转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr01G004552; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00011094-RA_Salv SmilChr01G004552 bZIP XP_057786668.1 MP00409 AATGGACACGTGGCA

可能结合的靶基因

8429 个结合位点 6252 个候选靶基因 第 108 / 126 下载 TSV

上一页 108 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr05G002169 Chr05 NC_080391.1:23017522-23017536promoter 内 3940-3954 bp - 47 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.9/ 100 1 23017583-23023623(+) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 CGCCACGTGTAGAAG
SmilChr07G000055 Chr07 NC_080393.1:240477-240491promoter 内 3921-3935 bp - 66 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.9/ 100 1 240557-241082(+) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 ATCCACGTGGCCTCA
SmilChr03G004443 Chr03 NC_080389.1:62561708-62561722promoter 内 3918-3932 bp + 69 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.9/ 100 1 62561791-62572113(+) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 ATATCCTACGTGGCA
SmilChr02G000480 Chr02 NC_080388.1:6586591-6586605promoter 内 3911-3925 bp - 76 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.9/ 100 1 6584781-6586515(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 CAAGTTGACGTGGCT
SmilChr04G002906 Chr04 NC_080390.1:45324864-45324878promoter 内 3872-3886 bp + 115 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.9/ 100 1 45324993-45326126(+) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 CTAAAACACGTGTCG
SmilChr04G003893 Chr04 NC_080390.1:54728645-54728659promoter 内 3845-3859 bp + 142 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.9/ 100 1 54728801-54730380(+) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 CCGCCCCACGTGGCC
SmilChr02G001461 Chr02 NC_080388.1:27316849-27316863promoter 内 3828-3842 bp - 159 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.9/ 100 1 27317022-27319718(+) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 GGCCACGTAAGCAGC
SmilChr03G004344 Chr03 NC_080389.1:61727791-61727805promoter 内 3803-3817 bp - 184 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.9/ 100 1 61727989-61734910(+) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 GTCCACGTGTGCAAT
SmilChr08G000207 Chr08 NC_080394.1:1406378-1406392promoter 内 3699-3713 bp - 288 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.9/ 100 1 1404517-1406090(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 TATTCCTACGTGGCA
SmilChr03G004343 Chr03 NC_080389.1:61727791-61727805promoter 内 3666-3680 bp - 321 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.9/ 100 1 61724727-61727470(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 ATTGCACACGTGGAC
SmilChr05G000400 Chr05 NC_080391.1:3008568-3008582promoter 内 3661-3675 bp - 326 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.9/ 100 1 3008908-3013875(+) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 TGCCACGTATTAAGT
SmilChr04G002905 Chr04 NC_080390.1:45324864-45324878promoter 内 3617-3631 bp + 370 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.9/ 100 1 45323556-45324494(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 CGACACGTGTTTTAG
SmilChr07G000010 Chr07 NC_080393.1:40788-40802promoter 内 3542-3556 bp - 445 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.9/ 100 1 41247-46652(+) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 CGCCACGTTGCCACA
SmilChr01G004690 Chr01 NC_080387.1:64954243-64954257promoter 内 3536-3550 bp - 451 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.9/ 100 1 64934331-64953792(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 ACGACAGACGTGGCT
SmilChr03G001102 Chr03 NC_080389.1:12677719-12677733promoter 内 3423-3437 bp + 564 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.9/ 100 1 12678297-12684786(+) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 ATATCCTACGTGGCA
SmilChr07G000644 Chr07 NC_080393.1:4337934-4337948promoter 内 3389-3403 bp + 598 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.9/ 100 1 4335201-4337336(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 TGCCACGTAAGATTA
SmilChr02G000037 Chr02 NC_080388.1:466287-466301promoter 内 3261-3275 bp + 726 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.9/ 100 1 467027-467542(+) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 ATATCCTACGTGGCA
SmilChr03G001295 Chr03 NC_080389.1:15157246-15157260promoter 内 3052-3066 bp + 935 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.9/ 100 1 15153383-15156311(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 TGCCACGTAAGATTA
SmilChr05G004308 Chr05 NC_080391.1:56771454-56771468promoter 内 3017-3031 bp + 970 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.9/ 100 1 56772438-56773515(+) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 TTTATCGACGTGGCG
SmilChr01G004103 Chr01 NC_080387.1:59506940-59506954promoter 内 2750-2764 bp - 1237 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.9/ 100 1 59503982-59505703(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 TAATCTTACGTGGCA
SmilChr02G000320 Chr02 NC_080388.1:4007137-4007151promoter 内 2747-2761 bp + 1240 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.9/ 100 1 4008391-4009094(+) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 ACTTAATACGTGGCA
SmilChr06G001971 Chr06 NC_080392.1:24871856-24871870promoter 内 2736-2750 bp - 1251 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.9/ 100 1 24873121-24875368(+) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 TGCCACGTAGGATAT
SmilChr07G000054 Chr07 NC_080393.1:240477-240491promoter 内 2631-2645 bp - 1356 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.9/ 100 1 236810-239121(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 TGAGGCCACGTGGAT
SmilChr01G000570 Chr01 NC_080387.1:11836682-11836696promoter 内 2629-2643 bp - 1358 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.9/ 100 1 11838054-11840706(+) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 GGCCACGTCTTGGGT
SmilChr07G000009 Chr07 NC_080393.1:40788-40802promoter 内 2547-2561 bp - 1440 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.9/ 100 1 32209-39348(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 TGTGGCAACGTGGCG
SmilChr05G002727 Chr05 NC_080391.1:31378834-31378848promoter 内 2546-2560 bp - 1441 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.9/ 100 1 31380289-31384080(+) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 CGCCACGTCGATTTA
SmilChr02G004414 Chr02 NC_080388.1:66493119-66493133promoter 内 2543-2557 bp - 1444 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.9/ 100 1 66486928-66491675(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 TATTACTACGTGGCA
SmilChr08G003662 Chr08 NC_080394.1:40397163-40397177promoter 内 2513-2527 bp - 1474 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.9/ 100 1 40398651-40400882(+) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 TGCCACGTAGGATAT
SmilChr05G001908 Chr05 NC_080391.1:19336468-19336482promoter 内 2508-2522 bp + 1479 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.9/ 100 1 19326899-19334989(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 TGCCACGTAGGATAT
SmilChr07G003271 Chr07 NC_080393.1:34479437-34479451promoter 内 2474-2488 bp + 1513 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.9/ 100 1 34472958-34477924(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 GGCCACGTATGCAAA
SmilChr08G004721 Chr08 NC_080394.1:56629790-56629804promoter 内 2451-2465 bp + 1536 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.9/ 100 1 56631340-56634500(+) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 AGCTGACACGTGGAG
SmilChr05G002380 Chr05 NC_080391.1:26219466-26219480promoter 内 2353-2367 bp - 1634 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.9/ 100 1 26215340-26217832(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 GGCGGTCACGTGGAT
SmilChr03G000767 Chr03 NC_080389.1:8783143-8783157promoter 内 2341-2355 bp + 1646 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.9/ 100 1 8779824-8781497(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 TTCCACGTGTTGACT
SmilChr08G001780 Chr08 NC_080394.1:15006576-15006590promoter 内 2138-2152 bp + 1849 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.9/ 100 1 15008439-15010005(+) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 TAGATCGACGTGGCG
SmilChr08G001361 Chr08 NC_080394.1:10884042-10884056promoter 内 2106-2120 bp - 1881 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.9/ 100 1 10882086-10882161(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 ATATCCTACGTGGCA
SmilChr01G001724 Chr01 NC_080387.1:32919028-32919042promoter 内 2093-2107 bp + 1894 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.9/ 100 1 31775044-32917134(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 TGCCACGTAGGATAT
SmilChr07G000073 Chr07 NC_080393.1:336429-336443promoter 内 2003-2017 bp + 1984 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.9/ 100 1 338427-346969(+) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 GTATATCACGTGGAA
SmilChr07G004672 Chr07 NC_080393.1:59670314-59670328promoter 内 1924-1938 bp - 2063 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.9/ 100 1 59672391-59672807(+) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 AGACACGTGTTACAC
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SmilChr08G002829 Chr08 NC_080394.1:28152074-28152088promoter 内 1883-1897 bp + 2104 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.9/ 100 1 28154192-28158290(+) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 AGTACACACGTGTCT
SmilChr02G004415 Chr02 NC_080388.1:66493119-66493133promoter 内 1873-1887 bp - 2114 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.9/ 100 1 66495247-66496458(+) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 TGCCACGTAGTAATA
SmilChr08G000206 Chr08 NC_080394.1:1406378-1406392promoter 内 1826-1840 bp - 2161 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.9/ 100 1 1400831-1404217(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 TATTCCTACGTGGCA
SmilChr01G000926 Chr01 NC_080387.1:19643745-19643759promoter 内 1773-1787 bp - 2214 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.9/ 100 1 19638550-19641531(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 ACTTAATACGTGGCA
SmilChr07G002969 Chr07 NC_080393.1:30203010-30203024promoter 内 1760-1774 bp - 2227 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.9/ 100 1 30200280-30200783(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 TGTGGCAACGTGGCG
SmilChr05G001248 Chr05 NC_080391.1:10617764-10617778promoter 内 1719-1733 bp + 2268 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.9/ 100 1 10620046-10625383(+) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 CTTGGCAACGTGGCA
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SmilChr06G002202 Chr06 NC_080392.1:30562728-30562742promoter 内 1701-1715 bp + 2286 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.9/ 100 1 30565028-30568746(+) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 CACGTCGACGTGGCC
SmilChr07G000224 Chr07 NC_080393.1:1433216-1433230promoter 内 1566-1580 bp - 2421 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.9/ 100 1 1435651-1439213(+) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 AGCCACGTCTACGAT
SmilChr06G001240 Chr06 NC_080392.1:12787761-12787775promoter 内 1532-1546 bp + 2455 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.9/ 100 1 12784414-12785306(-) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 TGCCACGTAGGATAT
SmilChr06G001566 Chr06 NC_080392.1:17102087-17102101promoter 内 1512-1526 bp + 2475 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.9/ 100 1 17104576-17107542(+) SMil_00011094-RA_Salv MP00409 ATATCCTACGTGGCA