转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr08G002543; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00020892-RA_Salv SmilChr08G002543 bZIP XP_057778423.1 MP00303 ACCAGCTGTCA

可能结合的靶基因

9868 个结合位点 7416 个候选靶基因 第 107 / 149 下载 TSV

上一页 107 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr01G000430 Chr01 NC_080387.1:8591871-8591881promoter 内 3945-3955 bp - 46 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 8591927-8592436(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GTACAGCTGGT
SmilChr04G003415 Chr04 NC_080390.1:50763735-50763745promoter 内 3945-3955 bp - 46 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 50763791-50764399(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GTACAGCTGGT
SmilChr02G001647 Chr02 NC_080388.1:30569651-30569661promoter 内 3902-3912 bp - 89 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 30568957-30569562(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 ACTAGCTGTCT
SmilChr03G001336 Chr03 NC_080389.1:15599044-15599054promoter 内 3874-3884 bp - 117 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 15595801-15598927(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TATGGCTGTCA
SmilChr02G001710 Chr02 NC_080388.1:31500972-31500982promoter 内 3861-3871 bp + 130 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 31501112-31504383(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TATGGCTGTCA
SmilChr05G002867 Chr05 NC_080391.1:34273027-34273037promoter 内 3849-3859 bp + 142 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 34266991-34272885(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCCATA
SmilChr05G002152 Chr05 NC_080391.1:22741962-22741972promoter 内 3846-3856 bp + 145 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 22742117-22744510(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CTTGGCTGTCA
SmilChr06G002498 Chr06 NC_080392.1:35870241-35870251promoter 内 3784-3794 bp - 207 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 35865010-35870034(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TATGGCTGTCA
SmilChr04G003314 Chr04 NC_080390.1:49878847-49878857promoter 内 3637-3647 bp + 354 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 49879211-49885029(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CATAGCTGTCG
SmilChr07G001438 Chr07 NC_080393.1:11151706-11151716promoter 内 3581-3591 bp - 410 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 11152126-11154133(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CGACAGCTTAT
SmilChr04G000309 Chr04 NC_080390.1:2853561-2853571promoter 内 3476-3486 bp + 515 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 2854086-2855614(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 ATAAGCTGTCG
SmilChr04G001728 Chr04 NC_080390.1:28518065-28518075promoter 内 3449-3459 bp - 542 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 28518617-28519920(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 ATACAGCTGGC
SmilChr07G003077 Chr07 NC_080393.1:32409006-32409016promoter 内 3329-3339 bp + 662 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 32409678-32410881(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 ATAAGCTGTCG
SmilChr05G004341 Chr05 NC_080391.1:57061608-57061618promoter 内 3324-3334 bp - 667 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 57062285-57064541(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCCAAG
SmilChr07G001986 Chr07 NC_080393.1:17494633-17494643promoter 内 3206-3216 bp - 785 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 17490742-17493848(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 ACCAGCTGTAC
SmilChr04G004054 Chr04 NC_080390.1:55706167-55706177promoter 内 3186-3196 bp - 805 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 55706982-55707053(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCCATA
SmilChr01G003399 Chr01 NC_080387.1:52701073-52701083promoter 内 3149-3159 bp - 842 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 52698126-52700231(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TATGGCTGTCA
SmilChr01G005923 Chr01 NC_080387.1:75041690-75041700promoter 内 3133-3143 bp + 858 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 75042558-75043921(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TATGGCTGTCA
SmilChr06G002726 Chr06 NC_080392.1:39368015-39368025promoter 内 3088-3098 bp - 903 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 39364115-39367112(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CTTGGCTGTCA
SmilChr05G000678 Chr05 NC_080391.1:5171069-5171079promoter 内 3048-3058 bp - 943 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 5172022-5181461(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCCAAG
SmilChr07G001181 Chr07 NC_080393.1:8950587-8950597promoter 内 3033-3043 bp - 958 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 8947016-8949629(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CTTGGCTGTCA
SmilChr07G001183 Chr07 NC_080393.1:8966114-8966124promoter 内 3033-3043 bp - 958 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 8962544-8965156(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CTTGGCTGTCA
SmilChr05G002493 Chr05 NC_080391.1:27610518-27610528promoter 内 2974-2984 bp + 1017 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 27608457-27609501(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCCAAG
SmilChr01G005610 Chr01 NC_080387.1:72647660-72647670promoter 内 2967-2977 bp + 1024 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 72648694-72652315(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 ACCAGCTGTAC
SmilChr03G002916 Chr03 NC_080389.1:45910796-45910806promoter 内 2959-2969 bp + 1032 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 45911838-45916057(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TATGGCTGTCA
SmilChr02G003119 Chr02 NC_080388.1:52213078-52213088promoter 内 2915-2925 bp + 1076 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 52210869-52212002(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCCAAG
SmilChr03G002068 Chr03 NC_080389.1:31586515-31586525promoter 内 2821-2831 bp - 1170 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 31585239-31585345(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CATAGCTGTCG
SmilChr04G001141 Chr04 NC_080390.1:16814741-16814751promoter 内 2800-2810 bp - 1191 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 16808700-16813550(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CTTGGCTGTCA
SmilChr03G002069 Chr03 NC_080389.1:31586515-31586525promoter 内 2795-2805 bp - 1196 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 31587721-31590478(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CGACAGCTATG
SmilChr04G002640 Chr04 NC_080390.1:41801772-41801782promoter 内 2795-2805 bp + 1196 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 41799818-41800576(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCCAAG
SmilChr03G003294 Chr03 NC_080389.1:51043550-51043560promoter 内 2790-2800 bp - 1201 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 51044761-51045769(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCCAAG
SmilChr05G002210 Chr05 NC_080391.1:23567383-23567393promoter 内 2780-2790 bp - 1211 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 23562165-23566172(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 ATAAGCTGTCG
SmilChr05G002219 Chr05 NC_080391.1:23730046-23730056promoter 内 2719-2729 bp - 1272 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 23724777-23728774(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 ATAAGCTGTCG
SmilChr02G003034 Chr02 NC_080388.1:51054251-51054261promoter 内 2519-2529 bp - 1472 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 51055733-51058690(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CGACAGCTTAT
SmilChr07G002063 Chr07 NC_080393.1:18763686-18763696promoter 内 2470-2480 bp + 1521 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 18765217-18768201(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 ACCAGCTGTAC
SmilChr01G003080 Chr01 NC_080387.1:49642686-49642696promoter 内 2451-2461 bp - 1540 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 49644236-49647282(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCCAAG
SmilChr04G002544 Chr04 NC_080390.1:40743367-40743377promoter 内 2437-2447 bp + 1554 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 40741741-40741813(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCCAAG
SmilChr04G000063 Chr04 NC_080390.1:577607-577617promoter 内 2381-2391 bp + 1610 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 571834-575997(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AGACAGCTAGT
SmilChr04G000302 Chr04 NC_080390.1:2791273-2791283promoter 内 2345-2355 bp + 1646 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 2792929-2793843(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TATGGCTGTCA
SmilChr06G002387 Chr06 NC_080392.1:34679589-34679599promoter 内 2327-2337 bp - 1664 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 34681263-34684019(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CGACAGCTTAT
SmilChr07G001827 Chr07 NC_080393.1:15765131-15765141promoter 内 2302-2312 bp - 1689 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 15766830-15768964(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CGACAGCTTAT
SmilChr05G002006 Chr05 NC_080391.1:20754601-20754611promoter 内 2234-2244 bp - 1757 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 20756368-20756468(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCCAAG
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SmilChr03G001942 Chr03 NC_080389.1:27668193-27668203promoter 内 2198-2208 bp + 1793 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 27664212-27666400(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 ATACAGCTGGC
SmilChr04G002543 Chr04 NC_080390.1:40743367-40743377promoter 内 2198-2208 bp + 1793 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 40739975-40741574(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCCAAG
SmilChr07G001904 Chr07 NC_080393.1:16446367-16446377promoter 内 2193-2203 bp + 1798 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 16441055-16444569(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCCAAG
SmilChr05G004122 Chr05 NC_080391.1:55117706-55117716promoter 内 2185-2195 bp - 1806 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 55115101-55115900(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TATGGCTGTCA
SmilChr04G003860 Chr04 NC_080390.1:54549998-54550008promoter 内 2133-2143 bp + 1858 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 54544578-54548140(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AGACAGCTAGT
SmilChr06G001219 Chr06 NC_080392.1:12570515-12570525promoter 内 2133-2143 bp - 1858 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 12572383-12573895(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CGACAGCTTAT
SmilChr05G002007 Chr05 NC_080391.1:20754601-20754611promoter 内 2060-2070 bp - 1931 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 20756542-20756615(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCCAAG