转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr02G003688; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00003637-RA_Salv SmilChr02G003688 MYB XP_057794248.1 MP00028 GGCTCAGCGCG

可能结合的靶基因

9024 个结合位点 6764 个候选靶基因 第 105 / 136 下载 TSV

上一页 105 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr03G001683 Chr03 NC_080389.1:22215336-22215346promoter 内 595-605 bp - 3396 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 1 22208652-22211940(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TTCTCAGCGCC
SmilChr02G005158 Chr02 NC_080388.1:72932117-72932127promoter 内 517-527 bp + 3474 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 1 72935601-72936998(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CTCTCAGCGCT
SmilChr04G001958 Chr04 NC_080390.1:31794863-31794873promoter 内 501-511 bp + 3490 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 1 31790335-31791373(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GTCGCTGAGCA
SmilChr01G004750 Chr01 NC_080387.1:65678745-65678755promoter 内 452-462 bp + 3539 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 1 65682294-65684219(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGCTCAGCGAT
SmilChr01G005779 Chr01 NC_080387.1:73900348-73900358promoter 内 410-420 bp - 3581 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 1 73903939-73906440(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GTCGCTGAGCA
SmilChr06G002536 Chr06 NC_080392.1:36394417-36394427promoter 内 324-334 bp - 3667 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 1 36388679-36390750(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TTCTCAGCGCC
SmilChr01G004809 Chr01 NC_080387.1:66291628-66291638promoter 内 289-299 bp + 3702 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 1 66295340-66297444(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TTCTCAGCGCC
SmilChr02G001965 Chr02 NC_080388.1:35566336-35566346promoter 内 288-298 bp - 3703 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 1 35570049-35571466(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TGCTCTGAGCC
SmilChr08G000202 Chr08 NC_080394.1:1371844-1371854promoter 内 275-285 bp - 3716 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 1 1375570-1382145(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TGCTCTGAGCC
SmilChr04G003612 Chr04 NC_080390.1:52619026-52619036promoter 内 269-279 bp - 3722 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 1 52606022-52615304(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGCTCAGAGCA
SmilChr01G005620 Chr01 NC_080387.1:72686783-72686793promoter 内 243-253 bp + 3748 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 1 72690541-72694629(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TTCTCAGCGCC
SmilChr07G001919 Chr07 NC_080393.1:16611814-16611824promoter 内 233-243 bp + 3758 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 1 16603842-16608056(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TGCTCTGAGCC
SmilChr01G004879 Chr01 NC_080387.1:66878255-66878265promoter 内 183-193 bp - 3808 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 1 66882073-66884023(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TCTGCTGAGCC
SmilChr08G000536 Chr08 NC_080394.1:3903733-3903743promoter 内 183-193 bp - 3808 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 1 3899042-3899925(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGCTCAGAGCA
SmilChr02G002523 Chr02 NC_080388.1:43884059-43884069promoter 内 3643-3653 bp - 348 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 3 43884417-43886031(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TGGGCTGAGCA
SmilChr01G000441 Chr01 NC_080387.1:8924804-8924814promoter 内 3041-3051 bp - 950 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 2 8925764-8930684(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CCCGCTGAGAA
SmilChr03G003077 Chr03 NC_080389.1:47782899-47782909promoter 内 2977-2987 bp - 1014 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 2 47783923-47784459(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TGGGCTGAGCA
SmilChr03G003075 Chr03 NC_080389.1:47781088-47781098promoter 内 2850-2860 bp + 1141 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 2 47777344-47779947(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TGGGCTGAGCA
SmilChr06G001174 Chr06 NC_080392.1:11950010-11950020promoter 内 2064-2074 bp - 1927 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 2 11951947-11952390(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CTCGCTGAGTG
SmilChr03G001668 Chr03 NC_080389.1:21691574-21691584promoter 内 387-397 bp + 3604 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 2 21684929-21687970(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CTCGCTGAGGA
SmilChr05G002187 Chr05 NC_080391.1:23357504-23357514promoter 内 3969-3979 bp + 22 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 23357536-23363109(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 ATCTCAGCGGC
SmilChr02G004583 Chr02 NC_080388.1:68328351-68328361promoter 内 3958-3968 bp - 33 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 68312853-68328318(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TGCTCAGCCCA
SmilChr05G003797 Chr05 NC_080391.1:51295453-51295463promoter 内 3834-3844 bp - 157 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 51295620-51298508(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CACGCTGAGAG
SmilChr03G001102 Chr03 NC_080389.1:12678119-12678129promoter 内 3823-3833 bp - 168 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 12678297-12684786(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CCCGCTGAGAA
SmilChr07G000293 Chr07 NC_080393.1:1900888-1900898promoter 内 3781-3791 bp + 210 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 1896403-1900678(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TGGGCTGAGCA
SmilChr01G005735 Chr01 NC_080387.1:73480558-73480568promoter 内 3774-3784 bp - 217 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 73479335-73480341(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TGCTCAGCCCA
SmilChr01G002405 Chr01 NC_080387.1:41411422-41411432promoter 内 3768-3778 bp - 223 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 41411060-41411199(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CTCTCAGCGTG
SmilChr06G002706 Chr06 NC_080392.1:39064074-39064084promoter 内 3753-3763 bp - 238 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 39064322-39069066(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GCCGCTGAGAT
SmilChr05G003805 Chr05 NC_080391.1:51361156-51361166promoter 内 3738-3748 bp - 253 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 51361419-51364198(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CACGCTGAGAG
SmilChr01G001676 Chr01 NC_080387.1:30955757-30955767promoter 内 3687-3697 bp - 304 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 30953499-30955453(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CACTCAGCGAG
SmilChr02G004121 Chr02 NC_080388.1:63483048-63483058promoter 内 3599-3609 bp + 392 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 63483450-63491767(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TGCTCAGCCCA
SmilChr02G005070 Chr02 NC_080388.1:72373250-72373260promoter 内 3597-3607 bp + 394 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 72370778-72372856(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TGGGCTGAGCA
SmilChr02G003322 Chr02 NC_080388.1:54480664-54480674promoter 内 3521-3531 bp + 470 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 54473930-54480194(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CTCGCTGAGGA
SmilChr08G003527 Chr08 NC_080394.1:37877201-37877211promoter 内 3383-3393 bp + 608 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 37875183-37876593(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TGGGCTGAGCA
SmilChr08G003529 Chr08 NC_080394.1:37882564-37882574promoter 内 3383-3393 bp + 608 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 37880544-37881956(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TGGGCTGAGCA
SmilChr01G004792 Chr01 NC_080387.1:66157842-66157852promoter 内 3378-3388 bp + 613 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 66158465-66160292(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CACTCAGCGAG
SmilChr03G003076 Chr03 NC_080389.1:47782899-47782909promoter 内 3376-3386 bp - 615 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 47781488-47782284(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TGCTCAGCCCA
SmilChr07G003941 Chr07 NC_080393.1:49786120-49786130promoter 内 3324-3334 bp + 667 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 49786797-49787599(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GCTTCAGCGCA
SmilChr07G003952 Chr07 NC_080393.1:50014587-50014597promoter 内 3324-3334 bp + 667 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 50015264-50016495(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GCTTCAGCGCA
SmilChr04G001265 Chr04 NC_080390.1:20073689-20073699promoter 内 3301-3311 bp + 690 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 20070177-20072999(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CACGCTGAGAG
SmilChr03G000481 Chr03 NC_080389.1:5123203-5123213promoter 内 3268-3278 bp - 723 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 5118033-5122480(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TCCTCAGCGAG
SmilChr01G004601 Chr01 NC_080387.1:63994661-63994671promoter 内 3235-3245 bp + 756 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 63995427-64002877(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TCCTCAGCGAG
SmilChr07G000002 Chr07 NC_080393.1:1173-1183promoter 内 1173-1183 bp + 756 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 1939-3355(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TGCTCAGCCCA
SmilChr06G001142 Chr06 NC_080392.1:11497787-11497797promoter 内 3208-3218 bp - 783 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 11492651-11497004(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CACTCAGCGAG
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SmilChr04G000829 Chr04 NC_080390.1:10447327-10447337promoter 内 3146-3156 bp + 845 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 10448182-10451174(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GCTTCAGCGCA
SmilChr04G003184 Chr04 NC_080390.1:48549599-48549609promoter 内 3049-3059 bp + 942 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 48548265-48548657(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TGGGCTGAGCA
SmilChr01G000591 Chr01 NC_080387.1:12876975-12876985promoter 内 3033-3043 bp + 958 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 12877943-12878883(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TGCTCAGCCCA
SmilChr04G000363 Chr04 NC_080390.1:3640414-3640424promoter 内 3016-3026 bp + 975 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 3641399-3644058(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TGCTCAGCCCA
SmilChr01G004076 Chr01 NC_080387.1:59205314-59205324promoter 内 3004-3014 bp + 987 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 59201299-59204327(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GCCGCTGAGAT