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转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family，查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。

预计算阈值必须与当前索引一致。非法、未支持或需四舍五入的输入会报错；页面与下载均不会自动切换阈值。

257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中，并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因，不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif；应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引，可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card，点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
SmilChr04G003117 XP_057809539.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr04G003114 XP_057809538.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr01G005298 XP_057788621.1
ARR-B 1
MP00010
 8344 9778 查靶基因
SmilChr03G003924 XP_057798851.1
NAC 1
MP00059
 8333 9940 查靶基因
SmilChr01G005344 XP_057788686.1
MYB 1
MP00296
 8304 9873 查靶基因
SmilChr08G004408 XP_057780613.1
MYB 1
MP00114
 8151 9897 查靶基因
SmilChr04G001094 XP_057804404.1
WRKY 1
MP00408
 8149 9902 查靶基因
SmilChr07G003597 XP_057773587.1
Nin-like 1
MP00449
 8096 9453 查靶基因
SmilChr02G005433 XP_057792682.1
WRKY 1
MP00209
 8083 9910 查靶基因
SmilChr04G004136 XP_057806072.1
MYB 1
MP00627
 8075 9835 查靶基因
SmilChr01G003955 XP_057779712.1
WRKY 1
MP00450
 8044 9901 查靶基因
SmilChr03G003685 XP_057798538.1
ERF 1
MP00558
 8044 9762 查靶基因
SmilChr07G002937 XP_057777490.1
MIKC_MADS 1
MP00096
 8019 9914 查靶基因
SmilChr02G003833 XP_057794421.1
MYB 1
MP00476
 7981 9904 查靶基因
SmilChr07G002803 XP_057777238.1
NAC 1
MP00221
 7965 9903 查靶基因
SmilChr05G002364 XP_057809766.1
WRKY 1
MP00069
 7882 9917 查靶基因
SmilChr08G003267 XP_057779249.1
MYB 1
MP00406
 7839 9917 查靶基因
SmilChr02G005012 XP_057792191.1
TALE 1
MP00670
 7758 9906 查靶基因
SmilChr07G001978 XP_057776996.1
SBP 1
MP00555
 7648 9805 查靶基因
SmilChr05G000741 XP_057764423.1
ARF 1
MP00021
 7629 9812 查靶基因
SmilChr01G004579 XP_057787263.1
MYB 1
MP00132
 7583 9926 查靶基因
SmilChr05G000593 XP_057764223.1
MIKC_MADS 1
MP00609
 7575 9941 查靶基因
SmilChr03G004518 XP_057799834.1
ERF 1
MP00529
 7559 9247 查靶基因
SmilChr06G001829 XP_057766988.1
MYB 1
MP00510
 7526 9799 查靶基因
SmilChr05G000830 XP_057764550.1
NAC 1
MP00058
 7440 9855 查靶基因
SmilChr08G002543 XP_057778423.1
bZIP 1
MP00303
 7416 9868 查靶基因
SmilChr01G002743 XP_057765725.1
MYB_related 1
MP00565
 7412 9785 查靶基因
SmilChr04G002704 XP_057807081.1
ERF 1
MP00026
 7408 9854 查靶基因
SmilChr05G001395 XP_057765344.1
WRKY 1
MP00071
 7408 9764 查靶基因
SmilChr04G002953 XP_057809314.1
ARF 1
MP00033
 7406 9827 查靶基因
SmilChr01G004199 XP_057782208.1
bHLH 1
MP00074
 7396 9969 查靶基因
SmilChr05G004009 XP_057810662.1
MYB 1
MP00216
 7342 9832 查靶基因
SmilChr03G001606 XP_057802772.1
WRKY 1
MP00539
 7338 9848 查靶基因
SmilChr02G004600 XP_057791481.1
ARF 1
MP00574
 7302 9846 查靶基因
SmilChr03G004179 XP_057799230.1
WRKY 1
MP00464
 7299 9864 查靶基因
SmilChr04G003805 XP_057805691.1
MIKC_MADS 1
MP00315
 7291 9567 查靶基因
SmilChr03G003761 XP_057798625.1
WRKY 1
MP00525
 7235 9838 查靶基因
SmilChr01G001885 XP_057806790.1
WRKY 1
MP00171
 7182 9833 查靶基因
SmilChr05G004392 XP_057811204.1
WRKY 1
MP00506
 7173 9818 查靶基因
SmilChr04G002757 XP_057807158.1
MIKC_MADS 1
MP00272
 7172 9889 查靶基因
SmilChr01G003404 XP_057773670.1
bZIP 1
MP00184
 7147 9840 查靶基因
SmilChr03G002335 XP_057801256.1
bZIP 1
MP00647
 7133 9953 查靶基因
SmilChr07G002075 XP_057773918.1
C2H2 1
MP00485
 7130 8059 查靶基因
SmilChr04G000162 XP_057807467.1
MYB 1
MP00134
 7078 8676 查靶基因
SmilChr04G000040 XP_057808382.1
ERF 1
MP00312
 7006 8490 查靶基因
SmilChr08G001896 XP_057783815.1
MYB 1
MP00564
 6984 9893 查靶基因
SmilChr02G005217 XP_057792502.1
G2-like 1
MP00022
 6959 9720 查靶基因
SmilChr05G000260 XP_057763683.1
bZIP 1
MP00040
 6920 9919 查靶基因
SmilChr01G002885 XP_057767601.1
ERF 1
MP00151
 6907 9976 查靶基因
SmilChr05G001518 XP_057765511.1
WRKY 1
MP00455
 6900 9792 查靶基因
SmilChr03G002503 XP_057801356.1
MYB 1
MP00482
 6899 8940 查靶基因
SmilChr03G001252 XP_057802461.1
bZIP 1
MP00291
 6894 9321 查靶基因
SmilChr06G001365 XP_057768799.1
SBP 1
MP00307
 6893 9755 查靶基因
SmilChr03G003439 XP_057798243.1
bHLH 1
MP00195
 6878 9832 查靶基因
SmilChr06G001111 XP_057768512.1
MYB 1
MP00388
 6870 9774 查靶基因
SmilChr02G000949 XP_057795176.1
bZIP 1
MP00318
 6849 9413 查靶基因
SmilChr01G000025 XP_057790305.1
SBP 1
MP00633
 6833 8026 查靶基因
SmilChr01G004313 XP_057783598.1
bHLH 1
MP00308
 6805 9826 查靶基因
SmilChr02G005502 XP_057792768.1
bHLH 1
MP00082
 6784 9435 查靶基因
SmilChr03G004274 XP_057799397.1
MIKC_MADS 1
MP00080
 6766 9850 查靶基因
SmilChr02G003688 XP_057794248.1
MYB 1
MP00028
 6764 9024 查靶基因
SmilChr04G003367 XP_057804957.1
MYB 1
MP00191
 6736 9690 查靶基因
SmilChr04G000157 XP_057807462.1
bHLH 1
MP00081
 6729 9942 查靶基因
SmilChr07G002147 XP_057774045.1
MYB 1
MP00500
 6697 9681 查靶基因
SmilChr05G002277 XP_057809665.1
ERF 1
MP00452
 6671 7783 查靶基因
SmilChr07G004480 XP_057776222.1
WRKY 1
MP00531
 6663 9784 查靶基因
SmilChr02G004447 XP_057797242.1
HD-ZIP 1
MP00200
 6661 9930 查靶基因
SmilChr04G000070 XP_057807324.1
bHLH 1
MP00034
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G002039 XP_057808459.1
bHLH 1
MP00660
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G005851 XP_057789306.1
MYB 1
MP00055
 6638 9685 查靶基因
SmilChr02G005238 XP_057792594.1
SBP 1
MP00634
 6619 7771 查靶基因
SmilChr06G002048 XP_057770293.1
bHLH 1
MP00035
 6618 9903 查靶基因
SmilChr07G000836 XP_057772437.1
MYB_related 1
MP00568
 6611 9696 查靶基因
SmilChr04G003119 XP_057809542.1
bZIP 1
MP00039
 6610 9936 查靶基因
SmilChr01G004114 XP_057781125.1
WRKY 1
MP00284
 6552 9774 查靶基因
SmilChr08G004246 XP_057780410.1
WRKY 1
MP00422
 6535 9791 查靶基因
SmilChr05G001980 XP_057766076.1
ARF 1
MP00153
 6534 9706 查靶基因
SmilChr04G000094 XP_057807365.1
YABBY 1
MP00620
 6504 9844 查靶基因
SmilChr02G002534 XP_057797741.1
TCP 1
MP00169
 6498 7295 查靶基因
SmilChr05G001269 XP_057765199.1
G2-like 1
MP00252
 6478 9780 查靶基因
SmilChr07G003441 XP_057773618.1
NAC 1
MP00108
 6458 9810 查靶基因
SmilChr02G001791 XP_057795933.1
TCP 1
MP00062
 6454 7249 查靶基因
SmilChr05G003285 XP_057810127.1
RAV 1
MP00024
 6450 9853 查靶基因
SmilChr05G000619 XP_057764205.1
WRKY 1
MP00167
 6439 9756 查靶基因
SmilChr04G003745 XP_057809144.1
C2H2 1
MP00416
 6433 9716 查靶基因
SmilChr02G004607 XP_057791470.1
C2H2 1
MP00608
 6398 9817 查靶基因
SmilChr02G003399 XP_057793859.1
ERF 1
MP00240
 6368 9978 查靶基因
SmilChr01G004920 XP_057788125.1
MYB_related 1
MP00607
 6362 9718 查靶基因
SmilChr06G001059 XP_057768449.1
Dof 1
MP00402
 6278 9875 查靶基因
SmilChr01G004552 XP_057786668.1
bZIP 1
MP00409
 6252 8429 查靶基因
SmilChr01G006187 XP_057798078.1
GRAS 1
MP00611
 6232 9807 查靶基因
SmilChr01G001516 XP_057803325.1
bZIP 1
MP00648
 6170 9939 查靶基因
SmilChr04G003955 XP_057805828.1
ERF 1
MP00120
 6144 7514 查靶基因
SmilChr01G004708 XP_057787833.1
WRKY 1
MP00251
 6140 9713 查靶基因
SmilChr05G001961 XP_057766054.1
MIKC_MADS 1
MP00077
 6125 9815 查靶基因
SmilChr08G000478 XP_057781809.1
GATA 1
MP00130
 6015 9821 查靶基因
SmilChr01G000943 XP_057790035.1
MIKC_MADS 1
MP00508
 5979 7481 查靶基因
SmilChr05G004106 XP_057810779.1
WRKY 1
MP00260
 5932 9706 查靶基因
SmilChr04G003973 XP_057805857.1
HD-ZIP 1
MP00013
 5927 9712 查靶基因
SmilChr03G002207 XP_057801109.1
WRKY 1
MP00299
 5919 9699 查靶基因

下载包含当前查询和阈值下的全部候选靶基因，每个基因保留一个最佳位点及命中位点数。0–100 标准化 motif 得分不代表结合概率。

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr04G002704; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00005062-RA_Salv SmilChr04G002704 ERF XP_057807081.1 MP00026 CACCGACCAT

可能结合的靶基因

9854 个结合位点 7408 个候选靶基因 第 99 / 149 下载 TSV

上一页 99 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 标准化 motif 得分 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr05G004383 Chr05 NC_080391.1:57322362-57322371promoter 内 410-419 bp - 3582 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 57310871-57318780(-) SMil_00005062-RA_Salv MP00026 CACCGACTAT
SmilChr06G001873 Chr06 NC_080392.1:22244396-22244405promoter 内 393-402 bp + 3599 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 22238063-22240797(-) SMil_00005062-RA_Salv MP00026 GGAGTCGGTG
SmilChr01G001104 Chr01 NC_080387.1:22610151-22610160promoter 内 368-377 bp + 3624 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 22613784-22615277(+) SMil_00005062-RA_Salv MP00026 CACCGACTCC
SmilChr01G001426 Chr01 NC_080387.1:27905800-27905809promoter 内 335-344 bp + 3657 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 27899043-27902143(-) SMil_00005062-RA_Salv MP00026 GGAGTCGGTG
SmilChr06G000415 Chr06 NC_080392.1:3448279-3448288promoter 内 333-342 bp + 3659 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 3435914-3444620(-) SMil_00005062-RA_Salv MP00026 AAGGTCGGTC
SmilChr05G002133 Chr05 NC_080391.1:22419150-22419159promoter 内 325-334 bp - 3667 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 22422826-22424163(+) SMil_00005062-RA_Salv MP00026 GGAGTCGGTG
SmilChr05G001697 Chr05 NC_080391.1:16151809-16151818promoter 内 317-326 bp + 3675 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 16155493-16160754(+) SMil_00005062-RA_Salv MP00026 CACCGACTCC
SmilChr01G004744 Chr01 NC_080387.1:65614333-65614342promoter 内 315-324 bp + 3677 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 65618019-65618738(+) SMil_00005062-RA_Salv MP00026 CACCGACTCC
SmilChr04G001962 Chr04 NC_080390.1:31818670-31818679promoter 内 287-296 bp - 3705 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 31810581-31814965(-) SMil_00005062-RA_Salv MP00026 CACCGACTCC
SmilChr05G000623 Chr05 NC_080391.1:4702561-4702570promoter 内 283-292 bp + 3709 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 4706279-4715947(+) SMil_00005062-RA_Salv MP00026 CACCGACTCC
SmilChr01G006171 Chr01 NC_080387.1:77206119-77206128promoter 内 263-272 bp + 3729 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 77209857-77211371(+) SMil_00005062-RA_Salv MP00026 CACCGACTCC
SmilChr05G000636 Chr05 NC_080391.1:4802102-4802111promoter 内 239-248 bp + 3753 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 4805864-4809650(+) SMil_00005062-RA_Salv MP00026 CACCGACTCC
SmilChr01G003643 Chr01 NC_080387.1:54919665-54919674promoter 内 236-245 bp - 3756 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 54923430-54924421(+) SMil_00005062-RA_Salv MP00026 AAGGTCGGTC
SmilChr04G002238 Chr04 NC_080390.1:36146742-36146751promoter 内 201-210 bp + 3791 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 36142056-36142951(-) SMil_00005062-RA_Salv MP00026 AAGGTCGGTC
SmilChr03G003382 Chr03 NC_080389.1:52189712-52189721promoter 内 197-206 bp + 3795 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 52175671-52185917(-) SMil_00005062-RA_Salv MP00026 ATAGTCGGTG
SmilChr01G004136 Chr01 NC_080387.1:59880108-59880117promoter 内 168-177 bp + 3824 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 59875231-59876284(-) SMil_00005062-RA_Salv MP00026 GGAGTCGGTG
SmilChr05G002652 Chr05 NC_080391.1:30019240-30019249promoter 内 164-173 bp + 3828 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 30014486-30015412(-) SMil_00005062-RA_Salv MP00026 GGAGTCGGTG
SmilChr03G002945 Chr03 NC_080389.1:46197983-46197992promoter 内 159-168 bp + 3833 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 46191717-46194150(-) SMil_00005062-RA_Salv MP00026 GGAGTCGGTG
SmilChr05G002390 Chr05 NC_080391.1:26401828-26401837promoter 内 115-124 bp - 3877 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 26396998-26397951(-) SMil_00005062-RA_Salv MP00026 CACCGACTCC
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SmilChr01G004419 Chr01 NC_080387.1:62309747-62309756promoter 内 76-85 bp + 3916 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 62313672-62316505(+) SMil_00005062-RA_Salv MP00026 CACCGACTCC
SmilChr04G001278 Chr04 NC_080390.1:20372941-20372950promoter 内 72-81 bp + 3920 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 20363576-20369021(-) SMil_00005062-RA_Salv MP00026 ATAGTCGGTG
SmilChr01G001465 Chr01 NC_080387.1:28456137-28456146promoter 内 58-67 bp - 3934 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 28450022-28452203(-) SMil_00005062-RA_Salv MP00026 CACCGACTAT
SmilChr01G001362 Chr01 NC_080387.1:26973207-26973216promoter 内 54-63 bp - 3938 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 26968437-26969269(-) SMil_00005062-RA_Salv MP00026 CACCGACTCC
SmilChr04G001103 Chr04 NC_080390.1:15792232-15792241promoter 内 23-32 bp + 3969 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 15785082-15788263(-) SMil_00005062-RA_Salv MP00026 GGAGTCGGTG
SmilChr01G001820 Chr01 NC_080387.1:33139988-33139997promoter 内 14-23 bp - 3978 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 33133079-33136010(-) SMil_00005062-RA_Salv MP00026 CACCGACTCC
SmilChr05G003274 Chr05 NC_080391.1:42528165-42528174promoter 内 9-18 bp + 3983 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 42532157-42532263(+) SMil_00005062-RA_Salv MP00026 CACCGACTCC
SmilChr02G003143 Chr02 NC_080388.1:52442650-52442659promoter 内 1635-1644 bp + 2357 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 5 52439416-52440293(-) SMil_00005062-RA_Salv MP00026 TTGGTCGGTA
SmilChr03G003278 Chr03 NC_080389.1:50779417-50779426promoter 内 1493-1502 bp - 2499 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 4 50776229-50776918(-) SMil_00005062-RA_Salv MP00026 CACCGACGGC
SmilChr04G002565 Chr04 NC_080390.1:40974665-40974674promoter 内 2195-2204 bp + 1797 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 3 40966533-40972868(-) SMil_00005062-RA_Salv MP00026 ACGGTCGGTT
SmilChr06G000820 Chr06 NC_080392.1:7727034-7727043promoter 内 2078-2087 bp + 1914 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 3 7722643-7725120(-) SMil_00005062-RA_Salv MP00026 GCCGTCGGTG
SmilChr01G004011 Chr01 NC_080387.1:58526960-58526969promoter 内 1434-1443 bp + 2558 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 3 58522849-58524402(-) SMil_00005062-RA_Salv MP00026 GCCGTCGGTG
SmilChr02G000545 Chr02 NC_080388.1:7522351-7522360promoter 内 1278-1287 bp + 2714 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 3 7515718-7519637(-) SMil_00005062-RA_Salv MP00026 GCCGTCGGTG
SmilChr04G000599 Chr04 NC_080390.1:6775269-6775278promoter 内 313-322 bp - 3679 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 3 6768654-6771590(-) SMil_00005062-RA_Salv MP00026 CACCGACGGC
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SmilChr04G002956 Chr04 NC_080390.1:45903650-45903659promoter 内 3386-3395 bp + 606 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 2 45904265-45908564(+) SMil_00005062-RA_Salv MP00026 AACCGACCGT
SmilChr04G004099 Chr04 NC_080390.1:55963885-55963894promoter 内 3362-3371 bp - 630 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 2 55964524-55966188(+) SMil_00005062-RA_Salv MP00026 CCGGTCGGTA
SmilChr01G000935 Chr01 NC_080387.1:19829944-19829953promoter 内 3211-3220 bp - 781 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 2 19827940-19829163(-) SMil_00005062-RA_Salv MP00026 AACCGACCGT
SmilChr05G002165 Chr05 NC_080391.1:22911987-22911996promoter 内 3138-3147 bp + 854 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 2 22905228-22911133(-) SMil_00005062-RA_Salv MP00026 GCCGTCGGTG
SmilChr05G002662 Chr05 NC_080391.1:30126948-30126957promoter 内 3083-3092 bp + 909 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 2 30127866-30128839(+) SMil_00005062-RA_Salv MP00026 AACCGACCGT
SmilChr06G000819 Chr06 NC_080392.1:7718488-7718497promoter 内 3059-3068 bp - 933 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 2 7719430-7722625(+) SMil_00005062-RA_Salv MP00026 GCCGTCGGTG
SmilChr04G002041 Chr04 NC_080390.1:33142058-33142067promoter 内 2800-2809 bp - 1192 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 2 33138419-33140866(-) SMil_00005062-RA_Salv MP00026 TACCGACCGG
SmilChr03G000432 Chr03 NC_080389.1:4681151-4681160promoter 内 2735-2744 bp - 1257 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 2 4682417-4684700(+) SMil_00005062-RA_Salv MP00026 GCCGTCGGTG
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SmilChr06G001393 Chr06 NC_080392.1:14560098-14560107promoter 内 2653-2662 bp - 1339 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 2 14561446-14562739(+) SMil_00005062-RA_Salv MP00026 ACGGTCGGTT
SmilChr02G001730 Chr02 NC_080388.1:31790337-31790346promoter 内 2597-2606 bp + 1395 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 2 31788837-31788942(-) SMil_00005062-RA_Salv MP00026 TTGGTCGGTA
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SmilChr02G001237 Chr02 NC_080388.1:22746122-22746131promoter 内 2414-2423 bp - 1578 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 2 22747709-22748731(+) SMil_00005062-RA_Salv MP00026 ACGGTCGGTT