RA_Salv MP00062 AGGACCAC