转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr02G003688; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00003637-RA_Salv SmilChr02G003688 MYB XP_057794248.1 MP00028 GGCTCAGCGCG

可能结合的靶基因

9024 个结合位点 6764 个候选靶基因 第 98 / 136 下载 TSV

上一页 98 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr01G001207 Chr01 NC_080387.1:24287613-24287623promoter 内 1213-1223 bp - 2778 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 24290401-24291253(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGCGCTGACTG
SmilChr07G003425 Chr07 NC_080393.1:37458326-37458336promoter 内 1197-1207 bp + 2794 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 37461130-37462188(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TCCTCAGCGTT
SmilChr04G003801 Chr04 NC_080390.1:54180491-54180501promoter 内 1196-1206 bp - 2795 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 54183296-54185539(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGCGCTGACTG
SmilChr08G004233 Chr08 NC_080394.1:51740795-51740805promoter 内 1157-1167 bp + 2834 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 51736758-51737961(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CCTGCTGAGCA
SmilChr07G000946 Chr07 NC_080393.1:6734385-6734395promoter 内 1155-1165 bp + 2836 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 6737231-6743222(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TCCTCAGCGTT
SmilChr03G002925 Chr03 NC_080389.1:46003815-46003825promoter 内 1154-1164 bp - 2837 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 46006662-46009630(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GAGGCTGAGCG
SmilChr05G001450 Chr05 NC_080391.1:13246447-13246457promoter 内 1143-1153 bp - 2848 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 13249305-13251886(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CCTGCTGAGCA
SmilChr05G003641 Chr05 NC_080391.1:48831076-48831086promoter 内 1132-1142 bp + 2859 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 48833945-48834784(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGCTCAGCCGT
SmilChr02G004624 Chr02 NC_080388.1:68739006-68739016promoter 内 1120-1130 bp - 2871 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 68741887-68742788(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AACGCTGAGGA
SmilChr01G002129 Chr01 NC_080387.1:37294643-37294653promoter 内 1110-1120 bp - 2881 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 37297534-37299100(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGCGCTGTGTG
SmilChr08G001446 Chr08 NC_080394.1:11638550-11638560promoter 内 1093-1103 bp - 2898 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 11641458-11648094(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AACGCTGAGGA
SmilChr07G001827 Chr07 NC_080393.1:15763866-15763876promoter 内 1037-1047 bp + 2954 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 15766830-15768964(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TCCTCAGCGTT
SmilChr07G000057 Chr07 NC_080393.1:257191-257201promoter 内 973-983 bp - 3018 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 246152-254173(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGCTCAGCCGT
SmilChr04G002716 Chr04 NC_080390.1:42790099-42790109promoter 内 906-916 bp + 3085 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 42793194-42809721(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGTTCAGCGCT
SmilChr07G000430 Chr07 NC_080393.1:3004761-3004771promoter 内 862-872 bp - 3129 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 2997062-3001632(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CACACAGCGCG
SmilChr02G000199 Chr02 NC_080388.1:2560744-2560754promoter 内 832-842 bp + 3159 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 2553398-2557585(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGGCCTGAGCC
SmilChr05G003918 Chr05 NC_080391.1:52933225-52933235promoter 内 669-679 bp + 3322 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 52936557-52937205(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGCTCAGCCTC
SmilChr02G001999 Chr02 NC_080388.1:36152780-36152790promoter 内 660-670 bp + 3331 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 36147494-36149449(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AACGCTGAGGA
SmilChr01G003557 Chr01 NC_080387.1:54194408-54194418promoter 内 649-659 bp + 3342 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 54188417-54191066(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CCTGCTGAGCA
SmilChr01G001722 Chr01 NC_080387.1:31728490-31728500promoter 内 563-573 bp + 3428 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 31731928-31733705(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TCCTCAGCGTT
SmilChr03G001916 Chr03 NC_080389.1:26834747-26834757promoter 内 554-564 bp + 3437 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 26838194-26840759(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGCTCAGCACT
SmilChr04G002215 Chr04 NC_080390.1:35835816-35835826promoter 内 508-518 bp - 3483 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 35839309-35843360(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCGCTGAACG
SmilChr03G002923 Chr03 NC_080389.1:46003815-46003825promoter 内 500-510 bp - 3491 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 45997804-46000324(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGCTCAGCCTC
SmilChr01G006050 Chr01 NC_080387.1:76014946-76014956promoter 内 489-499 bp + 3502 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 76010308-76011444(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CCTGCTGAGCA
SmilChr05G002018 Chr05 NC_080391.1:20935856-20935866promoter 内 476-486 bp - 3515 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 20930842-20932341(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TGCTCAGCAGG
SmilChr01G001799 Chr01 NC_080387.1:32863157-32863167promoter 内 392-402 bp + 3599 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 32866766-32868592(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TCCTCAGCGTT
SmilChr03G002553 Chr03 NC_080389.1:40707687-40707697promoter 内 390-400 bp - 3601 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 40711298-40712479(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGTGCTGAGCG
SmilChr01G000939 Chr01 NC_080387.1:19888214-19888224promoter 内 379-389 bp + 3612 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 19891836-19895713(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGCTCAGCCTC
SmilChr01G006168 Chr01 NC_080387.1:77174338-77174348promoter 内 377-387 bp - 3614 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 77167156-77170724(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGCTCAGCCTC
SmilChr02G000916 Chr02 NC_080388.1:15895080-15895090promoter 内 369-379 bp - 3622 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 15885038-15891458(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGCTCAGCCTC
SmilChr05G003185 Chr05 NC_080391.1:40755318-40755328promoter 内 340-350 bp - 3651 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 40758979-40760955(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCGCTGAACG
SmilChr07G003390 Chr07 NC_080393.1:36713041-36713051promoter 内 309-319 bp + 3682 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 36716733-36720321(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGCTCAGCCTC
SmilChr08G003222 Chr08 NC_080394.1:33074012-33074022promoter 内 274-284 bp - 3717 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 33077739-33079863(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGGCCTGAGCC
SmilChr01G005045 Chr01 NC_080387.1:68378808-68378818promoter 内 263-273 bp - 3728 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 68382546-68386868(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GAGGCTGAGCG
SmilChr07G000943 Chr07 NC_080393.1:6734385-6734395promoter 内 263-273 bp + 3728 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 6728200-6730657(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AACGCTGAGGA
SmilChr03G003016 Chr03 NC_080389.1:47078423-47078433promoter 内 244-254 bp - 3747 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 47067788-47074676(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGCTCAGCCTC
SmilChr03G004736 Chr03 NC_080389.1:64498583-64498593promoter 内 227-237 bp - 3764 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 64490771-64494819(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGTTCAGCGCT
SmilChr02G003720 Chr02 NC_080388.1:58816779-58816789promoter 内 213-223 bp - 3778 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 58812269-58813001(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TCCTCAGCGTT
SmilChr06G000077 Chr06 NC_080392.1:577851-577861promoter 内 198-208 bp + 3793 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 581654-583204(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TCGTCAGCGCC
SmilChr02G000918 Chr02 NC_080388.1:15895080-15895090promoter 内 128-138 bp - 3863 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 15898953-15902329(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GAGGCTGAGCG
SmilChr08G002289 Chr08 NC_080394.1:21337344-21337354promoter 内 99-109 bp - 3892 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 21341246-21342261(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGCGCTGACGA
SmilChr05G000523 Chr05 NC_080391.1:4018765-4018775promoter 内 89-99 bp + 3902 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 4012772-4014863(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GAGGCTGAGCG
SmilChr07G001435 Chr07 NC_080393.1:11136041-11136051promoter 内 63-73 bp + 3928 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 11139979-11143298(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CACACAGCGCG
SmilChr05G001598 Chr05 NC_080391.1:14689096-14689106promoter 内 42-52 bp - 3949 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 14693055-14714954(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GAGGCTGAGCG
SmilChr02G004386 Chr02 NC_080388.1:66202042-66202052promoter 内 3729-3739 bp - 262 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 13 66202314-66205202(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCGCTGACGG
SmilChr07G001367 Chr07 NC_080393.1:10607463-10607473promoter 内 3713-3723 bp - 278 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 12 10607751-10608560(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCGCTGACGG
SmilChr02G002006 Chr02 NC_080388.1:36195725-36195735promoter 内 3887-3897 bp - 104 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 9 36195839-36196471(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCGCTGACGG
SmilChr07G001559 Chr07 NC_080393.1:12740056-12740066promoter 内 3887-3897 bp - 104 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 9 12740170-12742662(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCGCTGACGG
SmilChr07G003234 Chr07 NC_080393.1:34312841-34312851promoter 内 110-120 bp - 3881 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 9 34304733-34308960(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CCGTCAGCGCT
SmilChr02G002005 Chr02 NC_080388.1:36195725-36195735promoter 内 103-113 bp - 3888 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 9 36188049-36191837(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CCGTCAGCGCT