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转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family，查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中，并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因，不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif；应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引，可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card，点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
SmilChr04G003117 XP_057809539.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr04G003114 XP_057809538.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr01G005298 XP_057788621.1
ARR-B 1
MP00010
 8344 9778 查靶基因
SmilChr03G003924 XP_057798851.1
NAC 1
MP00059
 8333 9940 查靶基因
SmilChr01G005344 XP_057788686.1
MYB 1
MP00296
 8304 9873 查靶基因
SmilChr08G004408 XP_057780613.1
MYB 1
MP00114
 8151 9897 查靶基因
SmilChr04G001094 XP_057804404.1
WRKY 1
MP00408
 8149 9902 查靶基因
SmilChr07G003597 XP_057773587.1
Nin-like 1
MP00449
 8096 9453 查靶基因
SmilChr02G005433 XP_057792682.1
WRKY 1
MP00209
 8083 9910 查靶基因
SmilChr04G004136 XP_057806072.1
MYB 1
MP00627
 8075 9835 查靶基因
SmilChr01G003955 XP_057779712.1
WRKY 1
MP00450
 8044 9901 查靶基因
SmilChr03G003685 XP_057798538.1
ERF 1
MP00558
 8044 9762 查靶基因
SmilChr07G002937 XP_057777490.1
MIKC_MADS 1
MP00096
 8019 9914 查靶基因
SmilChr02G003833 XP_057794421.1
MYB 1
MP00476
 7981 9904 查靶基因
SmilChr07G002803 XP_057777238.1
NAC 1
MP00221
 7965 9903 查靶基因
SmilChr05G002364 XP_057809766.1
WRKY 1
MP00069
 7882 9917 查靶基因
SmilChr08G003267 XP_057779249.1
MYB 1
MP00406
 7839 9917 查靶基因
SmilChr02G005012 XP_057792191.1
TALE 1
MP00670
 7758 9906 查靶基因
SmilChr07G001978 XP_057776996.1
SBP 1
MP00555
 7648 9805 查靶基因
SmilChr05G000741 XP_057764423.1
ARF 1
MP00021
 7629 9812 查靶基因
SmilChr01G004579 XP_057787263.1
MYB 1
MP00132
 7583 9926 查靶基因
SmilChr05G000593 XP_057764223.1
MIKC_MADS 1
MP00609
 7575 9941 查靶基因
SmilChr03G004518 XP_057799834.1
ERF 1
MP00529
 7559 9247 查靶基因
SmilChr06G001829 XP_057766988.1
MYB 1
MP00510
 7526 9799 查靶基因
SmilChr05G000830 XP_057764550.1
NAC 1
MP00058
 7440 9855 查靶基因
SmilChr08G002543 XP_057778423.1
bZIP 1
MP00303
 7416 9868 查靶基因
SmilChr01G002743 XP_057765725.1
MYB_related 1
MP00565
 7412 9785 查靶基因
SmilChr04G002704 XP_057807081.1
ERF 1
MP00026
 7408 9854 查靶基因
SmilChr05G001395 XP_057765344.1
WRKY 1
MP00071
 7408 9764 查靶基因
SmilChr04G002953 XP_057809314.1
ARF 1
MP00033
 7406 9827 查靶基因
SmilChr01G004199 XP_057782208.1
bHLH 1
MP00074
 7396 9969 查靶基因
SmilChr05G004009 XP_057810662.1
MYB 1
MP00216
 7342 9832 查靶基因
SmilChr03G001606 XP_057802772.1
WRKY 1
MP00539
 7338 9848 查靶基因
SmilChr02G004600 XP_057791481.1
ARF 1
MP00574
 7302 9846 查靶基因
SmilChr03G004179 XP_057799230.1
WRKY 1
MP00464
 7299 9864 查靶基因
SmilChr04G003805 XP_057805691.1
MIKC_MADS 1
MP00315
 7291 9567 查靶基因
SmilChr03G003761 XP_057798625.1
WRKY 1
MP00525
 7235 9838 查靶基因
SmilChr01G001885 XP_057806790.1
WRKY 1
MP00171
 7182 9833 查靶基因
SmilChr05G004392 XP_057811204.1
WRKY 1
MP00506
 7173 9818 查靶基因
SmilChr04G002757 XP_057807158.1
MIKC_MADS 1
MP00272
 7172 9889 查靶基因
SmilChr01G003404 XP_057773670.1
bZIP 1
MP00184
 7147 9840 查靶基因
SmilChr03G002335 XP_057801256.1
bZIP 1
MP00647
 7133 9953 查靶基因
SmilChr07G002075 XP_057773918.1
C2H2 1
MP00485
 7130 8059 查靶基因
SmilChr04G000162 XP_057807467.1
MYB 1
MP00134
 7078 8676 查靶基因
SmilChr04G000040 XP_057808382.1
ERF 1
MP00312
 7006 8490 查靶基因
SmilChr08G001896 XP_057783815.1
MYB 1
MP00564
 6984 9893 查靶基因
SmilChr02G005217 XP_057792502.1
G2-like 1
MP00022
 6959 9720 查靶基因
SmilChr05G000260 XP_057763683.1
bZIP 1
MP00040
 6920 9919 查靶基因
SmilChr01G002885 XP_057767601.1
ERF 1
MP00151
 6907 9976 查靶基因
SmilChr05G001518 XP_057765511.1
WRKY 1
MP00455
 6900 9792 查靶基因
SmilChr03G002503 XP_057801356.1
MYB 1
MP00482
 6899 8940 查靶基因
SmilChr03G001252 XP_057802461.1
bZIP 1
MP00291
 6894 9321 查靶基因
SmilChr06G001365 XP_057768799.1
SBP 1
MP00307
 6893 9755 查靶基因
SmilChr03G003439 XP_057798243.1
bHLH 1
MP00195
 6878 9832 查靶基因
SmilChr06G001111 XP_057768512.1
MYB 1
MP00388
 6870 9774 查靶基因
SmilChr02G000949 XP_057795176.1
bZIP 1
MP00318
 6849 9413 查靶基因
SmilChr01G000025 XP_057790305.1
SBP 1
MP00633
 6833 8026 查靶基因
SmilChr01G004313 XP_057783598.1
bHLH 1
MP00308
 6805 9826 查靶基因
SmilChr02G005502 XP_057792768.1
bHLH 1
MP00082
 6784 9435 查靶基因
SmilChr03G004274 XP_057799397.1
MIKC_MADS 1
MP00080
 6766 9850 查靶基因
SmilChr02G003688 XP_057794248.1
MYB 1
MP00028
 6764 9024 查靶基因
SmilChr04G003367 XP_057804957.1
MYB 1
MP00191
 6736 9690 查靶基因
SmilChr04G000157 XP_057807462.1
bHLH 1
MP00081
 6729 9942 查靶基因
SmilChr07G002147 XP_057774045.1
MYB 1
MP00500
 6697 9681 查靶基因
SmilChr05G002277 XP_057809665.1
ERF 1
MP00452
 6671 7783 查靶基因
SmilChr07G004480 XP_057776222.1
WRKY 1
MP00531
 6663 9784 查靶基因
SmilChr02G004447 XP_057797242.1
HD-ZIP 1
MP00200
 6661 9930 查靶基因
SmilChr04G000070 XP_057807324.1
bHLH 1
MP00034
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G002039 XP_057808459.1
bHLH 1
MP00660
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G005851 XP_057789306.1
MYB 1
MP00055
 6638 9685 查靶基因
SmilChr02G005238 XP_057792594.1
SBP 1
MP00634
 6619 7771 查靶基因
SmilChr06G002048 XP_057770293.1
bHLH 1
MP00035
 6618 9903 查靶基因
SmilChr07G000836 XP_057772437.1
MYB_related 1
MP00568
 6611 9696 查靶基因
SmilChr04G003119 XP_057809542.1
bZIP 1
MP00039
 6610 9936 查靶基因
SmilChr01G004114 XP_057781125.1
WRKY 1
MP00284
 6552 9774 查靶基因
SmilChr08G004246 XP_057780410.1
WRKY 1
MP00422
 6535 9791 查靶基因
SmilChr05G001980 XP_057766076.1
ARF 1
MP00153
 6534 9706 查靶基因
SmilChr04G000094 XP_057807365.1
YABBY 1
MP00620
 6504 9844 查靶基因
SmilChr02G002534 XP_057797741.1
TCP 1
MP00169
 6498 7295 查靶基因
SmilChr05G001269 XP_057765199.1
G2-like 1
MP00252
 6478 9780 查靶基因
SmilChr07G003441 XP_057773618.1
NAC 1
MP00108
 6458 9810 查靶基因
SmilChr02G001791 XP_057795933.1
TCP 1
MP00062
 6454 7249 查靶基因
SmilChr05G003285 XP_057810127.1
RAV 1
MP00024
 6450 9853 查靶基因
SmilChr05G000619 XP_057764205.1
WRKY 1
MP00167
 6439 9756 查靶基因
SmilChr04G003745 XP_057809144.1
C2H2 1
MP00416
 6433 9716 查靶基因
SmilChr02G004607 XP_057791470.1
C2H2 1
MP00608
 6398 9817 查靶基因
SmilChr02G003399 XP_057793859.1
ERF 1
MP00240
 6368 9978 查靶基因
SmilChr01G004920 XP_057788125.1
MYB_related 1
MP00607
 6362 9718 查靶基因
SmilChr06G001059 XP_057768449.1
Dof 1
MP00402
 6278 9875 查靶基因
SmilChr01G004552 XP_057786668.1
bZIP 1
MP00409
 6252 8429 查靶基因
SmilChr01G006187 XP_057798078.1
GRAS 1
MP00611
 6232 9807 查靶基因
SmilChr01G001516 XP_057803325.1
bZIP 1
MP00648
 6170 9939 查靶基因
SmilChr04G003955 XP_057805828.1
ERF 1
MP00120
 6144 7514 查靶基因
SmilChr01G004708 XP_057787833.1
WRKY 1
MP00251
 6140 9713 查靶基因
SmilChr05G001961 XP_057766054.1
MIKC_MADS 1
MP00077
 6125 9815 查靶基因
SmilChr08G000478 XP_057781809.1
GATA 1
MP00130
 6015 9821 查靶基因
SmilChr01G000943 XP_057790035.1
MIKC_MADS 1
MP00508
 5979 7481 查靶基因
SmilChr05G004106 XP_057810779.1
WRKY 1
MP00260
 5932 9706 查靶基因
SmilChr04G003973 XP_057805857.1
HD-ZIP 1
MP00013
 5927 9712 查靶基因
SmilChr03G002207 XP_057801109.1
WRKY 1
MP00299
 5919 9699 查靶基因

下载包含当前查询和阈值下的全部候选靶基因，每个基因保留一个最佳位点及命中位点数。0–100 标准化 motif 得分不代表结合概率。

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr01G003955; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00007215-RA_Salv SmilChr01G003955 WRKY XP_057779712.1 MP00450 AGCGTTGACTTTTT

可能结合的靶基因

9901 个结合位点 8044 个候选靶基因 第 110 / 161 下载 TSV

上一页 110 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 标准化 motif 得分 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr01G005117 Chr01 NC_080387.1:68946490-68946503promoter 内 1003-1016 bp - 2985 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 68949488-68952268(+) SMil_00007215-RA_Salv MP00450 TAAAAGTCAAATTT
SmilChr05G000583 Chr05 NC_080391.1:4396491-4396504promoter 内 993-1006 bp - 2995 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 4399499-4401407(+) SMil_00007215-RA_Salv MP00450 AAAAAGTCAATGAA
SmilChr02G005086 Chr02 NC_080388.1:72482624-72482637promoter 内 958-971 bp + 3030 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 72478046-72479594(-) SMil_00007215-RA_Salv MP00450 AAAAAGTCAAAACA
SmilChr05G000020 Chr05 NC_080391.1:81119-81132promoter 内 957-970 bp + 3031 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 84163-84805(+) SMil_00007215-RA_Salv MP00450 TTCATTGACTTTTT
SmilChr05G003567 Chr05 NC_080391.1:47613379-47613392promoter 内 945-958 bp + 3043 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 47609291-47610336(-) SMil_00007215-RA_Salv MP00450 AATAAGTCAAAGAT
SmilChr06G003064 Chr06 NC_080392.1:43544255-43544268promoter 内 896-909 bp - 3092 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 43540410-43541163(-) SMil_00007215-RA_Salv MP00450 GGCGTTGATTTTTC
SmilChr01G004803 Chr01 NC_080387.1:66244150-66244163promoter 内 853-866 bp - 3135 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 66237564-66241015(-) SMil_00007215-RA_Salv MP00450 GTGGTTGACTATCT
SmilChr05G000248 Chr05 NC_080391.1:1901414-1901427promoter 内 821-834 bp - 3167 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 1894098-1898247(-) SMil_00007215-RA_Salv MP00450 AGTTTTGACTTTTC
SmilChr01G000577 Chr01 NC_080387.1:11988748-11988761promoter 内 802-815 bp - 3186 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 11991947-11992411(+) SMil_00007215-RA_Salv MP00450 GGAAAGTCAAATAC
SmilChr03G003398 Chr03 NC_080389.1:52375032-52375045promoter 内 794-807 bp - 3194 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 52369776-52371838(-) SMil_00007215-RA_Salv MP00450 ACTGTTGACTTCCG
SmilChr01G001918 Chr01 NC_080387.1:34326685-34326698promoter 内 762-775 bp - 3226 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 34317381-34323459(-) SMil_00007215-RA_Salv MP00450 TGCATTGACTTTTA
SmilChr03G003497 Chr03 NC_080389.1:53586735-53586748promoter 内 753-766 bp - 3235 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 53582835-53583500(-) SMil_00007215-RA_Salv MP00450 CCATTTGACTTTCG
SmilChr03G004475 Chr03 NC_080389.1:62868281-62868294promoter 内 674-687 bp - 3314 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 62860215-62864967(-) SMil_00007215-RA_Salv MP00450 AAATTTGACTTTTA
SmilChr06G000310 Chr06 NC_080392.1:2231743-2231756promoter 内 656-669 bp + 3332 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 2235088-2238621(+) SMil_00007215-RA_Salv MP00450 CCATTTGACTTTCG
SmilChr01G001874 Chr01 NC_080387.1:33769915-33769928promoter 内 633-646 bp - 3355 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 33760644-33766560(-) SMil_00007215-RA_Salv MP00450 TGCATTGACTTTTA
SmilChr06G002361 Chr06 NC_080392.1:34394270-34394283promoter 内 592-605 bp - 3396 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 34397679-34398254(+) SMil_00007215-RA_Salv MP00450 TAAAAGTCAAACTT
SmilChr01G002314 Chr01 NC_080387.1:40128867-40128880promoter 内 586-599 bp + 3402 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 40123925-40125465(-) SMil_00007215-RA_Salv MP00450 CGAAAGTCAAACTC
SmilChr01G004565 Chr01 NC_080387.1:63726328-63726341promoter 内 509-522 bp - 3479 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 63722107-63722849(-) SMil_00007215-RA_Salv MP00450 AAATTTGACTTTTA
SmilChr03G004399 Chr03 NC_080389.1:62183156-62183169promoter 内 495-508 bp + 3493 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 62186662-62190383(+) SMil_00007215-RA_Salv MP00450 AAATTTGACTTTTA
SmilChr02G004273 Chr02 NC_080388.1:64937948-64937961promoter 内 477-490 bp + 3511 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 64941472-64943380(+) SMil_00007215-RA_Salv MP00450 ATCTTTGACTTATT
SmilChr03G003051 Chr03 NC_080389.1:47415075-47415088promoter 内 454-467 bp - 3534 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 47410249-47411541(-) SMil_00007215-RA_Salv MP00450 TGATTTGACTTTGC
SmilChr04G003389 Chr04 NC_080390.1:50440044-50440057promoter 内 451-464 bp - 3537 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 50443594-50446240(+) SMil_00007215-RA_Salv MP00450 TACAAGTCAACTCG
SmilChr06G000308 Chr06 NC_080392.1:2231743-2231756promoter 内 451-464 bp + 3537 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 2225031-2228206(-) SMil_00007215-RA_Salv MP00450 CGAAAGTCAAATGG
SmilChr07G001860 Chr07 NC_080393.1:16137259-16137272promoter 内 440-453 bp - 3548 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 16127593-16133711(-) SMil_00007215-RA_Salv MP00450 AAGTTTGACTTTTA
SmilChr04G000533 Chr04 NC_080390.1:5904335-5904348promoter 内 425-438 bp + 3563 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 5907911-5921541(+) SMil_00007215-RA_Salv MP00450 GTCTTTGACTTCCG
SmilChr02G003400 Chr02 NC_080388.1:55150040-55150053promoter 内 403-416 bp - 3585 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 55140322-55146455(-) SMil_00007215-RA_Salv MP00450 TGAGTTGACTTCAC
SmilChr01G003303 Chr01 NC_080387.1:51722660-51722673promoter 内 391-404 bp - 3597 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 51711980-51719063(-) SMil_00007215-RA_Salv MP00450 GGCGTTGATTTTTC
SmilChr06G001150 Chr06 NC_080392.1:11650181-11650194promoter 内 390-403 bp - 3598 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 11653792-11654811(+) SMil_00007215-RA_Salv MP00450 AATAAGTCAAAGAT
SmilChr02G003228 Chr02 NC_080388.1:53556048-53556061promoter 内 387-400 bp + 3601 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 53549063-53552447(-) SMil_00007215-RA_Salv MP00450 TAAAAGTCAAACTT
SmilChr05G002079 Chr05 NC_080391.1:21715977-21715990promoter 内 367-380 bp + 3621 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 21719611-21721931(+) SMil_00007215-RA_Salv MP00450 CCATTTGACTTTCG
SmilChr01G003000 Chr01 NC_080387.1:48985210-48985223promoter 内 280-293 bp + 3708 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 48980029-48981502(-) SMil_00007215-RA_Salv MP00450 GAAAAGTCAATGTC
SmilChr04G000589 Chr04 NC_080390.1:6555828-6555841promoter 内 243-256 bp + 3745 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 6559586-6578686(+) SMil_00007215-RA_Salv MP00450 TGTGTTGACTTCCT
SmilChr04G001391 Chr04 NC_080390.1:22604277-22604290promoter 内 207-220 bp - 3781 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 22608071-22614622(+) SMil_00007215-RA_Salv MP00450 CGAAAGTCAAACTC
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SmilChr03G003200 Chr03 NC_080389.1:49540984-49540997promoter 内 3910-3923 bp - 78 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 2 49541075-49543951(+) SMil_00007215-RA_Salv MP00450 GGAAAGTCAAATGT
SmilChr02G003263 Chr02 NC_080388.1:53920207-53920220promoter 内 3873-3886 bp - 115 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 2 53917226-53920092(-) SMil_00007215-RA_Salv MP00450 ACTTTTGACTTTTG
SmilChr01G000991 Chr01 NC_080387.1:20931019-20931032promoter 内 3840-3853 bp + 148 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 2 20931180-20931512(+) SMil_00007215-RA_Salv MP00450 GCTGTTGACTATTT
SmilChr03G004352 Chr03 NC_080389.1:61761000-61761013promoter 内 3648-3661 bp - 340 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 2 61759108-61760660(-) SMil_00007215-RA_Salv MP00450 CGGGTTGACTTGTA
SmilChr01G003520 Chr01 NC_080387.1:53843597-53843610promoter 内 3606-3619 bp - 382 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 2 53843992-53848842(+) SMil_00007215-RA_Salv MP00450 ATAAAGTCAAATGC
SmilChr04G002377 Chr04 NC_080390.1:38292550-38292563promoter 内 3131-3144 bp - 857 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 2 38281427-38291693(-) SMil_00007215-RA_Salv MP00450 TCTGTTGACTTATT
SmilChr02G000351 Chr02 NC_080388.1:4529475-4529488promoter 内 3061-3074 bp + 927 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 2 4526416-4528548(-) SMil_00007215-RA_Salv MP00450 TCAAAGTCAAATAC
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SmilChr03G004273 Chr03 NC_080389.1:61188291-61188304promoter 内 2858-2871 bp - 1130 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 2 61189434-61194104(+) SMil_00007215-RA_Salv MP00450 AAATAGTCAACTTG
SmilChr03G001666 Chr03 NC_080389.1:21676838-21676851promoter 内 2362-2375 bp + 1626 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 2 21673326-21675212(-) SMil_00007215-RA_Salv MP00450 TAAGAGTCAACTCT