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转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family，查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中，并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因，不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif；应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引，可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card，点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
SmilChr04G003117 XP_057809539.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr04G003114 XP_057809538.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr01G005298 XP_057788621.1
ARR-B 1
MP00010
 8344 9778 查靶基因
SmilChr03G003924 XP_057798851.1
NAC 1
MP00059
 8333 9940 查靶基因
SmilChr01G005344 XP_057788686.1
MYB 1
MP00296
 8304 9873 查靶基因
SmilChr08G004408 XP_057780613.1
MYB 1
MP00114
 8151 9897 查靶基因
SmilChr04G001094 XP_057804404.1
WRKY 1
MP00408
 8149 9902 查靶基因
SmilChr07G003597 XP_057773587.1
Nin-like 1
MP00449
 8096 9453 查靶基因
SmilChr02G005433 XP_057792682.1
WRKY 1
MP00209
 8083 9910 查靶基因
SmilChr04G004136 XP_057806072.1
MYB 1
MP00627
 8075 9835 查靶基因
SmilChr01G003955 XP_057779712.1
WRKY 1
MP00450
 8044 9901 查靶基因
SmilChr03G003685 XP_057798538.1
ERF 1
MP00558
 8044 9762 查靶基因
SmilChr07G002937 XP_057777490.1
MIKC_MADS 1
MP00096
 8019 9914 查靶基因
SmilChr02G003833 XP_057794421.1
MYB 1
MP00476
 7981 9904 查靶基因
SmilChr07G002803 XP_057777238.1
NAC 1
MP00221
 7965 9903 查靶基因
SmilChr05G002364 XP_057809766.1
WRKY 1
MP00069
 7882 9917 查靶基因
SmilChr08G003267 XP_057779249.1
MYB 1
MP00406
 7839 9917 查靶基因
SmilChr02G005012 XP_057792191.1
TALE 1
MP00670
 7758 9906 查靶基因
SmilChr07G001978 XP_057776996.1
SBP 1
MP00555
 7648 9805 查靶基因
SmilChr05G000741 XP_057764423.1
ARF 1
MP00021
 7629 9812 查靶基因
SmilChr01G004579 XP_057787263.1
MYB 1
MP00132
 7583 9926 查靶基因
SmilChr05G000593 XP_057764223.1
MIKC_MADS 1
MP00609
 7575 9941 查靶基因
SmilChr03G004518 XP_057799834.1
ERF 1
MP00529
 7559 9247 查靶基因
SmilChr06G001829 XP_057766988.1
MYB 1
MP00510
 7526 9799 查靶基因
SmilChr05G000830 XP_057764550.1
NAC 1
MP00058
 7440 9855 查靶基因
SmilChr08G002543 XP_057778423.1
bZIP 1
MP00303
 7416 9868 查靶基因
SmilChr01G002743 XP_057765725.1
MYB_related 1
MP00565
 7412 9785 查靶基因
SmilChr04G002704 XP_057807081.1
ERF 1
MP00026
 7408 9854 查靶基因
SmilChr05G001395 XP_057765344.1
WRKY 1
MP00071
 7408 9764 查靶基因
SmilChr04G002953 XP_057809314.1
ARF 1
MP00033
 7406 9827 查靶基因
SmilChr01G004199 XP_057782208.1
bHLH 1
MP00074
 7396 9969 查靶基因
SmilChr05G004009 XP_057810662.1
MYB 1
MP00216
 7342 9832 查靶基因
SmilChr03G001606 XP_057802772.1
WRKY 1
MP00539
 7338 9848 查靶基因
SmilChr02G004600 XP_057791481.1
ARF 1
MP00574
 7302 9846 查靶基因
SmilChr03G004179 XP_057799230.1
WRKY 1
MP00464
 7299 9864 查靶基因
SmilChr04G003805 XP_057805691.1
MIKC_MADS 1
MP00315
 7291 9567 查靶基因
SmilChr03G003761 XP_057798625.1
WRKY 1
MP00525
 7235 9838 查靶基因
SmilChr01G001885 XP_057806790.1
WRKY 1
MP00171
 7182 9833 查靶基因
SmilChr05G004392 XP_057811204.1
WRKY 1
MP00506
 7173 9818 查靶基因
SmilChr04G002757 XP_057807158.1
MIKC_MADS 1
MP00272
 7172 9889 查靶基因
SmilChr01G003404 XP_057773670.1
bZIP 1
MP00184
 7147 9840 查靶基因
SmilChr03G002335 XP_057801256.1
bZIP 1
MP00647
 7133 9953 查靶基因
SmilChr07G002075 XP_057773918.1
C2H2 1
MP00485
 7130 8059 查靶基因
SmilChr04G000162 XP_057807467.1
MYB 1
MP00134
 7078 8676 查靶基因
SmilChr04G000040 XP_057808382.1
ERF 1
MP00312
 7006 8490 查靶基因
SmilChr08G001896 XP_057783815.1
MYB 1
MP00564
 6984 9893 查靶基因
SmilChr02G005217 XP_057792502.1
G2-like 1
MP00022
 6959 9720 查靶基因
SmilChr05G000260 XP_057763683.1
bZIP 1
MP00040
 6920 9919 查靶基因
SmilChr01G002885 XP_057767601.1
ERF 1
MP00151
 6907 9976 查靶基因
SmilChr05G001518 XP_057765511.1
WRKY 1
MP00455
 6900 9792 查靶基因
SmilChr03G002503 XP_057801356.1
MYB 1
MP00482
 6899 8940 查靶基因
SmilChr03G001252 XP_057802461.1
bZIP 1
MP00291
 6894 9321 查靶基因
SmilChr06G001365 XP_057768799.1
SBP 1
MP00307
 6893 9755 查靶基因
SmilChr03G003439 XP_057798243.1
bHLH 1
MP00195
 6878 9832 查靶基因
SmilChr06G001111 XP_057768512.1
MYB 1
MP00388
 6870 9774 查靶基因
SmilChr02G000949 XP_057795176.1
bZIP 1
MP00318
 6849 9413 查靶基因
SmilChr01G000025 XP_057790305.1
SBP 1
MP00633
 6833 8026 查靶基因
SmilChr01G004313 XP_057783598.1
bHLH 1
MP00308
 6805 9826 查靶基因
SmilChr02G005502 XP_057792768.1
bHLH 1
MP00082
 6784 9435 查靶基因
SmilChr03G004274 XP_057799397.1
MIKC_MADS 1
MP00080
 6766 9850 查靶基因
SmilChr02G003688 XP_057794248.1
MYB 1
MP00028
 6764 9024 查靶基因
SmilChr04G003367 XP_057804957.1
MYB 1
MP00191
 6736 9690 查靶基因
SmilChr04G000157 XP_057807462.1
bHLH 1
MP00081
 6729 9942 查靶基因
SmilChr07G002147 XP_057774045.1
MYB 1
MP00500
 6697 9681 查靶基因
SmilChr05G002277 XP_057809665.1
ERF 1
MP00452
 6671 7783 查靶基因
SmilChr07G004480 XP_057776222.1
WRKY 1
MP00531
 6663 9784 查靶基因
SmilChr02G004447 XP_057797242.1
HD-ZIP 1
MP00200
 6661 9930 查靶基因
SmilChr04G000070 XP_057807324.1
bHLH 1
MP00034
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G002039 XP_057808459.1
bHLH 1
MP00660
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G005851 XP_057789306.1
MYB 1
MP00055
 6638 9685 查靶基因
SmilChr02G005238 XP_057792594.1
SBP 1
MP00634
 6619 7771 查靶基因
SmilChr06G002048 XP_057770293.1
bHLH 1
MP00035
 6618 9903 查靶基因
SmilChr07G000836 XP_057772437.1
MYB_related 1
MP00568
 6611 9696 查靶基因
SmilChr04G003119 XP_057809542.1
bZIP 1
MP00039
 6610 9936 查靶基因
SmilChr01G004114 XP_057781125.1
WRKY 1
MP00284
 6552 9774 查靶基因
SmilChr08G004246 XP_057780410.1
WRKY 1
MP00422
 6535 9791 查靶基因
SmilChr05G001980 XP_057766076.1
ARF 1
MP00153
 6534 9706 查靶基因
SmilChr04G000094 XP_057807365.1
YABBY 1
MP00620
 6504 9844 查靶基因
SmilChr02G002534 XP_057797741.1
TCP 1
MP00169
 6498 7295 查靶基因
SmilChr05G001269 XP_057765199.1
G2-like 1
MP00252
 6478 9780 查靶基因
SmilChr07G003441 XP_057773618.1
NAC 1
MP00108
 6458 9810 查靶基因
SmilChr02G001791 XP_057795933.1
TCP 1
MP00062
 6454 7249 查靶基因
SmilChr05G003285 XP_057810127.1
RAV 1
MP00024
 6450 9853 查靶基因
SmilChr05G000619 XP_057764205.1
WRKY 1
MP00167
 6439 9756 查靶基因
SmilChr04G003745 XP_057809144.1
C2H2 1
MP00416
 6433 9716 查靶基因
SmilChr02G004607 XP_057791470.1
C2H2 1
MP00608
 6398 9817 查靶基因
SmilChr02G003399 XP_057793859.1
ERF 1
MP00240
 6368 9978 查靶基因
SmilChr01G004920 XP_057788125.1
MYB_related 1
MP00607
 6362 9718 查靶基因
SmilChr06G001059 XP_057768449.1
Dof 1
MP00402
 6278 9875 查靶基因
SmilChr01G004552 XP_057786668.1
bZIP 1
MP00409
 6252 8429 查靶基因
SmilChr01G006187 XP_057798078.1
GRAS 1
MP00611
 6232 9807 查靶基因
SmilChr01G001516 XP_057803325.1
bZIP 1
MP00648
 6170 9939 查靶基因
SmilChr04G003955 XP_057805828.1
ERF 1
MP00120
 6144 7514 查靶基因
SmilChr01G004708 XP_057787833.1
WRKY 1
MP00251
 6140 9713 查靶基因
SmilChr05G001961 XP_057766054.1
MIKC_MADS 1
MP00077
 6125 9815 查靶基因
SmilChr08G000478 XP_057781809.1
GATA 1
MP00130
 6015 9821 查靶基因
SmilChr01G000943 XP_057790035.1
MIKC_MADS 1
MP00508
 5979 7481 查靶基因
SmilChr05G004106 XP_057810779.1
WRKY 1
MP00260
 5932 9706 查靶基因
SmilChr04G003973 XP_057805857.1
HD-ZIP 1
MP00013
 5927 9712 查靶基因
SmilChr03G002207 XP_057801109.1
WRKY 1
MP00299
 5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr04G000162; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00008183-RA_Salv SmilChr04G000162 MYB XP_057807467.1 MP00134 TCCACCTACCACCAC

可能结合的靶基因

8676 个结合位点 7078 个候选靶基因 第 10 / 142 下载 TSV

上一页 10 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr03G000976 Chr03 NC_080389.1:11050200-11050214promoter 内 75-89 bp + 3912 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 1 11043989-11046288(-) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 ATGGTGGTGGGTGGC
SmilChr06G000959 Chr06 NC_080392.1:9250962-9250976promoter 内 52-66 bp + 3935 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 1 9245258-9247027(-) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 GAGGAGGTAGGTGGC
SmilChr06G001308 Chr06 NC_080392.1:13590229-13590243promoter 内 2617-2631 bp + 1370 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 3 13586484-13588859(-) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 GTGGTGGTGGGTGAT
SmilChr04G001260 Chr04 NC_080390.1:19867484-19867498promoter 内 3553-3567 bp - 434 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 2 19866712-19867050(-) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 CCCAACTACCACCAA
SmilChr08G003746 Chr08 NC_080394.1:42474281-42474295promoter 内 3553-3567 bp - 434 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 2 42473509-42473847(-) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 CCCAACTACCACCAA
SmilChr01G003161 Chr01 NC_080387.1:50427777-50427791promoter 内 3428-3442 bp - 559 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 2 50424449-50427218(-) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 CTCACCTACCACACT
SmilChr04G000450 Chr04 NC_080390.1:4771696-4771710promoter 内 3939-3953 bp - 48 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 1 4769472-4771648(-) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 CTCAACAACCACCAC
SmilChr08G002557 Chr08 NC_080394.1:24870599-24870613promoter 内 3708-3722 bp - 279 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 1 24868593-24870320(-) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 CCCACCTACCAAGGC
SmilChr08G002542 Chr08 NC_080394.1:24696785-24696799promoter 内 3707-3721 bp - 280 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 1 24694734-24696505(-) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 CCCACCTACCAAGGC
SmilChr02G000887 Chr02 NC_080388.1:15278889-15278903promoter 内 3679-3693 bp + 308 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 1 15279211-15279675(+) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 CCCAACTACCACCAA
SmilChr01G003162 Chr01 NC_080387.1:50427777-50427791promoter 内 3580-3594 bp - 407 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 1 50428198-50431024(+) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 AGTGTGGTAGGTGAG
SmilChr02G001161 Chr02 NC_080388.1:21192461-21192475promoter 内 3553-3567 bp + 434 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 1 21192909-21193247(+) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 CCCAACTACCACCAA
SmilChr03G002217 Chr03 NC_080389.1:34932450-34932464promoter 内 3553-3567 bp + 434 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 1 34932898-34933236(+) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 CCCAACTACCACCAA
SmilChr04G000739 Chr04 NC_080390.1:8998148-8998162promoter 内 3553-3567 bp - 434 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 1 8997376-8997714(-) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 CCCAACTACCACCAA
SmilChr07G002330 Chr07 NC_080393.1:21607877-21607891promoter 内 3553-3567 bp - 434 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 1 21607105-21607443(-) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 CCCAACTACCACCAA
SmilChr08G002610 Chr08 NC_080394.1:25470228-25470242promoter 内 2598-2612 bp + 1389 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 1 25465970-25468839(-) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 GCGTAGGTAGGTGGA
SmilChr03G002110 Chr03 NC_080389.1:32823269-32823283promoter 内 2595-2609 bp - 1392 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 1 32818823-32821877(-) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 CCCAACTACCACCAA
SmilChr01G000657 Chr01 NC_080387.1:14637617-14637631promoter 内 2342-2356 bp + 1645 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 1 14639276-14640727(+) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 CCCACCTACCGTCGT
SmilChr01G003719 Chr01 NC_080387.1:55517862-55517876promoter 内 2335-2349 bp - 1652 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 1 55519528-55523997(+) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 GTGGTGGTGGGTGAT
SmilChr08G002556 Chr08 NC_080394.1:24870599-24870613promoter 内 1802-1816 bp - 2185 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 1 24866849-24868414(-) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 CCCACCTACCAAGGC
SmilChr02G004736 Chr02 NC_080388.1:69587974-69587988promoter 内 1648-1662 bp + 2339 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 1 69581968-69585635(-) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 TGGGAGGTAGGTGAG
SmilChr03G000324 Chr03 NC_080389.1:3702249-3702263promoter 内 1267-1281 bp + 2720 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 1 3704983-3705089(+) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 CCCAACTACCACCAA
SmilChr07G002532 Chr07 NC_080393.1:24008488-24008502promoter 内 1048-1062 bp + 2939 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 1 24011441-24014797(+) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 CCCACCTACCTCTCT
SmilChr04G002175 Chr04 NC_080390.1:35139414-35139428promoter 内 769-783 bp - 3218 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 1 35142646-35146257(+) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 GGGGTGGTAGTTGTG
SmilChr05G003313 Chr05 NC_080391.1:43383942-43383956promoter 内 103-117 bp - 3884 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 1 43387840-43388516(+) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 AGTGTGGTAGGTGAG
SmilChr01G000881 Chr01 NC_080387.1:18750343-18750357promoter 内 32-46 bp + 3955 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 1 18743230-18746388(-) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 GCGACGGTAGGTGAG
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SmilChr06G002108 Chr06 NC_080392.1:28158741-28158755promoter 内 3268-3282 bp + 719 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 5 28156702-28158022(-) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 GAAGAGGTAGGTGGA
SmilChr06G002106 Chr06 NC_080392.1:28139977-28139991promoter 内 3090-3104 bp + 897 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 5 28137937-28139080(-) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 GAAGAGGTAGGTGGA
SmilChr03G004373 Chr03 NC_080389.1:61934065-61934079promoter 内 2787-2801 bp + 1200 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 4 61935279-61939607(+) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 GCCACCTACCACCAT
SmilChr04G000721 Chr04 NC_080390.1:8470581-8470595promoter 内 1183-1197 bp + 2804 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 4 8461382-8467777(-) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 ATGGTGGTAGGTGGC
SmilChr04G003628 Chr04 NC_080390.1:52791165-52791179promoter 内 904-918 bp - 3083 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 3 52780274-52788082(-) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 TCCACCTACCTCTTC
SmilChr03G000241 Chr03 NC_080389.1:2860038-2860052promoter 内 756-770 bp - 3231 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 3 2855374-2856807(-) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 GCCACCTACCACCAT
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SmilChr02G001741 Chr02 NC_080388.1:31997641-31997655promoter 内 2738-2752 bp + 1249 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 2 31990017-31996392(-) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 TTGGTGGTGGGTGGT
SmilChr07G004204 Chr07 NC_080393.1:54146410-54146424promoter 内 2656-2670 bp - 1331 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 2 54147755-54148813(+) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 AGTGTGGTAGGTAGG
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SmilChr03G002309 Chr03 NC_080389.1:36328865-36328879promoter 内 3822-3836 bp - 165 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 1 36329044-36331922(+) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 ATGGTGGTAGGTGGC
SmilChr01G003701 Chr01 NC_080387.1:55402536-55402550promoter 内 3562-3576 bp - 425 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 1 55396510-55402111(-) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 GCCACCTACCACCAT
SmilChr01G001533 Chr01 NC_080387.1:29349255-29349269promoter 内 3314-3328 bp - 673 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 1 29345473-29348582(-) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 CGCACCTACCACCAG
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SmilChr01G001565 Chr01 NC_080387.1:29677073-29677087promoter 内 2781-2795 bp - 1206 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 1 29672780-29675867(-) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 CGCACCTACCACCAG