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转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family，查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。

预计算阈值必须与当前索引一致。非法、未支持或需四舍五入的输入会报错；页面与下载均不会自动切换阈值。

257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中，并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因，不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif；应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引，可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card，点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
SmilChr04G003117 XP_057809539.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr04G003114 XP_057809538.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr01G005298 XP_057788621.1
ARR-B 1
MP00010
 8344 9778 查靶基因
SmilChr03G003924 XP_057798851.1
NAC 1
MP00059
 8333 9940 查靶基因
SmilChr01G005344 XP_057788686.1
MYB 1
MP00296
 8304 9873 查靶基因
SmilChr08G004408 XP_057780613.1
MYB 1
MP00114
 8151 9897 查靶基因
SmilChr04G001094 XP_057804404.1
WRKY 1
MP00408
 8149 9902 查靶基因
SmilChr07G003597 XP_057773587.1
Nin-like 1
MP00449
 8096 9453 查靶基因
SmilChr02G005433 XP_057792682.1
WRKY 1
MP00209
 8083 9910 查靶基因
SmilChr04G004136 XP_057806072.1
MYB 1
MP00627
 8075 9835 查靶基因
SmilChr01G003955 XP_057779712.1
WRKY 1
MP00450
 8044 9901 查靶基因
SmilChr03G003685 XP_057798538.1
ERF 1
MP00558
 8044 9762 查靶基因
SmilChr07G002937 XP_057777490.1
MIKC_MADS 1
MP00096
 8019 9914 查靶基因
SmilChr02G003833 XP_057794421.1
MYB 1
MP00476
 7981 9904 查靶基因
SmilChr07G002803 XP_057777238.1
NAC 1
MP00221
 7965 9903 查靶基因
SmilChr05G002364 XP_057809766.1
WRKY 1
MP00069
 7882 9917 查靶基因
SmilChr08G003267 XP_057779249.1
MYB 1
MP00406
 7839 9917 查靶基因
SmilChr02G005012 XP_057792191.1
TALE 1
MP00670
 7758 9906 查靶基因
SmilChr07G001978 XP_057776996.1
SBP 1
MP00555
 7648 9805 查靶基因
SmilChr05G000741 XP_057764423.1
ARF 1
MP00021
 7629 9812 查靶基因
SmilChr01G004579 XP_057787263.1
MYB 1
MP00132
 7583 9926 查靶基因
SmilChr05G000593 XP_057764223.1
MIKC_MADS 1
MP00609
 7575 9941 查靶基因
SmilChr03G004518 XP_057799834.1
ERF 1
MP00529
 7559 9247 查靶基因
SmilChr06G001829 XP_057766988.1
MYB 1
MP00510
 7526 9799 查靶基因
SmilChr05G000830 XP_057764550.1
NAC 1
MP00058
 7440 9855 查靶基因
SmilChr08G002543 XP_057778423.1
bZIP 1
MP00303
 7416 9868 查靶基因
SmilChr01G002743 XP_057765725.1
MYB_related 1
MP00565
 7412 9785 查靶基因
SmilChr04G002704 XP_057807081.1
ERF 1
MP00026
 7408 9854 查靶基因
SmilChr05G001395 XP_057765344.1
WRKY 1
MP00071
 7408 9764 查靶基因
SmilChr04G002953 XP_057809314.1
ARF 1
MP00033
 7406 9827 查靶基因
SmilChr01G004199 XP_057782208.1
bHLH 1
MP00074
 7396 9969 查靶基因
SmilChr05G004009 XP_057810662.1
MYB 1
MP00216
 7342 9832 查靶基因
SmilChr03G001606 XP_057802772.1
WRKY 1
MP00539
 7338 9848 查靶基因
SmilChr02G004600 XP_057791481.1
ARF 1
MP00574
 7302 9846 查靶基因
SmilChr03G004179 XP_057799230.1
WRKY 1
MP00464
 7299 9864 查靶基因
SmilChr04G003805 XP_057805691.1
MIKC_MADS 1
MP00315
 7291 9567 查靶基因
SmilChr03G003761 XP_057798625.1
WRKY 1
MP00525
 7235 9838 查靶基因
SmilChr01G001885 XP_057806790.1
WRKY 1
MP00171
 7182 9833 查靶基因
SmilChr05G004392 XP_057811204.1
WRKY 1
MP00506
 7173 9818 查靶基因
SmilChr04G002757 XP_057807158.1
MIKC_MADS 1
MP00272
 7172 9889 查靶基因
SmilChr01G003404 XP_057773670.1
bZIP 1
MP00184
 7147 9840 查靶基因
SmilChr03G002335 XP_057801256.1
bZIP 1
MP00647
 7133 9953 查靶基因
SmilChr07G002075 XP_057773918.1
C2H2 1
MP00485
 7130 8059 查靶基因
SmilChr04G000162 XP_057807467.1
MYB 1
MP00134
 7078 8676 查靶基因
SmilChr04G000040 XP_057808382.1
ERF 1
MP00312
 7006 8490 查靶基因
SmilChr08G001896 XP_057783815.1
MYB 1
MP00564
 6984 9893 查靶基因
SmilChr02G005217 XP_057792502.1
G2-like 1
MP00022
 6959 9720 查靶基因
SmilChr05G000260 XP_057763683.1
bZIP 1
MP00040
 6920 9919 查靶基因
SmilChr01G002885 XP_057767601.1
ERF 1
MP00151
 6907 9976 查靶基因
SmilChr05G001518 XP_057765511.1
WRKY 1
MP00455
 6900 9792 查靶基因
SmilChr03G002503 XP_057801356.1
MYB 1
MP00482
 6899 8940 查靶基因
SmilChr03G001252 XP_057802461.1
bZIP 1
MP00291
 6894 9321 查靶基因
SmilChr06G001365 XP_057768799.1
SBP 1
MP00307
 6893 9755 查靶基因
SmilChr03G003439 XP_057798243.1
bHLH 1
MP00195
 6878 9832 查靶基因
SmilChr06G001111 XP_057768512.1
MYB 1
MP00388
 6870 9774 查靶基因
SmilChr02G000949 XP_057795176.1
bZIP 1
MP00318
 6849 9413 查靶基因
SmilChr01G000025 XP_057790305.1
SBP 1
MP00633
 6833 8026 查靶基因
SmilChr01G004313 XP_057783598.1
bHLH 1
MP00308
 6805 9826 查靶基因
SmilChr02G005502 XP_057792768.1
bHLH 1
MP00082
 6784 9435 查靶基因
SmilChr03G004274 XP_057799397.1
MIKC_MADS 1
MP00080
 6766 9850 查靶基因
SmilChr02G003688 XP_057794248.1
MYB 1
MP00028
 6764 9024 查靶基因
SmilChr04G003367 XP_057804957.1
MYB 1
MP00191
 6736 9690 查靶基因
SmilChr04G000157 XP_057807462.1
bHLH 1
MP00081
 6729 9942 查靶基因
SmilChr07G002147 XP_057774045.1
MYB 1
MP00500
 6697 9681 查靶基因
SmilChr05G002277 XP_057809665.1
ERF 1
MP00452
 6671 7783 查靶基因
SmilChr07G004480 XP_057776222.1
WRKY 1
MP00531
 6663 9784 查靶基因
SmilChr02G004447 XP_057797242.1
HD-ZIP 1
MP00200
 6661 9930 查靶基因
SmilChr04G000070 XP_057807324.1
bHLH 1
MP00034
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G002039 XP_057808459.1
bHLH 1
MP00660
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G005851 XP_057789306.1
MYB 1
MP00055
 6638 9685 查靶基因
SmilChr02G005238 XP_057792594.1
SBP 1
MP00634
 6619 7771 查靶基因
SmilChr06G002048 XP_057770293.1
bHLH 1
MP00035
 6618 9903 查靶基因
SmilChr07G000836 XP_057772437.1
MYB_related 1
MP00568
 6611 9696 查靶基因
SmilChr04G003119 XP_057809542.1
bZIP 1
MP00039
 6610 9936 查靶基因
SmilChr01G004114 XP_057781125.1
WRKY 1
MP00284
 6552 9774 查靶基因
SmilChr08G004246 XP_057780410.1
WRKY 1
MP00422
 6535 9791 查靶基因
SmilChr05G001980 XP_057766076.1
ARF 1
MP00153
 6534 9706 查靶基因
SmilChr04G000094 XP_057807365.1
YABBY 1
MP00620
 6504 9844 查靶基因
SmilChr02G002534 XP_057797741.1
TCP 1
MP00169
 6498 7295 查靶基因
SmilChr05G001269 XP_057765199.1
G2-like 1
MP00252
 6478 9780 查靶基因
SmilChr07G003441 XP_057773618.1
NAC 1
MP00108
 6458 9810 查靶基因
SmilChr02G001791 XP_057795933.1
TCP 1
MP00062
 6454 7249 查靶基因
SmilChr05G003285 XP_057810127.1
RAV 1
MP00024
 6450 9853 查靶基因
SmilChr05G000619 XP_057764205.1
WRKY 1
MP00167
 6439 9756 查靶基因
SmilChr04G003745 XP_057809144.1
C2H2 1
MP00416
 6433 9716 查靶基因
SmilChr02G004607 XP_057791470.1
C2H2 1
MP00608
 6398 9817 查靶基因
SmilChr02G003399 XP_057793859.1
ERF 1
MP00240
 6368 9978 查靶基因
SmilChr01G004920 XP_057788125.1
MYB_related 1
MP00607
 6362 9718 查靶基因
SmilChr06G001059 XP_057768449.1
Dof 1
MP00402
 6278 9875 查靶基因
SmilChr01G004552 XP_057786668.1
bZIP 1
MP00409
 6252 8429 查靶基因
SmilChr01G006187 XP_057798078.1
GRAS 1
MP00611
 6232 9807 查靶基因
SmilChr01G001516 XP_057803325.1
bZIP 1
MP00648
 6170 9939 查靶基因
SmilChr04G003955 XP_057805828.1
ERF 1
MP00120
 6144 7514 查靶基因
SmilChr01G004708 XP_057787833.1
WRKY 1
MP00251
 6140 9713 查靶基因
SmilChr05G001961 XP_057766054.1
MIKC_MADS 1
MP00077
 6125 9815 查靶基因
SmilChr08G000478 XP_057781809.1
GATA 1
MP00130
 6015 9821 查靶基因
SmilChr01G000943 XP_057790035.1
MIKC_MADS 1
MP00508
 5979 7481 查靶基因
SmilChr05G004106 XP_057810779.1
WRKY 1
MP00260
 5932 9706 查靶基因
SmilChr04G003973 XP_057805857.1
HD-ZIP 1
MP00013
 5927 9712 查靶基因
SmilChr03G002207 XP_057801109.1
WRKY 1
MP00299
 5919 9699 查靶基因

下载包含当前查询和阈值下的全部候选靶基因，每个基因保留一个最佳位点及命中位点数。0–100 标准化 motif 得分不代表结合概率。

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr01G002743; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00022510-RA_Salv SmilChr01G002743 MYB_related XP_057765725.1 MP00565 AACCTTATCCATAAA

可能结合的靶基因

9785 个结合位点 7412 个候选靶基因 第 115 / 149 下载 TSV

上一页 115 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 标准化 motif 得分 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr01G004807 Chr01 NC_080387.1:66263948-66263962promoter 内 1352-1366 bp - 2635 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.0/ 100 1 66266597-66270367(+) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 AAAGAAGATAAGGTC
SmilChr01G005721 Chr01 NC_080387.1:73385842-73385856promoter 内 1350-1364 bp - 2637 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.0/ 100 1 73388493-73389101(+) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 GTTTTGGATAATCCA
SmilChr03G003041 Chr03 NC_080389.1:47308655-47308669promoter 内 1311-1325 bp + 2676 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.0/ 100 1 47311345-47321670(+) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 ATCCATATCCATTAT
SmilChr03G004161 Chr03 NC_080389.1:60394761-60394775promoter 内 1273-1287 bp - 2714 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.0/ 100 1 60391093-60392047(-) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 TTGCTTATCCTTATT
SmilChr03G002868 Chr03 NC_080389.1:45302250-45302264promoter 内 1237-1251 bp - 2750 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.0/ 100 1 45305014-45309383(+) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 AAAATGGATAAATTT
SmilChr04G001065 Chr04 NC_080390.1:15226241-15226255promoter 内 1237-1251 bp + 2750 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.0/ 100 1 15219369-15223491(-) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 TATGTGGATAAGTAG
SmilChr01G001600 Chr01 NC_080387.1:30164202-30164216promoter 内 1230-1244 bp + 2757 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.0/ 100 1 30158031-30161445(-) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 AATTTTGATAAGGTT
SmilChr01G004346 Chr01 NC_080387.1:61618433-61618447promoter 内 1203-1217 bp + 2784 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.0/ 100 1 61613125-61615649(-) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 TATGTGGATAAATTT
SmilChr01G004884 Chr01 NC_080387.1:66906978-66906992promoter 内 1143-1157 bp - 2844 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.0/ 100 1 66909836-66914661(+) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 CTATCGGATAAGTTA
SmilChr03G001892 Chr03 NC_080389.1:26425737-26425751promoter 内 1097-1111 bp + 2890 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.0/ 100 1 26428641-26428979(+) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 TCCCTTATCTATTAA
SmilChr01G005836 Chr01 NC_080387.1:74381122-74381136promoter 内 1084-1098 bp - 2903 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.0/ 100 1 74371627-74378219(-) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 TAGTTTATCCAAAAA
SmilChr03G002081 Chr03 NC_080389.1:32020942-32020956promoter 内 1050-1064 bp + 2937 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.0/ 100 1 32014229-32018005(-) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 AAAATGGATATGGAT
SmilChr03G000584 Chr03 NC_080389.1:6508348-6508362promoter 内 1044-1058 bp + 2943 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.0/ 100 1 6504695-6505405(-) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 GGATAAGATAAGGTG
SmilChr02G003127 Chr02 NC_080388.1:52294954-52294968promoter 内 1043-1057 bp + 2944 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.0/ 100 1 52297912-52299027(+) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 AAATTTATCCAATAA
SmilChr03G001578 Chr03 NC_080389.1:19944134-19944148promoter 内 1043-1057 bp - 2944 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.0/ 100 1 19947092-19951504(+) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 ACTACGGATAAGGAC
SmilChr01G001582 Chr01 NC_080387.1:29840984-29840998promoter 内 1010-1024 bp - 2977 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.0/ 100 1 29834000-29838007(-) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 ATCCATATCCATTTT
SmilChr04G001586 Chr04 NC_080390.1:26360255-26360269promoter 内 1010-1024 bp - 2977 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.0/ 100 1 26363246-26364595(+) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 TGATCAGATAAGGTA
SmilChr01G005506 Chr01 NC_080387.1:71917216-71917230promoter 内 1008-1022 bp - 2979 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.0/ 100 1 71920209-71927452(+) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 ATTCCGGATAAGAAT
SmilChr03G004243 Chr03 NC_080389.1:60948824-60948838promoter 内 961-975 bp + 3026 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.0/ 100 1 60942628-60945798(-) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 CCATTGGATAAAGCT
SmilChr01G004945 Chr01 NC_080387.1:67557506-67557520promoter 内 958-972 bp - 3029 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.0/ 100 1 67552464-67554477(-) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 AACCTTATCTGAAGA
SmilChr02G002073 Chr02 NC_080388.1:37322901-37322915promoter 内 946-960 bp + 3041 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.0/ 100 1 37325956-37330395(+) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 ATGCTTATCCTCTCC
SmilChr01G004501 Chr01 NC_080387.1:63115802-63115816promoter 内 944-958 bp + 3043 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.0/ 100 1 63118859-63119747(+) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 GATTTTATCCAAACA
SmilChr01G004324 Chr01 NC_080387.1:61399482-61399496promoter 内 898-912 bp + 3089 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.0/ 100 1 61402585-61404376(+) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 TTTATTATCCACATT
SmilChr01G002466 Chr01 NC_080387.1:42345546-42345560promoter 内 897-911 bp + 3090 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.0/ 100 1 42348650-42358688(+) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 TTGATTATCCATATC
SmilChr01G003197 Chr01 NC_080387.1:50742164-50742178promoter 内 840-854 bp - 3147 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.0/ 100 1 50734261-50739017(-) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 GAGATTATCCAAATT
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SmilChr02G003741 Chr02 NC_080388.1:59061260-59061274promoter 内 820-834 bp - 3167 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.0/ 100 1 59064441-59066787(+) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 GGATTGGATAATGGA
SmilChr03G000501 Chr03 NC_080389.1:5397613-5397627promoter 内 775-789 bp - 3212 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.0/ 100 1 5393394-5394401(-) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 TATTTTATCCAATCG
SmilChr03G004485 Chr03 NC_080389.1:62979280-62979294promoter 内 769-783 bp + 3218 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.0/ 100 1 62971886-62976062(-) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 TGTTTGGATAAAAAT
SmilChr01G000953 Chr01 NC_080387.1:20168666-20168680promoter 内 751-765 bp + 3236 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.0/ 100 1 20171916-20171987(+) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 CGTCTTATCCGTTTT
SmilChr02G004111 Chr02 NC_080388.1:63403558-63403572promoter 内 732-746 bp + 3255 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.0/ 100 1 63406827-63409082(+) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 GATTTTATCCAAACA
SmilChr01G002104 Chr01 NC_080387.1:37070443-37070457promoter 内 700-714 bp - 3287 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.0/ 100 1 37073744-37074483(+) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 AAAATGGATATGGAT
SmilChr03G003420 Chr03 NC_080389.1:52545212-52545226promoter 内 667-681 bp + 3320 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.0/ 100 1 52539660-52541892(-) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 AGACTGGATAAGGGA
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SmilChr03G004384 Chr03 NC_080389.1:62050714-62050728promoter 内 640-654 bp - 3347 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.0/ 100 1 62054075-62056403(+) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 TGTTTGGATAAAATC
SmilChr01G005019 Chr01 NC_080387.1:68188675-68188689promoter 内 607-621 bp + 3380 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.0/ 100 1 68182488-68185295(-) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 GGACCGGATAAGGCC
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SmilChr03G003527 Chr03 NC_080389.1:53887738-53887752promoter 内 473-487 bp - 3514 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.0/ 100 1 53878008-53884224(-) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 TCCCTTATCTAAAAT
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SmilChr04G003816 Chr04 NC_080390.1:54315966-54315980promoter 内 414-428 bp - 3573 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.0/ 100 1 54319553-54320253(+) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 AATATGGATATGGTG
SmilChr04G003957 Chr04 NC_080390.1:55114652-55114666promoter 内 381-395 bp - 3606 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.0/ 100 1 55108764-55111046(-) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 ATCCATATCCATTTT
SmilChr04G003309 Chr04 NC_080390.1:49825096-49825110promoter 内 319-333 bp + 3668 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.0/ 100 1 49819436-49821428(-) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 AATAAAGATAAGGAA
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SmilChr04G004079 Chr04 NC_080390.1:55858385-55858399promoter 内 268-282 bp - 3719 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.0/ 100 1 55848981-55854666(-) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 TGTTTTATCCAAATA
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SmilChr02G003114 Chr02 NC_080388.1:52138354-52138368promoter 内 230-244 bp - 3757 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.0/ 100 1 52132638-52134597(-) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 GATTTTATCCAAACA
SmilChr03G004671 Chr03 NC_080389.1:64162760-64162774promoter 内 202-216 bp - 3785 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.0/ 100 1 64166559-64168856(+) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 TTTGTGGATAAATTT
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SmilChr01G004685 Chr01 NC_080387.1:64927903-64927917promoter 内 139-153 bp - 3848 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.0/ 100 1 64921586-64924055(-) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 AACCTTATCAAAAAT