转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr05G000260; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00013647-RA_Salv SmilChr05G000260 bZIP XP_057763683.1 MP00040 TGCTGACGTGGC

可能结合的靶基因

9919 个结合位点 6920 个候选靶基因 第 101 / 139 下载 TSV

上一页 101 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr02G003617 Chr02 NC_080388.1:57445491-57445502promoter 内 3644-3655 bp + 346 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 57441488-57445145(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GCCACGTGTCAA
SmilChr01G005388 Chr01 NC_080387.1:71174826-71174837promoter 内 3619-3630 bp + 371 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 71175208-71178122(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 CGTGGACGTGGG
SmilChr02G002073 Chr02 NC_080388.1:37325539-37325550promoter 内 3584-3595 bp + 406 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 37325956-37330395(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 CTGAGACGTGGA
SmilChr02G003293 Chr02 NC_080388.1:54213349-54213360promoter 内 3576-3587 bp + 414 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 54206696-54212935(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TCCACGTCTCAC
SmilChr04G003566 Chr04 NC_080390.1:52029347-52029358promoter 内 3557-3568 bp - 433 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 52024493-52028914(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 ACGAGACGTGGA
SmilChr02G000566 Chr02 NC_080388.1:7988137-7988148promoter 内 3548-3559 bp + 442 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 7980525-7987695(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 ACCACGTCTCAC
SmilChr01G002214 Chr01 NC_080387.1:38481355-38481366promoter 内 3523-3534 bp - 467 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 38481833-38482558(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 CCCACGTCTCAT
SmilChr02G001226 Chr02 NC_080388.1:22543788-22543799promoter 内 3462-3473 bp - 528 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 22542391-22543260(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 CGTGGACGTGGG
SmilChr02G001753 Chr02 NC_080388.1:32243857-32243868promoter 内 3457-3468 bp + 533 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 32242239-32243324(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 ACCACGTCTCTG
SmilChr03G001114 Chr03 NC_080389.1:12850888-12850899promoter 内 3409-3420 bp - 581 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 12851480-12855465(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TACACGTCAGTA
SmilChr04G001657 Chr04 NC_080390.1:27548860-27548871promoter 内 3406-3417 bp - 584 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 27547765-27548276(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 CCTAGACGTGGA
SmilChr02G002477 Chr02 NC_080388.1:43152247-43152258promoter 内 3159-3170 bp - 831 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 43153089-43160224(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TACACGTCAGTA
SmilChr03G000385 Chr03 NC_080389.1:4282054-4282065promoter 内 3155-3166 bp - 835 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 4282900-4291525(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 CCCACGTCTTTG
SmilChr04G001360 Chr04 NC_080390.1:22080133-22080144promoter 内 3102-3113 bp + 888 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 22081032-22087702(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GGTGGACGTGGG
SmilChr04G000834 Chr04 NC_080390.1:10476017-10476028promoter 内 3089-3100 bp - 901 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 10476929-10478260(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GCTACGTCAGGA
SmilChr01G000656 Chr01 NC_080387.1:14620317-14620328promoter 内 3084-3095 bp - 906 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 14614324-14619411(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 AAGAGACGTGGG
SmilChr02G005443 Chr02 NC_080388.1:74806081-74806092promoter 内 3059-3070 bp + 931 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 74807023-74811315(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TAGACACGTGGC
SmilChr03G003657 Chr03 NC_080389.1:55405692-55405703promoter 内 3021-3032 bp + 969 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 55402730-55404723(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GCCACGTGTCAA
SmilChr02G002087 Chr02 NC_080388.1:37455232-37455243promoter 内 2960-2971 bp - 1030 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 37456273-37458321(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TCCACGTCTTGC
SmilChr04G003400 Chr04 NC_080390.1:50551671-50551682promoter 内 2934-2945 bp - 1056 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 50549416-50550615(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 ATGAGACGTGGG
SmilChr02G004559 Chr02 NC_080388.1:68110813-68110824promoter 内 2915-2926 bp - 1075 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 68111899-68113130(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 CCCACGTCCACC
SmilChr04G002383 Chr04 NC_080390.1:38372923-38372934promoter 内 2868-2879 bp + 1122 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 38369075-38371801(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 CCCACGTCCACC
SmilChr01G001786 Chr01 NC_080387.1:32736948-32736959promoter 内 2811-2822 bp + 1179 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 32738138-32740854(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TCCTGACGTTGC
SmilChr04G000391 Chr04 NC_080390.1:3997374-3997385promoter 内 2804-2815 bp + 1186 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 3992879-3996188(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 ACCACGTCTTGG
SmilChr01G003377 Chr01 NC_080387.1:52458374-52458385promoter 内 2709-2720 bp + 1281 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 52451698-52457093(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 CCCACGTCCTCG
SmilChr01G003986 Chr01 NC_080387.1:58301016-58301027promoter 内 2658-2669 bp - 1332 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 58299614-58299684(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 CAGAGACGTGGA
SmilChr01G002250 Chr01 NC_080387.1:39126191-39126202promoter 内 2652-2663 bp + 1338 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 39124182-39124853(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 CCCACGTCTTGT
SmilChr01G000441 Chr01 NC_080387.1:8924406-8924417promoter 内 2643-2654 bp + 1347 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 8925764-8930684(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TGGGCACGTGGC
SmilChr02G001341 Chr02 NC_080388.1:24987659-24987670promoter 内 2642-2653 bp + 1348 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 24989018-24994857(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GTAAGACGTGGG
SmilChr05G000441 Chr05 NC_080391.1:3338460-3338471promoter 内 2603-2614 bp + 1387 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 3335967-3337073(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 CCCACGTCTCAT
SmilChr03G002175 Chr03 NC_080389.1:33796000-33796011promoter 内 2596-2607 bp - 1394 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 33788937-33794606(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 ATGAGACGTGGG
SmilChr03G004360 Chr03 NC_080389.1:61839564-61839575promoter 内 2550-2561 bp + 1440 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 61841015-61841767(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TTGACACGTGGC
SmilChr01G003936 Chr01 NC_080387.1:57665968-57665979promoter 内 2517-2528 bp + 1473 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 57663503-57664495(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GCCACGTGTCAA
SmilChr03G002705 Chr03 NC_080389.1:42998515-42998526promoter 内 2514-2525 bp - 1476 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 43000002-43017483(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TACACGTCAGAA
SmilChr02G002198 Chr02 NC_080388.1:39224278-39224289promoter 内 2484-2495 bp + 1506 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 39225795-39226538(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 CTGAGACGTGGA
SmilChr01G001390 Chr01 NC_080387.1:27321457-27321468promoter 内 2456-2467 bp - 1534 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 27323002-27328058(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GCCACGTGTCAA
SmilChr04G001543 Chr04 NC_080390.1:25529624-25529635promoter 内 2341-2352 bp + 1649 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 25524323-25527975(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TCCACGTCTAGC
SmilChr01G001507 Chr01 NC_080387.1:28899424-28899435promoter 内 2281-2292 bp - 1709 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 28901144-28904373(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 CCCACGTCTTTC
SmilChr02G002445 Chr02 NC_080388.1:42685420-42685431promoter 内 2257-2268 bp - 1733 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 42687164-42687237(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 ACCACGTCTCTC
SmilChr05G000377 Chr05 NC_080391.1:2829855-2829866promoter 内 2232-2243 bp + 1758 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 2831624-2833390(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 CCTAGACGTGGT
SmilChr02G004164 Chr02 NC_080388.1:63958952-63958963promoter 内 2209-2220 bp - 1781 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 63960744-63963558(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GCCACGTGTCAA
SmilChr01G001158 Chr01 NC_080387.1:23537675-23537686promoter 内 2183-2194 bp + 1807 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 23531645-23535868(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 ACCACGTCTCTC
SmilChr01G002572 Chr01 NC_080387.1:43820846-43820857promoter 内 2174-2185 bp - 1816 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 43815300-43819030(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GCTAGACGTGGT
SmilChr01G003987 Chr01 NC_080387.1:58301016-58301027promoter 内 2153-2164 bp - 1837 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 58302864-58303077(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TCCACGTCTCTG
SmilChr05G000049 Chr05 NC_080391.1:227685-227696promoter 内 2130-2141 bp + 1860 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 229556-230703(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GTAAGACGTGGG
SmilChr02G002865 Chr02 NC_080388.1:48818836-48818847promoter 内 2100-2111 bp - 1890 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 48813301-48816946(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GTGAGACGTGGT
SmilChr02G002428 Chr02 NC_080388.1:42266354-42266365promoter 内 2063-2074 bp + 1927 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 42268292-42268364(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TTCTGACGTGTT
SmilChr05G000048 Chr05 NC_080391.1:230368-230379promoter 内 2037-2048 bp + 1953 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 226007-228415(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 ACCACGTCTCGT
SmilChr04G003669 Chr04 NC_080390.1:53133371-53133382promoter 内 2026-2037 bp + 1964 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 53130248-53131407(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 CCCACGTCCTCG
SmilChr04G003909 Chr04 NC_080390.1:54830856-54830867promoter 内 1972-1983 bp + 2018 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 54832885-54835347(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TTGACACGTGGC