转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr04G001094; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00021820-RA_Salv SmilChr04G001094 WRKY XP_057804404.1 MP00408 AGCGTTGACTTTT

可能结合的靶基因

9902 个结合位点 8149 个候选靶基因 第 10 / 163 下载 TSV

上一页 10 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr03G001951 Chr03 NC_080389.1:27829016-27829028promoter 内 2245-2257 bp + 1744 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 1 27830772-27838316(+) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 AGCGTTGACTTGT
SmilChr05G002175 Chr05 NC_080391.1:23182658-23182670promoter 内 1925-1937 bp + 2064 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 1 23184734-23187820(+) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 AGCGTTGACTTGT
SmilChr06G001648 Chr06 NC_080392.1:18673551-18673563promoter 内 1554-1566 bp - 2435 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 1 18675998-18677570(+) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 CATAGTCAACGCC
SmilChr02G001068 Chr02 NC_080388.1:18996902-18996914promoter 内 1407-1419 bp - 2582 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 1 18992446-18994320(-) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 GTCGTTGACTTTA
SmilChr01G001074 Chr01 NC_080387.1:22162471-22162483promoter 内 1175-1187 bp + 2814 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 1 22157957-22159657(-) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 CATAGTCAACGCC
SmilChr08G001825 Chr08 NC_080394.1:15590119-15590131promoter 内 1138-1150 bp + 2851 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 1 15592982-15595066(+) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 GTCGTTGACTTTA
SmilChr05G000690 Chr05 NC_080391.1:5221195-5221207promoter 内 921-933 bp + 3068 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 1 5224275-5227206(+) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 GTCGTTGACTTTA
SmilChr08G002899 Chr08 NC_080394.1:28954564-28954576promoter 内 796-808 bp - 3193 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 1 28936597-28951371(-) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 AGCGTTGACTTGT
SmilChr01G000633 Chr01 NC_080387.1:14219945-14219957promoter 内 513-525 bp - 3476 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 1 14213891-14216469(-) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 TACGTTGACTTTG
SmilChr06G003001 Chr06 NC_080392.1:42879387-42879399promoter 内 498-510 bp - 3491 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 1 42882890-42884234(+) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 ACAAGTCAACGCT
SmilChr06G000891 Chr06 NC_080392.1:8420550-8420562promoter 内 406-418 bp + 3583 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 1 8424145-8424609(+) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 GTCGTTGACTTTA
SmilChr07G002824 Chr07 NC_080393.1:28301297-28301309promoter 内 361-373 bp + 3628 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 1 28293124-28297669(-) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 TAAAGTCAACGAC
SmilChr05G004003 Chr05 NC_080391.1:53947658-53947670promoter 内 144-156 bp + 3845 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 1 53941056-53943813(-) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 CAAAGTCAACGTA
SmilChr03G002439 Chr03 NC_080389.1:38736991-38737003promoter 内 1951-1963 bp + 2038 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 11 38739041-38739967(+) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 AGCGTTGACTTCG
SmilChr08G002190 Chr08 NC_080394.1:19780921-19780933promoter 内 2362-2374 bp - 1627 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 10 19782560-19787121(+) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 CGAAGTCAACGCT
SmilChr03G002440 Chr03 NC_080389.1:38736991-38737003promoter 内 727-739 bp + 3262 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 10 38740265-38741618(+) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 AGCGTTGACTTCG
SmilChr07G003235 Chr07 NC_080393.1:34320274-34320286promoter 内 2377-2389 bp + 1612 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 8 34314041-34318662(-) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 CGAAGTCAACGCT
SmilChr05G001134 Chr05 NC_080391.1:9470747-9470759promoter 内 2332-2344 bp - 1657 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 7 9472416-9475494(+) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 CGAAGTCAACGCT
SmilChr03G002323 Chr03 NC_080389.1:36577780-36577792promoter 内 2347-2359 bp - 1642 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 6 36579434-36582596(+) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 CGAAGTCAACGCT
SmilChr04G003423 Chr04 NC_080390.1:50822421-50822433promoter 内 2144-2156 bp - 1845 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 5 50817578-50820576(-) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 AGCGTTGACTTCG
SmilChr02G001204 Chr02 NC_080388.1:22201393-22201405promoter 内 2209-2221 bp - 1780 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 4 22198792-22199613(-) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 AGCGTTGACTTCG
SmilChr06G001694 Chr06 NC_080392.1:19356696-19356708promoter 内 696-708 bp + 3293 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 4 19360001-19363806(+) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 AGCGTTGACTTCG
SmilChr02G004956 Chr02 NC_080388.1:71508536-71508548promoter 内 3325-3337 bp + 664 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 3 71505615-71507872(-) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 GAAAGTCAACGAT
SmilChr02G004957 Chr02 NC_080388.1:71508536-71508548promoter 内 656-668 bp + 3333 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 3 71511881-71517933(+) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 ATCGTTGACTTTC
SmilChr05G000122 Chr05 NC_080391.1:949864-949876promoter 内 3545-3557 bp + 444 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 2 950320-959083(+) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 ATCGTTGACTTTC
SmilChr05G002647 Chr05 NC_080391.1:29904126-29904138promoter 内 3460-3472 bp + 529 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 2 29904667-29906354(+) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 AACGTTGACTTTC
SmilChr01G004042 Chr01 NC_080387.1:58832982-58832994promoter 内 2742-2754 bp - 1247 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 2 58828095-58831735(-) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 GGCGTTGACTCTT
SmilChr05G000121 Chr05 NC_080391.1:949864-949876promoter 内 1119-1131 bp + 2870 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 2 946289-946994(-) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 GAAAGTCAACGAT
SmilChr02G004287 Chr02 NC_080388.1:65184414-65184426promoter 内 233-245 bp - 3756 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 2 65174032-65180658(-) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 ATCGTTGACTTTC
SmilChr02G000544 Chr02 NC_080388.1:7500159-7500171promoter 内 3834-3846 bp + 155 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 1 7500326-7500844(+) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 GCCGTTGACTATG
SmilChr04G000125 Chr04 NC_080390.1:1067064-1067076promoter 内 3652-3664 bp - 337 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 1 1063140-1066727(-) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 AACGTTGACTTTC
SmilChr04G000347 Chr04 NC_080390.1:3257449-3257461promoter 内 2920-2932 bp - 1069 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 1 3258530-3258973(+) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 GGAAGTCAACGCC
SmilChr07G000246 Chr07 NC_080393.1:1585416-1585428promoter 内 2499-2511 bp - 1490 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 1 1582773-1583926(-) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 GCCGTTGACTATG
SmilChr03G000112 Chr03 NC_080389.1:1256223-1256235promoter 内 2406-2418 bp - 1583 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 1 1241646-1254640(-) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 GGCGTTGACTCTT
SmilChr06G003031 Chr06 NC_080392.1:43132248-43132260promoter 内 1868-1880 bp + 2121 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 1 43134381-43140020(+) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 AGCGTTGACTTCG
SmilChr01G000204 Chr01 NC_080387.1:3520332-3520344promoter 内 1498-1510 bp - 2491 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 1 3514613-3517841(-) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 GCCGTTGACTATG
SmilChr05G003087 Chr05 NC_080391.1:39065936-39065948promoter 内 593-605 bp + 3396 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 1 39069344-39070778(+) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 GGCGTTGACTTCC
SmilChr01G001666 Chr01 NC_080387.1:30754428-30754440promoter 内 466-478 bp - 3523 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 1 30748494-30750905(-) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 AGCGTTGACCTTG
SmilChr07G000248 Chr07 NC_080393.1:1585416-1585428promoter 内 355-367 bp - 3634 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 1 1589062-1590921(+) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 CATAGTCAACGGC
SmilChr07G000245 Chr07 NC_080393.1:1585416-1585428promoter 内 353-365 bp - 3636 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 1 1579872-1581780(-) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 GCCGTTGACTATG
SmilChr01G001772 Chr01 NC_080387.1:32639340-32639352promoter 内 193-205 bp + 3796 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 1 32630790-32635544(-) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 GAAAGTCAACGAT
SmilChr02G000543 Chr02 NC_080388.1:7500159-7500171promoter 内 62-74 bp + 3927 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 1 7493156-7496232(-) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 CATAGTCAACGGC
SmilChr06G000174 Chr06 NC_080392.1:1207349-1207361promoter 内 1800-1812 bp + 2189 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.8/ 100 3 1204193-1205160(-) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 AAAGGTCAACGGG
SmilChr03G001529 Chr03 NC_080389.1:19081173-19081185promoter 内 1262-1274 bp + 2727 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.8/ 100 2 19077686-19078446(-) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 CAAGGTCAACGGT
SmilChr07G001278 Chr07 NC_080393.1:9845216-9845228promoter 内 3524-3536 bp + 465 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.8/ 100 1 9841209-9844751(-) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 ACAAGTCAACGGT
SmilChr02G002704 Chr02 NC_080388.1:46888813-46888825promoter 内 2871-2883 bp - 1118 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.8/ 100 1 46882839-46887695(-) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 CGCGTTGACTTCT
SmilChr06G001617 Chr06 NC_080392.1:17983062-17983074promoter 内 2591-2603 bp + 1398 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.8/ 100 1 17978972-17981664(-) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 GGAAGTCAACGGC
SmilChr08G002925 Chr08 NC_080394.1:29320651-29320663promoter 内 2540-2552 bp - 1449 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.8/ 100 1 29316323-29319202(-) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 TGCGTTGACCTTT
SmilChr04G002136 Chr04 NC_080390.1:34347443-34347455promoter 内 2299-2311 bp + 1690 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.8/ 100 1 34341697-34345753(-) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 CAAGGTCAACGGT
SmilChr06G002258 Chr06 NC_080392.1:32002821-32002833promoter 内 2082-2094 bp - 1907 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.8/ 100 1 32004740-32005574(+) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 AAAGGTCAACGGG